Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_14737
• Subject: XM_011511345.3
• Aligned Length: 1308
• Identities: 1080
• Gaps: 228

Alignment

Query    1  ATGAGGCTGGCGCGGCTGCTTCGCGGAGCCGCCTTGGCCGGCCCGGGCCCGGGGCTGCGCGCCGCCGGCTTCAG  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CCGCAGCTTCAGCTCGGACTCGGGCTCCAGCCCGGCGTCCGAGCGCGGCGTTCCGGGCCAGGTGGACTTCTACG  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  CGCGCTTCTCGCCGTCCCCGCTCTCCATGAAGCAGTTCCTGGACTTCGGATCAGTGAATGCTTGTGAAAAGACC  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  TCATTTATGTTTCTGCGGCAAGAGTTGCCTGTCAGACTGGCAAATATAATGAAAGAAATAAGTCTCCTTCCAGA  296
                  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ------ATGTTTCTGCGGCAAGAGTTGCCTGTCAGACTGGCAAATATAATGAAAGAAATAAGTCTCCTTCCAGA  68

Query  297  TAATCTTCTCAGGACACCATCCGTTCAATTGGTACAAAGCTGGTATATCCAGAGTCTTCAGGAGCTTCTTGATT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   69  TAATCTTCTCAGGACACCATCCGTTCAATTGGTACAAAGCTGGTATATCCAGAGTCTTCAGGAGCTTCTTGATT  142

Query  371  TTAAGGACAAAAGTGCTGAGGATGCTAAAGCTATTTATGACTTTACAGATACTGTGATACGGATCAGAAACCGA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  143  TTAAGGACAAAAGTGCTGAGGATGCTAAAGCTATTTATGACTTTACAGATACTGTGATACGGATCAGAAACCGA  216

Query  445  CACAATGATGTCATTCCCACAATGGCCCAGGGTGTGATTGAATACAAGGAGAGCTTTGGGGTGGATCCTGTCAC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  217  CACAATGATGTCATTCCCACAATGGCCCAGGGTGTGATTGAATACAAGGAGAGCTTTGGGGTGGATCCTGTCAC  290

Query  519  CAGCCAGAATGTTCAGTACTTTTTGGATCGATTCTACATGAGTCGCATTTCAATTAGAATGTTACTCAATCAGC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  291  CAGCCAGAATGTTCAGTACTTTTTGGATCGATTCTACATGAGTCGCATTTCAATTAGAATGTTACTCAATCAGC  364

Query  593  ACTCTTTATTGTTTGGTGGAAAAGGCAAAGGAAGTCCATCTCATCGAAAACACATTGGAAGCATAAATCCAAAC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  365  ACTCTTTATTGTTTGGTGGAAAAGGCAAAGGAAGTCCATCTCATCGAAAACACATTGGAAGCATAAATCCAAAC  438

Query  667  TGCAATGTACTTGAAGTTATTAAAGATGGCTATGAAAATGCTAGGCGTCTGTGTGATTTGTATTATATTAACTC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  439  TGCAATGTACTTGAAGTTATTAAAGATGGCTATGAAAATGCTAGGCGTCTGTGTGATTTGTATTATATTAACTC  512

Query  741  TCCCGAACTAGAACTTGAAGAACTAAATGCAAAATCACCAGGACAGCCAATACAAGTGGTTTATGTACCATCCC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  513  TCCCGAACTAGAACTTGAAGAACTAAATGCAAAATCACCAGGACAGCCAATACAAGTGGTTTATGTACCATCCC  586

Query  815  ATCTCTATCACATGGTGTTTGAACTTTTCAAGAATGCAATGAGAGCCACTATGGAACACCATGCCAACAGAGGT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  587  ATCTCTATCACATGGTGTTTGAACTTTTCAAGAATGCAATGAGAGCCACTATGGAACACCATGCCAACAGAGGT  660

Query  889  GTTTACCCCCCTATTCAAGTTCATGTCACGCTGGGTAATGAGGATTTGACTGTGAAGATGAGTGACCGAGGAGG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  661  GTTTACCCCCCTATTCAAGTTCATGTCACGCTGGGTAATGAGGATTTGACTGTGAAGATGAGTGACCGAGGAGG  734

Query  963  TGGCGTTCCTTTGAGGAAAATTGACAGACTTTTCAACTACATGTATTCAACTGCACCAAGACCTCGTGTTGAGA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  735  TGGCGTTCCTTTGAGGAAAATTGACAGACTTTTCAACTACATGTATTCAACTGCACCAAGACCTCGTGTTGAGA  808

Query 1037  CCTCCCGCGCAGTGCCTCTGGCTGGTTTTGGTTATGGATTGCCCATATCACGTCTTTACGCACAATACTTCCAA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  809  CCTCCCGCGCAGTGCCTCTGGCTGGTTTTGGTTATGGATTGCCCATATCACGTCTTTACGCACAATACTTCCAA  882

Query 1111  GGAGACCTGAAGCTGTATTCCCTAGAGGGTTACGGGACAGATGCAGTTATCTACATTAAGGCTCTGTCAACAGA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  883  GGAGACCTGAAGCTGTATTCCCTAGAGGGTTACGGGACAGATGCAGTTATCTACATTAAGGCTCTGTCAACAGA  956

Query 1185  CTCAATAGAAAGACTCCCAGTGTATAACAAAGCTGCCTGGAAGCATTACAACACCAACCACGAGGCTGATGACT  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  957  CTCAATAGAAAGACTCCCAGTGTATAACAAAGCTGCCTGGAAGCATTACAACACCAACCACGAGGCTGATGACT  1030

Query 1259  GGTGCGTCCCCAGCAGAGAACCCAAAGACATGACGACGTTCCGCAGTGCC  1308
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1031  GGTGCGTCCCCAGCAGAGAACCCAAAGACATGACGACGTTCCGCAGTGCC  1080