Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_14704
- Subject:
- NM_001037128.1
- Aligned Length:
- 2638
- Identities:
- 2293
- Gaps:
- 35
Alignment
Query 1 ATGAGAGAGCTCGTCAACATTCCACTGGTACATATTCTTACTCTGGTTGCCTTCAGCGGAACTGAGAAACTTCC 74
|||||||||||.|||||||||||||||.||||.||.||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1 ATGAGAGAGCTTGTCAACATTCCACTGTTACAGATGCTCACCCTGGTTGCCTTCAGCGGGACTGAGAAACTTCC 74
Query 75 AAAAGCTCCTGTCATCACCACTCCTCTTGAAACAGTGGATGCCTTAGTTGAAGAAGTGGCTACTTTCATGTGTG 148
||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||
Sbjct 75 AAAAGCCCCTGTCATCACCACGCCTCTTGAAACTGTAGATGCCTTGGTTGAAGAAGTAGCGACTTTCATGTGTG 148
Query 149 CAGTGGAATCCTACCCCCAGCCTGAGATTTCCTGGACTAGAAATAAAATTCTCATTAAACTCTTTGACACCCGG 222
|.||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.
Sbjct 149 CCGTGGAATCCTACCCTCAGCCCGAGATTTCTTGGACCAGAAATAAAATTCTCATTAAGCTGTTTGACACCCGC 222
Query 223 TACAGCATCCGGGAGAATGGGCAGCTCCTCACCATCCTGAGTGTGGAAGACAGTGATGATGGCATTTACTGCTG 296
||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 223 TACAGCATCCGGGAGAATGGTCAGCTCCTCACCATTCTGAGCGTGGAAGACAGTGATGATGGCATCTACTGCTG 296
Query 297 CACGGCCAACAATGGTGTGGGAGGAGCTGTGGAGAGTTGTGGAGCCCTGCAAGTGAAGATGAAACCTAAAATAA 370
||..|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CATAGCCAACAATGGAGTGGGAGGAGCCGTGGAGAGTTGTGGTGCCCTGCAAGTGAAGATGAAACCTAAAATAA 370
Query 371 CTCGCCCTCCCATAAATGTGAAAATAATAGAGGGATTAAAAGCAGTCCTACCATGTACTACAATGGGTAATCCC 444
||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||.|||||.||.||.||.|||||.||||||||.|||
Sbjct 371 CTCGTCCTCCCATTAATGTAAAAATAATAGAGGGATTGAAGGCAGTTCTGCCGTGCACTACGATGGGTAACCCC 444
Query 445 AAACCATCAGTGTCTTGGATAAAGGGAGACAGCCCTCTCAGGGAAAATTCCCGAATTGCAGTTCTTGAATCTGG 518
||||||||.|||||.|||||.|||||.||||...|||||||||||||||||.||||.|||||||||||||||||
Sbjct 445 AAACCATCTGTGTCCTGGATCAAGGGGGACAATGCTCTCAGGGAAAATTCCAGAATCGCAGTTCTTGAATCTGG 518
Query 519 GAGCTTGAGGATTCATAACGTACAAAAGGAAGATGCAGGACAGTATCGATGTGTGGCAAAAAACAGCCTCGGGA 592
||||||.|||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||.||.|
Sbjct 519 GAGCTTAAGGATCCATAATGTGCAAAAGGAAGATGCAGGACAGTACCGCTGTGTGGCCAAAAACAGCCTGGGCA 592
Query 593 CAGCATATTCCAAAGTGGTGAAGCTGGAAGTTGAG------------------------------GTTTTTGCC 636
||||.||.||||||.||||||||||||||||.||| ||||||||.
Sbjct 593 CAGCTTACTCCAAACTGGTGAAGCTGGAAGTGGAGGAAGACAGAGAACCTGAGCAGGACGCTAAAGTTTTTGCA 666
Query 637 AGGATCCTGCGGGCTCCTGAATCCCACAATGTCACCTTTGGCTCCTTTGTGACCCTGCACTGTACAGCAACAGG 710
||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|.|||.|||||||.|||
Sbjct 667 AGAATCCTGCGTGCTCCTGAATCCCACAATGTCACCTTTGGTTCCTTTGTAACCCTACGCTGCACAGCAATAGG 740
Query 711 CATTCCTGTCCCCACCATCACCTGGATTGAAAACGGAAATGCTGTTTCTTCTGGGTCCATTCAAGAGAGTGTGA 784
|||.||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||
Sbjct 741 CATCCCTGTCCCCACCATCAGCTGGATTGAAAACGGAAATGCTGTTTCTTCAGGTTCCATTCAAGAGAGTGTGA 814
Query 785 AAGACCGAGTGATTGACTCAAGACTGCAGCTGTTTATCACCAAGCCAGGACTCTACACATGCATAGCTACCAAT 858
|||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 AAGACCGAGTGATTGACTCAAGACTCCAGCTCTTCATCACAAAGCCAGGACTCTACACATGCATAGCTACCAAT 888
Query 859 AAGCATGGGGAGAAGTTCAGTACTGCCAAGGCTGCAGCCACCATCAGCATAGCAGAATGGAGTAAACCACAGAA 932
|||||.||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||..||||||||||||||||||||||..|||||||
Sbjct 889 AAGCACGGAGAAAAGTTCAGTACCGCAAAGGCTGCAGCCACTGTCAGCATAGCAGAATGGAGTAAGTCACAGAA 962
Query 933 AGATAACAAAGGCTACTGCGCCCAGTACAGAGGGGAGGTGTGTAATGCAGTCCTGGCAAAAGATGCTCTTGTTT 1006
|||.|.|.||||||||||.||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.||||||||||||||.|
Sbjct 963 AGACAGCCAAGGCTACTGTGCCCAGTACAGAGGGGAGGTGTGTGATGCAGTCCTGGCGAAAGATGCTCTTGTCT 1036
Query 1007 TTCTCAACACCTCCTATGCGGACCCTGAGGAGGCCCAAGAGCTACTGGTCCACACGGCCTGGAATGAACTGAAA 1080
|..|||||||||||||...||||||.|||||.|||||.|||||.|||.|||||||.||.||||||||.|||||.
Sbjct 1037 TCTTCAACACCTCCTACCGGGACCCCGAGGACGCCCAGGAGCTGCTGATCCACACTGCGTGGAATGAGCTGAAG 1110
Query 1081 GTAGTGAGCCCAGTCTGCCGGCCAGCTGCTGAGGCTTTGTTGTGTAACCACATCTTCCAGGAGTGCAGTCCTGG 1154
|..|||||.|||.|.|||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||.||||||||.|||||
Sbjct 1111 GCTGTGAGTCCACTGTGCCGGCCAGCTGCTGAGGCTCTGCTGTGTAACCACCTCTTCCAAGAGTGCAGCCCTGG 1184
Query 1155 AGTAGTGCCTACTCCTATTCCCATTTGCAGAGAGTACTGCTTGGCAGTAAAGGAGCTCTTCTGCGCAAAAGAAT 1228
|||.||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||.||||.|||||||||||||||||.|||||.||||
Sbjct 1185 AGTGGTACCTACTCCCATGCCCATTTGCAGAGAGTACTGCCTGGCGGTAAAGGAGCTCTTCTGTGCAAAGGAAT 1258
Query 1229 GGCTGGTAATGGAAGAGAAGACCCACAGAGGACTCTACAGATCCGAGATGCATTTGCTGTCC-GTGCCAGAATG 1301
|||.||.||||||||..|||.|||||.|.||.|||||||||||.|.|||||||.|.|| ||| ||.|||||.||
Sbjct 1259 GGCAGGCAATGGAAGGAAAGGCCCACCGGGGCCTCTACAGATCTGGGATGCATCTCCT-TCCGGTACCAGAGTG 1331
Query 1302 CAGCAAGCTTCCCAGCATGCATTGGGACCCCACGGCCTGTGCCAGACTGCCACATCTAGATTATAACAAAGAAA 1375
|||||||||||||||||||||..||||||||||.|||||..|.|||||||||.||.||||||||||.|||||||
Sbjct 1332 CAGCAAGCTTCCCAGCATGCACCGGGACCCCACAGCCTGCACAAGACTGCCATATTTAGATTATAAAAAAGAAA 1405
Query 1376 ACCTAAAAACATTCCCACCAATGACGTCCTCAAAGCCAAGTGTGGACATTCCAAATCTGCCTTCCTCCTCCTCT 1449
||.|||.|||||||||..||||.||||||||.|.|||.||.|.||||||||||||.||||||.|||||.||
Sbjct 1406 ACATAACAACATTCCCGTCAATAACGTCCTCCAGGCCGAGCGCGGACATTCCAAACCTGCCTGCCTCCACC--- 1476
Query 1450 TCTTCCTTCTCTGTCTCACCTACATACTCCATGACTGTAATAATCTCCATCATGTCCAGCTTTGCAATATTTGT 1523
||||||||..|.|||||.|||.|.|||||||||||.||.||.|||||||||.|||||||||||||..|.||||.
Sbjct 1477 TCTTCCTTTGCCGTCTCGCCTGCGTACTCCATGACCGTCATCATCTCCATCGTGTCCAGCTTTGCCCTGTTTGC 1550
Query 1524 GCTTCTTACCATAACTACTCTCTATTGCTGCCGAAGAAGAAAACAATGGAAAAATAAGAAAAGAGAATCAGCAG 1597
.|||||.|||||..||||||||||||||||||||||.||.|||.||||||||||||||||||||||.||..|.|
Sbjct 1551 TCTTCTCACCATCGCTACTCTCTATTGCTGCCGAAGGAGGAAAGAATGGAAAAATAAGAAAAGAGAGTCGACCG 1624
Query 1598 CAGTAACCCTCACCACACTGCCTTCTGAGCTCTTACTAGATAGACTTCATCCCAACCCCATGTACCAGAGGATG 1671
|.||.|||||||||||..|||||||.||||||.|.||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1625 CGGTGACCCTCACCACGTTGCCTTCCGAGCTCCTGCTGGATAGGCTCCATCCCAACCCCATGTACCAGAGGATG 1698
Query 1672 CCGCTCCTTCTGAACCCCAAATTGCTCAGCCTGGAGTATCCAAGGAATAACATTGAATATGTGAGAGACATCGG 1745
||.|||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||..||||||||||
Sbjct 1699 CCACTCCTTCTGAATCCTAAGTTGCTCAGCCTGGAGTATCCGAGGAATAACATTGAGTATGTCCGAGACATCGG 1772
Query 1746 AGAGGGAGCGTTTGGAAGGGTGTTTCAAGCAAGGGCACCAGGCTTACTTCCCTATGAACCTTTCACTATGGTGG 1819
||||||.|||||||||||.||.||.|||||||||||.||.|||||.||.||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 1773 AGAGGGGGCGTTTGGAAGAGTCTTCCAAGCAAGGGCCCCTGGCTTGCTGCCTTATGAACCTTTCACTATGGTGG 1846
Query 1820 CAGTAAAGATGCTCAAAGAAGAAGCCTCGGCAGATATGCAAGCGGACTTTCAGAGGGAGGCAGCCCTCATGGCA 1893
|.||.||||||||.||.|||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1847 CCGTGAAGATGCTTAAGGAAGAGGCCTCTGCAGACATGCAAGCGGACTTTCAGAGGGAGGCGGCCCTCATGGCA 1920
Query 1894 GAATTTGACAACCCTAACATTGTGAAGCTATTAGGAGTGTGTGCTGTCGGGAAGCCAATGTGCCTGCTCTTTGA 1967
||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||.||||||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||
Sbjct 1921 GAGTTTGACAACCCCAACATTGTGAAACTCTTAGGTGTGTGTGCCGTTGGGAAGCCGATGTGTCTGCTCTTTGA 1994
Query 1968 ATACATGGCCTATGGTGACCTCAATGAGTTCCTCCGCAGCATGTCCCCTCACACCGTGTGCAGCCTCAGTCACA 2041
|||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.||.|||||||||||.||||
Sbjct 1995 ATATATGGCCTATGGTGACCTCAATGAGTTCCTCCGAAGTATGTCCCCGCACACTGTTTGCAGCCTCAGCCACA 2068
Query 2042 GTGACTTGTCTATGAGGGCTCAGGTCTCCAGCCCTGGGCCCCCACCCCTCTCCTGTGCTGAGCAGCTTTGCATT 2115
|||||.||||.|.||||||||.|||.||.||||||||.||.|||||.||.||||||||.||.|||||.||||||
Sbjct 2069 GTGACCTGTCCACGAGGGCTCGGGTGTCTAGCCCTGGTCCTCCACCACTGTCCTGTGCAGAACAGCTCTGCATT 2142
Query 2116 GCCAGGCAGGTGGCAGCTGGCATGGCTTACCTCTCAGAACGTAAGTTTGTTCACCGAGATTTAGCCACCAGGAA 2189
||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||.||||||||.|||||.||.|||||.||||||||
Sbjct 2143 GCCAGGCAGGTGGCAGCTGGCATGGCCTACCTTTCAGAGCGCAAGTTTGTCCACCGGGACTTAGCTACCAGGAA 2216
Query 2190 CTGCCTGGTGGGCGAGAACATGGTGGTGAAAATTGCCGACTTTGGCCTCTCCAGGAACATCTACTCAGCAGACT 2263
|||||||||.||.||||.||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||
Sbjct 2217 CTGCCTGGTTGGGGAGACCATGGTGGTGAAAATTGCAGACTTTGGCCTCTCCAGGAACATCTATTCCGCAGACT 2290
Query 2264 ACTACAAAGCTAATGAAAACGACGCTATCCCTATCCGTTGGATGCCACCAGAGTCCATTTTTTATAACCGCTAC 2337
|||||||||||.|||.|||.|||||.|||||||||||.||||||||.||.|||||.||.||.||.|||||||||
Sbjct 2291 ACTACAAAGCTGATGGAAATGACGCCATCCCTATCCGCTGGATGCCGCCCGAGTCTATCTTCTACAACCGCTAC 2364
Query 2338 ACTACAGAGTCTGATGTGTGGGCCTATGGCGTGGTCCTCTGGGAGATCTTCTCCTATGGCCTGCAGCCCTACTA 2411
||.||.|||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 2365 ACCACTGAGTCGGATGTATGGGCCTATGGTGTGGTCCTCTGGGAGATCTTCTCCTATGGGCTGCAGCCCTACTA 2438
Query 2412 TGGGATGGCCCATGAGGAGGTCATTTACTACGTGCGAGATGGCAACATCCTCTCCTGCCCTGAGAACTGCCCCG 2485
|||.||||||||.|||||||||||||||||.|||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.
Sbjct 2439 TGGAATGGCCCACGAGGAGGTCATTTACTATGTGAGAGATGGCAACATCCTCGCCTGCCCTGAGAACTGCCCCT 2512
Query 2486 TGGAGCTGTACAATCTCATGCGTCTATGTTGGAGCAAGCTGCCTGCAGACAGACCCAGTTTCACCAGTATTCAC 2559
||||.||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||..||||||.|||
Sbjct 2513 TGGAACTGTACAACCTCATGCGCCTGTGTTGGAGCAAGCTGCCTGCTGATAGACCCAGCTTCTGCAGTATCCAC 2586
Query 2560 CGAATTCTGGAACGCATGTGTGAGAGGGCAGAGGGAACTGTGAGTGTC 2607
.|.||.|||.|.||||||||.|||||.|||||||||||.|||.|||||
Sbjct 2587 AGGATCCTGCAGCGCATGTGCGAGAGAGCAGAGGGAACGGTGGGTGTC 2634