Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_14737
• Subject: XR_427094.1
• Aligned Length: 1575
• Identities: 1231
• Gaps: 344

Alignment

Query    1  -------------------------------------------------------------ATGAGGCTGGCGC  13
                                                                         |||||||||||||
Sbjct    1  ACTCGGCAGAGGCGCGGGGAAACCTGGCGTACTGGCTGTGGCTTCTCTAGCGGGACTCGGCATGAGGCTGGCGC  74

Query   14  GGCTGCTTCGCGGAGCCGCCTTGGCCGGCCCGGGCCCGGGGCTGCGCGCCGCCGGCTTCAGCCGCAGCTTCAGC  87
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGCTGCTTCGCGGAGCCGCCTTGGCCGGCCCGGGCCCGGGGCTGCGCGCCGCCGGCTTCAGCCGCAGCTTCAGC  148

Query   88  TCGGACTCGGGCTCCAGCCCGGCGTCCGAGCGCGGCGTTCCGGGCCAGGTGGACTTCTACGCGCGCTTCTCGCC  161
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TCGGACTCGGGCTCCAGCCCGGCGTCCGAGCGCGGCGTTCCGGGCCAGGTGGACTTCTACGCGCGCTTCTCGCC  222

Query  162  GTCCCCGCTCTCCATGAAGCAGTTCCTGGACTTCGGATCAGTGAATGCTTGTGAAAAGACCTCATTTATGTTTC  235
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GTCCCCGCTCTCCATGAAGCAGTTCCTGGACTTCGGATCAGTGAATGCTTGTGAAAAGACCTCATTTATGTTTC  296

Query  236  TGCGGCAAGAGTTGCCTGTCAGACTGGCAAATATAATGAAAGAAATAAGTCTCCTTCCAGATAATCTTCTCAGG  309
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGCGGCAAGAGTTGCCTGTCAGACTGGCAAATATAATGAAAGAAATAAGTCTCCTTCCAGATAATCTTCTCAGG  370

Query  310  ACACCATCCGTTCAATTGGTACAAAGCTGGTATATCCAGAGTCTTCAGGAGCTTCTTGATTTTAAGGACAAAAG  383
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ACACCATCCGTTCAATTGGTACAAAGCTGGTATATCCAGAGTCTTCAGGAGCTTCTTGATTTTAAGGACAAAAG  444

Query  384  TGCTGAGGATGCTAAAGCTATTTATGA-----------------------------------------------  410
            |||||||||||||||||||||||||||                                               
Sbjct  445  TGCTGAGGATGCTAAAGCTATTTATGAAAGGCCTAGAAGAACATGGTTGCAGGTCTCTAGTTTATGCTGTATGG  518

Query  411  -------------CTTTACAGATACTGTGATACGGATCAGAAACCGACACAATGATGTCATTCCCACAATGGCC  471
                         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CCTGCAAGATGATCTTTACAGATACTGTGATACGGATCAGAAACCGACACAATGATGTCATTCCCACAATGGCC  592

Query  472  CAGGGTGTGATTGAATACAAGGAGAGCTTTGGGGTGGATCCTGTCACCAGCCAGAATGTTCAGTACTTTTTGGA  545
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CAGGGTGTGATTGAATACAAGGAGAGCTTTGGGGTGGATCCTGTCACCAGCCAGAATGTTCAGTACTTTTTGGA  666

Query  546  TCGATTCTACATGAGTCGCATTTCAATTAGAATGTTACTCAATCAGCACTCTTTATTGTTTGGTGGAAAAGGCA  619
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TCGATTCTACATGAGTCGCATTTCAATTAGAATGTTACTCAATCAGCACTCTTTATTGTTTGGTGGAAAAGGCA  740

Query  620  AAGGAAGTCCATCTCATCGAAAACACATTGGAAGCATAAATCCAAACTGCAATGTACTTGAAGTTATTAAAGAT  693
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AAGGAAGTCCATCTCATCGAAAACACATTGGAAGCATAAATCCAAACTGCAATGTACTTGAAGTTATTAAAGAT  814

Query  694  GGCTATGAAAATGCTAGGCGTCTGTGTGATTTGTATTATATTAACTCTCCCGAACTAGAACTTGAAGAACTAAA  767
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GGCTATGAAAATGCTAGGCGTCTGTGTGATTTGTATTATATTAACTCTCCCGAACTAGAACTTGAAGAACTAAA  888

Query  768  TGCAAAATCACCAGGACAGCCAATACAAGTGGTTTATGTACCATCCCATCTCTATCACATGGTGTTTGAACTTT  841
            |                                                                         
Sbjct  889  T-------------------------------------------------------------------------  889

Query  842  TCAAGAATGCAATGAGAGCCACTATGGAACACCATGCCAACAGAGGTGTTTACCCCCCTATTCAAGTTCATGTC  915
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  890  ----GAATGCAATGAGAGCCACTATGGAACACCATGCCAACAGAGGTGTTTACCCCCCTATTCAAGTTCATGTC  959

Query  916  ACGCTGGGTAATGAGGATTTGACTGTGAAGATGAGTGACCGAGGAGGTGGCGTTCCTTTGAGGAAAATTGACAG  989
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  960  ACGCTGGGTAATGAGGATTTGACTGTGAAGATGAGTGACCGAGGAGGTGGCGTTCCTTTGAGGAAAATTGACAG  1033

Query  990  ACTTTTCAACTACATGTATTCAACTGCACCAAGACCTCGTGTTGAGACCTCCCGCGCAGTGCCTCTGGCTGGTT  1063
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1034  ACTTTTCAACTACATGTATTCAACTGCACCAAGACCTCGTGTTGAGACCTCCCGCGCAGTGCCTCTGGCTGGTT  1107

Query 1064  TTGGTTATGGATTGCCCATATCACGTCTTTACGCACAATACTTCCAAGGAGACCTGAAGCTGTATTCCCTAGAG  1137
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1108  TTGGTTATGGATTGCCCATATCACGTCTTTACGCACAATACTTCCAAGGAGACCTGAAGCTGTATTCCCTAGAG  1181

Query 1138  GGTTACGGGACAGATGCAGTTATCTACATTAAGGCTCTGTCAACAGACTCAATAGAAAGACTCCCAGTGTATAA  1211
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1182  GGTTACGGGACAGATGCAGTTATCTACATTAAGGCTCTGTCAACAGACTCAATAGAAAGACTCCCAGTGTATAA  1255

Query 1212  CAAAGCTGCCTGGAAGCATTACAACACCAACCACGAGGCTGATGACTGGTGCGTCCCCAGCAGAGAACCCAAAG  1285
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1256  CAAAGCTGCCTGGAAGCATTACAACACCAACCACGAGGCTGATGACTGGTGCGTCCCCAGCAGAGAACCCAAAG  1329

Query 1286  ACATGACGACGTTCCGCAGTGCC---------------------------------------------------  1308
            |||||||||||||||||||||||                                                   
Sbjct 1330  ACATGACGACGTTCCGCAGTGCCTAGACACACTTGGGACATCGGAAAATCCAAATGTGGCTTTTGTATTAAATT  1403

Query 1309  --------------------------------------------------------------------------  1308
                                                                                      
Sbjct 1404  TGGAAGGTATGGTGTTCAGAACTATATTATACCAAGTACTTTATTTATCGTTTTCACAAAACTATTTGAGTAGA  1477

Query 1309  ---------------------  1308
                                 
Sbjct 1478  ATAAATGGAAACTGAATTCCA  1498