Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_14686
- Subject:
- NM_001145832.1
- Aligned Length:
- 2065
- Identities:
- 1826
- Gaps:
- 8
Alignment
Query 1 ATGGTGGAGAATGAGCGACTGAGGCAGGAGATGCGGCGCTGTGAGGCCGAGCTGCAAGAGCTGCGCACAAAGCC 74
||||||||||||||||..||||||||||||.||.||||||||||||.|||.|||||.|||||.||..| ||
Sbjct 1 ATGGTGGAGAATGAGCAGCTGAGGCAGGAGCTGAGGCGCTGTGAGGTCGAACTGCAGGAGCTTCGGGC----CC 70
Query 75 AGCAGGT----CCCTGCCCAGGTTGTGAGCACAGCCAGGAGAGCGCCCAGCTCCGTGACAAGCTGTCCCAGCTG 144
|||.||| ||||||...||.|||||||||||||||||||||..||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 71 AGCCGGTGGTGCCCTGCGAGGGCTGTGAGCACAGCCAGGAGAGCAGCCAGCTCCGTGACAAGCTGTCCCAGCTG 144
Query 145 CAGCTGGAGATGGCGGAAAGCAAAGGCATGCTGTCAGAGCTGAACCTAGAGGTGCAGCAGAAGACCGACCGGCT 218
|||.||||..||||.||.|.|||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.||.||||||||
Sbjct 145 CAGTTGGAAGTGGCTGAGAACAAAGGCATGCTGTCGGAACTGAACCTGGAGGTGCAGCAGAAAACGGACCGGCT 218
Query 219 GGCTGAGGTGGAGCTGCGACTCAAGGACTGCCTGGCTGAGAAGGCACAGGAGGAGGAGCGGCTTAGTCGGCGCC 292
|||.|||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||.|||||.||.|||||||
Sbjct 219 GGCAGAGGTAGAGCTGCGCCTCAAGGACTGTCTGGCTGAGAAAGCCCAGGAGGAGGAACGGCTCAGCCGGCGCC 292
Query 293 TGCGTGACAGCCACGAGACCATTGCCAGCCTGCGGGCCCAGTCCCCACCTGTCAAGTATGTCATCAAGACAGTG 366
|||||||||||||.|||||.||.|||||.|||.|||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 293 TGCGTGACAGCCATGAGACTATCGCCAGTCTGAGGGCCCAGTCCCCACCTGTTAAGTATGTCATCAAGACAGTG 366
Query 367 GAGGTGGAGTCGTCCAAGACCAAGCAGGCCCTCAGCGAGTCCCAGGCCCGGAACCAGCACCTGCAGGAGCAGGT 440
|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 367 GAGGTAGAGTCTTCCAAGACCAAGCAGGCCCTCAGCGAGTCCCAGACCCGGAACCAGCACCTGCAGGAGCAAGT 440
Query 441 GGCTATGCAGAGGCAGGTGCTGAAGGAGATGGAACAGCAGCTGCAGAGCTCACACCAGCTGACCGCGCGGCTCC 514
|||.||||||.||||||||||||||||||||||.||||||||.||||.|||.|||||||||||.|..|.|.|.|
Sbjct 441 GGCCATGCAGCGGCAGGTGCTGAAGGAGATGGAGCAGCAGCTACAGAACTCCCACCAGCTGACAGTCCAGTTGC 514
Query 515 GGGCGCAGATTGCCATGTACGAGTCAGAGCTGGAGCGGGCCCATGGGCAGATGCTGGAGGAGATGCAGTCCCTG 588
||||.||||||||||||||.|||.||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 515 GGGCTCAGATTGCCATGTATGAGGCAGAGCTGGAGCGGGCACACGGGCAGATGCTGGAGGAGATGCAGTCCTTG 588
Query 589 GAAGAGGACAAGAACCGGGCCATTGAGGAGGCCTTTGCCAGAGCCCAGGTGGAGATGAAGGCTGTGCACGAGAA 662
||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||..|.||||||||||||||||||||.||.||||||||
Sbjct 589 GAGGAGGATAAGAACCGGGCCATTGAGGAGGCCTTTGCACGGGCCCAGGTGGAGATGAAGGCAGTACACGAGAA 662
Query 663 TCTAGCAGGCGTCCGGACCAACTTGCTGACCTTGCAGCCGGCACTGCGGACCCTCACCAACGACTACAATGGGC 736
.||.|||||.|||.||||||||.|||||||..|||||||.||.|||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 663 CCTGGCAGGTGTCAGGACCAACCTGCTGACGCTGCAGCCTGCGCTGAGGACCCTCACCAACGACTACAATGGGC 736
Query 737 TCAAGCGGCAGGTGCGCGTCTTCCCACTGCTGCTGCAGGAGGCCCTCAGGAGTGTCAAGGCCGAGATAGGCCAG 810
||||||||||||||||.|.||||||..||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||.||||||
Sbjct 737 TCAAGCGGCAGGTGCGGGGCTTCCCCTTGCTGCTGCAGGAGGCTCTCAGGAGTGTCAAAGCTGAGATCGGCCAG 810
Query 811 GCCATCGAGGAGGTCAACAGCAACAACCAGGAGCTGCTGCGCAAGTACCGCCGCGAGCTGCAGCTGCGTAAGAA 884
||||||||||||||.||.||||||||||||||||||.||||||||||||||||.||.||.||||||||.|||||
Sbjct 811 GCCATCGAGGAGGTTAATAGCAACAACCAGGAGCTGTTGCGCAAGTACCGCCGGGAACTACAGCTGCGCAAGAA 884
Query 885 GTGCCACAATGAGCTCGTGCGGCTGAAAGGGAACATCCGAGTGATTGCTCGTGTCCGGCCAGTCACCAAAGAGG 958
.|||||.||.|||||.||.||||||||.||.||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.||||
Sbjct 885 ATGCCATAACGAGCTGGTCCGGCTGAAGGGAAACATCCGGGTGATTGCCCGAGTCCGGCCAGTCACCAAGGAGG 958
Query 959 ATGGGGAAGGACCTGAGGCCACCAATGCTGTGACTTTCGATGCCGACGACGACTCCATCATCCACCTGCTGCAC 1032
||||.||||||||.|||||.||||||||||||||.||.||..|.||.||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 959 ATGGAGAAGGACCCGAGGCAACCAATGCTGTGACCTTTGACCCTGATGATGACTCCATCATCCACCTGCTGCAC 1032
Query 1033 AAGGGCAAGCCTGTGTCCTTCGAGCTGGACAAGGTCTTCTCCCCACAGGCCTCGCAGCAGGACGTGTTCCAGGA 1106
|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||...|||.||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1033 AAGGGCAAGCCCGTGTCCTTCGAGCTGGACAAGGTCTTCTCCCCGTGGGCTTCCCAGCAGGACGTGTTCCAGGA 1106
Query 1107 GGTGCAGGCCCTGGTCACCTCTTGCATTGATGGCTTCAATGTCTGCATCTTTGCGTACGGCCAGACGGGCGCCG 1180
||||||||||||..|.|||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||.||||
Sbjct 1107 GGTGCAGGCCCTCATTACCTCCTGCATCGATGGCTTCAATGTCTGTATCTTTGCTTACGGCCAGACAGGTGCCG 1180
Query 1181 GCAAGACGTACACGATGGAGGGGACCGCTGAGAACCCAGGTATCAACCAGCGGGCCCTGCAGCTGCTCTTCTCC 1254
|||||||.||.||.|||||||||||..|.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1181 GCAAGACATATACAATGGAGGGGACTCCCGAGAACCCGGGCATCAACCAGCGGGCCCTGCAGCTGCTCTTCTCG 1254
Query 1255 GAGGTGCAGGAGAAGGCGTCTGACTGGGAGTACACCATCACCGTCAGCGCTGCGGAGATCTACAATGAGGTCCT 1328
|||||||||||||||||||||||||||.||||||.|||||||||||||||.||.|||||.||||||||.|||||
Sbjct 1255 GAGGTGCAGGAGAAGGCGTCTGACTGGCAGTACAACATCACCGTCAGCGCAGCTGAGATTTACAATGAAGTCCT 1328
Query 1329 CAGGGACCTGCTAGGGAAAGAGCCTCAGGAAAAACTGGAGATCCGGCTGTGCCCAGACGGCAGTGGGCAGCTGT 1402
||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||.||.|||||||||||.||||
Sbjct 1329 CAGGGACCTGCTGGGGAAAGAGCCTCAGGAGAAGCTGGAGATCCGACTGTGCCCGGATGGCAGTGGGCAACTGT 1402
Query 1403 ATGTACCAGGGCTGACTGAGTTCCAAGTGCAGAGCGTGGACGACATCAACAAGGTGTTTGAGTTTGGCCACACT 1476
||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.|||..
Sbjct 1403 ATGTGCCAGGGCTGACTGAGTTCCAGGTGCAGAGCGTGGATGACATCAACAAGGTGTTTGAGTTTGGCTACAAC 1476
Query 1477 AATCGCACGACCGAGTTCACCAACCTGAACGAGCACAGCTCCCGCTCGCACGCACTGCTCATCGTGACGGTGCG 1550
||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||.|
Sbjct 1477 AACCGCACCACCGAGTTCACCAACCTGAACGAACACAGCTCCCGCTCCCACGCTCTGCTCATCGTGACAGTGAG 1550
Query 1551 AGGCGTGGACTGCAGCACAGGCCTCCGCACCACGGGGAAGCTGAACCTGGTGGACTTGGCTGGCTCGGAGCGCG 1624
|||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.||.|||||.|
Sbjct 1551 AGGTGTGGATTGCAGCACAGGCCTCCGCACCACGGGGAAGCTGAACCTGGTGGACCTGGCTGGTTCAGAGCGTG 1624
Query 1625 TGGGCAAGTCGGGGGCCGAGGGCAGCCGCCTGCGGGAGGCGCAGCACATCAACAAGTCGCTGTCGGCTCTGGGG 1698
||||||||||||||||.|||||||.|||||||||.|||||.|||||||||||||.|||.||.||.||.||||||
Sbjct 1625 TGGGCAAGTCGGGGGCTGAGGGCAACCGCCTGCGAGAGGCACAGCACATCAACAGGTCACTATCCGCCCTGGGG 1698
Query 1699 GACGTCATTGCTGCCCTGCGCTCCCGCCAGGGCCACGTGCCCTTCCGCAACTCCAAGCTCACCTACCTGCTGCA 1772
||||||||||||||||||||.||.||.||.|||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1699 GACGTCATTGCTGCCCTGCGTTCTCGACAAGGCCATGTGCCCTTCCGCAATTCCAAACTCACCTACCTGCTGCA 1772
Query 1773 GGATTCGCTTAGTGGTGACAGCAAGACCCTCATGGTGGTACAGGTGTCCCCCGTGGAGAAGAACACTAGCGAGA 1846
|||.||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1773 GGACTCACTCAGTGGTGACAGCAAGACCCTTATGGTGGTACAGGTGTCCCCAGTGGAGAAGAACACCAGCGAGA 1846
Query 1847 CGCTCTATTCCCTCAAGTTTGCTGAGAGGGTGCGCTCTGTGGAGCTGGGGCCTGGGCTACGCAGGGCAGAGCTT 1920
|.||.||.|||||||..||||||||||||||.||||||||||||.||||.||||||...|||.|..|||||||.
Sbjct 1847 CTCTGTACTCCCTCAGATTTGCTGAGAGGGTTCGCTCTGTGGAGTTGGGCCCTGGGTCCCGCCGCACAGAGCTG 1920
Query 1921 GGGTCCTGGTCAAGCCAGGAGCATCTAGAGTGGGAGCCGGCTTGTCAGACGCCACAGCCCTCGGCCTGGGCCCA 1994
||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||..|.||..|.|||||
Sbjct 1921 GGTTCCTGGTCAAGCCAGGAGCACCTGGAGTGGGAGCCGGCTTGCCAGACACCACAGCCTACAGCACGAGCCCA 1994
Query 1995 CTCAGCCCCCAGCTCTGGGACCAGTAGCCGCCCTGGATCCATCCGGAGGAAGCTGCAGCCCTCGGCC 2061
|||.|||||..||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.||||||||.||.|||
Sbjct 1995 CTCTGCCCCTGGCTCTGGGACCAGTAGCCGCCCAGGTTCCATCCGAAGGAAACTGCAGCCGTCAGCC 2061