Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_14743
• Subject: NM_008825.4
• Aligned Length: 1557
• Identities: 1346
• Gaps: 43

Alignment

Query    1  ATGTCTG------GGGCATCTTCCTCAGAACAGAACAACAACAGCTATGAAACCAAAACCCCAAATCTTCGAAT  68
            |||||||      |..|||.||||.|||||.|...|||||.|||||||.||.||.|..||.|||||||.||||.
Sbjct    1  ATGTCTGAGAATAGTACATTTTCCCCAGAAGACTGCAACAGCAGCTATAAACCCCACGCCTCAAATCTGCGAAG  74

Query   69  GTCAGAGAAGAAATGTTCATGGGCCTCCTACATGACCAACTCCCCGACTCTGATCGTTATGATTGGTTTGCCAG  142
            |.|||.|||||.|||.||||||||.|||||.||||||||||||||.||.||.||.|||||||||||.|||||||
Sbjct   75  GGCAGGGAAGACATGCTCATGGGCTTCCTATATGACCAACTCCCCAACACTCATTGTTATGATTGGCTTGCCAG  148

Query  143  CCCGGGGTAAAACCTACGTGTCCAAGAAACTAACACGCTACCTCAACTGGATTGGAGTCCCCACCAAAGTGTTT  216
            |||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  149  CCCGGGGTAAAACTTATGTGTCTAAGAAACTAACACGCTACCTCAACTGGATTGGAGTACCCACCAAAGTGTTT  222

Query  217  AATCTTGGGGTGTATCGGCGTGAAGCAGTCAAGTCCTATAAGTCCTACGACTTCTTTCGGCATGACAATGAGGA  290
            |||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||.||||.||.||.||||||||.|||||||||||.||
Sbjct  223  AATCTTGGGGTATATCGACGTGAAGCAGTCAAGTCCTATCAGTCTTATGATTTCTTTCGACATGACAATGAAGA  296

Query  291  GGCCATGAAGATCCGCAAACAGTGTGCTCTGGTGGCGCTGGAAGATGTTAAGGCGTATCTCACTGAGGAGAATG  364
            |||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||.|.|||||.||||.||
Sbjct  297  GGCTATGAAGATCCGCAAACAGTGTGCTCTGGTGGCACTGGAAGATGTTAAAGCCTATTTTACTGAAGAGAGTG  370

Query  365  GTCAGATTGCGGTGTTTGATGCCACCAATACAACCCGGGAGAGGAGGGACATGATTTTGAACTTTGCTGAACAG  438
            |.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||..|.|||
Sbjct  371  GGCAGATTGCGGTGTTTGATGCCACCAATACCACTCGGGAGAGGAGGGACATGATTTTGAACTTTGCCAAGCAG  444

Query  439  AATTCCTTCAAGGTATTCTTTGTGGAATCCGTCTGTGATGATCCTGATGTCATTGCTGCCAATATTCTGGAGGT  512
            |||.|||||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AATGCCTTCAAGGTATTTTTTGTAGAATCTGTCTGTGATGATCCTGATGTCATTGCTGCCAATATTCTGGAGGT  518

Query  513  TAAGGTATCAAGCCCTGACTATCCTGAAAGGAATAGAGAGAACGTGATGGAGGACTTCCTGAAGAGAATTGAAT  586
            .||.||.||.|||||||||||.||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  519  AAAAGTGTCGAGCCCTGACTACCCCGAAAGGAATAGGGAGAATGTGATGGAGGACTTCCTGAAGAGAATTGAGT  592

Query  587  GCTACAAAGTTACCTACCGACCTCTTGACCCAGACAACTATGACAAGGATCTTTCTTTCATCAAAGTGATAAAC  660
            |||||||.||.||.||||..||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||.
Sbjct  593  GCTACAAGGTCACTTACCAGCCCCTTGACCCAGACAACTATGATAAGGATCTTTCTTTCATAAAGGTGATAAAT  666

Query  661  GTGGGCCAGCGATTTTTAGTCAACAGAGTCCAGGACTACATCCAGAGCCAGATAGTCTACTACCTCATGAANAT  734
            ||.||||||.||||..|.|||||||||||.|||||||||||||||||..||||.|||||||||||.|||||.||
Sbjct  667  GTAGGCCAGAGATTCCTGGTCAACAGAGTTCAGGACTACATCCAGAGTAAGATTGTCTACTACCTGATGAATAT  740

Query  735  CCACGTCCANCNCTCGCACCATTTACCTTTNNCGGCATGGANNAAGCGAGTTCNATCTCTTGGGNAANATNGGG  808
            |||||||||.| ||||||||||.|||||||..|||||.||....|||||||||.|.||.|||||.||.||.|||
Sbjct  741  CCACGTCCATC-CTCGCACCATCTACCTTTGCCGGCACGGCGAGAGCGAGTTCAACCTTTTGGGGAAGATTGGG  813

Query  809  GGTGACTCTGGCCTCCTCGGTGCGGGGNAAGCAGTTTGCCCAAGCTCTAAGGAAATTTCTGAGGGAACAGGAAA  882
            |||||||||||||| |||.|||||.||.|||||||||||.||.|||||.|.|||.||||||..|||||||||.|
Sbjct  814  GGTGACTCTGGCCT-CTCCGTGCGAGGAAAGCAGTTTGCTCATGCTCTGAAGAAGTTTCTGGAGGAACAGGAGA  886

Query  883  TAACA-GACCTCAAAGTGTGGACAAGCCAGTGNAAGAGGACCATACAGACTGCTGAATCTCTCGGGGTGCCCTA  955
            | .|| |||||.|||||||||||.|||||||..||||||||.||.|||||||||||.|||||.||||||.||||
Sbjct  887  T-CCAGGACCTTAAAGTGTGGACGAGCCAGTTGAAGAGGACAATTCAGACTGCTGAGTCTCTTGGGGTGACCTA  959

Query  956  TGAGCAGTGGAAGATTCTGAATGAGATTGATGCTGGTGTGTGTGAAGAGATGACCTATGCAGAGATTGAGAAAC  1029
            |||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||.|||||||||||.|||
Sbjct  960  TGAGCAGTGGAAGATCCTCAATGAGATTGATGCTGGCGTGTGTGAGGAGATGACATATTCAGAGATTGAGCAAC  1033

Query 1030  GGTACCCAGAAGAGTTTGCACTTCGAGATCAAGAGAAGTATCTGTATCGATATCCTGGTGGGGAGTCATACCAG  1103
            ||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||
Sbjct 1034  GGTACCCAGAGGAATTTGCACTCCGAGATCAAGAGAAGTATCTGTACCGATACCCTGGTGGGGAGTCCTACCAG  1107

Query 1104  GACCTGGTGCAGCGGCTGGAGCCTGTCATCATGGAGCTGGAACGTCAGGGCAATGTCCTCGTCATCTCCCACCA  1177
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||..|||||||.|||||.|||||
Sbjct 1108  GACCTGGTGCAGCGGCTGGAGCCTGTCATCATGGAGCTAGAGCGTCAAGGCAACATCCTCGTTATCTCTCACCA  1181

Query 1178  GGCTGTCATGCGCTGCCTCCTGGCCTACTTCTTGGATAAGGGCGCAGATGAGCTACCATACTTGAGATGCCCTC  1251
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.|||||||||||||.|||||.|
Sbjct 1182  GGCTGTCATGCGCTGCCTCCTGGCCTACTTCTTGGATAAAGGCGCAGATGAGTTACCATACTTGAGGTGCCCCC  1255

Query 1252  TCCATACCATCTTCAAACTTACTCCTGTGGCCTATGGGTGCAAAGTGGAAACAATTAAACTTAACGTGGAGGCT  1325
            |.||.|.||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||..||.||.|||||.|||
Sbjct 1256  TGCACATCATCTTCAAACTTACTCCTGTGGCCTATGGTTGCAAAGTGGAAACAATTACTCTGAATGTGGATGCT  1329

Query 1326  GTGAACACGCACCGTGACAAGCCAACTAACAACTTCCCCAAGAACCAAACCCCTGTAAGGATGAGAAGGAACAG  1399
            ||..||||.||.|||||||||||||||.|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1330  GTAGACACACATCGTGACAAGCCAACTCACAACTTCCCCAAGAGCCAAACCCCTGTAAGGATGAGAAGGAACAG  1403

Query 1400  CTTTACGCCTCTGTCCAGTTCGAATACAATAAGGCGTCCAAGAAATTACAGTGTTGGGAGCCGGCCCCTCAAGC  1473
            ||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 1404  CTTTACGCCTCTGTCCAGTTCGAACACAATAAGGCGTCCAAGAAATTACAGTGTTGGGAGCCGACCCCTCAAGC  1477

Query 1474  CCCTCAGCCCTCTCCGTGCCCAGGACATGCAAGAAGGGGCCGAC------------------------------  1517
            |||||||||||||||||||.|.||||||||||||||||||.|||                              
Sbjct 1478  CCCTCAGCCCTCTCCGTGCTCTGGACATGCAAGAAGGGGCGGACCAGCCGAAGACCCAAGTCAGCATTCCGGTG  1551

Query 1518  ---  1517
               
Sbjct 1552  GTG  1554