Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_14737
• Subject: NM_001278549.2
• Aligned Length: 1368
• Identities: 1308
• Gaps: 60

Alignment

Query    1  ATGAGGCTGGCGCGGCTGCTTCGCGGAGCCGCCTTGGCCGGCCCGGGCCCGGGGCTGCGCGCCGCCGGCTTCAG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAGGCTGGCGCGGCTGCTTCGCGGAGCCGCCTTGGCCGGCCCGGGCCCGGGGCTGCGCGCCGCCGGCTTCAG  74

Query   75  CCGCAGCTTCAGCTCGGACTCGGGCTCCAGCCCGGCGTCCGAGCGCGGCGTTCCGGGCCAGGTGGACTTCTACG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCGCAGCTTCAGCTCGGACTCGGGCTCCAGCCCGGCGTCCGAGCGCGGCGTTCCGGGCCAGGTGGACTTCTACG  148

Query  149  CGCGCTTCTCGCCGTCCCCGCTCTCCATGAAGCAGTTCCTGGACTTCGGATCAGTGAATGCTTGTGAAAAGACC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CGCGCTTCTCGCCGTCCCCGCTCTCCATGAAGCAGTTCCTGGACTTCGGATCAGTGAATGCTTGTGAAAAGACC  222

Query  223  TCATTTATGTTTCTGCGGCAAGAGTTGCCTGTCAGACTGGCAAATATAATGAAAGAAATAAGTCTCCTTCCAGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TCATTTATGTTTCTGCGGCAAGAGTTGCCTGTCAGACTGGCAAATATAATGAAAGAAATAAGTCTCCTTCCAGA  296

Query  297  TAATCTTCTCAGGACACCATCCGTTCAATTGGTACAAAGCTGGTATATCCAGAGTCTTCAGGAGCTTCTTGATT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TAATCTTCTCAGGACACCATCCGTTCAATTGGTACAAAGCTGGTATATCCAGAGTCTTCAGGAGCTTCTTGATT  370

Query  371  TTAAGGACAAAAGTGCTGAGGATGCTAAAGCTATTTATGA----------------------------------  410
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                                  
Sbjct  371  TTAAGGACAAAAGTGCTGAGGATGCTAAAGCTATTTATGAAAGGCCTAGAAGAACATGGTTGCAGGTCTCTAGT  444

Query  411  --------------------------CTTTACAGATACTGTGATACGGATCAGAAACCGACACAATGATGTCAT  458
                                      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TTATGCTGTATGGCCTGCAAGATGATCTTTACAGATACTGTGATACGGATCAGAAACCGACACAATGATGTCAT  518

Query  459  TCCCACAATGGCCCAGGGTGTGATTGAATACAAGGAGAGCTTTGGGGTGGATCCTGTCACCAGCCAGAATGTTC  532
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TCCCACAATGGCCCAGGGTGTGATTGAATACAAGGAGAGCTTTGGGGTGGATCCTGTCACCAGCCAGAATGTTC  592

Query  533  AGTACTTTTTGGATCGATTCTACATGAGTCGCATTTCAATTAGAATGTTACTCAATCAGCACTCTTTATTGTTT  606
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AGTACTTTTTGGATCGATTCTACATGAGTCGCATTTCAATTAGAATGTTACTCAATCAGCACTCTTTATTGTTT  666

Query  607  GGTGGAAAAGGCAAAGGAAGTCCATCTCATCGAAAACACATTGGAAGCATAAATCCAAACTGCAATGTACTTGA  680
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GGTGGAAAAGGCAAAGGAAGTCCATCTCATCGAAAACACATTGGAAGCATAAATCCAAACTGCAATGTACTTGA  740

Query  681  AGTTATTAAAGATGGCTATGAAAATGCTAGGCGTCTGTGTGATTTGTATTATATTAACTCTCCCGAACTAGAAC  754
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AGTTATTAAAGATGGCTATGAAAATGCTAGGCGTCTGTGTGATTTGTATTATATTAACTCTCCCGAACTAGAAC  814

Query  755  TTGAAGAACTAAATGCAAAATCACCAGGACAGCCAATACAAGTGGTTTATGTACCATCCCATCTCTATCACATG  828
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TTGAAGAACTAAATGCAAAATCACCAGGACAGCCAATACAAGTGGTTTATGTACCATCCCATCTCTATCACATG  888

Query  829  GTGTTTGAACTTTTCAAGAATGCAATGAGAGCCACTATGGAACACCATGCCAACAGAGGTGTTTACCCCCCTAT  902
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GTGTTTGAACTTTTCAAGAATGCAATGAGAGCCACTATGGAACACCATGCCAACAGAGGTGTTTACCCCCCTAT  962

Query  903  TCAAGTTCATGTCACGCTGGGTAATGAGGATTTGACTGTGAAGATGAGTGACCGAGGAGGTGGCGTTCCTTTGA  976
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TCAAGTTCATGTCACGCTGGGTAATGAGGATTTGACTGTGAAGATGAGTGACCGAGGAGGTGGCGTTCCTTTGA  1036

Query  977  GGAAAATTGACAGACTTTTCAACTACATGTATTCAACTGCACCAAGACCTCGTGTTGAGACCTCCCGCGCAGTG  1050
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GGAAAATTGACAGACTTTTCAACTACATGTATTCAACTGCACCAAGACCTCGTGTTGAGACCTCCCGCGCAGTG  1110

Query 1051  CCTCTGGCTGGTTTTGGTTATGGATTGCCCATATCACGTCTTTACGCACAATACTTCCAAGGAGACCTGAAGCT  1124
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CCTCTGGCTGGTTTTGGTTATGGATTGCCCATATCACGTCTTTACGCACAATACTTCCAAGGAGACCTGAAGCT  1184

Query 1125  GTATTCCCTAGAGGGTTACGGGACAGATGCAGTTATCTACATTAAGGCTCTGTCAACAGACTCAATAGAAAGAC  1198
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GTATTCCCTAGAGGGTTACGGGACAGATGCAGTTATCTACATTAAGGCTCTGTCAACAGACTCAATAGAAAGAC  1258

Query 1199  TCCCAGTGTATAACAAAGCTGCCTGGAAGCATTACAACACCAACCACGAGGCTGATGACTGGTGCGTCCCCAGC  1272
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TCCCAGTGTATAACAAAGCTGCCTGGAAGCATTACAACACCAACCACGAGGCTGATGACTGGTGCGTCCCCAGC  1332

Query 1273  AGAGAACCCAAAGACATGACGACGTTCCGCAGTGCC  1308
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  AGAGAACCCAAAGACATGACGACGTTCCGCAGTGCC  1368