Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_14720
• Subject: NM_002529.3
• Aligned Length: 2388
• Identities: 2370
• Gaps: 18

Alignment

Query    1  ATGCTGCGAGGCGGACGGCGCGGGCAGCTTGGCTGGCACAGCTGGGCTGCGGGGCCGGGCAGCCTGCTGGCTTG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCTGCGAGGCGGACGGCGCGGGCAGCTTGGCTGGCACAGCTGGGCTGCGGGGCCGGGCAGCCTGCTGGCTTG  74

Query   75  GCTGATACTGGCATCTGCGGGCGCCGCACCCTGCCCCGATGCCTGCTGCCCCCACGGCTCCTCGGGACTGCGAT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GCTGATACTGGCATCTGCGGGCGCCGCACCCTGCCCCGATGCCTGCTGCCCCCACGGCTCCTCGGGACTGCGAT  148

Query  149  GCACCCGGGATGGGGCCCTGGATAGCCTCCACCACCTGCCCGGCGCAGAGAACCTGACTGAGCTCTACATCGAG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GCACCCGGGATGGGGCCCTGGATAGCCTCCACCACCTGCCCGGCGCAGAGAACCTGACTGAGCTCTACATCGAG  222

Query  223  AACCAGCAGCATCTGCAGCATCTGGAGCTCCGTGATCTGAGGGGCCTGGGGGAGCTGAGAAACCTCACCATCGT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AACCAGCAGCATCTGCAGCATCTGGAGCTCCGTGATCTGAGGGGCCTGGGGGAGCTGAGAAACCTCACCATCGT  296

Query  297  GAAGAGTGGTCTCCGTTTCGTGGCGCCAGATGCCTTCCATTTCACTCCTCGGCTCAGTCGCCTGAATCTCTCCT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GAAGAGTGGTCTCCGTTTCGTGGCGCCAGATGCCTTCCATTTCACTCCTCGGCTCAGTCGCCTGAATCTCTCCT  370

Query  371  TCAACGCTCTGGAGTCTCTCTCCTGGAAAACTGTGCAGGGCCTCTCCTTACAGGAACTGGTCCTGTCGGGGAAC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TCAACGCTCTGGAGTCTCTCTCCTGGAAAACTGTGCAGGGCCTCTCCTTACAGGAACTGGTCCTGTCGGGGAAC  444

Query  445  CCTCTGCACTGTTCTTGTGCCCTGCGCTGGCTACAGCGCTGGGAGGAGGAGGGACTGGGCGGAGTGCCTGAACA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CCTCTGCACTGTTCTTGTGCCCTGCGCTGGCTACAGCGCTGGGAGGAGGAGGGACTGGGCGGAGTGCCTGAACA  518

Query  519  GAAGCTGCAGTGTCATGGGCAAGGGCCCCTGGCCCACATGCCCAATGCCAGCTGTGGTGTGCCCACGCTGAAGG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GAAGCTGCAGTGTCATGGGCAAGGGCCCCTGGCCCACATGCCCAATGCCAGCTGTGGTGTGCCCACGCTGAAGG  592

Query  593  TCCAGGTGCCCAATGCCTCGGTGGATGTGGGGGACGACGTGCTGCTGCGGTGCCAGGTGGAGGGGCGGGGCCTG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TCCAGGTGCCCAATGCCTCGGTGGATGTGGGGGACGACGTGCTGCTGCGGTGCCAGGTGGAGGGGCGGGGCCTG  666

Query  667  GAGCAGGCCGGCTGGATCCTCACAGAGCTGGAGCAGTCAGCCACGGTGATGAAATCTGGGGGTCTGCCATCCCT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GAGCAGGCCGGCTGGATCCTCACAGAGCTGGAGCAGTCAGCCACGGTGATGAAATCTGGGGGTCTGCCATCCCT  740

Query  741  GGGGCTGACCCTGGCCAATGTCACCAGTGACCTCAACAGGAAGAACGTGACGTGCTGGGCAGAGAACGATGTGG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GGGGCTGACCCTGGCCAATGTCACCAGTGACCTCAACAGGAAGAACGTGACGTGCTGGGCAGAGAACGATGTGG  814

Query  815  GCCGGGCAGAGGTCTCTGTTCAGGTCAACGTCTCCTTCCCGGCCAGTGTGCAGCTGCACACGGCGGTGGAGATG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GCCGGGCAGAGGTCTCTGTTCAGGTCAACGTCTCCTTCCCGGCCAGTGTGCAGCTGCACACGGCGGTGGAGATG  888

Query  889  CACCACTGGTGCATCCCCTTCTCTGTGGATGGGCAGCCGGCACCGTCTCTGCGCTGGCTCTTCAATGGCTCCGT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CACCACTGGTGCATCCCCTTCTCTGTGGATGGGCAGCCGGCACCGTCTCTGCGCTGGCTCTTCAATGGCTCCGT  962

Query  963  GCTCAATGAGACCAGCTTCATCTTCACTGAGTTCCTGGAGCCGGCAGCCAATGAGACCGTGCGGCACGGGTGTC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GCTCAATGAGACCAGCTTCATCTTCACTGAGTTCCTGGAGCCGGCAGCCAATGAGACCGTGCGGCACGGGTGTC  1036

Query 1037  TGCGCCTCAACCAGCCCACCCACGTCAACAACGGCAACTACACGCTGCTGGCTGCCAACCCCTTCGGCCAGGCC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TGCGCCTCAACCAGCCCACCCACGTCAACAACGGCAACTACACGCTGCTGGCTGCCAACCCCTTCGGCCAGGCC  1110

Query 1111  TCCGCCTCCATCATGGCTGCCTTCATGGACAACCCTTTCGAGTTCAACCCCGAGGACCCCATCCCT--------  1176
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        
Sbjct 1111  TCCGCCTCCATCATGGCTGCCTTCATGGACAACCCTTTCGAGTTCAACCCCGAGGACCCCATCCCTGTCTCCTT  1184

Query 1177  ----------GACACTAACAGCACATCTGGAGACCCGGTGGAGAAGAAGGACGAAACACCTTTTGGGGTCTCGG  1240
                      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CTCGCCGGTGGACACTAACAGCACATCTGGAGACCCGGTGGAGAAGAAGGACGAAACACCTTTTGGGGTCTCGG  1258

Query 1241  TGGCTGTGGGCCTGGCCGTCTTTGCCTGCCTCTTCCTTTCTACGCTGCTCCTTGTGCTCAACAAATGTGGACGG  1314
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TGGCTGTGGGCCTGGCCGTCTTTGCCTGCCTCTTCCTTTCTACGCTGCTCCTTGTGCTCAACAAATGTGGACGG  1332

Query 1315  AGAAACAAGTTTGGGATCAACCGCCCGGCTGTGCTGGCTCCAGAGGATGGGCTGGCCATGTCCCTGCATTTCAT  1388
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  AGAAACAAGTTTGGGATCAACCGCCCGGCTGTGCTGGCTCCAGAGGATGGGCTGGCCATGTCCCTGCATTTCAT  1406

Query 1389  GACATTGGGTGGCAGCTCCCTGTCCCCCACCGAGGGCAAAGGCTCTGGGCTCCAAGGCCACATCATCGAGAACC  1462
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GACATTGGGTGGCAGCTCCCTGTCCCCCACCGAGGGCAAAGGCTCTGGGCTCCAAGGCCACATCATCGAGAACC  1480

Query 1463  CACAATACTTCAGTGATGCCTGTGTTCACCACATCAAGCGCCGGGACATCGTGCTCAAGTGGGAGCTGGGGGAG  1536
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  CACAATACTTCAGTGATGCCTGTGTTCACCACATCAAGCGCCGGGACATCGTGCTCAAGTGGGAGCTGGGGGAG  1554

Query 1537  GGCGCCTTTGGGAAGGTCTTCCTTGCTGAGTGCCACAACCTCCTGCCTGAGCAGGACAAGATGCTGGTGGCTGT  1610
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  GGCGCCTTTGGGAAGGTCTTCCTTGCTGAGTGCCACAACCTCCTGCCTGAGCAGGACAAGATGCTGGTGGCTGT  1628

Query 1611  CAAGGCACTGAAGGAGGCGTCCGAGAGTGCTCGGCAGGACTTCCAGCGTGAGGCTGAGCTGCTCACCATGCTGC  1684
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  CAAGGCACTGAAGGAGGCGTCCGAGAGTGCTCGGCAGGACTTCCAGCGTGAGGCTGAGCTGCTCACCATGCTGC  1702

Query 1685  AGCACCAGCACATCGTGCGCTTCTTCGGCGTCTGCACCGAGGGCCGCCCCCTGCTCATGGTCTTTGAGTATATG  1758
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  AGCACCAGCACATCGTGCGCTTCTTCGGCGTCTGCACCGAGGGCCGCCCCCTGCTCATGGTCTTTGAGTATATG  1776

Query 1759  CGGCACGGGGACCTCAACCGCTTCCTCCGATCCCATGGACCTGATGCCAAGCTGCTGGCTGGTGGGGAGGATGT  1832
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  CGGCACGGGGACCTCAACCGCTTCCTCCGATCCCATGGACCTGATGCCAAGCTGCTGGCTGGTGGGGAGGATGT  1850

Query 1833  GGCTCCAGGCCCCCTGGGTCTGGGGCAGCTGCTGGCCGTGGCTAGCCAGGTCGCTGCGGGGATGGTGTACCTGG  1906
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  GGCTCCAGGCCCCCTGGGTCTGGGGCAGCTGCTGGCCGTGGCTAGCCAGGTCGCTGCGGGGATGGTGTACCTGG  1924

Query 1907  CGGGTCTGCATTTTGTGCACCGGGACCTGGCCACACGCAACTGTCTAGTGGGCCAGGGACTGGTGGTCAAGATT  1980
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  CGGGTCTGCATTTTGTGCACCGGGACCTGGCCACACGCAACTGTCTAGTGGGCCAGGGACTGGTGGTCAAGATT  1998

Query 1981  GGTGATTTTGGCATGAGCAGGGATATCTACAGCACCGACTATTACCGTGTGGGAGGCCGCACCATGCTGCCCAT  2054
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  GGTGATTTTGGCATGAGCAGGGATATCTACAGCACCGACTATTACCGTGTGGGAGGCCGCACCATGCTGCCCAT  2072

Query 2055  TCGCTGGATGCCGCCCGAGAGCATCCTGTACCGTAAGTTCACCACCGAGAGCGACGTGTGGAGCTTCGGCGTGG  2128
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  TCGCTGGATGCCGCCCGAGAGCATCCTGTACCGTAAGTTCACCACCGAGAGCGACGTGTGGAGCTTCGGCGTGG  2146

Query 2129  TGCTCTGGGAGATCTTCACCTACGGCAAGCAGCCCTGGTACCAGCTCTCCAACACGGAGGCAATCGACTGCATC  2202
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  TGCTCTGGGAGATCTTCACCTACGGCAAGCAGCCCTGGTACCAGCTCTCCAACACGGAGGCAATCGACTGCATC  2220

Query 2203  ACGCAGGGACGTGAGTTGGAGCGGCCACGTGCCTGCCCACCAGAGGTCTACGCCATCATGCGGGGCTGCTGGCA  2276
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  ACGCAGGGACGTGAGTTGGAGCGGCCACGTGCCTGCCCACCAGAGGTCTACGCCATCATGCGGGGCTGCTGGCA  2294

Query 2277  GCGGGAGCCCCAGCAACGCCACAGCATCAAGGATGTGCACGCCCGGCTGCAAGCCCTGGCCCAGGCACCTCCTG  2350
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  GCGGGAGCCCCAGCAACGCCACAGCATCAAGGATGTGCACGCCCGGCTGCAAGCCCTGGCCCAGGCACCTCCTG  2368

Query 2351  TCTACCTGGATGTCCTGGGC  2370
            ||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  TCTACCTGGATGTCCTGGGC  2388