Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_14737
• Subject: XM_011239446.2
• Aligned Length: 1422
• Identities: 950
• Gaps: 351

Alignment

Query    1  ATGAGGCTGGCGCGGCTGCTTCGCGGAGCCGCCTTGGCCGGCCCGGGCCCGGGGCTGCGCGCCGCCGGCTTCAG  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CCGCAGCTTCAGCTCGGACTCGGGCTCCAGCCCGGCGTCCGAGCGCGGCGTTCCGGGCCAGGTGGACTTCTACG  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  CGCGCTTCTCGCCGTCCCCGCTCTCCATGAAGCAGTTCCTGGACTTCGGATCAGTGAATGCTTGTGAAAAGACC  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  TCATTTATGTTTCTGCGGCAAGAGTTGCCTGTCAGACTGGCAAATATAATGAAAGAAATAAGTCTCCTTCCAGA  296
                  |||||||||||.||||||||||||||.|||.||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.||
Sbjct    1  ------ATGTTTCTGCGACAAGAGTTGCCTGTTAGATTGGCAAATATAATGAAAGAAATCAGCCTCCTCCCCGA  68

Query  297  TAATCTTCTCAGGACACCATCCGTTCAATTGGTACAAAG-----------------------------------  335
            .||||||||||||||.||||||||.||..||||.|||||                                   
Sbjct   69  CAATCTTCTCAGGACCCCATCCGTACAGCTGGTGCAAAGTTGGCCTGGAGCTCAGCATACAGACCAGGTTGACA  142

Query  336  --------------------------------------------------------------------------  335
                                                                                      
Sbjct  143  TGGAACTGGCAGCGATTCTTTTGCCTCTACCTCTCTGGTATTACAGGGATGTGCTTCCGTGTCCAGTTACTGTG  216

Query  336  --CTGGTATATCCAGAGTCTTCAGGAGCTTCTTGATTTTAAGGACAAAAGTGCTGAGGATGCTAAAGCTATTTA  407
              |.||||||||||.||.|||||||||.|.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||.|||||||
Sbjct  217  TCCAGGTATATCCAAAGCCTTCAGGAGTTGCTTGATTTTAAAGACAAAAGTGCTGAAGATGCTAAAACTATTTA  290

Query  408  TGACTTTACAGATACTGTGATACGGATCAGAAACCGACACAATGATGTCATTCCCACAATGGCCCAGGGTGTGA  481
            |||.||.|||||.||.||||||.|||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  291  TGAATTCACAGACACAGTGATAAGGATCAGAAACCGGCACAATGATGTCATTCCCACCATGGCCCAGGGTGTGA  364

Query  482  TTGAATACAAGGAGAGCTTTGGGGTGGATCCTGTCACCAGCCAGAATGTTCAGTACTTTTTGGATCGATTCTAC  555
            .||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  365  CTGAATACAAGGAGAGCTTCGGGGTGGATCCTGTCACCAGCCAAAATGTTCAGTACTTTTTGGATCGATTCTAC  438

Query  556  ATGAGTCGCATTTCAATTAGAATGTTACTCAATCAGCACTCTTTATTGTTTGGTGGAAAAGGCAAAGGAAGTCC  629
            |||||||||||.||||||||||||.|||||||.||||||||.||||||||.||||||      |||||||||||
Sbjct  439  ATGAGTCGCATCTCAATTAGAATGCTACTCAACCAGCACTCCTTATTGTTCGGTGGA------AAAGGAAGTCC  506

Query  630  ATCTCATCGAAAACACATTGGAAGCATAAATCCAAACTGCAATGTACTTGAAGTTATTAAAGATGGCTATGAAA  703
            ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.|.||..|.||.||.|||||||||||||||||.|
Sbjct  507  ATCTCATCGAAAGCACATTGGAAGCATAAATCCAAACTGCGACGTGGTGGAGGTCATTAAAGATGGCTATGAGA  580

Query  704  ATGCTAGGCGTCTGTGTGATTTGTATTATATTAACTCTCCCGAACTAGAACTTGAAGAACTAAATGCAAAATCA  777
            |.||||||||.||.|||||||||||||||.||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  581  ACGCTAGGCGGCTTTGTGATTTGTATTATGTTAACTCTCCTGAACTTGAACTTGAAGAACTAAATGCGAAATCA  654

Query  778  CCAGGACAGCCAATACAAGTGGTTTATGTACCATCCCATCTCTATCACATGGTGTTTGAACTTTTCAAGAATGC  851
            |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  655  CCAGGACAGACAATACAAGTGGTTTATGTACCATCCCATCTCTATCACATGGTGTTTGAACTGTTCAAGAATGC  728

Query  852  AATGAGAGCCACTATGGAACACCATGCCAACAGAGGTGTTTACCCCCCTATTCAAGTTCATGTCACGCTGGGTA  925
            .||||||||.||.|||||.|||||.||..|||.|||.|||||.|||||.|||||.|||||.|||||||||||..
Sbjct  729  CATGAGAGCGACCATGGAGCACCACGCGGACAAAGGCGTTTATCCCCCGATTCAGGTTCACGTCACGCTGGGCG  802

Query  926  ATGAGGATTTGACTGTGAAGATGAGTGACCGAGGAGGTGGCGTTCCTTTGAGGAAAATTGACAGACTTTTCAAC  999
            |.||||||.||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||..|||||||.||.||||||||.||||||
Sbjct  803  AGGAGGATCTGACTGTGAAGATGAGTGACCGGGGAGGCGGTGTTCCACTGAGGAAGATCGACAGACTCTTCAAC  876

Query 1000  TACATGTATTCAACTGCACCAAGACCTCGTGTTGAGACCTCCCGCGCAGTGCCTCTGGCTGGTTTTGGTTATGG  1073
            ||||||||.|||||.|||||..|.|||||||||||.||.|||||.||.|||||.||||||||.||||||||.||
Sbjct  877  TACATGTACTCAACCGCACCCCGGCCTCGTGTTGAAACGTCCCGTGCTGTGCCCCTGGCTGGGTTTGGTTACGG  950

Query 1074  ATTGCCCATATCACGTCTTTACGCACAATACTTCCAAGGAGACCTGAAGCTGTATTCCCTAGAGGGTTACGGGA  1147
            |||||||||||||||.||.||.|||||.||||||||.||||||||.||||||||||||.|||||||.|||||||
Sbjct  951  ATTGCCCATATCACGCCTCTATGCACAGTACTTCCAGGGAGACCTAAAGCTGTATTCCTTAGAGGGCTACGGGA  1024

Query 1148  CAGATGCAGTTATCTACATTAAGGCTCTGTCAACAGACTCAATAGAAAGACTCCCAGTGTATAACAAAGCTGCC  1221
            |||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||..|.||.||||||||.|||||.||.|||||.|||
Sbjct 1025  CAGATGCGGTTATCTACATTAAGGCTCTGTCGACAGAATCCGTCGAGAGACTCCCTGTGTACAATAAAGCCGCC  1098

Query 1222  TGGAAGCATTACAACACCAACCACGAGGCTGATGACTGGTGCGTCCCCAGCAGAGAACCCAAAGACATGACGAC  1295
            ||||||||||||||..||||||||||||||||.||||||||.||.||||||.||||.||.|||||||||||.||
Sbjct 1099  TGGAAGCATTACAAAGCCAACCACGAGGCTGACGACTGGTGTGTGCCCAGCCGAGAGCCGAAAGACATGACCAC  1172

Query 1296  GTTCCGCAGTGCC---  1308
            .|||||.||   |   
Sbjct 1173  ATTCCGAAG---CTCT  1185