Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_14737
• Subject: XM_017317590.1
• Aligned Length: 1311
• Identities: 950
• Gaps: 240

Alignment

Query    1  ATGAGGCTGGCGCGGCTGCTTCGCGGAGCCGCCTTGGCCGGCCCGGGCCCGGGGCTGCGCGCCGCCGGCTTCAG  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CCGCAGCTTCAGCTCGGACTCGGGCTCCAGCCCGGCGTCCGAGCGCGGCGTTCCGGGCCAGGTGGACTTCTACG  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  CGCGCTTCTCGCCGTCCCCGCTCTCCATGAAGCAGTTCCTGGACTTCGGATCAGTGAATGCTTGTGAAAAGACC  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  TCATTTATGTTTCTGCGGCAAGAGTTGCCTGTCAGACTGGCAAATATAATGAAAGAAATAAGTCTCCTTCCAGA  296
                  |||||||||||.||||||||||||||.|||.||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.||
Sbjct    1  ------ATGTTTCTGCGACAAGAGTTGCCTGTTAGATTGGCAAATATAATGAAAGAAATCAGCCTCCTCCCCGA  68

Query  297  TAATCTTCTCAGGACACCATCCGTTCAATTGGTACAAAGCTGGTATATCCAGAGTCTTCAGGAGCTTCTTGATT  370
            .||||||||||||||.||||||||.||..||||.|||||.|||||||||||.||.|||||||||.|.|||||||
Sbjct   69  CAATCTTCTCAGGACCCCATCCGTACAGCTGGTGCAAAGTTGGTATATCCAAAGCCTTCAGGAGTTGCTTGATT  142

Query  371  TTAAGGACAAAAGTGCTGAGGATGCTAAAGCTATTTATGACTTTACAGATACTGTGATACGGATCAGAAACCGA  444
            ||||.||||||||||||||.|||||||||.||||||||||.||.|||||.||.||||||.|||||||||||||.
Sbjct  143  TTAAAGACAAAAGTGCTGAAGATGCTAAAACTATTTATGAATTCACAGACACAGTGATAAGGATCAGAAACCGG  216

Query  445  CACAATGATGTCATTCCCACAATGGCCCAGGGTGTGATTGAATACAAGGAGAGCTTTGGGGTGGATCCTGTCAC  518
            ||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  217  CACAATGATGTCATTCCCACCATGGCCCAGGGTGTGACTGAATACAAGGAGAGCTTCGGGGTGGATCCTGTCAC  290

Query  519  CAGCCAGAATGTTCAGTACTTTTTGGATCGATTCTACATGAGTCGCATTTCAATTAGAATGTTACTCAATCAGC  592
            ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.|||||||.||||
Sbjct  291  CAGCCAAAATGTTCAGTACTTTTTGGATCGATTCTACATGAGTCGCATCTCAATTAGAATGCTACTCAACCAGC  364

Query  593  ACTCTTTATTGTTTGGTGGAAAAGGCAAAGGAAGTCCATCTCATCGAAAACACATTGGAAGCATAAATCCAAAC  666
            ||||.||||||||.||||||      |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct  365  ACTCCTTATTGTTCGGTGGA------AAAGGAAGTCCATCTCATCGAAAGCACATTGGAAGCATAAATCCAAAC  432

Query  667  TGCAATGTACTTGAAGTTATTAAAGATGGCTATGAAAATGCTAGGCGTCTGTGTGATTTGTATTATATTAACTC  740
            |||.|.||..|.||.||.|||||||||||||||||.||.||||||||.||.|||||||||||||||.|||||||
Sbjct  433  TGCGACGTGGTGGAGGTCATTAAAGATGGCTATGAGAACGCTAGGCGGCTTTGTGATTTGTATTATGTTAACTC  506

Query  741  TCCCGAACTAGAACTTGAAGAACTAAATGCAAAATCACCAGGACAGCCAATACAAGTGGTTTATGTACCATCCC  814
            |||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  507  TCCTGAACTTGAACTTGAAGAACTAAATGCGAAATCACCAGGACAGACAATACAAGTGGTTTATGTACCATCCC  580

Query  815  ATCTCTATCACATGGTGTTTGAACTTTTCAAGAATGCAATGAGAGCCACTATGGAACACCATGCCAACAGAGGT  888
            |||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||.|||||.|||||.||..|||.|||.
Sbjct  581  ATCTCTATCACATGGTGTTTGAACTGTTCAAGAATGCCATGAGAGCGACCATGGAGCACCACGCGGACAAAGGC  654

Query  889  GTTTACCCCCCTATTCAAGTTCATGTCACGCTGGGTAATGAGGATTTGACTGTGAAGATGAGTGACCGAGGAGG  962
            |||||.|||||.|||||.|||||.|||||||||||..|.||||||.||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct  655  GTTTATCCCCCGATTCAGGTTCACGTCACGCTGGGCGAGGAGGATCTGACTGTGAAGATGAGTGACCGGGGAGG  728

Query  963  TGGCGTTCCTTTGAGGAAAATTGACAGACTTTTCAACTACATGTATTCAACTGCACCAAGACCTCGTGTTGAGA  1036
            .||.|||||..|||||||.||.||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||..|.|||||||||||.|
Sbjct  729  CGGTGTTCCACTGAGGAAGATCGACAGACTCTTCAACTACATGTACTCAACCGCACCCCGGCCTCGTGTTGAAA  802

Query 1037  CCTCCCGCGCAGTGCCTCTGGCTGGTTTTGGTTATGGATTGCCCATATCACGTCTTTACGCACAATACTTCCAA  1110
            |.|||||.||.|||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||.||.|||||.||||||||.
Sbjct  803  CGTCCCGTGCTGTGCCCCTGGCTGGGTTTGGTTACGGATTGCCCATATCACGCCTCTATGCACAGTACTTCCAG  876

Query 1111  GGAGACCTGAAGCTGTATTCCCTAGAGGGTTACGGGACAGATGCAGTTATCTACATTAAGGCTCTGTCAACAGA  1184
            ||||||||.||||||||||||.|||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct  877  GGAGACCTAAAGCTGTATTCCTTAGAGGGCTACGGGACAGATGCGGTTATCTACATTAAGGCTCTGTCGACAGA  950

Query 1185  CTCAATAGAAAGACTCCCAGTGTATAACAAAGCTGCCTGGAAGCATTACAACACCAACCACGAGGCTGATGACT  1258
            .||..|.||.||||||||.|||||.||.|||||.|||||||||||||||||..||||||||||||||||.||||
Sbjct  951  ATCCGTCGAGAGACTCCCTGTGTACAATAAAGCCGCCTGGAAGCATTACAAAGCCAACCACGAGGCTGACGACT  1024

Query 1259  GGTGCGTCCCCAGCAGAGAACCCAAAGACATGACGACGTTCCGCAGTGCC---  1308
            ||||.||.||||||.||||.||.|||||||||||.||.|||||.||   |   
Sbjct 1025  GGTGTGTGCCCAGCCGAGAGCCGAAAGACATGACCACATTCCGAAG---CTCT  1074