Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_14748
• Subject: NM_012395.3
• Aligned Length: 1353
• Identities: 1346
• Gaps: 3

Alignment

Query    1  ATGCACGGTTACTTTGGCTGCAATGCTGCTGCAGAGCCCGGTTACTCTGCCTTCGTGGGAACTCCACAGATATG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCACGGTTACTTTGGCTGCAATGCTGCTGCAGAGCCCGGTTACTCTGCCTTCGTGGGAACTCCACAGATATG  74

Query   75  TGTCACAAAGATGTCTACACGGAACTGCCAGGGAATGGACTCAGTGATCAAACCCCTGGACACAATTCCTGAGG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TGTCACAAAGATGTCTACACGGAACTGCCAGGGAATGGACTCAGTGATCAAACCCCTGGACACAATTCCTGAGG  148

Query  149  ATAAAAAAGTCAGAGTTCAGAGGACACAGAGCACTTTTGACCCATTTGAGAAACCAGCTAATCAAGTAAAGAGG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ATAAAAAAGTCAGAGTTCAGAGGACACAGAGCACTTTTGACCCATTTGAGAAACCAGCTAATCAAGTAAAGAGG  222

Query  223  GTGCATTCTGAGAACAATGCTTGCATTAACTTTAAGACCTCCTCCACTGGCAAAGAGTCACCTAAAGTTAGGCG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GTGCATTCTGAGAACAATGCTTGCATTAACTTTAAGACCTCCTCCACTGGCAAAGAGTCACCTAAAGTTAGGCG  296

Query  297  GCACTCCAGCCCCAGCTCGCCAACAAGTCCCAAATTTGGAAAAGCTGACTCATATGAAAAGCTGGAAAAACTAG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GCACTCCAGCCCCAGCTCGCCAACAAGTCCCAAATTTGGAAAAGCTGACTCATATGAAAAGCTGGAAAAACTAG  370

Query  371  GGGAAGGATCTTATGCTACAGTATACAAAGGGAAAAGCAAGGTAAATGGGAAGTTGGTAGCTCTGAAGGTGATC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GGGAAGGATCTTATGCTACAGTATACAAAGGGAAAAGCAAGGTAAATGGGAAGTTGGTAGCTCTGAAGGTGATC  444

Query  445  AGGCTGCAGGAAGAAGAAGGGACACCTTTCACAGCTATCAGGGAAGCTTCTCTTTTAAAAGGACTAAAACATGC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AGGCTGCAGGAAGAAGAAGGGACACCTTTCACAGCTATCAGGGAAGCTTCTCTTTTAAAAGGACTAAAACATGC  518

Query  519  TAACATAGTGCTACTTCATGACATCATCCATACCAAGGAGACGCTGACACTTGTGTTTGAATATGTGCACACTG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TAACATAGTGCTACTTCATGACATCATCCATACCAAGGAGACGCTGACACTTGTGTTTGAATATGTGCACACTG  592

Query  593  ATTTATGTCAGTACATGGACAAGCACCCTGGGGGGCTGCATCCAGATAATGTGAAGTTGTTTTTATTTCAGTTG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ATTTATGTCAGTACATGGACAAGCACCCTGGGGGGCTGCATCCAGATAATGTGAAGTTGTTTTTATTTCAGTTG  666

Query  667  CTGCGAGGTCTGTCTTACATCCACCAGCGTTATATTTTGCACAGAGACCTGAAACCACAGAACNTTCTGATCAN  740
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.
Sbjct  667  CTGCGAGGTCTGTCTTACATCCACCAGCGTTATATTTTGCACAGAGACCTGAAACCACAGAACCTTCTGATCAG  740

Query  741  TGACACGGGGGNNTTAAAGCTGGCAGATTTCGGTCTTGCAAGAGCAAAATCCGTCCCTAGCCACACATACTCCA  814
            |||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGACACGGGGGAGTTAAAGCTGGCAGATTTCGGTCTTGCAAGAGCAAAATCCGTCCCTAGCCACACATACTCCA  814

Query  815  ACGAAGTGGTTACCTTGTGGTACAGACCTCCAGATGTCCTTCTAGGCTCAACAGAATATTCCACCTGCCTTGAC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ACGAAGTGGTTACCTTGTGGTACAGACCTCCAGATGTCCTTCTAGGCTCAACAGAATATTCCACCTGCCTTGAC  888

Query  889  ATGTGGGGAGTAGGTTGCATCTTTGTTGAAATGATCCAAGGAGTTGCTGCTTTTCCAGGAATGAAAGACATTCA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  ATGTGGGGAGTAGGTTGCATCTTTGTTGAAATGATCCAAGGAGTTGCTGCTTTTCCAGGAATGAAAGACATTCA  962

Query  963  GGATCAACTTGAACGAATATTTCTGGTTCTTGGAACACCAAATGAGGACACATGGCCTGGAGTTCATTCTTTAC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GGATCAACTTGAACGAATATTTCTGGTTCTTGGAACACCAAATGAGGACACATGGCCTGGAGTTCATTCTTTAC  1036

Query 1037  CACATTTTAAGCCAGAACGCTTTACCCTGTACAGCTCTAAAAACCTTAGACAAGCATGGAATAAGCTCAGCTAT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CACATTTTAAGCCAGAACGCTTTACCCTGTACAGCTCTAAAAACCTTAGACAAGCATGGAATAAGCTCAGCTAT  1110

Query 1111  GTGAACCATGCAGAGGACCTGGCCTCCAAGCTCCTACAATGTTCCCCAAAGAACAGACTGTCGGCACAGGCTGC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GTGAACCATGCAGAGGACCTGGCCTCCAAGCTCCTACAATGTTCCCCAAAGAACAGACTGTCGGCACAGGCTGC  1184

Query 1185  CTTGAGCCACGAGTATTTTAGTGACCTGCCGCCACGGCTATGGGAACTCACCGACATGTCTTCTATTTTTACTG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CTTGAGCCACGAGTATTTTAGTGACCTGCCGCCACGGCTATGGGAACTCACCGACATGTCTTCTATTTTTACTG  1258

Query 1259  TCCCAAATGTGAGATTGCAACCAGAAGCTGGAGAAAGCATGCGGGCCTTTGGGAAAAACAATAGTTATGGCAAA  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TCCCAAATGTGAGATTGCAACCAGAAGCTGGAGAAAGCATGCGGGCCTTTGGGAAAAACAATAGTTATGGCAAA  1332

Query 1333  AGTCTATCAAACAGCAAG---  1350
            ||||||||||||||||||   
Sbjct 1333  AGTCTATCAAACAGCAAGCAC  1353