Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_14722
- Subject:
- NM_182809.2
- Aligned Length:
- 2553
- Identities:
- 1612
- Gaps:
- 753
Alignment
Query 1 ATGGATGTCTCTCTTTGCCCAGCCAAGTGTAGTTTCTGGCGGATTTTCTTGCTGGGAAGCGTCTGGCTGGACTA 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGATGTCTCTCTTTGCCCAGCCAAGTGTAGTTTCTGGCGGATTTTCTTGCTGGGAAGCGTCTGGCTGGACTA 74
Query 75 TGTGGGCTCCGTGCTGGCTTGCCCTGCAAATTGTGTCTGCAGCAAGACTGAGATCAATTGCCGGCGGCCGGACG 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 TGTGGGCTCCGTGCTGGCTTGCCCTGCAAATTGTGTCTGCAGCAAGACTGAGATCAATTGCCGGCGGCCGGACG 148
Query 149 ATGGGAACCTCTTCCCCCTCCTGGAAGGGCAGGATTCAGGGAACAGCAATGGGAACGCCAGTATCAACATCACG 222
||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||
Sbjct 149 ATGGGAACCTCTTCCCTCTCCTGGAAGGGCAGGATTCAGGGAACAGCAATGGGAACGCCAGCATCAACATTACG 222
Query 223 GACATCTCAAGGAATATCACTTCCATACACATAGAGAACTGGCGCAGTCTTCACACGCTCAACGCCGTGGACAT 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|.||.|||||.|||||.||.||||||||
Sbjct 223 GACATCTCAAGGAATATCACTTCCATACACATAGAGAACTGGCGAGGCCTGCACACACTCAATGCTGTGGACAT 296
Query 297 GGAGCTCTACACCGGACTTCAAAAGCTGACCATCAAGAACTCAGGACTTCGGAGCATTCAGCCCAGAGCCTTTG 370
||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||.||.|||||.||||.|||.||||||||||||||.|
Sbjct 297 GGAGCTCTACACGGGACTCCAGAAGCTGACCATCAAGAATTCTGGACTCCGGAACATCCAGCCCAGAGCCTTCG 370
Query 371 CCAAGAACCCCCATTTGCGTTATATAAACCTGTCAAGTAACCGGCTCACCACACTCTCGTGGCAGCTCTTCCAG 444
|||||||||||||.|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 371 CCAAGAACCCCCACTTGCGTTATATAAACTTGTCAAGTAACCGGCTCACCACACTCTCCTGGCAGCTCTTCCAG 444
Query 445 ACGCTGAGTCTTCGGGAATTGCAG-TTGGAGCAGAACTTTTTCAACTGCAGCTGTGACATCCGCTGGATGCAGC 517
||||||||.|||||||||||| || .|||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 ACGCTGAGCCTTCGGGAATTG-AGACTGGAGCAGAACTTCTTCAACTGCAGCTGTGACATCCGCTGGATGCAGC 517
Query 518 TCTGGCAGGAGCAGGGGGAGGCCAAGCTCAACAGCCAGAACCTCTACTGCATCAACGCTGATGGCTCCCAGCTT 591
|.||||||||.|||||||||||...|||..|||||||||.|||.||||||||||..||||||||||||||.||.
Sbjct 518 TGTGGCAGGAACAGGGGGAGGCGCGGCTGGACAGCCAGAGCCTTTACTGCATCAGTGCTGATGGCTCCCAACTC 591
Query 592 CCTCTCTTCCGCATGAACATCAGTCAGTGTGACCTTCCTGAGATCAGCGTGAGCCACGTCAACCTGACCGTACG 665
||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||.||||||||||||||||||||.||.||
Sbjct 592 CCCCTCTTCCGCATGAACATCAGTCAGTGTGATCTCCCAGAGATCAGTGTGAGCCACGTCAACCTGACTGTCCG 665
Query 666 AGAGGGTGACAATGCTGTTATCACTTGCAATGGCTCTGGATCACCCCTTCCTGATGTGGACTGGATAGTCACTG 739
|||.||.||||||||.||.||||||||||||||||||||.||.||..|.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 666 AGAAGGAGACAATGCCGTGATCACTTGCAATGGCTCTGGCTCTCCTTTGCCTGATGTGGACTGGATAGTCACTG 739
Query 740 GGCTGCAGTCCATCAACACTCACCAGACCAATCTGAACTGGACCAATGTTCATGCCATCAACTTGACGCTGGTG 813
|||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||
Sbjct 740 GGCTGCAGTCCATCAACACCCACCAGACCAATCTGAACTGGACCAATGTACATGCCATCAACTTGACCCTGGTG 813
Query 814 AATGTGACGAGTGAGGACAATGGCTTCACCCTGACGTGCATTGCAGAGAACGTGGTGGGCATGAGCAATGCCAG 887
||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 814 AACGTGACGAGCGAGGACAATGGCTTCACCCTGACGTGCATTGCAGAGAACGTGGTGGGCATGAGCAATGCCAG 887
Query 888 TGTTGCCCTCACTGTCTACTATCCCCCACGTGTGGTGAGCCTGGAGGAGCCTGAGCTGCGCCTGGAGCACTGCA 961
||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||.||||||||||.|.||||||||.||.||||
Sbjct 888 TGTTGCTCTCACTGTCTACTACCCTCCACGTGTGGTGAGCCTGGTGGAGCCTGAGGTACGCCTGGAACATTGCA 961
Query 962 TCGAGTTTGTGGTGCGTGGCAACCCCCCACCAACGCTGCACTGGCTGCACAATGGGCAGCCTCTGCGGGAGTCC 1035
|.|||||||||||||||||||||||..||||.|||||.|||||||||.|||||||.|||||..||.||||||||
Sbjct 962 TTGAGTTTGTGGTGCGTGGCAACCCGACACCCACGCTCCACTGGCTGTACAATGGACAGCCATTGAGGGAGTCC 1035
Query 1036 AAGATCATCCATGTGGAATACTACCAAGAGGGAGAGATTTCCGAGGGCTGCCTGCTCTTCAACAAGCCCACCCA 1109
||||||||.||..||||.||||||||.|||||.|||.|.||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1036 AAGATCATTCACATGGACTACTACCAGGAGGGGGAGGTCTCAGAGGGCTGCCTGCTCTTCAACAAGCCCACCCA 1109
Query 1110 CTACAACAATGGCAACTATACCCTCATTGCCAAAAACCCACTGGGCACAGCCAACCAGACCATCAATGGCCACT 1183
||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||..|.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1110 CTACAACAATGGCAACTACACCCTCATTGCTAAGAATGCCCTGGGCACGGCCAACCAGACCATCAACGGCCACT 1183
Query 1184 TCCTCAAGGAGCCCTTTCCAGAGAGCACGGATAACTTTATCTTGTTTGA---CGAAGTGAGTCCCACACCTCCT 1254
||||.|||||||||||||||||||||||.|||..||||..| ||||| .||.|.|||.||.|||||||||
Sbjct 1184 TCCTGAAGGAGCCCTTTCCAGAGAGCACAGATTTCTTTGAC---TTTGAGTCTGATGCGAGCCCTACACCTCCT 1254
Query 1255 ATCACTGTGACCCACAAACCAGAAGAAGACACTTTTGGGGTATCCATAGCAGTTGGACTTGCTGCTTTTGCCTG 1328
|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||
Sbjct 1255 ATCACTGTGACCCACAAACCAGAGGAAGACACTTTTGGGGTGTCCATAGCAGTCGGACTTGCTGCCTTTGCCTG 1328
Query 1329 TGTCCTGTTGGTGGTTCTCTTCGTCATGATCAACAAATATGGTCGACGGTCCAAATTTGGAATGAAGGGTCCCG 1402
.|||||..|||||||||||||..|||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1329 CGTCCTTCTGGTGGTTCTCTTTATCATGATCAACAAGTATGGTCGCCGGTCCAAATTTGGAATGAAGGGTCCTG 1402
Query 1403 TGGCTGTCATCAGTGGTGAGGAGGACTCAGCCAGCCCACTGCACCACATCAACCACGGCATCACCACGCCCTCG 1476
|||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||.||.||.
Sbjct 1403 TGGCTGTTATCAGTGGAGAGGAGGACTCAGCCAGCCCACTGCATCACATCAACCATGGCATCACTACACCATCA 1476
Query 1477 TCACTGGATGCCGGGCCCGACACTGTGGTCATTGGCATGACTCGCATCCCTGTCATTGAGAACCCCCAGTACTT 1550
||..|||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1477 TCGTTGGATGCTGGGCCTGACACAGTGGTCATTGGCATGACCCGCATCCCAGTCATTGAGAACCCCCAGTACTT 1550
Query 1551 CCGTCAGGGACACAACTGCCACAAGCCGGACAC----GTATGTGCAGCACATTAAGAGGAGAGAC-ATCGTGCT 1619
|||||||||.|||||.|||||||||||.||||| ||.|.|.|| .|||| |||| |||
Sbjct 1551 CCGTCAGGGTCACAATTGCCACAAGCCAGACACATGGGTCTTTTCA-AACAT---------AGACAATC----- 1609
Query 1620 GAAGCGA----GAACTGGGTGAGGGAGCCTTTGGAAAGGTCTTCCTGGCCGAGTGCTA-CAACCTCAGCCCGAC 1688
|.|.|| .|||| |||.|||...| |.||.||.| |.|||.|.| ||| |||
Sbjct 1610 -ATGGGATATTAAACT---TGAAGGACAAT----AGAGATCAT------CTAGTCCCATCAA-CTC-------- 1660
Query 1689 CAAGGACAAGATGCTTGTGGCTGTGAAGGCCCTGAAGGATCCCACCCTGGCTGCCCGGAAGGATTTCCAGAGGG 1762
||.|.|| .|.|||.|..|||||.| |||||||.|
Sbjct 1661 -----ACTATAT--------ATATGAGGAACCTGAGG----------------------------TCCAGAGTG 1693
Query 1763 AGGCCGAGCTG-CTCACCAACCTGCAGCATGAGCACATTGTCAAGTTCTATGGAGTGTGCGGCGATGGGGACCC 1835
.| ||..|| ||.||| ||.|..|||||.|| |.|.|.||
Sbjct 1694 GG---GATGTGTCTTACC---------CAAGGTCACATGGT----------------TTCAGAGA--------- 1730
Query 1836 CCTCATCATGGTCTTTGAATACATGAAGCAT----GGAGA--CCTGAATAAGTTCCTC---AGGGCCCATGGGC 1900
.||.||| ||||||.||..||||.| |||.| || ||| |||| | ||||||
Sbjct 1731 ---AATTATG----TTGAATCCAATAAGCCTTTCCGGACATTCC-----AAG--CCTCTTAA----CCATGG-- 1784
Query 1901 CA-----------GATG-CAATGATCCTTGTGGATGGACAGCCACGCCAGGCCAAGGGTGAGCTGGGGCTCTCC 1962
|| |||| |||||.|..|| .||||.| |||.| ||.| .||||.|
Sbjct 1785 CATCTATGTTGAGGATGTCAATGTTTATT--------TCAGCAA----AGGAC----GTCA----TGGCTTT-- 1836
Query 1963 CAAATGCTCCACATTGCCAGTCAGATCGCCTCGGGTATGGTGTACCTGGCCTCCCAGCACTTTGTGCACCGAGA 2036
Sbjct 1837 -------------------------------------------------------------------------- 1836
Query 2037 CCTGGCCACCAGGAACTGCCTGGTTGGAGCGAATCTGCTAGTGAAGATTGGGGACTTCGGCATGTCCAGAGATG 2110
Sbjct 1837 -------------------------------------------------------------------------- 1836
Query 2111 TCTACAGCACGGATTATTACAGGCTCTTTAATCCATCTGGAAATGATTTTTGTATATGGTGTGAGGTGGGAGGA 2184
Sbjct 1837 -------------------------------------------------------------------------- 1836
Query 2185 CACACCATGCTCCCCATTCGCTGGATGCCTCCTGAAAGCATCATGTACCGGAAGTTCACTACAGAGAGTGATGT 2258
Sbjct 1837 -------------------------------------------------------------------------- 1836
Query 2259 ATGGAGCTTCGGGGTGATCCTCTGGGAGATCTTCACCTATGGAAAGCAGCCATGGTTCCAACTCTCAAACACGG 2332
Sbjct 1837 -------------------------------------------------------------------------- 1836
Query 2333 AGGTCATTGAGTGCATTACCCAAGGTCGTGTTTTGGAGCGGCCCCGAGTCTGCCCCAAAGAGGTGTACGATGTC 2406
Sbjct 1837 -------------------------------------------------------------------------- 1836
Query 2407 ATGCTGGGGTGCTGGCAGAGGGAACCACAGCAGCGGTTGAACATCAAGGAGATCTACAAAATCCTCCATGCTTT 2480
Sbjct 1837 -------------------------------------------------------------------------- 1836
Query 2481 GGGGAAGGCCACCCCAATCTACCTGGACATTCTTGGC 2517
Sbjct 1837 ------------------------------------- 1836
