Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_14704
• Subject: NM_001166280.2
• Aligned Length: 879
• Identities: 772
• Gaps: 106

Alignment

Query   1  MRELVNIPLVHILTLVAFSGTEKLPKAPVITTPLETVDALVEEVATFMCAVESYPQPEISWTRNKILIKLFDTR  74
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  MRELVNIPLVHILTLVAFSGTEKLPKAPVITTPLETVDALVEEVATFMCAVESYPQPEISWTRNKILIKLFDTR  74

Query  75  YSIRENGQLLTILSVEDSDDGIYCCTANNGVGGAVESCGALQVKMKPKITRPPINVKIIEGLKAVLPCTTMGNP  148
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  YSIRENGQLLTILSVEDSDDGIYCCTANNGVGGAVESCGALQVKMKPKITRPPINVKIIEGLKAVLPCTTMGNP  148

Query 149  KPSVSWIKGDSPLRENSRIAVLESGSLRIHNVQKEDAGQYRCVAKNSLGTAYSKVVKLEVE----------VFA  212
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          |||
Sbjct 149  KPSVSWIKGDSPLRENSRIAVLESGSLRIHNVQKEDAGQYRCVAKNSLGTAYSKVVKLEVEEESEPEQDTKVFA  222

Query 213  RILRAPESHNVTFGSFVTLHCTATGIPVPTITWIENGNAVSSGSIQESVKDRVIDSRLQLFITKPGLYTCIATN  286
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223  RILRAPESHNVTFGSFVTLHCTATGIPVPTITWIENGNAVSSGSIQESVKDRVIDSRLQLFITKPGLYTCIATN  296

Query 287  KHGEKFSTAKAAATISIAEWSKPQKDNKGYCAQYRGEVCNAVLAKDALVFLNTSYADPEEAQELLVHTAWNELK  360
           ||||||||||||||||||||                                                      
Sbjct 297  KHGEKFSTAKAAATISIAEW------------------------------------------------------  316

Query 361  VVSPVCRPAAEALLCNHIFQECSPGVVPTPIPICREYCLAVKELFCAKEWLVMEEKTHRGLYRSEMHLLSVPEC  434
                                             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 317  ----------------------------------REYCLAVKELFCAKEWLVMEEKTHRGLYRSEMHLLSVPEC  356

Query 435  SKLPSMHWDPTACARLPHLDYNKENLKTFPPMTSSKPSVDIPNLPSSSSSSFSVSPTYSMTVIISIMSSFAIFV  508
           |||||||||||||||||||        .||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 357  SKLPSMHWDPTACARLPHL--------AFPPMTSSKPSVDIPNLPSSSSSSFSVSPTYSMTVIISIMSSFAIFV  422

Query 509  LLTITTLYCCRRRKQWKNKKRESAAVTLTTLPSELLLDRLHPNPMYQRMPLLLNPKLLSLEYPRNNIEYVRDIG  582
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 423  LLTITTLYCCRRRKQWKNKKRESAAVTLTTLPSELLLDRLHPNPMYQRMPLLLNPKLLSLEYPRNNIEYVRDIG  496

Query 583  EGAFGRVFQARAPGLLPYEPFTMVAVKMLKEEASADMQADFQREAALMAEFDNPNIVKLLGVCAVGKPMCLLFE  656
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 497  EGAFGRVFQARAPGLLPYEPFTMVAVKMLKEEASADMQADFQREAALMAEFDNPNIVKLLGVCAVGKPMCLLFE  570

Query 657  YMAYGDLNEFLRSMSPHTVCSLSHSDLSMRAQVSSPGPPPLSCAEQLCIARQVAAGMAYLSERKFVHRDLATRN  730
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Sbjct 571  YMAYGDLNEFLRSMSPHTVCSLSHSDLSMRAQVSSPGPPPLSCAEQLCIARQVAAGMAYLSERKFVHRDLATRN  644

Query 731  CLVGENMVVKIADFGLSRNIYSADYYKANENDAIPIRWMPPESIFYNRYTTESDVWAYGVVLWEIFSYGLQPYY  804
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 645  CLVGENMVVKIADFGLSRNIYSADYYKANENDAIPIRWMPPESIFYNRYTTESDVWAYGVVLWEIFSYGLQPYY  718

Query 805  GMAHEEVIYYVRDGNILSCPENCPVELYNLMRLCWSKLPADRPSFTSIHRILERMCERAEGTVSV  869
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Sbjct 719  GMAHEEVIYYVRDGNILSCPENCPVELYNLMRLCWSKLPADRPSFTSIHRILERMCERAEGTVSV  783