Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_14737
• Subject: XM_011239444.1
• Aligned Length: 1438
• Identities: 1137
• Gaps: 155

Alignment

Query    1  ATGAGGCTGGCGCGGCTGCTTCGCGGAGCCGCCTTGGCCGGCCCG-------GGCCCGGGGCTGCGCGCCG---  64
            |||||||||||..|||||||.||            ||.||||.||       ||||    |||..||||||   
Sbjct    1  ATGAGGCTGGCAAGGCTGCTGCG------------GGGCGGCACGAGCGTCAGGCC----GCTCTGCGCCGTCC  58

Query   65  CCGGCTTCAGCCGCA-----GCTTCAG-CTCGGACTCGGGCTCCAGCCCGGCGTCCGAGCGCGGCGTTCCGGGC  132
            ||.||..||||||.|     ||.||.| |||||.||||||.|||.|.||||||||.||||..||||||||||||
Sbjct   59  CCTGCGCCAGCCGTAGCCTGGCCTCGGCCTCGGCCTCGGGTTCCGGGCCGGCGTCGGAGCTTGGCGTTCCGGGC  132

Query  133  CAGGTGGACTTCTACGCGCGCTTCTCGCCGTCCCCGCTCTCCATGAAGCAGTTCCTGGACTTCGGATCAGTGAA  206
            ||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  133  CAGGTGGACTTCTATGCGCGCTTCTCGCCGTCGCCACTCTCCATGAAGCAGTTCCTGGACTTCGGGTCAGTGAA  206

Query  207  TGCTTGTGAAAAGACCTCATTTATGTTTCTGCGGCAAGAGTTGCCTGTCAGACTGGCAAATATAATGAAAGAAA  280
            ||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  207  TGCTTGTGAAAAGACCTCGTTTATGTTTCTGCGACAAGAGTTGCCTGTTAGATTGGCAAATATAATGAAAGAAA  280

Query  281  TAAGTCTCCTTCCAGATAATCTTCTCAGGACACCATCCGTTCAATTGGTACAAAG-------------------  335
            |.||.|||||.||.||.||||||||||||||.||||||||.||..||||.|||||                   
Sbjct  281  TCAGCCTCCTCCCCGACAATCTTCTCAGGACCCCATCCGTACAGCTGGTGCAAAGTTGGCCTGGAGCTCAGCAT  354

Query  336  --------------------------------------------------------------------------  335
                                                                                      
Sbjct  355  ACAGACCAGGTTGACATGGAACTGGCAGCGATTCTTTTGCCTCTACCTCTCTGGTATTACAGGGATGTGCTTCC  428

Query  336  ------------------CTGGTATATCCAGAGTCTTCAGGAGCTTCTTGATTTTAAGGACAAAAGTGCTGAGG  391
                              |.||||||||||.||.|||||||||.|.|||||||||||.||||||||||||||.|
Sbjct  429  GTGTCCAGTTACTGTGTCCAGGTATATCCAAAGCCTTCAGGAGTTGCTTGATTTTAAAGACAAAAGTGCTGAAG  502

Query  392  ATGCTAAAGCTATTTATGACTTTACAGATACTGTGATACGGATCAGAAACCGACACAATGATGTCATTCCCACA  465
            ||||||||.||||||||||.||.|||||.||.||||||.|||||||||||||.||||||||||||||||||||.
Sbjct  503  ATGCTAAAACTATTTATGAATTCACAGACACAGTGATAAGGATCAGAAACCGGCACAATGATGTCATTCCCACC  576

Query  466  ATGGCCCAGGGTGTGATTGAATACAAGGAGAGCTTTGGGGTGGATCCTGTCACCAGCCAGAATGTTCAGTACTT  539
            ||||||||||||||||.||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct  577  ATGGCCCAGGGTGTGACTGAATACAAGGAGAGCTTCGGGGTGGATCCTGTCACCAGCCAAAATGTTCAGTACTT  650

Query  540  TTTGGATCGATTCTACATGAGTCGCATTTCAATTAGAATGTTACTCAATCAGCACTCTTTATTGTTTGGTGGAA  613
            |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.|||||||.||||||||.||||||||.|||||| 
Sbjct  651  TTTGGATCGATTCTACATGAGTCGCATCTCAATTAGAATGCTACTCAACCAGCACTCCTTATTGTTCGGTGGA-  723

Query  614  AAGGCAAAGGAAGTCCATCTCATCGAAAACACATTGGAAGCATAAATCCAAACTGCAATGTACTTGAAGTTATT  687
                 |||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.|.||..|.||.||.|||
Sbjct  724  -----AAAGGAAGTCCATCTCATCGAAAGCACATTGGAAGCATAAATCCAAACTGCGACGTGGTGGAGGTCATT  792

Query  688  AAAGATGGCTATGAAAATGCTAGGCGTCTGTGTGATTTGTATTATATTAACTCTCCCGAACTAGAACTTGAAGA  761
            ||||||||||||||.||.||||||||.||.|||||||||||||||.||||||||||.|||||.|||||||||||
Sbjct  793  AAAGATGGCTATGAGAACGCTAGGCGGCTTTGTGATTTGTATTATGTTAACTCTCCTGAACTTGAACTTGAAGA  866

Query  762  ACTAAATGCAAAATCACCAGGACAGCCAATACAAGTGGTTTATGTACCATCCCATCTCTATCACATGGTGTTTG  835
            |||||||||.|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  867  ACTAAATGCGAAATCACCAGGACAGACAATACAAGTGGTTTATGTACCATCCCATCTCTATCACATGGTGTTTG  940

Query  836  AACTTTTCAAGAATGCAATGAGAGCCACTATGGAACACCATGCCAACAGAGGTGTTTACCCCCCTATTCAAGTT  909
            ||||.|||||||||||.||||||||.||.|||||.|||||.||..|||.|||.|||||.|||||.|||||.|||
Sbjct  941  AACTGTTCAAGAATGCCATGAGAGCGACCATGGAGCACCACGCGGACAAAGGCGTTTATCCCCCGATTCAGGTT  1014

Query  910  CATGTCACGCTGGGTAATGAGGATTTGACTGTGAAGATGAGTGACCGAGGAGGTGGCGTTCCTTTGAGGAAAAT  983
            ||.|||||||||||..|.||||||.||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||..|||||||.||
Sbjct 1015  CACGTCACGCTGGGCGAGGAGGATCTGACTGTGAAGATGAGTGACCGGGGAGGCGGTGTTCCACTGAGGAAGAT  1088

Query  984  TGACAGACTTTTCAACTACATGTATTCAACTGCACCAAGACCTCGTGTTGAGACCTCCCGCGCAGTGCCTCTGG  1057
            .||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||..|.|||||||||||.||.|||||.||.|||||.||||
Sbjct 1089  CGACAGACTCTTCAACTACATGTACTCAACCGCACCCCGGCCTCGTGTTGAAACGTCCCGTGCTGTGCCCCTGG  1162

Query 1058  CTGGTTTTGGTTATGGATTGCCCATATCACGTCTTTACGCACAATACTTCCAAGGAGACCTGAAGCTGTATTCC  1131
            ||||.||||||||.|||||||||||||||||.||.||.|||||.||||||||.||||||||.||||||||||||
Sbjct 1163  CTGGGTTTGGTTACGGATTGCCCATATCACGCCTCTATGCACAGTACTTCCAGGGAGACCTAAAGCTGTATTCC  1236

Query 1132  CTAGAGGGTTACGGGACAGATGCAGTTATCTACATTAAGGCTCTGTCAACAGACTCAATAGAAAGACTCCCAGT  1205
            .|||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||..|.||.||||||||.||
Sbjct 1237  TTAGAGGGCTACGGGACAGATGCGGTTATCTACATTAAGGCTCTGTCGACAGAATCCGTCGAGAGACTCCCTGT  1310

Query 1206  GTATAACAAAGCTGCCTGGAAGCATTACAACACCAACCACGAGGCTGATGACTGGTGCGTCCCCAGCAGAGAAC  1279
            |||.||.|||||.|||||||||||||||||..||||||||||||||||.||||||||.||.||||||.||||.|
Sbjct 1311  GTACAATAAAGCCGCCTGGAAGCATTACAAAGCCAACCACGAGGCTGACGACTGGTGTGTGCCCAGCCGAGAGC  1384

Query 1280  CCAAAGACATGACGACGTTCCGCAGTGCC---  1308
            |.|||||||||||.||.|||||.||   |   
Sbjct 1385  CGAAAGACATGACCACATTCCGAAG---CTCT  1413