Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_14638
• Subject: XM_011242121.1
• Aligned Length: 2461
• Identities: 1970
• Gaps: 269

Alignment

Query    1  ATGTGGAGCTGGAAGTGCCTCCTCTTCTGGGCTGTGCTGGTCACAGCCACACTCTGCACCGCTAGGCCGTCCCC  74
            ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||..||||
Sbjct    1  ATGTGGGGCTGGAAGTGCCTCCTCTTCTGGGCTGTGCTGGTCACAGCCACTCTCTGCACTGCCAGGCCAGCCCC  74

Query   75  GACCTTGCCTGAACAAGCCCAGCCCTGGGGAGCCCCTGTGGAAGTGGAGTCCTTCCTGGTCCACCCCGGTGACC  148
            .||||||||||||||                                                           
Sbjct   75  AACCTTGCCTGAACA-----------------------------------------------------------  89

Query  149  TGCTGCAGCTTCGCTGTCGGCTGCGGGACGATGTGCAGAGCATCAACTGGCTGCGGGACGGGGTGCAGCTGGCG  222
                                                                                      
Sbjct   90  --------------------------------------------------------------------------  89

Query  223  GAAAGCAACCGCACCCGCATCACAGGGGAGGAGGTGGAGGTGCAGGACTCCGTGCCCGCAGACTCCGGCCTCTA  296
                                                                                      
Sbjct   90  --------------------------------------------------------------------------  89

Query  297  TGCTTGCGTAACCAGCAGCCCCTCGGGCAGTGACACCACCTACTTCTCCGTCAATGTTTCAGATGCTCTCCCCT  370
                                                                        ||||||.|||||.|
Sbjct   90  ------------------------------------------------------------AGATGCACTCCCAT  103

Query  371  CCTCGGAGGATGATGATGATGATGATGACTCCTCTTCAGAGGAGAAAGAAACAGATAACACCAAACCAAACCCC  444
            |||||||.||||||||.||.||.|||||||||||.||.|||||||||||.||.||.|||||||||||||||||.
Sbjct  104  CCTCGGAAGATGATGACGACGACGATGACTCCTCCTCGGAGGAGAAAGAGACGGACAACACCAAACCAAACCCT  177

Query  445  GTAGCTCCATATTGGACATCCCCAGAAAAGATGGAAAAGAAATTGCATGCAGTGCCGGCTGCCAAGACAGTGAA  518
            ||||||||.||.||||||||||||||.||.|||||.||||||.|||||||.|||||.|||||||||||.|||||
Sbjct  178  GTAGCTCCCTACTGGACATCCCCAGAGAAAATGGAGAAGAAACTGCATGCGGTGCCCGCTGCCAAGACGGTGAA  251

Query  519  GTTCAAATGCCCTTCCAGTGGGACCCCAAACCCCACACTGCGCTGGTTGAAAAATGGCAAAGAATTCAAACCTG  592
            ||||||.|||||.||.||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||
Sbjct  252  GTTCAAGTGCCCGTCGAGTGGGACACCCAACCCCACTCTGCGCTGGTTGAAAAATGGCAAAGAGTTTAAGCCTG  325

Query  593  ACCACAGAATTGGAGGCTACAAGGTCCGTTATGCCACCTGGAGCATCATAATGGACTCTGTGGTGCCCTCTGAC  666
            |||||.|||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||
Sbjct  326  ACCACCGAATTGGAGGCTACAAGGTTCGCTATGCCACCTGGAGCATCATAATGGATTCTGTGGTGCCTTCTGAC  399

Query  667  AAGGGCAACTACACCTGCATTGTGGAGAATGAGTACGGCAGCATCAACCACACATACCAGCTGGATGTCGTGGA  740
            ||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||.||.||||||||
Sbjct  400  AAGGGCAACTACACCTGCATCGTGGAGAATGAGTATGGGAGCATCAACCACACCTACCAGCTTGACGTCGTGGA  473

Query  741  GCGGTCCCCTCACCGGCCCATCCTGCAAGCAGGGTTGCCCGCCAACAAAACAGTGGCCCTGGGTAGCAACGTGG  814
            .||.||.||.|||||.||||||||.||.||||||.||||.||||||||.||||||||||||||.|||||.||||
Sbjct  474  ACGATCTCCGCACCGACCCATCCTTCAGGCAGGGCTGCCTGCCAACAAGACAGTGGCCCTGGGCAGCAATGTGG  547

Query  815  AGTTCATGTGTAAGGTGTACAGTGACCCGCAGCCGCACATCCAGTGGCTAAAGCACATCGAGGTGAATGGGAGC  888
            ||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||.
Sbjct  548  AGTTCATGTGTAAGGTGTACAGCGATCCGCAGCCTCACATTCAGTGGCTGAAGCACATCGAGGTGAACGGGAGT  621

Query  889  AAGATTGGCCCAGACAACCTGCCTTATGTCCAGATCTTGAAGACTGCTGGAGTTAATACCACCGACAAAGAGAT  962
            |||||.||.|||||||||.||||.||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.||.||
Sbjct  622  AAGATCGGGCCAGACAACTTGCCGTATGTCCAGATCCTGAAGACTGCTGGAGTTAATACCACCGACAAGGAAAT  695

Query  963  GGAGGTGCTTCACTTAAGAAATGTCTCCTTTGAGGACGCAGGGGAGTATACGTGCTTGGCGGGTAACTCTATCG  1036
            ||||||||||||..||.|.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  696  GGAGGTGCTTCATCTACGGAATGTCTCCTTTGAGGATGCGGGGGAGTATACGTGCTTGGCGGGTAACTCTATCG  769

Query 1037  GACTCTCCCATCACTCTGCATGGTTGACCGTTCTGGAAGCCCTGGAAGAGAGGCCGGCAGTGATGACCTCGCCC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.||.
Sbjct  770  GACTCTCCCATCACTCTGCATGGTTGACCGTTCTGGAAGCCCTGGAAGAGAGACCAGCTGTGATGACCTCACCG  843

Query 1111  CTGTACCTGGAGATCATCATCTATTGCACAGGGGCCTTCCTCATCTCCTGCATGGTGGGGTCGGTCATCGTCTA  1184
            ||.||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||.||||.||.||||||.||||
Sbjct  844  CTCTACCTGGAGATCATTATCTACTGCACCGGGGCCTTCCTGATCTCCTGCATGTTGGGCTCTGTCATCATCTA  917

Query 1185  CAAGATGAAGAGTGGTACCAAGAAGAGTGACTTCCACAGCCAGATGGCTGTGCACAAGCTGGCCAAGAGCATCC  1258
            .|||||||||||.||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  918  TAAGATGAAGAGCGGCACCAAGAAGAGCGACTTCCATAGCCAGATGGCTGTGCACAAGCTGGCCAAGAGCATCC  991

Query 1259  CTCTGCGCAGACAGGTAACAGTGTCTGCTGACTCCAGTGCATCCATGAACTCTGGGGTTCTTCTGGTTCGGCCA  1332
            |||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.
Sbjct  992  CTCTGCGCAGACAGGTAACAGTGTCAGCTGACTCCAGTGCATCCATGAACTCTGGGGTTCTCCTGGTTCGGCCC  1065

Query 1333  TCACGGCTCTCCTCCAGTGGGACTCCCATGCTAGCAGGGGTCTCTGAGTATGAGCTTCCCGAAGACCCTCGCTG  1406
            |||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.||.|||||.||.||||||||.||.||.||.||.|||||
Sbjct 1066  TCACGGCTCTCCTCCAGCGGGACCCCCATGCTGGCTGGAGTCTCCGAATATGAGCTCCCTGAGGATCCCCGCTG  1139

Query 1407  GGAGCTGCCTCGGGACAGACTGGTCTTAGGCAAACCCCTGGGAGAGGGCTGCTTTGGGCAGGTGGTGTTGGCAG  1480
            |||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|
Sbjct 1140  GGAGCTGCCACGAGACAGACTGGTCTTAGGCAAACCACTTGGCGAGGGCTGCTTCGGGCAGGTGGTGTTGGCTG  1213

Query 1481  AGGCTATCGGGCTGGACAAGGACAAACCCAACCGTGTGACCAAAGTGGCTGTGAAGATGTTGAAGTCGGACGCA  1554
            ||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1214  AGGCCATCGGGCTGGATAAGGACAAACCCAACCGTGTGACCAAAGTGGCCGTGAAGATGTTGAAGTCCGACGCA  1287

Query 1555  ACAGAGAAAGACTTGTCAGACCTGATCTCAGAAATGGAGATGATGAAGATGATCGGGAAGCATAAGAATATCAT  1628
            ||.|||||.|||.||||.||.||||||||.||.||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||
Sbjct 1288  ACGGAGAAGGACCTGTCGGATCTGATCTCGGAGATGGAGATGATGAAAATGATTGGGAAGCACAAGAATATCAT  1361

Query 1629  CAACCTGCTGGGGGCCTGCACGCAGGATGGTCC-CTTGTATGTCATCGTGGAGTATGCCTCCAAGGGCAACCTG  1701
            ||||||.|||||.||.|||||.||||||||||| ||| ||||||||.||||||||.||||||||.|||||.||.
Sbjct 1362  CAACCTTCTGGGAGCGTGCACACAGGATGGTCCTCTT-TATGTCATTGTGGAGTACGCCTCCAAAGGCAATCTC  1434

Query 1702  CGGGAGTACCTGCAGGCCCGGAGGCCCCCAGGGCTGGAATACTGCTACAACCCCAGCCACAACCCAGAGGAGCA  1775
            ||||||||.||.||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||
Sbjct 1435  CGGGAGTATCTACAGGCCCGGAGGCCTCCTGGGCTGGAGTACTGCTATAACCCCAGCCACAACCCCGAGGAACA  1508

Query 1776  GCTCTCCTCCAAGGACCTGGTGTCCTGCGCCTACCAGGTGGCCCGAGGCATGGAGTATCTGGCCTCCAAGAAGT  1849
            |||.||.|||||.||.|||||.|||||.|||||.||||||||.||.||||||||||||||.|||||.|||||||
Sbjct 1509  GCTGTCTTCCAAAGATCTGGTATCCTGTGCCTATCAGGTGGCTCGGGGCATGGAGTATCTTGCCTCTAAGAAGT  1582

Query 1850  GCATACACCGAGACCTGGCAGCCAGGAATGTCCTGGTGACAGAGGACAATGTGATGAAGATAGCAGACTTTGGC  1923
            |.|||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||.|||||.||.||.||||||||.||||||||||||
Sbjct 1583  GTATACACCGAGACCTGGCTGCTAGGAACGTCCTGGTGACCGAGGATAACGTAATGAAGATCGCAGACTTTGGC  1656

Query 1924  CTCGCACGGGACATTCACCACATCGACTACTATAAAAAGACAACCAACGGCCGACTGCCTGTGAAGTGGATGGC  1997
            .|.||.||.||||||||.||.|||||||||||.||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1657  TTAGCTCGAGACATTCATCATATCGACTACTACAAGAAAACCACCAACGGCCGGCTGCCTGTGAAGTGGATGGC  1730

Query 1998  ACCCGAGGCATTATTTGACCGGATCTACACCCACCAGAGTGATGTGTGGTCTTTCGGGGTGCTCCTGTGGGAGA  2071
            .||.|||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||.||||||.|||||||||
Sbjct 1731  CCCTGAGGCGTTGTTTGACCGGATCTACACACACCAGAGCGATGTGTGGTCTTTTGGAGTGCTCTTGTGGGAGA  1804

Query 2072  TCTTCACTCTGGGCGGCTCCCCATACCCCGGTGTGCCTGTGGAGGAACTTTTCAAGCTGCTGAAGGAGGGTCAC  2145
            |||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1805  TCTTCACTCTGGGTGGCTCCCCATACCCCGGTGTGCCTGTGGAGGAACTTTTCAAGCTGCTGAAGGAGGGTCAT  1878

Query 2146  CGCATGGACAAGCCCAGTAACTGCACCAACGAGCTGTACATGATGATGCGGGACTGCTGGCATGCAGTGCCCTC  2219
            ||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1879  CGAATGGACAAGCCCAGTAACTGTACCAATGAGCTGTACATGATGATGCGGGACTGCTGGCATGCAGTGCCCTC  1952

Query 2220  ACAGAGACCCACCTTCAAGCAGCTGGTGGAAGACCTGGACCGCATCGTGGCCTTGACCTCCAACCAGGAGTACC  2293
            .||||||||.||.|||||||||.||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1953  TCAGAGACCTACGTTCAAGCAGTTGGTGGAAGACCTGGACCGCATTGTGGCCTTGACCTCCAACCAGGAGTATC  2026

Query 2294  TGGACCTGTCCATGCCCCTGGACCAGTACTCCCCCAGCTTTCCCGACACCCGGAGCTCTACGTGCTCCTCAGGG  2367
            |||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||
Sbjct 2027  TGGACCTGTCCATACCGCTGGACCAGTACTCACCCAGCTTTCCCGACACACGGAGCTCCACCTGCTCCTCAGGG  2100

Query 2368  GAGGATTCCGTCTTCTCTCATGAGCCGCTGCCCGAGGAGCCCTGCCTGCCCCGACACCCAGCCCAGCTTGCCAA  2441
            |||||.||.||||||||||||||||||.|.||.|||||||||||.|||||.||||||||..|||||||||||||
Sbjct 2101  GAGGACTCTGTCTTCTCTCATGAGCCGTTACCTGAGGAGCCCTGTCTGCCTCGACACCCCACCCAGCTTGCCAA  2174

Query 2442  TGGCGGACTCAAACGCCGC  2460
            ..|.|||||||||||.|||
Sbjct 2175  CAGTGGACTCAAACGGCGC  2193