Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_14748
- Subject:
- NM_001310448.1
- Aligned Length:
- 1353
- Identities:
- 1152
- Gaps:
- 87
Alignment
Query 1 ATGCACGGTTACTTTGGCTGCAATGCTGCTGCAGAGCCCGGTTACTCTGCCTTCGTGGGAACTCCACAGATATG 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 TGTCACAAAGATGTCTACACGGAACTGCCAGGGAATGGACTCAGTGATCAAACCCCTGGACACAATTCCTGAGG 148
||||||||.||||||||||||||.|..||.|||||||||||.|.||||||||||||||||||.|
Sbjct 1 ----------ATGTCTACCCGGAACTGCCAGGGGACAGATTCAGTGATCAAGCACCTGGACACAATTCCTGAAG 64
Query 149 ATAAAAAAGTCAGAGTTCAGAGGACACAGAGCACTTTTGACCCATTTGAGAAACCAGCTAATCAAGTAAAGAGG 222
|.||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.|||
Sbjct 65 ACAAGAAAGTCAGGGTTCAGAGGACGCAGAGCACTTTTGACCCATTTGAGAAACCAGCCAACCAAGTCAAAAGG 138
Query 223 GTGCATTCTGAGAACAATGCTTGCATTAACTTTAAGACCTCCTCCACTGGCAAAGAGTCACCTAAAGTTAGGCG 296
||.|||||||||||||||||.||||||||||||||..|||||||..|||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 139 GTCCATTCTGAGAACAATGCATGCATTAACTTTAAATCCTCCTCTGCTGGCAAAGAGTCACCTAAAGTTCGGCG 212
Query 297 GCACTCCAGCCCCAGCTCGCCAACAAGTCCCAAATTTGGAAAAGCTGACTCATATGAAAAGCTGGAAAAACTAG 370
||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|
Sbjct 213 GCACTCCAGCCCCAGCTCGCCAACGAGTCCCAAATTTGGAAAAGCTGACTCATACGAAAAACTGGAAAAACTGG 286
Query 371 GGGAAGGATCTTATGCTACAGTATACAAAGGGAAAAGCAAGGTAAATGGGAAGTTGGTAGCTCTGAAGGTGATC 444
||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||.||||.|||||.|||||||||
Sbjct 287 GGGAAGGATCTTATGCAACAGTGTACAAAGGGAAAAGCAAAGTGAATGGGAAGCTGGTGGCTCTAAAGGTGATC 360
Query 445 AGGCTGCAGGAAGAAGAAGGGACACCTTTCACAGCTATCAGGGAAGCTTCTCTTTTAAAAGGACTAAAACATGC 518
.||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||.||.||.|||||||||||.||.||
Sbjct 361 CGGCTGCAGGAAGAAGAGGGCACACCTTTCACAGCCATCAGGGAAGCTTCCCTGTTGAAAGGACTAAAGCACGC 434
Query 519 TAACATAGTGCTACTTCATGACATCATCCATACCAAGGAGACGCTGACACTTGTGTTTGAATATGTGCACACTG 592
.|||||.|||.|.|||||.|||||||||||.||.|||||.||.|||||.|||||.||||||||.||||||||||
Sbjct 435 CAACATCGTGTTGCTTCACGACATCATCCACACTAAGGAAACCCTGACCCTTGTCTTTGAATACGTGCACACTG 508
Query 593 ATTTATGTCAGTACATGGACAAGCACCCTGGGGGGCTGCATCCAGATAATGTGAAGTTGTTTTTATTTCAGTTG 666
|||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 509 ATTTATGTCAGTACATGGACAAGCACCCTGGAGGACTCCATCCAGATAATGTGAAGTTGTTTTTATTTCAGCTG 582
Query 667 CTGCGAGGTCTGTCTTACATCCACCAGCGTTATATTTTGCACAGAGACCTGAAACCACAGAACNTTCTGATCAN 740
||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.||||.||||.
Sbjct 583 CTGCGAGGACTGTCTTACATCCACCAGCGTTATATTTTGCACAGAGACCTGAAACCGCAGAACCTTCTCATCAG 656
Query 741 TGACACGGGGGNNTTAAAGCTGGCAGATTTCGGTCTTGCAAGAGCAAAATCCGTCCCTAGCCACACATACTCCA 814
.||.|||||||..||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 657 CGATACGGGGGAGTTGAAGCTGGCAGATTTCGGTCTGGCAAGAGCAAAATCCGTCCCTAGCCACACATACTCCA 730
Query 815 ACGAAGTGGTTACCTTGTGGTACAGACCTCCAGATGTCCTTCTAGGCTCAACAGAATATTCCACCTGCCTTGAC 888
|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 731 ATGAAGTGGTTACCTTGTGGTACAGACCTCCAGATGTTCTTCTGGGCTCTACAGAATATTCCACCTGCCTTGAC 804
Query 889 ATGTGGGGAGTAGGTTGCATCTTTGTTGAAATGATCCAAGGAGTTGCTGCTTTTCCAGGAATGAAAGACATTCA 962
|||||||||||.||.||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 805 ATGTGGGGAGTTGGCTGTATCTTCGTTGAGATGATCCAAGGAGTTGCTGCGTTTCCAGGAATGAAAGACATTCA 878
Query 963 GGATCAACTTGAACGAATATTTCTGGTTCTTGGAACACCAAATGAGGACACATGGCCTGGAGTTCATTCTTTAC 1036
|||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 879 GGATCAACTTGAACGGATATTTCTGGTTCTTGGAACACCGAATGAGGACACGTGGCCTGGAGTTCATTCTTTAC 952
Query 1037 CACATTTTAAGCCAGAACGCTTTACCCTGTACAGCTCTAAAAACCTTAGACAAGCATGGAATAAGCTCAGCTAT 1110
||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 953 CACATTTTAAGCCAGAACGCTTTACCGTGTACAGCTCTAAAAGCCTTAGACAAGCATGGAATAAGCTCAGCTAT 1026
Query 1111 GTGAACCATGCAGAGGACCTGGCCTCCAAGCTCCTACAATGTTCCCCAAAGAACAGACTGTCGGCACAGGCTGC 1184
||.||.|||||.||.|||.|||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||.||.||.||||||||.||
Sbjct 1027 GTAAATCATGCTGAAGACTTGGCCTCCAAGCTTCTCCAGTGTTCCCCAAAGAACAGGCTATCAGCACAGGCCGC 1100
Query 1185 CTTGAGCCACGAGTATTTTAGTGACCTGCCGCCACGGCTATGGGAACTCACCGACATGTCTTCTATTTTTACTG 1258
|||||||||.||||||||.||.||.|||||.||||||||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||.|
Sbjct 1101 CTTGAGCCATGAGTATTTCAGCGATCTGCCTCCACGGCTATGGGAGCTGACTGATATGTCTTCTATTTTTACCG 1174
Query 1259 TCCCAAATGTGAGATTGCAACCAGAAGCTGGAGAAAGCATGCGGGCCTTTGGGAAAAACAATAGTTATGGCAAA 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.||||||||||.|||||||||||||||||.|||
Sbjct 1175 TCCCAAATGTGAGATTGCAACCAGAAGCTGGAGAGAGCATGAGGGCCTTTGGAAAAAACAATAGTTATGGGAAA 1248
Query 1333 AGTCTATCAAACAGCAAG--- 1350
||.|||||.||||||||.
Sbjct 1249 AGCCTATCGAACAGCAAACAC 1269