Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_14737
• Subject: XM_011511344.2
• Aligned Length: 1368
• Identities: 1080
• Gaps: 288

Alignment

Query    1  ATGAGGCTGGCGCGGCTGCTTCGCGGAGCCGCCTTGGCCGGCCCGGGCCCGGGGCTGCGCGCCGCCGGCTTCAG  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CCGCAGCTTCAGCTCGGACTCGGGCTCCAGCCCGGCGTCCGAGCGCGGCGTTCCGGGCCAGGTGGACTTCTACG  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  CGCGCTTCTCGCCGTCCCCGCTCTCCATGAAGCAGTTCCTGGACTTCGGATCAGTGAATGCTTGTGAAAAGACC  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  TCATTTATGTTTCTGCGGCAAGAGTTGCCTGTCAGACTGGCAAATATAATGAAAGAAATAAGTCTCCTTCCAGA  296
                  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ------ATGTTTCTGCGGCAAGAGTTGCCTGTCAGACTGGCAAATATAATGAAAGAAATAAGTCTCCTTCCAGA  68

Query  297  TAATCTTCTCAGGACACCATCCGTTCAATTGGTACAAAGCTGGTATATCCAGAGTCTTCAGGAGCTTCTTGATT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   69  TAATCTTCTCAGGACACCATCCGTTCAATTGGTACAAAGCTGGTATATCCAGAGTCTTCAGGAGCTTCTTGATT  142

Query  371  TTAAGGACAAAAGTGCTGAGGATGCTAAAGCTATTTATGA----------------------------------  410
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                                  
Sbjct  143  TTAAGGACAAAAGTGCTGAGGATGCTAAAGCTATTTATGAAAGGCCTAGAAGAACATGGTTGCAGGTCTCTAGT  216

Query  411  --------------------------CTTTACAGATACTGTGATACGGATCAGAAACCGACACAATGATGTCAT  458
                                      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  217  TTATGCTGTATGGCCTGCAAGATGATCTTTACAGATACTGTGATACGGATCAGAAACCGACACAATGATGTCAT  290

Query  459  TCCCACAATGGCCCAGGGTGTGATTGAATACAAGGAGAGCTTTGGGGTGGATCCTGTCACCAGCCAGAATGTTC  532
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  291  TCCCACAATGGCCCAGGGTGTGATTGAATACAAGGAGAGCTTTGGGGTGGATCCTGTCACCAGCCAGAATGTTC  364

Query  533  AGTACTTTTTGGATCGATTCTACATGAGTCGCATTTCAATTAGAATGTTACTCAATCAGCACTCTTTATTGTTT  606
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  365  AGTACTTTTTGGATCGATTCTACATGAGTCGCATTTCAATTAGAATGTTACTCAATCAGCACTCTTTATTGTTT  438

Query  607  GGTGGAAAAGGCAAAGGAAGTCCATCTCATCGAAAACACATTGGAAGCATAAATCCAAACTGCAATGTACTTGA  680
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  439  GGTGGAAAAGGCAAAGGAAGTCCATCTCATCGAAAACACATTGGAAGCATAAATCCAAACTGCAATGTACTTGA  512

Query  681  AGTTATTAAAGATGGCTATGAAAATGCTAGGCGTCTGTGTGATTTGTATTATATTAACTCTCCCGAACTAGAAC  754
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  513  AGTTATTAAAGATGGCTATGAAAATGCTAGGCGTCTGTGTGATTTGTATTATATTAACTCTCCCGAACTAGAAC  586

Query  755  TTGAAGAACTAAATGCAAAATCACCAGGACAGCCAATACAAGTGGTTTATGTACCATCCCATCTCTATCACATG  828
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  587  TTGAAGAACTAAATGCAAAATCACCAGGACAGCCAATACAAGTGGTTTATGTACCATCCCATCTCTATCACATG  660

Query  829  GTGTTTGAACTTTTCAAGAATGCAATGAGAGCCACTATGGAACACCATGCCAACAGAGGTGTTTACCCCCCTAT  902
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  661  GTGTTTGAACTTTTCAAGAATGCAATGAGAGCCACTATGGAACACCATGCCAACAGAGGTGTTTACCCCCCTAT  734

Query  903  TCAAGTTCATGTCACGCTGGGTAATGAGGATTTGACTGTGAAGATGAGTGACCGAGGAGGTGGCGTTCCTTTGA  976
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  735  TCAAGTTCATGTCACGCTGGGTAATGAGGATTTGACTGTGAAGATGAGTGACCGAGGAGGTGGCGTTCCTTTGA  808

Query  977  GGAAAATTGACAGACTTTTCAACTACATGTATTCAACTGCACCAAGACCTCGTGTTGAGACCTCCCGCGCAGTG  1050
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  809  GGAAAATTGACAGACTTTTCAACTACATGTATTCAACTGCACCAAGACCTCGTGTTGAGACCTCCCGCGCAGTG  882

Query 1051  CCTCTGGCTGGTTTTGGTTATGGATTGCCCATATCACGTCTTTACGCACAATACTTCCAAGGAGACCTGAAGCT  1124
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  883  CCTCTGGCTGGTTTTGGTTATGGATTGCCCATATCACGTCTTTACGCACAATACTTCCAAGGAGACCTGAAGCT  956

Query 1125  GTATTCCCTAGAGGGTTACGGGACAGATGCAGTTATCTACATTAAGGCTCTGTCAACAGACTCAATAGAAAGAC  1198
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  957  GTATTCCCTAGAGGGTTACGGGACAGATGCAGTTATCTACATTAAGGCTCTGTCAACAGACTCAATAGAAAGAC  1030

Query 1199  TCCCAGTGTATAACAAAGCTGCCTGGAAGCATTACAACACCAACCACGAGGCTGATGACTGGTGCGTCCCCAGC  1272
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1031  TCCCAGTGTATAACAAAGCTGCCTGGAAGCATTACAACACCAACCACGAGGCTGATGACTGGTGCGTCCCCAGC  1104

Query 1273  AGAGAACCCAAAGACATGACGACGTTCCGCAGTGCC  1308
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1105  AGAGAACCCAAAGACATGACGACGTTCCGCAGTGCC  1140