Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_14737
• Subject: NM_172665.5
• Aligned Length: 1327
• Identities: 1137
• Gaps: 44

Alignment

Query    1  ATGAGGCTGGCGCGGCTGCTTCGCGGAGCCGCCTTGGCCGGCCCG-------GGCCCGGGGCTGCGCGCCG---  64
            |||||||||||..|||||||.||            ||.||||.||       ||||    |||..||||||   
Sbjct    1  ATGAGGCTGGCAAGGCTGCTGCG------------GGGCGGCACGAGCGTCAGGCC----GCTCTGCGCCGTCC  58

Query   65  CCGGCTTCAGCCGCA-----GCTTCAG-CTCGGACTCGGGCTCCAGCCCGGCGTCCGAGCGCGGCGTTCCGGGC  132
            ||.||..||||||.|     ||.||.| |||||.||||||.|||.|.||||||||.||||..||||||||||||
Sbjct   59  CCTGCGCCAGCCGTAGCCTGGCCTCGGCCTCGGCCTCGGGTTCCGGGCCGGCGTCGGAGCTTGGCGTTCCGGGC  132

Query  133  CAGGTGGACTTCTACGCGCGCTTCTCGCCGTCCCCGCTCTCCATGAAGCAGTTCCTGGACTTCGGATCAGTGAA  206
            ||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  133  CAGGTGGACTTCTATGCGCGCTTCTCGCCGTCGCCACTCTCCATGAAGCAGTTCCTGGACTTCGGGTCAGTGAA  206

Query  207  TGCTTGTGAAAAGACCTCATTTATGTTTCTGCGGCAAGAGTTGCCTGTCAGACTGGCAAATATAATGAAAGAAA  280
            ||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  207  TGCTTGTGAAAAGACCTCGTTTATGTTTCTGCGACAAGAGTTGCCTGTTAGATTGGCAAATATAATGAAAGAAA  280

Query  281  TAAGTCTCCTTCCAGATAATCTTCTCAGGACACCATCCGTTCAATTGGTACAAAGCTGGTATATCCAGAGTCTT  354
            |.||.|||||.||.||.||||||||||||||.||||||||.||..||||.|||||.|||||||||||.||.|||
Sbjct  281  TCAGCCTCCTCCCCGACAATCTTCTCAGGACCCCATCCGTACAGCTGGTGCAAAGTTGGTATATCCAAAGCCTT  354

Query  355  CAGGAGCTTCTTGATTTTAAGGACAAAAGTGCTGAGGATGCTAAAGCTATTTATGACTTTACAGATACTGTGAT  428
            ||||||.|.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||.||||||||||.||.|||||.||.|||||
Sbjct  355  CAGGAGTTGCTTGATTTTAAAGACAAAAGTGCTGAAGATGCTAAAACTATTTATGAATTCACAGACACAGTGAT  428

Query  429  ACGGATCAGAAACCGACACAATGATGTCATTCCCACAATGGCCCAGGGTGTGATTGAATACAAGGAGAGCTTTG  502
            |.|||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.||||||||||||||||||.|
Sbjct  429  AAGGATCAGAAACCGGCACAATGATGTCATTCCCACCATGGCCCAGGGTGTGACTGAATACAAGGAGAGCTTCG  502

Query  503  GGGTGGATCCTGTCACCAGCCAGAATGTTCAGTACTTTTTGGATCGATTCTACATGAGTCGCATTTCAATTAGA  576
            ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  503  GGGTGGATCCTGTCACCAGCCAAAATGTTCAGTACTTTTTGGATCGATTCTACATGAGTCGCATCTCAATTAGA  576

Query  577  ATGTTACTCAATCAGCACTCTTTATTGTTTGGTGGAAAAGGCAAAGGAAGTCCATCTCATCGAAAACACATTGG  650
            |||.|||||||.||||||||.||||||||.||||||      |||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  577  ATGCTACTCAACCAGCACTCCTTATTGTTCGGTGGA------AAAGGAAGTCCATCTCATCGAAAGCACATTGG  644

Query  651  AAGCATAAATCCAAACTGCAATGTACTTGAAGTTATTAAAGATGGCTATGAAAATGCTAGGCGTCTGTGTGATT  724
            |||||||||||||||||||.|.||..|.||.||.|||||||||||||||||.||.||||||||.||.|||||||
Sbjct  645  AAGCATAAATCCAAACTGCGACGTGGTGGAGGTCATTAAAGATGGCTATGAGAACGCTAGGCGGCTTTGTGATT  718

Query  725  TGTATTATATTAACTCTCCCGAACTAGAACTTGAAGAACTAAATGCAAAATCACCAGGACAGCCAATACAAGTG  798
            ||||||||.||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  719  TGTATTATGTTAACTCTCCTGAACTTGAACTTGAAGAACTAAATGCGAAATCACCAGGACAGACAATACAAGTG  792

Query  799  GTTTATGTACCATCCCATCTCTATCACATGGTGTTTGAACTTTTCAAGAATGCAATGAGAGCCACTATGGAACA  872
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||.|||||.||
Sbjct  793  GTTTATGTACCATCCCATCTCTATCACATGGTGTTTGAACTGTTCAAGAATGCCATGAGAGCGACCATGGAGCA  866

Query  873  CCATGCCAACAGAGGTGTTTACCCCCCTATTCAAGTTCATGTCACGCTGGGTAATGAGGATTTGACTGTGAAGA  946
            |||.||..|||.|||.|||||.|||||.|||||.|||||.|||||||||||..|.||||||.||||||||||||
Sbjct  867  CCACGCGGACAAAGGCGTTTATCCCCCGATTCAGGTTCACGTCACGCTGGGCGAGGAGGATCTGACTGTGAAGA  940

Query  947  TGAGTGACCGAGGAGGTGGCGTTCCTTTGAGGAAAATTGACAGACTTTTCAACTACATGTATTCAACTGCACCA  1020
            ||||||||||.|||||.||.|||||..|||||||.||.||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||.
Sbjct  941  TGAGTGACCGGGGAGGCGGTGTTCCACTGAGGAAGATCGACAGACTCTTCAACTACATGTACTCAACCGCACCC  1014

Query 1021  AGACCTCGTGTTGAGACCTCCCGCGCAGTGCCTCTGGCTGGTTTTGGTTATGGATTGCCCATATCACGTCTTTA  1094
            .|.|||||||||||.||.|||||.||.|||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||.||
Sbjct 1015  CGGCCTCGTGTTGAAACGTCCCGTGCTGTGCCCCTGGCTGGGTTTGGTTACGGATTGCCCATATCACGCCTCTA  1088

Query 1095  CGCACAATACTTCCAAGGAGACCTGAAGCTGTATTCCCTAGAGGGTTACGGGACAGATGCAGTTATCTACATTA  1168
            .|||||.||||||||.||||||||.||||||||||||.|||||||.||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1089  TGCACAGTACTTCCAGGGAGACCTAAAGCTGTATTCCTTAGAGGGCTACGGGACAGATGCGGTTATCTACATTA  1162

Query 1169  AGGCTCTGTCAACAGACTCAATAGAAAGACTCCCAGTGTATAACAAAGCTGCCTGGAAGCATTACAACACCAAC  1242
            ||||||||||.|||||.||..|.||.||||||||.|||||.||.|||||.|||||||||||||||||..|||||
Sbjct 1163  AGGCTCTGTCGACAGAATCCGTCGAGAGACTCCCTGTGTACAATAAAGCCGCCTGGAAGCATTACAAAGCCAAC  1236

Query 1243  CACGAGGCTGATGACTGGTGCGTCCCCAGCAGAGAACCCAAAGACATGACGACGTTCCGCAGTGCC---  1308
            |||||||||||.||||||||.||.||||||.||||.||.|||||||||||.||.|||||.||   |   
Sbjct 1237  CACGAGGCTGACGACTGGTGTGTGCCCAGCCGAGAGCCGAAAGACATGACCACATTCCGAAG---CTCT  1302