Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_14686
• Subject: XM_006530726.3
• Aligned Length: 2284
• Identities: 1827
• Gaps: 227

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGTCCCAGCTTCAGGAGGAGCTGGTAGTCCTTCGGGAGAGGCTGGCCCTCCACGACAGTGACCGGCAAGCCAC  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  AACCACCCAGCTGCAGAACCAGGTGGAGAATCTAAAGGAAAAGCTCATTAGCCAGGCCCAGGAAGTGAGCCGAC  148

Query    1  --------------------------------------------------ATGGTGGAGAATGAGCGACTGAGG  24
                                                              ||||||||||||||||..||||||
Sbjct  149  TGCGATCAGAACTGGGAGGCACGGACGCGGAGAAGCACAGGGACAGACTGATGGTGGAGAATGAGCAGCTGAGG  222

Query   25  CAGGAGATGCGGCGCTGTGAGGCCGAGCTGCAAGAGCTGCGCACAAAGCCAGCAGGT----CCCTGCCCAGGTT  94
            ||||||.||.||||||||||||.|||.|||||.|||||.||..|    |||||.|||    ||||||...||.|
Sbjct  223  CAGGAGCTGAGGCGCTGTGAGGTCGAACTGCAGGAGCTTCGGGC----CCAGCCGGTGGTGCCCTGCGAGGGCT  292

Query   95  GTGAGCACAGCCAGGAGAGCGCCCAGCTCCGTGACAAGCTGTCCCAGCTGCAGCTGGAGATGGCGGAAAGCAAA  168
            ||||||||||||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||.||||..||||.||.|.||||
Sbjct  293  GTGAGCACAGCCAGGAGAGCAGCCAGCTCCGTGACAAGCTGTCCCAGCTGCAGTTGGAAGTGGCTGAGAACAAA  366

Query  169  GGCATGCTGTCAGAGCTGAACCTAGAGGTGCAGCAGAAGACCGACCGGCTGGCTGAGGTGGAGCTGCGACTCAA  242
            |||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||.||||||||.|||||
Sbjct  367  GGCATGCTGTCGGAACTGAACCTGGAGGTGCAGCAGAAAACGGACCGGCTGGCAGAGGTAGAGCTGCGCCTCAA  440

Query  243  GGACTGCCTGGCTGAGAAGGCACAGGAGGAGGAGCGGCTTAGTCGGCGCCTGCGTGACAGCCACGAGACCATTG  316
            ||||||.|||||||||||.||.|||||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||.|||||.||.|
Sbjct  441  GGACTGTCTGGCTGAGAAAGCCCAGGAGGAGGAACGGCTCAGCCGGCGCCTGCGTGACAGCCATGAGACTATCG  514

Query  317  CCAGCCTGCGGGCCCAGTCCCCACCTGTCAAGTATGTCATCAAGACAGTGGAGGTGGAGTCGTCCAAGACCAAG  390
            ||||.|||.|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||
Sbjct  515  CCAGTCTGAGGGCCCAGTCCCCACCTGTTAAGTATGTCATCAAGACAGTGGAGGTAGAGTCTTCCAAGACCAAG  588

Query  391  CAGGCCCTCAGCGAGTCCCAGGCCCGGAACCAGCACCTGCAGGAGCAGGTGGCTATGCAGAGGCAGGTGCTGAA  464
            |||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||.|||||||||||||
Sbjct  589  CAGGCCCTCAGCGAGTCCCAGACCCGGAACCAGCACCTGCAGGAGCAAGTGGCCATGCAGCGGCAGGTGCTGAA  662

Query  465  GGAGATGGAACAGCAGCTGCAGAGCTCACACCAGCTGACCGCGCGGCTCCGGGCGCAGATTGCCATGTACGAGT  538
            |||||||||.||||||||.||||.|||.|||||||||||.|..|.|.|.|||||.||||||||||||||.|||.
Sbjct  663  GGAGATGGAGCAGCAGCTACAGAACTCCCACCAGCTGACAGTCCAGTTGCGGGCTCAGATTGCCATGTATGAGG  736

Query  539  CAGAGCTGGAGCGGGCCCATGGGCAGATGCTGGAGGAGATGCAGTCCCTGGAAGAGGACAAGAACCGGGCCATT  612
            ||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||.||||.|||||.|||||||||||||||
Sbjct  737  CAGAGCTGGAGCGGGCACACGGGCAGATGCTGGAGGAGATGCAGTCCTTGGAGGAGGATAAGAACCGGGCCATT  810

Query  613  GAGGAGGCCTTTGCCAGAGCCCAGGTGGAGATGAAGGCTGTGCACGAGAATCTAGCAGGCGTCCGGACCAACTT  686
            ||||||||||||||..|.||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.|||||.|||.||||||||.|
Sbjct  811  GAGGAGGCCTTTGCACGGGCCCAGGTGGAGATGAAGGCAGTACACGAGAACCTGGCAGGTGTCAGGACCAACCT  884

Query  687  GCTGACCTTGCAGCCGGCACTGCGGACCCTCACCAACGACTACAATGGGCTCAAGCGGCAGGTGCGCGTCTTCC  760
            ||||||..|||||||.||.|||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||
Sbjct  885  GCTGACGCTGCAGCCTGCGCTGAGGACCCTCACCAACGACTACAATGGGCTCAAGCGGCAGGTGCGGGGCTTCC  958

Query  761  CACTGCTGCTGCAGGAGGCCCTCAGGAGTGTCAAGGCCGAGATAGGCCAGGCCATCGAGGAGGTCAACAGCAAC  834
            |..||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||.||.||||||
Sbjct  959  CCTTGCTGCTGCAGGAGGCTCTCAGGAGTGTCAAAGCTGAGATCGGCCAGGCCATCGAGGAGGTTAATAGCAAC  1032

Query  835  AACCAGGAGCTGCTGCGCAAGTACCGCCGCGAGCTGCAGCTGCGTAAGAAGTGCCACAATGAGCTCGTGCGGCT  908
            ||||||||||||.||||||||||||||||.||.||.||||||||.|||||.|||||.||.|||||.||.|||||
Sbjct 1033  AACCAGGAGCTGTTGCGCAAGTACCGCCGGGAACTACAGCTGCGCAAGAAATGCCATAACGAGCTGGTCCGGCT  1106

Query  909  GAAAGGGAACATCCGAGTGATTGCTCGTGTCCGGCCAGTCACCAAAGAGGATGGGGAAGGACCTGAGGCCACCA  982
            |||.||.||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||.||||
Sbjct 1107  GAAGGGAAACATCCGGGTGATTGCCCGAGTCCGGCCAGTCACCAAGGAGGATGGAGAAGGACCCGAGGCAACCA  1180

Query  983  ATGCTGTGACTTTCGATGCCGACGACGACTCCATCATCCACCTGCTGCACAAGGGCAAGCCTGTGTCCTTCGAG  1056
            ||||||||||.||.||..|.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1181  ATGCTGTGACCTTTGACCCTGATGATGACTCCATCATCCACCTGCTGCACAAGGGCAAGCCCGTGTCCTTCGAG  1254

Query 1057  CTGGACAAGGTCTTCTCCCCACAGGCCTCGCAGCAGGACGTGTTCCAGGAGGTGCAGGCCCTGGTCACCTCTTG  1130
            ||||||||||||||||||||...|||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||..|.|||||.||
Sbjct 1255  CTGGACAAGGTCTTCTCCCCGTGGGCTTCCCAGCAGGACGTGTTCCAGGAGGTGCAGGCCCTCATTACCTCCTG  1328

Query 1131  CATTGATGGCTTCAATGTCTGCATCTTTGCGTACGGCCAGACGGGCGCCGGCAAGACGTACACGATGGAGGGGA  1204
            |||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||.||.||.||||||||||
Sbjct 1329  CATCGATGGCTTCAATGTCTGTATCTTTGCTTACGGCCAGACAGGTGCCGGCAAGACATATACAATGGAGGGGA  1402

Query 1205  CCGCTGAGAACCCAGGTATCAACCAGCGGGCCCTGCAGCTGCTCTTCTCCGAGGTGCAGGAGAAGGCGTCTGAC  1278
            |..|.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1403  CTCCCGAGAACCCGGGCATCAACCAGCGGGCCCTGCAGCTGCTCTTCTCGGAGGTGCAGGAGAAGGCGTCTGAC  1476

Query 1279  TGGGAGTACACCATCACCGTCAGCGCTGCGGAGATCTACAATGAGGTCCTCAGGGACCTGCTAGGGAAAGAGCC  1352
            |||.||||||.|||||||||||||||.||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1477  TGGCAGTACAACATCACCGTCAGCGCAGCTGAGATTTACAATGAAGTCCTCAGGGACCTGCTGGGGAAAGAGCC  1550

Query 1353  TCAGGAAAAACTGGAGATCCGGCTGTGCCCAGACGGCAGTGGGCAGCTGTATGTACCAGGGCTGACTGAGTTCC  1426
            ||||||.||.|||||||||||.||||||||.||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1551  TCAGGAGAAGCTGGAGATCCGACTGTGCCCGGATGGCAGTGGGCAACTGTATGTGCCAGGGCTGACTGAGTTCC  1624

Query 1427  AAGTGCAGAGCGTGGACGACATCAACAAGGTGTTTGAGTTTGGCCACACTAATCGCACGACCGAGTTCACCAAC  1500
            |.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.|||..||.|||||.|||||||||||||||
Sbjct 1625  AGGTGCAGAGCGTGGATGACATCAACAAGGTGTTTGAGTTTGGCTACAACAACCGCACCACCGAGTTCACCAAC  1698

Query 1501  CTGAACGAGCACAGCTCCCGCTCGCACGCACTGCTCATCGTGACGGTGCGAGGCGTGGACTGCAGCACAGGCCT  1574
            ||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||.||||.|||||.||||||||||||||
Sbjct 1699  CTGAACGAACACAGCTCCCGCTCCCACGCTCTGCTCATCGTGACAGTGAGAGGTGTGGATTGCAGCACAGGCCT  1772

Query 1575  CCGCACCACGGGGAAGCTGAACCTGGTGGACTTGGCTGGCTCGGAGCGCGTGGGCAAGTCGGGGGCCGAGGGCA  1648
            |||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1773  CCGCACCACGGGGAAGCTGAACCTGGTGGACCTGGCTGGTTCAGAGCGTGTGGGCAAGTCGGGGGCTGAGGGCA  1846

Query 1649  GCCGCCTGCGGGAGGCGCAGCACATCAACAAGTCGCTGTCGGCTCTGGGGGACGTCATTGCTGCCCTGCGCTCC  1722
            .|||||||||.|||||.|||||||||||||.|||.||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.
Sbjct 1847  ACCGCCTGCGAGAGGCACAGCACATCAACAGGTCACTATCCGCCCTGGGGGACGTCATTGCTGCCCTGCGTTCT  1920

Query 1723  CGCCAGGGCCACGTGCCCTTCCGCAACTCCAAGCTCACCTACCTGCTGCAGGATTCGCTTAGTGGTGACAGCAA  1796
            ||.||.|||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||
Sbjct 1921  CGACAAGGCCATGTGCCCTTCCGCAATTCCAAACTCACCTACCTGCTGCAGGACTCACTCAGTGGTGACAGCAA  1994

Query 1797  GACCCTCATGGTGGTACAGGTGTCCCCCGTGGAGAAGAACACTAGCGAGACGCTCTATTCCCTCAAGTTTGCTG  1870
            ||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||.||.|||||||..|||||||
Sbjct 1995  GACCCTTATGGTGGTACAGGTGTCCCCAGTGGAGAAGAACACCAGCGAGACTCTGTACTCCCTCAGATTTGCTG  2068

Query 1871  AGAGGGTGCGCTCTGTGGAGCTGGGGCCTGGGCTACGCAGGGCAGAGCTTGGGTCCTGGTCAAGCCAGGAGCAT  1944
            |||||||.||||||||||||.||||.||||||...|||.|..|||||||.||.||||||||||||||||||||.
Sbjct 2069  AGAGGGTTCGCTCTGTGGAGTTGGGCCCTGGGTCCCGCCGCACAGAGCTGGGTTCCTGGTCAAGCCAGGAGCAC  2142

Query 1945  CTAGAGTGGGAGCCGGCTTGTCAGACGCCACAGCCCTCGGCCTGGGCCCACTCAGCCCCCAGCTCTGGGACCAG  2018
            ||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||..|.||..|.||||||||.|||||..|||||||||||||
Sbjct 2143  CTGGAGTGGGAGCCGGCTTGCCAGACACCACAGCCTACAGCACGAGCCCACTCTGCCCCTGGCTCTGGGACCAG  2216

Query 2019  TAGCCGCCCTGGATCCATCCGGAGGAAGCTGCAGCCCTC-----------GGCC----------  2061
            |||||||||.||.||||||||.|||||.||||||||.||           ||||          
Sbjct 2217  TAGCCGCCCAGGTTCCATCCGAAGGAAACTGCAGCCGTCAGGGAAGTTGAGGCCAGTGCCTGTG  2280