Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_14737
• Subject: XR_001738775.2
• Aligned Length: 1758
• Identities: 1308
• Gaps: 450

Alignment

Query    1  -------------------------------------------------------------------------A  1
                                                                                     |
Sbjct    1  CCCTCACGTACCACTCGGCAGAGGCGCGGGGAAACCTGGCGTACTGGCTGTGGCTTCTCTAGCGGGACTCGGCA  74

Query    2  TGAGGCTGGCGCGGCTGCTTCGCGGAGCCGCCTTGGCCGGCCCGGGCCCGGGGCTGCGCGCCGCCGGCTTCAGC  75
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TGAGGCTGGCGCGGCTGCTTCGCGGAGCCGCCTTGGCCGGCCCGGGCCCGGGGCTGCGCGCCGCCGGCTTCAGC  148

Query   76  CGCAGCTTCAGCTCGGACTCGGGCTCCAGCCCGGCGTCCGAGCGCGGCGTTCCGGGCCAGGTGGACTTCTACGC  149
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CGCAGCTTCAGCTCGGACTCGGGCTCCAGCCCGGCGTCCGAGCGCGGCGTTCCGGGCCAGGTGGACTTCTACGC  222

Query  150  GCGCTTCTCGCCGTCCCCGCTCTCCATGAAGCAGTTCCTGGACTTCGGATCAGTGAATGCTTGTGAAAAGACCT  223
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GCGCTTCTCGCCGTCCCCGCTCTCCATGAAGCAGTTCCTGGACTTCGGATCAGTGAATGCTTGTGAAAAGACCT  296

Query  224  CATTTATGTTTCTGCGGCAAGAGTTGCCTGTCAGACTGGCAAATATAATGAAAGAAATAAGTCTCCTTCCAGAT  297
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CATTTATGTTTCTGCGGCAAGAGTTGCCTGTCAGACTGGCAAATATAATGAAAGAAATAAGTCTCCTTCCAGAT  370

Query  298  AATCTTCTCAGGACACCATCCGTTCAATTGGTACAAAGCTGGTATATCCAGAGTCTTCAGGAGCTTCTTGATTT  371
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AATCTTCTCAGGACACCATCCGTTCAATTGGTACAAAGCTGGTATATCCAGAGTCTTCAGGAGCTTCTTGATTT  444

Query  372  TAAGGACAAAAGTGCTGAGGATGCTAAAGCTATTTATGACTTTACAGATACTGTGATACGGATCAGAAACCGAC  445
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TAAGGACAAAAGTGCTGAGGATGCTAAAGCTATTTATGACTTTACAGATACTGTGATACGGATCAGAAACCGAC  518

Query  446  ACAATGATGTCATTCCCACAATGGCCCAGGGTGTGATTGAATACAAGGAGAGCTTTGGGGTGGATCCTGTCACC  519
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  ACAATGATGTCATTCCCACAATGGCCCAGGGTGTGATTGAATACAAGGAGAGCTTTGGGGTGGATCCTGTCACC  592

Query  520  AGCCAGAATGTTCAGTACTTTTTGGATCGATTCTACATGAGTCGCATTTCAATTAGAATGTTACTCAATCAGCA  593
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AGCCAGAATGTTCAGTACTTTTTGGATCGATTCTACATGAGTCGCATTTCAATTAGAATGTTACTCAATCAGCA  666

Query  594  CTCTTTATTGTTTGGTGGAAAAGGCAAAGGAAGTCCATCTCATCGAAAACACATTGGAAGCATAAATCCAAACT  667
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CTCTTTATTGTTTGGTGGAAAAGGCAAAGGAAGTCCATCTCATCGAAAACACATTGGAAGCATAAATCCAAACT  740

Query  668  GCAATGTACTTGAAGTTATTAAAGATGGCTATGAAAATGCTAGGCGTCTGTGTGATTTGTATTATATTAACTCT  741
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GCAATGTACTTGAAGTTATTAAAGATGGCTATGAAAATGCTAGGCGTCTGTGTGATTTGTATTATATTAACTCT  814

Query  742  CCCGAACTAGAACTTGAAGAACTAAATGCAAAATCACCAGGACAGCCAATACAAGTGGTTTATGTACCATCCCA  815
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CCCGAACTAGAACTTGAAGAACTAAATGCAAAATCACCAGGACAGCCAATACAAGTGGTTTATGTACCATCCCA  888

Query  816  TCTCTATCACATGGTGTTTGAACTTTTCAAGAATGCAATGAGAGCCACTATGGAACACCATGCCAACAGAGGTG  889
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TCTCTATCACATGGTGTTTGAACTTTTCAAGAATGCAATGAGAGCCACTATGGAACACCATGCCAACAGAGGTG  962

Query  890  TTTACCCCCCTATTCAAGTTCATGTCACGCTGGGTAATGAGGATTTGACTGTGAAGATGAGTGACCGAGGAGGT  963
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TTTACCCCCCTATTCAAGTTCATGTCACGCTGGGTAATGAGGATTTGACTGTGAAGATGAGTGACCGAGGAGGT  1036

Query  964  GGCGTTCCTTTGAGGAAAATTGACAGACTTTTCAACTACATGTATTCAACTGCACCAAGACCTCGTGTTGAGAC  1037
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GGCGTTCCTTTGAGGAAAATTGACAGACTTTTCAACTACATGTATTCAACTGCACCAAGACCTCGTGTTGAGAC  1110

Query 1038  CTCCCGCGCAGTGCCTCTGGCTGGTTTTGGTTATGGATTGCCCATATCACGTCTTTACGCACAATACTTCCAAG  1111
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CTCCCGCGCAGTGCCTCTGGCTGGTTTTGGTTATGGATTGCCCATATCACGTCTTTACGCACAATACTTCCAAG  1184

Query 1112  GAGACCTGAAGCTGTATTCCCTAGAGGGTTACGGGACAGATGCAGTTATCTACATTAAGGCTCTGTCAACAGAC  1185
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GAGACCTGAAGCTGTATTCCCTAGAGGGTTACGGGACAGATGCAGTTATCTACATTAAGGCTCTGTCAACAGAC  1258

Query 1186  TCAATAGAAAGACTCCCAGTGTATAACAAAGCTGCCTGGAAGCATTACAACACCAACCACGAGGCTGATGACTG  1259
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TCAATAGAAAGACTCCCAGTGTATAACAAAGCTGCCTGGAAGCATTACAACACCAACCACGAGGCTGATGACTG  1332

Query 1260  GTGCGTCCCCAGCAGAGAACCCAAAGACATGACGACGTTCCGCAGTGCC-------------------------  1308
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                         
Sbjct 1333  GTGCGTCCCCAGCAGAGAACCCAAAGACATGACGACGTTCCGCAGTGCCTAGACACACTTGGGACATCGGAAAA  1406

Query 1309  --------------------------------------------------------------------------  1308
                                                                                      
Sbjct 1407  TCCAAATGTGGCTTTTGTATTAAATTTGGAAGGTCCGTAAAAGCCCTGGGCTCAGCCAGAGCAGGGCAGAGGAT  1480

Query 1309  --------------------------------------------------------------------------  1308
                                                                                      
Sbjct 1481  GACGGGATGACCAGCTGCAGAGAGGAGTACTCTACTGATAACTGGAGATGATGGGCGACCACCTTCAGAGAGAA  1554

Query 1309  --------------------------------------------------------------------------  1308
                                                                                      
Sbjct 1555  ACTGTTAGCAGAGAGGAGCTGCCGTCTGCTGAGAGCTTCAGAGACCTGCAGACATCTGAATGACTTGCCTGCAG  1628

Query 1309  --------------------------------------------------------------------------  1308
                                                                                      
Sbjct 1629  AGAGGAGCCACTCTTTTCAGGGCCTTCTCTCAGCTGAGAGCTGAACACCCAATGGGATAATTGCCTACAGAGAG  1702

Query 1309  --------------------------------------------------------  1308
                                                                    
Sbjct 1703  GAGCCACCCACTCCTCTGAGCTGTTCCAACACAATAAAACTCTTTTTCACCCTTCA  1758