Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_14682
Subject:
NM_010591.2
Aligned Length:
1002
Identities:
910
Gaps:
9

Alignment

Query    1  ATGACTGCAAAGATGGAAACGACCTTCTATGACGATGCCCTCAACGCCTCGTTCCTCCCGTCCGAGAGCGGACC  74
            |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||..|
Sbjct    1  ATGACTGCAAAGATGGAAACGACCTTCTACGACGATGCCCTCAACGCCTCGTTCCTCCAGTCCGAGAGCGGTGC  74

Query   75  TTATGGCTACAGTAACCCCAAGATCCTGAAACAGAGCATGACCCTGAACCTGGCCGACCCAGTGGGGAGCCTGA  148
            .||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||.||||||||||||||||.|||||.||.||||
Sbjct   75  CTACGGCTACAGTAACCCTAAGATCCTAAAACAGAGCATGACCTTGAACCTGGCCGACCCGGTGGGCAGTCTGA  148

Query  149  AGCCGCACCTCCGCGCCAAGAACTCGGACCTCCTCACCTCGCCCGACGTGGGGCTGCTCAAGCTGGCGTCGCCC  222
            |||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.
Sbjct  149  AGCCGCACCTCCGCGCCAAGAACTCGGACCTTCTCACGTCGCCCGACGTCGGGCTGCTCAAGCTGGCGTCGCCG  222

Query  223  GAGCTGGAGCGCCTGATAATCCAGTCCAGCAACGGGCACATCACCACCACGCCGACCCCCACCCAGTTCCTGTG  296
            |||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||||||.||||
Sbjct  223  GAGCTGGAGCGCCTGATCATCCAGTCCAGCAATGGGCACATCACCACTACACCGACCCCCACCCAGTTCTTGTG  296

Query  297  CCCCAAGAACGTGACAGATGAGCAGGAGGGCTTCGCCGAGGGCTTCGTGCGCGCCCTGGCCGAACTGCACAGCC  370
            |||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||
Sbjct  297  CCCCAAGAACGTGACCGACGAGCAGGAGGGCTTCGCCGAGGGCTTCGTGCGCGCCCTGGCTGAACTGCATAGCC  370

Query  371  AGAACACGCTGCCCAGCGTCACGTCGGCGGCGCAGCCGGTCAACGGGGCAGGCATGGTGGCTCCCGCGGTAGCC  444
            ||||||||||.|||||.|||||.||.|||||.||||||||||.||||||.||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  371  AGAACACGCTTCCCAGTGTCACCTCCGCGGCACAGCCGGTCAGCGGGGCGGGCATGGTGGCTCCCGCGGTGGCC  444

Query  445  TCGGTGGCAGGGGGCAGCGGCAGCGGCGGCTTCAGCGCCAGCCTGCACAGCGAGCCGCCGGTCTACGCAAACCT  518
            ||.||.|||||.|...|||||.|.||.||||.||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||
Sbjct  445  TCAGTAGCAGGCGCTGGCGGCGGTGGTGGCTACAGCGCCAGCCTGCACAGTGAGCCTCCGGTCTACGCCAACCT  518

Query  519  CAGCAACTTCAACCCAGGCGCGCTGAGCAGCGGCGGCGGGGCGCCCTCCTACGGCGCGGCCGGCCTGGCCTTTC  592
            |||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||
Sbjct  519  CAGCAACTTCAACCCGGGTGCGCTGAGCAGCGGCGGTGGGGCGCCCTCCTATGGCGCGGCCGGGCTGGCCTTTC  592

Query  593  CCGCGCAACCCCAGCAGCAGCAG---------CAGCCGCCGCACCACCTGCCCCAGCAGATGCCCGTGCAGCAC  657
            ||.||||.||.||||||||||||         |||||||||||||||.|||||||.|||||.||.|||||||||
Sbjct  593  CCTCGCAGCCGCAGCAGCAGCAGCAGCCGCCTCAGCCGCCGCACCACTTGCCCCAACAGATCCCGGTGCAGCAC  666

Query  658  CCGCGGCTGCAGGCCCTGAAGGAGGAGCCTCAGACAGTGCCCGAGATGCCCGGCGAGACACCGCCCCTGTCCCC  731
            |||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||.||||||||.||.|||||.||||||||||||||
Sbjct  667  CCGCGGCTGCAAGCCCTGAAGGAAGAGCCGCAGACCGTGCCGGAGATGCCGGGAGAGACGCCGCCCCTGTCCCC  740

Query  732  CATCGACATGGAGTCCCAGGAGCGGATCAAGGCGGAGAGGAAGCGCATGAGGAACCGCATCGCTGCCTCCAAGT  805
            .||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||
Sbjct  741  TATCGACATGGAGTCTCAGGAGCGGATCAAGGCAGAGAGGAAGCGCATGAGGAACCGCATTGCCGCCTCCAAGT  814

Query  806  GCCGAAAAAGGAAGCTGGAGAGAATCGCCCGGCTGGAGGAAAAAGTGAAAACCTTGAAAGCTCAGAACTCGGAG  879
            ||||.|||||||||||||||.|.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||
Sbjct  815  GCCGGAAAAGGAAGCTGGAGCGGATCGCTCGGCTAGAGGAAAAAGTGAAAACCTTGAAAGCGCAAAACTCCGAG  888

Query  880  CTGGCGTCCACGGCCAACATGCTCAGGGAACAGGTGGCACAGCTTAAACAGAAAGTCATGAACCACGTTAACAG  953
            |||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CTGGCATCCACGGCCAACATGCTCAGGGAACAGGTGGCACAGCTTAAGCAGAAAGTCATGAACCACGTTAACAG  962

Query  954  TGGGTGCCAACTCATGCTATCGCAGCAGTTGCAAACATTT  993
            |||||||||||||||||||.||||||||||||||||.|||
Sbjct  963  TGGGTGCCAACTCATGCTAACGCAGCAGTTGCAAACGTTT  1002