Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_14686
- Subject:
- XM_006530724.3
- Aligned Length:
- 2389
- Identities:
- 1827
- Gaps:
- 332
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGAATGTAGAAAATACAGGTGGGCGGCTCTTTGGCATCGGGAGGTGCTCAAGCCTGTCCGGGGCACCAGGCCC 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 AGACCCCGTGGTACATAGGACCGTGGAGGCCATGTCCCAGCTTCAGGAGGAGCTGGTAGTCCTTCGGGAGAGGC 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 TGGCCCTCCACGACAGTGACCGGCAAGCCACAACCACCCAGCTGCAGAACCAGGTGGAGAATCTAAAGGAAAAG 222
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 223 CTCATTAGCCAGGCCCAGGAAGTGAGCCGACTGCGATCAGAACTGGGAGGCACGGACGCGGAGAAGCACAGGGA 296
Query 1 -------ATGGTGGAGAATGAGCGACTGAGGCAGGAGATGCGGCGCTGTGAGGCCGAGCTGCAAGAGCTGCGCA 67
||||||||||||||||..||||||||||||.||.||||||||||||.|||.|||||.|||||.||..
Sbjct 297 CAGACTGATGGTGGAGAATGAGCAGCTGAGGCAGGAGCTGAGGCGCTGTGAGGTCGAACTGCAGGAGCTTCGGG 370
Query 68 CAAAGCCAGCAGGT----CCCTGCCCAGGTTGTGAGCACAGCCAGGAGAGCGCCCAGCTCCGTGACAAGCTGTC 137
| |||||.||| ||||||...||.|||||||||||||||||||||..|||||||||||||||||||||
Sbjct 371 C----CCAGCCGGTGGTGCCCTGCGAGGGCTGTGAGCACAGCCAGGAGAGCAGCCAGCTCCGTGACAAGCTGTC 440
Query 138 CCAGCTGCAGCTGGAGATGGCGGAAAGCAAAGGCATGCTGTCAGAGCTGAACCTAGAGGTGCAGCAGAAGACCG 211
||||||||||.||||..||||.||.|.|||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.||.|
Sbjct 441 CCAGCTGCAGTTGGAAGTGGCTGAGAACAAAGGCATGCTGTCGGAACTGAACCTGGAGGTGCAGCAGAAAACGG 514
Query 212 ACCGGCTGGCTGAGGTGGAGCTGCGACTCAAGGACTGCCTGGCTGAGAAGGCACAGGAGGAGGAGCGGCTTAGT 285
||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||.|||||.||.
Sbjct 515 ACCGGCTGGCAGAGGTAGAGCTGCGCCTCAAGGACTGTCTGGCTGAGAAAGCCCAGGAGGAGGAACGGCTCAGC 588
Query 286 CGGCGCCTGCGTGACAGCCACGAGACCATTGCCAGCCTGCGGGCCCAGTCCCCACCTGTCAAGTATGTCATCAA 359
||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||.|||.|||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 589 CGGCGCCTGCGTGACAGCCATGAGACTATCGCCAGTCTGAGGGCCCAGTCCCCACCTGTTAAGTATGTCATCAA 662
Query 360 GACAGTGGAGGTGGAGTCGTCCAAGACCAAGCAGGCCCTCAGCGAGTCCCAGGCCCGGAACCAGCACCTGCAGG 433
||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 663 GACAGTGGAGGTAGAGTCTTCCAAGACCAAGCAGGCCCTCAGCGAGTCCCAGACCCGGAACCAGCACCTGCAGG 736
Query 434 AGCAGGTGGCTATGCAGAGGCAGGTGCTGAAGGAGATGGAACAGCAGCTGCAGAGCTCACACCAGCTGACCGCG 507
||||.|||||.||||||.||||||||||||||||||||||.||||||||.||||.|||.|||||||||||.|..
Sbjct 737 AGCAAGTGGCCATGCAGCGGCAGGTGCTGAAGGAGATGGAGCAGCAGCTACAGAACTCCCACCAGCTGACAGTC 810
Query 508 CGGCTCCGGGCGCAGATTGCCATGTACGAGTCAGAGCTGGAGCGGGCCCATGGGCAGATGCTGGAGGAGATGCA 581
|.|.|.|||||.||||||||||||||.|||.||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 811 CAGTTGCGGGCTCAGATTGCCATGTATGAGGCAGAGCTGGAGCGGGCACACGGGCAGATGCTGGAGGAGATGCA 884
Query 582 GTCCCTGGAAGAGGACAAGAACCGGGCCATTGAGGAGGCCTTTGCCAGAGCCCAGGTGGAGATGAAGGCTGTGC 655
||||.||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||..|.||||||||||||||||||||.||.|
Sbjct 885 GTCCTTGGAGGAGGATAAGAACCGGGCCATTGAGGAGGCCTTTGCACGGGCCCAGGTGGAGATGAAGGCAGTAC 958
Query 656 ACGAGAATCTAGCAGGCGTCCGGACCAACTTGCTGACCTTGCAGCCGGCACTGCGGACCCTCACCAACGACTAC 729
|||||||.||.|||||.|||.||||||||.|||||||..|||||||.||.|||.||||||||||||||||||||
Sbjct 959 ACGAGAACCTGGCAGGTGTCAGGACCAACCTGCTGACGCTGCAGCCTGCGCTGAGGACCCTCACCAACGACTAC 1032
Query 730 AATGGGCTCAAGCGGCAGGTGCGCGTCTTCCCACTGCTGCTGCAGGAGGCCCTCAGGAGTGTCAAGGCCGAGAT 803
|||||||||||||||||||||||.|.||||||..||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||
Sbjct 1033 AATGGGCTCAAGCGGCAGGTGCGGGGCTTCCCCTTGCTGCTGCAGGAGGCTCTCAGGAGTGTCAAAGCTGAGAT 1106
Query 804 AGGCCAGGCCATCGAGGAGGTCAACAGCAACAACCAGGAGCTGCTGCGCAAGTACCGCCGCGAGCTGCAGCTGC 877
.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||.||||||||||||||||.||.||.|||||||
Sbjct 1107 CGGCCAGGCCATCGAGGAGGTTAATAGCAACAACCAGGAGCTGTTGCGCAAGTACCGCCGGGAACTACAGCTGC 1180
Query 878 GTAAGAAGTGCCACAATGAGCTCGTGCGGCTGAAAGGGAACATCCGAGTGATTGCTCGTGTCCGGCCAGTCACC 951
|.|||||.|||||.||.|||||.||.||||||||.||.||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||
Sbjct 1181 GCAAGAAATGCCATAACGAGCTGGTCCGGCTGAAGGGAAACATCCGGGTGATTGCCCGAGTCCGGCCAGTCACC 1254
Query 952 AAAGAGGATGGGGAAGGACCTGAGGCCACCAATGCTGTGACTTTCGATGCCGACGACGACTCCATCATCCACCT 1025
||.||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||.||.||..|.||.||.|||||||||||||||||
Sbjct 1255 AAGGAGGATGGAGAAGGACCCGAGGCAACCAATGCTGTGACCTTTGACCCTGATGATGACTCCATCATCCACCT 1328
Query 1026 GCTGCACAAGGGCAAGCCTGTGTCCTTCGAGCTGGACAAGGTCTTCTCCCCACAGGCCTCGCAGCAGGACGTGT 1099
||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||...|||.||.|||||||||||||
Sbjct 1329 GCTGCACAAGGGCAAGCCCGTGTCCTTCGAGCTGGACAAGGTCTTCTCCCCGTGGGCTTCCCAGCAGGACGTGT 1402
Query 1100 TCCAGGAGGTGCAGGCCCTGGTCACCTCTTGCATTGATGGCTTCAATGTCTGCATCTTTGCGTACGGCCAGACG 1173
|||||||||||||||||||..|.|||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.
Sbjct 1403 TCCAGGAGGTGCAGGCCCTCATTACCTCCTGCATCGATGGCTTCAATGTCTGTATCTTTGCTTACGGCCAGACA 1476
Query 1174 GGCGCCGGCAAGACGTACACGATGGAGGGGACCGCTGAGAACCCAGGTATCAACCAGCGGGCCCTGCAGCTGCT 1247
||.|||||||||||.||.||.|||||||||||..|.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1477 GGTGCCGGCAAGACATATACAATGGAGGGGACTCCCGAGAACCCGGGCATCAACCAGCGGGCCCTGCAGCTGCT 1550
Query 1248 CTTCTCCGAGGTGCAGGAGAAGGCGTCTGACTGGGAGTACACCATCACCGTCAGCGCTGCGGAGATCTACAATG 1321
||||||.|||||||||||||||||||||||||||.||||||.|||||||||||||||.||.|||||.|||||||
Sbjct 1551 CTTCTCGGAGGTGCAGGAGAAGGCGTCTGACTGGCAGTACAACATCACCGTCAGCGCAGCTGAGATTTACAATG 1624
Query 1322 AGGTCCTCAGGGACCTGCTAGGGAAAGAGCCTCAGGAAAAACTGGAGATCCGGCTGTGCCCAGACGGCAGTGGG 1395
|.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||.||.|||||||||
Sbjct 1625 AAGTCCTCAGGGACCTGCTGGGGAAAGAGCCTCAGGAGAAGCTGGAGATCCGACTGTGCCCGGATGGCAGTGGG 1698
Query 1396 CAGCTGTATGTACCAGGGCTGACTGAGTTCCAAGTGCAGAGCGTGGACGACATCAACAAGGTGTTTGAGTTTGG 1469
||.||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1699 CAACTGTATGTGCCAGGGCTGACTGAGTTCCAGGTGCAGAGCGTGGATGACATCAACAAGGTGTTTGAGTTTGG 1772
Query 1470 CCACACTAATCGCACGACCGAGTTCACCAACCTGAACGAGCACAGCTCCCGCTCGCACGCACTGCTCATCGTGA 1543
|.|||..||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||||
Sbjct 1773 CTACAACAACCGCACCACCGAGTTCACCAACCTGAACGAACACAGCTCCCGCTCCCACGCTCTGCTCATCGTGA 1846
Query 1544 CGGTGCGAGGCGTGGACTGCAGCACAGGCCTCCGCACCACGGGGAAGCTGAACCTGGTGGACTTGGCTGGCTCG 1617
|.|||.||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.||.
Sbjct 1847 CAGTGAGAGGTGTGGATTGCAGCACAGGCCTCCGCACCACGGGGAAGCTGAACCTGGTGGACCTGGCTGGTTCA 1920
Query 1618 GAGCGCGTGGGCAAGTCGGGGGCCGAGGGCAGCCGCCTGCGGGAGGCGCAGCACATCAACAAGTCGCTGTCGGC 1691
|||||.|||||||||||||||||.|||||||.|||||||||.|||||.|||||||||||||.|||.||.||.||
Sbjct 1921 GAGCGTGTGGGCAAGTCGGGGGCTGAGGGCAACCGCCTGCGAGAGGCACAGCACATCAACAGGTCACTATCCGC 1994
Query 1692 TCTGGGGGACGTCATTGCTGCCCTGCGCTCCCGCCAGGGCCACGTGCCCTTCCGCAACTCCAAGCTCACCTACC 1765
.||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.|||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||
Sbjct 1995 CCTGGGGGACGTCATTGCTGCCCTGCGTTCTCGACAAGGCCATGTGCCCTTCCGCAATTCCAAACTCACCTACC 2068
Query 1766 TGCTGCAGGATTCGCTTAGTGGTGACAGCAAGACCCTCATGGTGGTACAGGTGTCCCCCGTGGAGAAGAACACT 1839
||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.
Sbjct 2069 TGCTGCAGGACTCACTCAGTGGTGACAGCAAGACCCTTATGGTGGTACAGGTGTCCCCAGTGGAGAAGAACACC 2142
Query 1840 AGCGAGACGCTCTATTCCCTCAAGTTTGCTGAGAGGGTGCGCTCTGTGGAGCTGGGGCCTGGGCTACGCAGGGC 1913
||||||||.||.||.|||||||..||||||||||||||.||||||||||||.||||.||||||...|||.|..|
Sbjct 2143 AGCGAGACTCTGTACTCCCTCAGATTTGCTGAGAGGGTTCGCTCTGTGGAGTTGGGCCCTGGGTCCCGCCGCAC 2216
Query 1914 AGAGCTTGGGTCCTGGTCAAGCCAGGAGCATCTAGAGTGGGAGCCGGCTTGTCAGACGCCACAGCCCTCGGCCT 1987
||||||.||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||..|.||..
Sbjct 2217 AGAGCTGGGTTCCTGGTCAAGCCAGGAGCACCTGGAGTGGGAGCCGGCTTGCCAGACACCACAGCCTACAGCAC 2290
Query 1988 GGGCCCACTCAGCCCCCAGCTCTGGGACCAGTAGCCGCCCTGGATCCATCCGGAGGAAGCTGCAGCCCTC---- 2057
|.||||||||.|||||..||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.||||||||.||
Sbjct 2291 GAGCCCACTCTGCCCCTGGCTCTGGGACCAGTAGCCGCCCAGGTTCCATCCGAAGGAAACTGCAGCCGTCAGGG 2364
Query 2058 -------GGCC---------- 2061
||||
Sbjct 2365 AAGTTGAGGCCAGTGCCTGTG 2385