Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_14689
• Subject: NM_002314.4
• Aligned Length: 1943
• Identities: 1935
• Gaps: 7

Alignment

Query    1  ATGAGGTTGACGCTACTTTGTTGCACCTGGAGGGAAGAACGTATGGGAGAGGAAGGAAGCGAGTTGCCCGTGTG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAGGTTGACGCTACTTTGTTGCACCTGGAGGGAAGAACGTATGGGAGAGGAAGGAAGCGAGTTGCCCGTGTG  74

Query   75  TGCAAGCTGCGGCCAGAGGATCTATGATGGCCAGTACCTCCAGGCCCTGAACGCGGACTGGCACGCAGACTGCT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TGCAAGCTGCGGCCAGAGGATCTATGATGGCCAGTACCTCCAGGCCCTGAACGCGGACTGGCACGCAGACTGCT  148

Query  149  TCAGGTGTTGTGACTGCAGTGCCTCCCTGTCGCACCAGTACTATGAGAAGGATGGGCAGCTCTTCTGCAAGAAG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TCAGGTGTTGTGACTGCAGTGCCTCCCTGTCGCACCAGTACTATGAGAAGGATGGGCAGCTCTTCTGCAAGAAG  222

Query  223  GACTACTGGGCCCGCTATGGCGAGTCCTGCCATGGGTGCTCTGAGCAAATCACCAAGGGACTGGTTATGGTGGC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GACTACTGGGCCCGCTATGGCGAGTCCTGCCATGGGTGCTCTGAGCAAATCACCAAGGGACTGGTTATGGTGGC  296

Query  297  TGGGGAGCTGAAGTACCACCCCGAGTGTTTCATCTGCCTCACGTGTGGGACCTTTATCGGTGACGGGGACACCT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGGGGAGCTGAAGTACCACCCCGAGTGTTTCATCTGCCTCACGTGTGGGACCTTTATCGGTGACGGGGACACCT  370

Query  371  ACACGCTGGTGGAGCACTCCAAGCTGTACTGCGGGCACTGCTACTACCAGACTGTGGTGACCCCCGTCATCGAG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ACACGCTGGTGGAGCACTCCAAGCTGTACTGCGGGCACTGCTACTACCAGACTGTGGTGACCCCCGTCATCGAG  444

Query  445  CAGATCCTGCCTGACTCCCCTGGCTCCCACCTGCCCCACACCGTCACCCTGGTGTCCATCCCAGCCTCATCTCA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CAGATCCTGCCTGACTCCCCTGGCTCCCACCTGCCCCACACCGTCACCCTGGTGTCCATCCCAGCCTCATCTCA  518

Query  519  TGGCAAGCGTGGACTTTCAGTCTCCATTGACCCCCCGCACGGCCCACCGGGCTGTGGCACCGAGCACTCACACA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TGGCAAGCGTGGACTTTCAGTCTCCATTGACCCCCCGCACGGCCCACCGGGCTGTGGCACCGAGCACTCACACA  592

Query  593  CCGTCCGCGTCCAGGGAGTGGATCCCGGGCTGCATGAGCCCAGATGTGAAGAATTCCATCCACGTCGGAGACCG  666
            ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CCGTCCGCGTCCAGGGAGTGGAT-CCGGGCTGCATGAGCCCAGATGTGAAGAATTCCATCCACGTCGGAGACCG  665

Query  667  GATCTTGGAAATCAATGGCACGCCCATCCGAAATGTGCCCCTGGACGAGATTGACCTGCTGATTCAGGAAACCA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  666  GATCTTGGAAATCAATGGCACGCCCATCCGAAATGTGCCCCTGGACGAGATTGACCTGCTGATTCAGGAAACCA  739

Query  741  GCCGCCTGCTCCAGCTGACCCTCGAGCATGACCCTCACGATACACTGGGCCACGGGCTGGGGCCTGAGACCAGC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  740  GCCGCCTGCTCCAGCTGACCCTCGAGCATGACCCTCACGATACACTGGGCCACGGGCTGGGGCCTGAGACCAGC  813

Query  815  CCCCTGAGCTCTCCGGCTTATACTCCCAGCGGGGAGGCGGGCAGCTCTGCCCGGCAGAAACCTGTCTTGAGGAG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  814  CCCCTGAGCTCTCCGGCTTATACTCCCAGCGGGGAGGCGGGCAGCTCTGCCCGGCAGAAACCTGTCTTGAGGAG  887

Query  889  CTGCAGCATCGACAGGTCTCCGGGCGCTGGCTCACTGGGCTCCCCGGCCTCCCAGCGCAAGGACCTGGGTCGCT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  888  CTGCAGCATCGACAGGTCTCCGGGCGCTGGCTCACTGGGCTCCCCGGCCTCCCAGCGCAAGGACCTGGGTCGCT  961

Query  963  CTGAGTCCCTCCGCGTAGTCTGCCGGCCACACCGCATCTTCCGGCCGTCGGACCTCATCCACGGGGAGGTGCTG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  962  CTGAGTCCCTCCGCGTAGTCTGCCGGCCACACCGCATCTTCCGGCCGTCGGACCTCATCCACGGGGAGGTGCTG  1035

Query 1037  GGCAAGGGCTGCTTCGGCCAGGCTATCAAGGTGACACACCGTGAGACAGGTGAGGTGATGGTGATGAAGGAGCT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1036  GGCAAGGGCTGCTTCGGCCAGGCTATCAAGGTGACACACCGTGAGACAGGTGAGGTGATGGTGATGAAGGAGCT  1109

Query 1111  GATCCGGTTCGACGAGGAGACCCAGAGGACGTTCCTCAAGGAGGTGAAGGTCATGCGATGCCTGGAACACCCCA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1110  GATCCGGTTCGACGAGGAGACCCAGAGGACGTTCCTCAAGGAGGTGAAGGTCATGCGATGCCTGGAACACCCCA  1183

Query 1185  ACGTGCTCAAGTTCATCGGGGTGCTCTAC-AGGAC-AGA-GCTCA--CTCATCACTGAGTACATCAAAGGGCGG  1253
            ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||  .||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1184  ACGTGCTCAAGTTCATCGGGGTGCTCTACAAGGACAAGAGGCTCAACTTCATCACTGAGTACATC-AAGGGCGG  1256

Query 1254  CACGCTCCGGGGCATCATCAAGAGCATGGACAGCCAGTACCCATGGAGCCAGAGAGTGAGCTTTGCCAAGGACA  1327
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1257  CACGCTCCGGGGCATCATCAAGAGCATGGACAGCCAGTACCCATGGAGCCAGAGAGTGAGCTTTGCCAAGGACA  1330

Query 1328  TCGCATCAGGGATGGCCTACCTCCACTCCATGAACATCATCCACCGAGACCTCAACTCCCACAACTGCCTGGTC  1401
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1331  TCGCATCAGGGATGGCCTACCTCCACTCCATGAACATCATCCACCGAGACCTCAACTCCCACAACTGCCTGGTC  1404

Query 1402  CGCGAGAACAAGAATGTGGTGGTGGCTGACTTCGGGCTGGCGCGTCTCATGGTGGACGAGAAGACTCAGCCTGA  1475
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1405  CGCGAGAACAAGAATGTGGTGGTGGCTGACTTCGGGCTGGCGCGTCTCATGGTGGACGAGAAGACTCAGCCTGA  1478

Query 1476  GGGCCTGCGGAGCCTCAAGAAGCCAGACCGCAAGAAGCGCTACACCGTGGTGGGCAACCCCTACTGGATGGCAC  1549
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1479  GGGCCTGCGGAGCCTCAAGAAGCCAGACCGCAAGAAGCGCTACACCGTGGTGGGCAACCCCTACTGGATGGCAC  1552

Query 1550  CTGAGATGATCAACGGCCGCAGCTATGATGAGAAGGTGGATGTGTTCTCCTTTGGGATCGTCCTGTGCGAGATC  1623
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1553  CTGAGATGATCAACGGCCGCAGCTATGATGAGAAGGTGGATGTGTTCTCCTTTGGGATCGTCCTGTGCGAGATC  1626

Query 1624  ATCGGGCGGGTGAACGCAGACCCTGACTACCTGCCCCGCACCATGGACTTTGGCCTCAACGTGCGAGGATTCCT  1697
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1627  ATCGGGCGGGTGAACGCAGACCCTGACTACCTGCCCCGCACCATGGACTTTGGCCTCAACGTGCGAGGATTCCT  1700

Query 1698  GGACCGCTACTGCCCCCCAAACTGCCCCCCGAGCTTCTTCCCCATCACCGTGCGCTGTTGCGATCTGGACCCCG  1771
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1701  GGACCGCTACTGCCCCCCAAACTGCCCCCCGAGCTTCTTCCCCATCACCGTGCGCTGTTGCGATCTGGACCCCG  1774

Query 1772  AGAAGAGGCCATCCTTTGTGAAGCTGGAACACTGGCTGGAGACCCTCCGCATGCACCTGGCCGGCCACCTGCCA  1845
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1775  AGAAGAGGCCATCCTTTGTGAAGCTGGAACACTGGCTGGAGACCCTCCGCATGCACCTGGCCGGCCACCTGCCA  1848

Query 1846  CTGGGCCCACAGCTGGAGCAGCTGGACAGAGGTTTCTGGGAGACCTACCGGCGCGGCGAGAGCGGACTGCCTGC  1919
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1849  CTGGGCCCACAGCTGGAGCAGCTGGACAGAGGTTTCTGGGAGACCTACCGGCGCGGCGAGAGCGGACTGCCTGC  1922

Query 1920  CCACCCTGAGGTCCCCGAC  1938
            |||||||||||||||||||
Sbjct 1923  CCACCCTGAGGTCCCCGAC  1941