Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_14748
• Subject: XM_006503544.4
• Aligned Length: 1431
• Identities: 1228
• Gaps: 81

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGCTTTTGAAGCAGCACTGCATTGCAAATCAATATCTTTCTGGAGAGACAGGGTGTAGTGGATTGCCTGGACA  74

Query    1  ----ATGCACGGTTACTTTGGCTGCAATGCTGCTGCAGAGCCCGGTTACTCTGCCTTCGTGGGAACTCCACAGA  70
                ||||..||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||.|||||||.|||||||
Sbjct   75  GCATATGCGTGGTTCCTCTGGCTGCAATGCTGCTGCAGAGCCCGCTCACTCTGCCTTCCTGGGAACCCCACAGA  148

Query   71  TATGTGTCACAAAGATGTCTACACGGAACTGCCAGGGAATGGACTCAGTGATCAAACCCCTGGACACAATTCCT  144
            ||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|..||.|||||||||||.|.||||||||||||||||
Sbjct  149  TATGTGTCACAAAGATGTCTACCCGGAACTGCCAGGGGACAGATTCAGTGATCAAGCACCTGGACACAATTCCT  222

Query  145  GAGGATAAAAAAGTCAGAGTTCAGAGGACACAGAGCACTTTTGACCCATTTGAGAAACCAGCTAATCAAGTAAA  218
            ||.||.||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||
Sbjct  223  GAAGACAAGAAAGTCAGGGTTCAGAGGACGCAGAGCACTTTTGACCCATTTGAGAAACCAGCCAACCAAGTCAA  296

Query  219  GAGGGTGCATTCTGAGAACAATGCTTGCATTAACTTTAAGACCTCCTCCACTGGCAAAGAGTCACCTAAAGTTA  292
            .|||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||..|||||||..|||||||||||||||||||||||.
Sbjct  297  AAGGGTCCATTCTGAGAACAATGCATGCATTAACTTTAAATCCTCCTCTGCTGGCAAAGAGTCACCTAAAGTTC  370

Query  293  GGCGGCACTCCAGCCCCAGCTCGCCAACAAGTCCCAAATTTGGAAAAGCTGACTCATATGAAAAGCTGGAAAAA  366
            ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||
Sbjct  371  GGCGGCACTCCAGCCCCAGCTCGCCAACGAGTCCCAAATTTGGAAAAGCTGACTCATACGAAAAACTGGAAAAA  444

Query  367  CTAGGGGAAGGATCTTATGCTACAGTATACAAAGGGAAAAGCAAGGTAAATGGGAAGTTGGTAGCTCTGAAGGT  440
            ||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||.||||.|||||.|||||
Sbjct  445  CTGGGGGAAGGATCTTATGCAACAGTGTACAAAGGGAAAAGCAAAGTGAATGGGAAGCTGGTGGCTCTAAAGGT  518

Query  441  GATCAGGCTGCAGGAAGAAGAAGGGACACCTTTCACAGCTATCAGGGAAGCTTCTCTTTTAAAAGGACTAAAAC  514
            ||||.||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||.||.||.|||||||||||.|
Sbjct  519  GATCCGGCTGCAGGAAGAAGAGGGCACACCTTTCACAGCCATCAGGGAAGCTTCCCTGTTGAAAGGACTAAAGC  592

Query  515  ATGCTAACATAGTGCTACTTCATGACATCATCCATACCAAGGAGACGCTGACACTTGTGTTTGAATATGTGCAC  588
            |.||.|||||.|||.|.|||||.|||||||||||.||.|||||.||.|||||.|||||.||||||||.||||||
Sbjct  593  ACGCCAACATCGTGTTGCTTCACGACATCATCCACACTAAGGAAACCCTGACCCTTGTCTTTGAATACGTGCAC  666

Query  589  ACTGATTTATGTCAGTACATGGACAAGCACCCTGGGGGGCTGCATCCAGATAATGTGAAGTTGTTTTTATTTCA  662
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ACTGATTTATGTCAGTACATGGACAAGCACCCTGGAGGACTCCATCCAGATAATGTGAAGTTGTTTTTATTTCA  740

Query  663  GTTGCTGCGAGGTCTGTCTTACATCCACCAGCGTTATATTTTGCACAGAGACCTGAAACCACAGAACNTTCTGA  736
            |.||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.||||.|
Sbjct  741  GCTGCTGCGAGGACTGTCTTACATCCACCAGCGTTATATTTTGCACAGAGACCTGAAACCGCAGAACCTTCTCA  814

Query  737  TCANTGACACGGGGGNNTTAAAGCTGGCAGATTTCGGTCTTGCAAGAGCAAAATCCGTCCCTAGCCACACATAC  810
            |||..||.|||||||..||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TCAGCGATACGGGGGAGTTGAAGCTGGCAGATTTCGGTCTGGCAAGAGCAAAATCCGTCCCTAGCCACACATAC  888

Query  811  TCCAACGAAGTGGTTACCTTGTGGTACAGACCTCCAGATGTCCTTCTAGGCTCAACAGAATATTCCACCTGCCT  884
            |||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TCCAATGAAGTGGTTACCTTGTGGTACAGACCTCCAGATGTTCTTCTGGGCTCTACAGAATATTCCACCTGCCT  962

Query  885  TGACATGTGGGGAGTAGGTTGCATCTTTGTTGAAATGATCCAAGGAGTTGCTGCTTTTCCAGGAATGAAAGACA  958
            |||||||||||||||.||.||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct  963  TGACATGTGGGGAGTTGGCTGTATCTTCGTTGAGATGATCCAAGGAGTTGCTGCGTTTCCAGGAATGAAAGACA  1036

Query  959  TTCAGGATCAACTTGAACGAATATTTCTGGTTCTTGGAACACCAAATGAGGACACATGGCCTGGAGTTCATTCT  1032
            |||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TTCAGGATCAACTTGAACGGATATTTCTGGTTCTTGGAACACCGAATGAGGACACGTGGCCTGGAGTTCATTCT  1110

Query 1033  TTACCACATTTTAAGCCAGAACGCTTTACCCTGTACAGCTCTAAAAACCTTAGACAAGCATGGAATAAGCTCAG  1106
            ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TTACCACATTTTAAGCCAGAACGCTTTACCGTGTACAGCTCTAAAAGCCTTAGACAAGCATGGAATAAGCTCAG  1184

Query 1107  CTATGTGAACCATGCAGAGGACCTGGCCTCCAAGCTCCTACAATGTTCCCCAAAGAACAGACTGTCGGCACAGG  1180
            ||||||.||.|||||.||.|||.|||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||.||.||.|||||||
Sbjct 1185  CTATGTAAATCATGCTGAAGACTTGGCCTCCAAGCTTCTCCAGTGTTCCCCAAAGAACAGGCTATCAGCACAGG  1258

Query 1181  CTGCCTTGAGCCACGAGTATTTTAGTGACCTGCCGCCACGGCTATGGGAACTCACCGACATGTCTTCTATTTTT  1254
            |.|||||||||||.||||||||.||.||.|||||.||||||||||||||.||.||.||.|||||||||||||||
Sbjct 1259  CCGCCTTGAGCCATGAGTATTTCAGCGATCTGCCTCCACGGCTATGGGAGCTGACTGATATGTCTTCTATTTTT  1332

Query 1255  ACTGTCCCAAATGTGAGATTGCAACCAGAAGCTGGAGAAAGCATGCGGGCCTTTGGGAAAAACAATAGTTATGG  1328
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1333  ACCGTCCCAAATGTGAGATTGCAACCAGAAGCTGGAGAGAGCATGAGGGCCTTTGGAAAAAACAATAGTTATGG  1406

Query 1329  CAAAAGTCTATCAAACAGCAAG---  1350
            .|||||.|||||.||||||||.   
Sbjct 1407  GAAAAGCCTATCGAACAGCAAACAC  1431