Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_14689
• Subject: NM_010717.3
• Aligned Length: 1944
• Identities: 1703
• Gaps: 9

Alignment

Query    1  ATGAGGTTGACGCTACTTTGTTGCACCTGGAGGGAAGAACGTATGGGAGAGGAAGGAAGCGAGTTGCCCGTGTG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct    1  ATGAGGTTGACGCTACTTTGTTGCACCTGGAGGGAAGAACGTATGGGAGAGGAAGGAAGCGAGTTGCCTGTGTG  74

Query   75  TGCAAGCTGCGGCCAGAGGATCTATGATGGCCAGTACCTCCAGGCCCTGAACGCGGACTGGCACGCAGACTGCT  148
            |||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||
Sbjct   75  TGCGAGCTGTGGCCAGAGGATCTATGACGGCCAGTACCTCCAGGCCCTGAATGCTGACTGGCATGCAGACTGCT  148

Query  149  TCAGGTGTTGTGACTGCAGTGCCTCCCTGTCGCACCAGTACTATGAGAAGGATGGGCAGCTCTTCTGCAAGAAG  222
            |||||||.||.||.||.||.|.||||||.||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct  149  TCAGGTGCTGCGAGTGTAGCGTCTCCCTTTCACACCAGTACTACGAGAAGGATGGACAGCTCTTCTGCAAGAAG  222

Query  223  GACTACTGGGCCCGCTATGGCGAGTCCTGCCATGGGTGCTCTGAGCAAATCACCAAGGGACTGGTTATGGTGGC  296
            ||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||.||||||||.||.|||||.||||||||
Sbjct  223  GACTACTGGGCCCGCTATGGCGAGTCTTGCCACGGGTGCTCCGAGCACATCACCAAAGGGCTGGTCATGGTGGC  296

Query  297  TGGGGAGCTGAAGTACCACCCCGAGTGTTTCATCTGCCTCACGTGTGGGACCTTTATCGGTGACGGGGACACCT  370
            |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.|.|||||.|.|||.||.||.||.||||||||||
Sbjct  297  TGGGGAGCTGAAGTACCACCCTGAGTGTTTCATCTGCCTCGCCTGTGGAAACTTCATTGGCGATGGGGACACCT  370

Query  371  ACACGCTGGTGGAGCACTCCAAGCTGTACTGCGGGCACTGCTACTACCAGACTGTGGTGACCCCCGTCATCGAG  444
            ||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||.|||||.||.||.||||||||.
Sbjct  371  ACACACTGGTGGAGCACTCCAAGCTGTACTGTGGCCAGTGCTACTACCAGACCGTGGTAACTCCAGTCATCGAA  444

Query  445  CAGATCCTGCCTGACTCCCCTGGCTCCCACCTGCCCCACACCGTCACCCTGGTGTCCATCCCAGCCTCATCTCA  518
            ||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||..|.||
Sbjct  445  CAGATCCTACCTGACTCACCCGGCTCCCACCTGCCCCACACAGTCACCCTCGTGTCTATCCCAGCCTCTGCCCA  518

Query  519  TGGCAAGCGTGGACTTTCAGTCTCCATTGACCCCCCGCACGGCCCACCGGGCTGTGGCACCGAGCACTCACACA  592
            ||||||.||.||.||.||.||||||||.||||||||.|||||||||||.||.||||||||.|||||.||.||||
Sbjct  519  TGGCAAACGAGGCCTGTCTGTCTCCATCGACCCCCCTCACGGCCCACCAGGATGTGGCACGGAGCATTCGCACA  592

Query  593  CCGTCCGCGTCCAGGGAGTGGATCCCGGGCTGCATGAGCCCAGATGTGAAGAATTCCATCCACGTCGGAGACCG  666
            |.|||||.|||||.|||||||| |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  593  CTGTCCGAGTCCAAGGAGTGGA-CCCAGGCTGCATGAGCCCAGATGTGAAGAATTCCATCCACGTTGGAGACCG  665

Query  667  GATCTTGGAAATCAATGGCACGCCCATCCGAAATGTGCCCCTGGACGAGATTGACCTGCTGATTCAGGAAACCA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||.|||||||.|||||.||||
Sbjct  666  GATCTTGGAAATCAATGGCACGCCCATCCGGAATGTGCCGCTGGACGAGATCGACTTGCTGATCCAGGAGACCA  739

Query  741  GCCGCCTGCTCCAGCTGACCCTCGAGCATGACCCTCACGATACACTGGGCCACGGGCTGGGGCCTGAGACCAGC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||..||||||||||.||||..|.|.|.||..|||||
Sbjct  740  GCCGCCTGCTCCAGCTGACCCTCGAGCACGACCCCCATGACTCACTGGGCCATGGGCCCGTGTCGGATCCCAGC  813

Query  815  CCCCTGAGCTCTCCGGCTTATACTCCCAGCGGGGAGGCGGGCAGCTCTGCCCGGCAGAAACCTGTCTTGAGGAG  888
            |||||||||||.||||...|.|||||||||||..||||.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  814  CCCCTGAGCTCCCCGGTGCACACTCCCAGCGGACAGGCAGCCAGCTCTGCCCGGCAGAAACCTGTCTTGAGGAG  887

Query  889  CTGCAGCATCGACAGGTCTCCGGGCGCTGGCTCACTGGGCTCCCCGGCCTCCCAGCGCAAGGACCTGGGTCGCT  962
            ||||||.||.||||.|||.|||||..|..|||||||.|.|||.||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  888  CTGCAGTATTGACACGTCCCCGGGTACCAGCTCACTAGCCTCTCCAGCCTCCCAGCGCAAGGACCTGGGTCGCT  961

Query  963  CTGAGTCCCTCCGCGTAGTCTGCCGGCCACACCGCATCTTCCGGCCGTCGGACCTCATCCACGGGGAGGTGCTG  1036
            |.||.||||||||.||.||||||||.||||||||.|||||||||||.||.||.||||||||.|||||.||||||
Sbjct  962  CCGAATCCCTCCGAGTGGTCTGCCGACCACACCGAATCTTCCGGCCATCTGATCTCATCCATGGGGAAGTGCTG  1035

Query 1037  GGCAAGGGCTGCTTCGGCCAGGCTATCAAGGTGACACACCGTGAGACAGGTGAGGTGATGGTGATGAAGGAGCT  1110
            |||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1036  GGCAAGGGCTGTTTTGGCCAGGCCATCAAGGTGACACACCGAGAAACAGGCGAGGTGATGGTGATGAAGGAACT  1109

Query 1111  GATCCGGTTCGACGAGGAGACCCAGAGGACGTTCCTCAAGGAGGTGAAGGTCATGCGATGCCTGGAACACCCCA  1184
            .||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||.|
Sbjct 1110  TATCCGGTTTGATGAGGAGACCCAGAGGACATTCCTCAAGGAGGTAAAGGTCATGCGCTGCCTGGAGCACCCTA  1183

Query 1185  ACGTGCTCAAGTTCATCGGGGTGCTCTAC-AGGACAGA---GCTCA--CTCATCACTGAGTACATCAAAGGGCG  1252
            |||||||||||||||||||.||||||||| |||||| |   |||.|  .|||||||.||||||||| |||||||
Sbjct 1184  ACGTGCTCAAGTTCATCGGAGTGCTCTACAAGGACA-AGCGGCTAAACTTCATCACAGAGTACATC-AAGGGCG  1255

Query 1253  GCACGCTCCGGGGCATCATCAAGAGCATGGACAGCCAGTACCCATGGAGCCAGAGAGTGAGCTTTGCCAAGGAC  1326
            ||||.||.||||||||||||||||.||||||||||||||||||.|||||.|||||.||.|||||||||||||||
Sbjct 1256  GCACCCTGCGGGGCATCATCAAGAACATGGACAGCCAGTACCCGTGGAGTCAGAGGGTCAGCTTTGCCAAGGAC  1329

Query 1327  ATCGCATCAGGGATGGCCTACCTCCACTCCATGAACATCATCCACCGAGACCTCAACTCCCACAACTGCCTGGT  1400
            ||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1330  ATTGCATCAGGGATGGCCTACCTCCATTCGATGAACATCATCCACCGAGACCTCAACTCCCACAACTGTCTGGT  1403

Query 1401  CCGCGAGAACAAGAATGTGGTGGTGGCTGACTTCGGGCTGGCGCGTCTCATGGTGGACGAGAAGACTCAGCCTG  1474
            |||.|||||.|.|||.|||||||||||.|||||.||||||||.||.||||||.|.||.||.||||.||||.|||
Sbjct 1404  CCGTGAGAATAGGAACGTGGTGGTGGCCGACTTTGGGCTGGCTCGACTCATGATCGATGAAAAGAATCAGTCTG  1477

Query 1475  AGGGCCTGCGGAGCCTCAAGAAGCCAGACCGCAAGAAGCGCTACACCGTGGTGGGCAACCCCTACTGGATGGCA  1548
            |.|.|.|.||.|||||.||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1478  AAGACTTACGCAGCCTTAAGAAGCCGGACCGCAAGAAGCGGTACACAGTGGTGGGCAACCCCTACTGGATGGCG  1551

Query 1549  CCTGAGATGATCAACGGCCGCAGCTATGATGAGAAGGTGGATGTGTTCTCCTTTGGGATCGTCCTGTGCGAGAT  1622
            ||.|||||||||||.||.||.||.||||||||.||||||||.|||||.||||||||.||.|||||.||.|||||
Sbjct 1552  CCAGAGATGATCAATGGTCGTAGTTATGATGAAAAGGTGGACGTGTTTTCCTTTGGAATTGTCCTCTGTGAGAT  1625

Query 1623  CATCGGGCGGGTGAACGCAGACCCTGACTACCTGCCCCGCACCATGGACTTTGGCCTCAACGTGCGAGGATTCC  1696
            .||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||..|.||.||||
Sbjct 1626  TATCGGGCGTGTGAATGCAGACCCTGACTATCTGCCCCGCACTATGGACTTTGGCCTCAATGTAAGGGGTTTCC  1699

Query 1697  TGGACCGCTACTGCCCCCCAAACTGCCCCCCGAGCTTCTTCCCCATCACCGTGCGCTGTTGCGATCTGGACCCC  1770
            |||||||||||||.||.||||||||.|||||.||.||||||||||||||.||||||||.||.||.|||||.||.
Sbjct 1700  TGGACCGCTACTGTCCACCAAACTGTCCCCCAAGTTTCTTCCCCATCACTGTGCGCTGCTGTGACCTGGATCCT  1773

Query 1771  GAGAAGAGGCCATCCTTTGTGAAGCTGGAACACTGGCTGGAGACCCTCCGCATGCACCTGGCCGGCCACCTGCC  1844
            ||.|||||.||.||.|||||.|||||||||||.|||||.||.||.||.|||||||||.||.|.||.||||||||
Sbjct 1774  GAAAAGAGACCCTCTTTTGTAAAGCTGGAACAATGGCTAGAAACACTTCGCATGCACTTGTCTGGTCACCTGCC  1847

Query 1845  ACTGGGCCCACAGCTGGAGCAGCTGGACAGAGGTTTCTGGGAGACCTACCGGCGCGGCGAGAGCGGACTGCCTG  1918
            ||||||||||||.|||||.||.|||||..|.||.||||||||||||||||||||.|||||||||..||||||||
Sbjct 1848  ACTGGGCCCACAACTGGAACAACTGGAGCGGGGCTTCTGGGAGACCTACCGGCGGGGCGAGAGCTCACTGCCTG  1921

Query 1919  CCCACCCTGAGGTCCCCGAC  1938
            |||||||.||||||||.|||
Sbjct 1922  CCCACCCCGAGGTCCCTGAC  1941