Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_14748
• Subject: XM_017320708.1
• Aligned Length: 1353
• Identities: 1152
• Gaps: 87

Alignment

Query    1  ATGCACGGTTACTTTGGCTGCAATGCTGCTGCAGAGCCCGGTTACTCTGCCTTCGTGGGAACTCCACAGATATG  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  TGTCACAAAGATGTCTACACGGAACTGCCAGGGAATGGACTCAGTGATCAAACCCCTGGACACAATTCCTGAGG  148
                      ||||||||.||||||||||||||.|..||.|||||||||||.|.||||||||||||||||||.|
Sbjct    1  ----------ATGTCTACCCGGAACTGCCAGGGGACAGATTCAGTGATCAAGCACCTGGACACAATTCCTGAAG  64

Query  149  ATAAAAAAGTCAGAGTTCAGAGGACACAGAGCACTTTTGACCCATTTGAGAAACCAGCTAATCAAGTAAAGAGG  222
            |.||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.|||
Sbjct   65  ACAAGAAAGTCAGGGTTCAGAGGACGCAGAGCACTTTTGACCCATTTGAGAAACCAGCCAACCAAGTCAAAAGG  138

Query  223  GTGCATTCTGAGAACAATGCTTGCATTAACTTTAAGACCTCCTCCACTGGCAAAGAGTCACCTAAAGTTAGGCG  296
            ||.|||||||||||||||||.||||||||||||||..|||||||..|||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  139  GTCCATTCTGAGAACAATGCATGCATTAACTTTAAATCCTCCTCTGCTGGCAAAGAGTCACCTAAAGTTCGGCG  212

Query  297  GCACTCCAGCCCCAGCTCGCCAACAAGTCCCAAATTTGGAAAAGCTGACTCATATGAAAAGCTGGAAAAACTAG  370
            ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|
Sbjct  213  GCACTCCAGCCCCAGCTCGCCAACGAGTCCCAAATTTGGAAAAGCTGACTCATACGAAAAACTGGAAAAACTGG  286

Query  371  GGGAAGGATCTTATGCTACAGTATACAAAGGGAAAAGCAAGGTAAATGGGAAGTTGGTAGCTCTGAAGGTGATC  444
            ||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||.||||.|||||.|||||||||
Sbjct  287  GGGAAGGATCTTATGCAACAGTGTACAAAGGGAAAAGCAAAGTGAATGGGAAGCTGGTGGCTCTAAAGGTGATC  360

Query  445  AGGCTGCAGGAAGAAGAAGGGACACCTTTCACAGCTATCAGGGAAGCTTCTCTTTTAAAAGGACTAAAACATGC  518
            .||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||.||.||.|||||||||||.||.||
Sbjct  361  CGGCTGCAGGAAGAAGAGGGCACACCTTTCACAGCCATCAGGGAAGCTTCCCTGTTGAAAGGACTAAAGCACGC  434

Query  519  TAACATAGTGCTACTTCATGACATCATCCATACCAAGGAGACGCTGACACTTGTGTTTGAATATGTGCACACTG  592
            .|||||.|||.|.|||||.|||||||||||.||.|||||.||.|||||.|||||.||||||||.||||||||||
Sbjct  435  CAACATCGTGTTGCTTCACGACATCATCCACACTAAGGAAACCCTGACCCTTGTCTTTGAATACGTGCACACTG  508

Query  593  ATTTATGTCAGTACATGGACAAGCACCCTGGGGGGCTGCATCCAGATAATGTGAAGTTGTTTTTATTTCAGTTG  666
            |||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  509  ATTTATGTCAGTACATGGACAAGCACCCTGGAGGACTCCATCCAGATAATGTGAAGTTGTTTTTATTTCAGCTG  582

Query  667  CTGCGAGGTCTGTCTTACATCCACCAGCGTTATATTTTGCACAGAGACCTGAAACCACAGAACNTTCTGATCAN  740
            ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.||||.||||.
Sbjct  583  CTGCGAGGACTGTCTTACATCCACCAGCGTTATATTTTGCACAGAGACCTGAAACCGCAGAACCTTCTCATCAG  656

Query  741  TGACACGGGGGNNTTAAAGCTGGCAGATTTCGGTCTTGCAAGAGCAAAATCCGTCCCTAGCCACACATACTCCA  814
            .||.|||||||..||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  657  CGATACGGGGGAGTTGAAGCTGGCAGATTTCGGTCTGGCAAGAGCAAAATCCGTCCCTAGCCACACATACTCCA  730

Query  815  ACGAAGTGGTTACCTTGTGGTACAGACCTCCAGATGTCCTTCTAGGCTCAACAGAATATTCCACCTGCCTTGAC  888
            |.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct  731  ATGAAGTGGTTACCTTGTGGTACAGACCTCCAGATGTTCTTCTGGGCTCTACAGAATATTCCACCTGCCTTGAC  804

Query  889  ATGTGGGGAGTAGGTTGCATCTTTGTTGAAATGATCCAAGGAGTTGCTGCTTTTCCAGGAATGAAAGACATTCA  962
            |||||||||||.||.||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  805  ATGTGGGGAGTTGGCTGTATCTTCGTTGAGATGATCCAAGGAGTTGCTGCGTTTCCAGGAATGAAAGACATTCA  878

Query  963  GGATCAACTTGAACGAATATTTCTGGTTCTTGGAACACCAAATGAGGACACATGGCCTGGAGTTCATTCTTTAC  1036
            |||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  879  GGATCAACTTGAACGGATATTTCTGGTTCTTGGAACACCGAATGAGGACACGTGGCCTGGAGTTCATTCTTTAC  952

Query 1037  CACATTTTAAGCCAGAACGCTTTACCCTGTACAGCTCTAAAAACCTTAGACAAGCATGGAATAAGCTCAGCTAT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  953  CACATTTTAAGCCAGAACGCTTTACCGTGTACAGCTCTAAAAGCCTTAGACAAGCATGGAATAAGCTCAGCTAT  1026

Query 1111  GTGAACCATGCAGAGGACCTGGCCTCCAAGCTCCTACAATGTTCCCCAAAGAACAGACTGTCGGCACAGGCTGC  1184
            ||.||.|||||.||.|||.|||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||.||.||.||||||||.||
Sbjct 1027  GTAAATCATGCTGAAGACTTGGCCTCCAAGCTTCTCCAGTGTTCCCCAAAGAACAGGCTATCAGCACAGGCCGC  1100

Query 1185  CTTGAGCCACGAGTATTTTAGTGACCTGCCGCCACGGCTATGGGAACTCACCGACATGTCTTCTATTTTTACTG  1258
            |||||||||.||||||||.||.||.|||||.||||||||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||.|
Sbjct 1101  CTTGAGCCATGAGTATTTCAGCGATCTGCCTCCACGGCTATGGGAGCTGACTGATATGTCTTCTATTTTTACCG  1174

Query 1259  TCCCAAATGTGAGATTGCAACCAGAAGCTGGAGAAAGCATGCGGGCCTTTGGGAAAAACAATAGTTATGGCAAA  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.||||||||||.|||||||||||||||||.|||
Sbjct 1175  TCCCAAATGTGAGATTGCAACCAGAAGCTGGAGAGAGCATGAGGGCCTTTGGAAAAAACAATAGTTATGGGAAA  1248

Query 1333  AGTCTATCAAACAGCAAG---  1350
            ||.|||||.||||||||.   
Sbjct 1249  AGCCTATCGAACAGCAAACAC  1269