Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_14751
• Subject: NM_008832.2
• Aligned Length: 3727
• Identities: 3312
• Gaps: 107

Alignment

Query    1  ATGAGGAGCCGGAGTAACTCCGGGGTCCGGCTGGACGGCTACGCTCGACTGGTGCAACAGACCATCCTGTGCCA  74
            |||||||||||.||||||||.||.|||||.|||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAGGAGCCGCAGTAACTCGGGAGTCCGCCTGGACGGCTATGCTCGGCTGGTGCATCAGACCATCCTGTGCCA  74

Query   75  TCAGAATCCAGTGACTGGCTTGCTTCCAGCCAGCTATGATCAGAAAGATGCTTGGGTCCGAGATAATGTGTACA  148
            |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TCAGAATCCAGTGACAGGCTTGCTTCCAGCCAGCTATGATCAAAAAGATGCCTGGGTCCGAGATAATGTGTACA  148

Query  149  GCATCTTGGCTGTGTGGGGTTTGGGCCTGGCCTATCGGAAGAATGCAGACCGGGATGAGGATAAGGCAAAGGCC  222
            |.|||.|||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||.|||||.||||||||.||||||||||||
Sbjct  149  GTATCCTGGCTGTGTGGGGTTTGGGCCTGGCATATCGCAAAAATGCTGACCGTGATGAGGACAAGGCAAAGGCC  222

Query  223  TATGAATTGGAGCAGAGTGTAGTGAAGCTGATGAGAGGACTACTGCACTGCATGATCAGACAGGTGGATAAAGT  296
            ||||||.||||||||||||||||||||.|.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TATGAACTGGAGCAGAGTGTAGTGAAGTTAATGAGGGGACTGCTGCACTGCATGATCAGACAGGTGGATAAAGT  296

Query  297  AGAATCCTTCAAATATAGTCAGAGTACTAAGGATAGCCTCCATGCAAAGTACAACACCAAAACCTGTGCCACTG  370
            |||.||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct  297  AGAGTCCTTCAAGTACAGTCAGAGTACTAAAGATAGCCTCCATGCCAAGTACAACACCAAAACTTGTGCCACTG  370

Query  371  TAGTGGGTGATGATCAATGGGGACACCTGCAGTTGGATGCTACCTCTGTGTACCTGCTCTTCTTAGCCCAAATG  444
            |.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.||||.||||||
Sbjct  371  TGGTGGGTGATGACCAGTGGGGACACCTGCAGTTGGATGCTACTTCTGTGTACCTGCTCTTCCTAGCACAAATG  444

Query  445  ACTGCCTCAGGACTCCATATCATCCACAGCCTAGATGAAGTCAATTTCATACAGAACCTTGTGTTTTACATTGA  518
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||
Sbjct  445  ACTGCCTCAGGACTCCATATCATCCACAGCCTAGACGAAGTCAATTTTATACAGAACCTCGTGTTTTACATTGA  518

Query  519  AGCTGCATATAAAACTGCTGACTTCGGGATATGGGAACGTGGAGACAAGACCAACCAAGGGATCTCAGAGTTGA  592
            ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.|||||.||.||||
Sbjct  519  AGCTGCATATAAAACTGCTGACTTTGGGATATGGGAACGTGGCGATAAGACAAACCAAGGCATCTCGGAATTGA  592

Query  593  ATGCCAGTTCAGTTGGAATGGCAAAGGCAGCCCTGGAAGCATTAGATGAACTGGATCTGTTTGGTGTGAAAGGT  666
            ||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||.||||||||.|.||..|||||||||||||||||
Sbjct  593  ATGCGAGTTCAGTTGGAATGGCCAAGGCAGCCCTGGAAGCACTAGATGAATTAGACTTGTTTGGTGTGAAAGGT  666

Query  667  GGGCCTCAATCAGTTATCCATGTCCTGGCTGATGAAGTACAGCACTGCCAGTCTATCCTAAATTCACTACTGCC  740
            |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct  667  GGGCCACAATCAGTTATCCATGTCCTGGCTGATGAAGTCCAACACTGCCAGTCTATCCTGAATTCACTACTGCC  740

Query  741  CCGTGCTTC-ACAT-CAAAGA--GTGATGCTAGTCTACTCTCAGTGGTTTCCTTCCCTGCC-TTGCAGTAGAGG  809
            |.|.||||| |||| ||||||  .||||||.|||||.|||||||||||.||.|||||.||| ||||.|||||||
Sbjct  741  CAGGGCTTCAACATCCAAAGAAGTTGATGCCAGTCTGCTCTCAGTGGTCTCTTTCCCAGCCTTTGCTGTAGAGG  814

Query  810  GTAGCCAGTTGGTGGAGCTCACAAAACAGGAAATCATCACCAAGCTTCAGGGTCGTTATGGTTGCTGTCGCTTT  883
            ..|||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  815  ACAGCCATTTGGTGGAGCTCACCAAACAGGAGATCATCACCAAGCTTCAGGGTCGTTATGGTTGCTGTCGTTTT  888

Query  884  CTACGAGATGGATATAAAACTCCTAAAGAGGATCCCAATCGTCTGTACTATGAACCAGCTGAGCTGAAGCTATT  957
            ||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CTGCGAGATGGATATAAAACTCCTAAAGAGGATCCCAATCGCCTATACTATGAACCAGCTGAGCTGAAGCTATT  962

Query  958  TGAAAACATTGAGTGTGAATGGCCATTGTTCTGGACATACTTTATTCTTGATGGGGTCTTCAGTGGCAATGCAG  1031
            |||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.|||||||||||||.|.||
Sbjct  963  TGAAAACATTGAGTGCGAATGGCCATTGTTCTGGACATACTTTATCCTTGATGGGATCTTCAGTGGCAACGTAG  1036

Query 1032  AACAGGTTCAAGAATATAAAGAGGCTCTTGAAGCAGTCCTCATCAAGGGCAAAAATGGAGTCCCACTTCTGCCA  1105
            ||||||||||||||||||.||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||
Sbjct 1037  AACAGGTTCAAGAATATAGAGAGGCTCTTGATGCAGTCCTCATCAAGGGCAAAAATGGAGTCCCTCTTCTTCCA  1110

Query 1106  GAGCTGTACAGTGTTCCTCCTGACAGGGTCGATGAAGAATATCAGAATCCTCACACTGTGGACCGAGTCCCCAT  1179
            ||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.||||||||.||
Sbjct 1111  GAGCTGTACAGTGTCCCTCCTGACAGGGTTGATGAAGAGTATCAAAATCCCCACACTGTGGATCGAGTCCCTAT  1184

Query 1180  GGGGAAATTGCCTCACATGTGGGGTCAGTCTCTATACATTTTAGGAAGCTTGATGGCAGAGGGATTTTTAGCCC  1253
            |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1185  GGGAAAATTGCCTCACATGTGGGGTCAGTCTCTATACATTTTAGGAAGCTTGATGGCAGAGGGATTTTTAGCTC  1258

Query 1254  CTGGAGAAATTGATCCCCTGAATCGCAGGTTTTCTACTGTACCGAAGCCCGATGTTGTGGTTCAAGTCTCCATT  1327
            |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||.|||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CTGGAGAAATTGATCCCCTGAATCGTAGGTTTTCTACTGTGCCAAAGCCAGATGTGGTGGTTCAAGTCTCCATT  1332

Query 1328  CTAGCTGAAACAGAAGAAATCAAGACCATTTTGAAGGACAAGGGAATTTACGTGGAGACCATTGCTGAGGTATA  1401
            ||.|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.||||||.|.|||||||||||||||||.||.||
Sbjct 1333  CTGGCTGAAACAGAAGAAATCAAGGCCATTTTGAAGGACAAAGGAATTGATGTGGAGACCATTGCTGAAGTGTA  1406

Query 1402  CCCCATCAGAGTACAACCAGCTCGTATTCTCAGCCACATTTATTCCAGCCTAGGATGCAACAATAGAATGAAAC  1475
            ||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1407  CCCCATAAGAGTACAGCCAGCTCGTATTCTCAGCCATATTTATTCTAGTCTAGGATGCAACAGTAGAATGAAAC  1480

Query 1476  TCAGTGGACGACCCTACAGACACATGGGAGTGCTTGGAACTTCAAAACTCTATGACATTCGGAAAACTATCTTT  1549
            |||||||||||||||||||.|.||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1481  TCAGTGGACGACCCTACAGGCTCATGGGTGTGCTTGGAACATCAAAACTTTATGACATTCGCAAAACTATCTTT  1554

Query 1550  ACTTTCACTCCACAGTTTATAGACCAGCAACAGTTCTACCTGGCTCTGGACAACAAGATGATAGTGGAAATGCT  1623
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.||||||||
Sbjct 1555  ACTTTCACTCCACAGTTTATAGACCAGCAACAGTTCTACCTGGCTCTGGACAACCAGATGATAGTAGAAATGCT  1628

Query 1624  TAGAACAGACCTCTCCTACCTCTGTAGCCGCTGGCGGATGACAGGCCAGCCCACCATCACCTTCCCCATCTCAT  1697
            .|||||||||||.|||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||..
Sbjct 1629  CAGAACAGACCTTTCCTACCTCTGTAGCCGCTGGAGGATGACAGGCCAGCCCACGATCACTTTCCCTATCTCGC  1702

Query 1698  ACAGCATGCTTGATGAAGATGGAACAAGCTTGAATTCAAGTATCCTGGCAGCACTCCGAAAAATGCAAGATGGG  1771
            |||.|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.|||||.
Sbjct 1703  ACACCATGCTTGATGAAGATGGAACCAGCTTGAATTCAAGTATCTTGGCAGCACTCCGAAAAATGCAGGATGGC  1776

Query 1772  TATTTTGGTGGGGCAAGGGTTCAAACAGGTAAATTGTCAGAGTTTTTGACAACATCTTGTTGCACACACTTGAG  1845
            ||||||||||||||.|||.|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||
Sbjct 1777  TATTTTGGTGGGGCCAGGATCCAAACAGGTAAATTGTCAGAGTTTTTGACAACATCTTGCTGCACACACTTAAG  1850

Query 1846  CTTCATGGACCCTGGACCTGAGGGTAAGCTGTACAGTGAAGATTATGATGACAACTAT---GATTACCTGGAAT  1916
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||   |||.|..||||.|
Sbjct 1851  CTTCATGGACCCTGGACCTGAGGGTAAGCTGTACAGTGAAGATTATGATGAAGACTATGAAGATGATTTGGACT  1924

Query 1917  CTGGCAACTGGATGAATGATTATGATTCAACCAGTCATGCTCGCTGTGGTGATGAAGTTGCTCGTTATTTAGAT  1990
            ||||||||||||||.|....|||||||||||.|||.|||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.
Sbjct 1925  CTGGCAACTGGATGGACAGCTATGATTCAACAAGTAATGCTCGCTGTGGTGATGAAGTTGCCCGTTATTTAGAC  1998

Query 1991  CACCTTTTGGCGCACACTGCTCCCCATCCTAAACTAGCCCCTACCTCACAGAAGGGAGGGCTAGATCGGTTCCA  2064
            |.|||||||||.|||||||.||||||||||||||||||.||||||||||.|||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1999  CGCCTTTTGGCACACACTGTTCCCCATCCTAAACTAGCTCCTACCTCACGGAAGGGAGGGCTAGATCGGTTCCG  2072

Query 2065  AGCTGCTGTGCAAACAACCTGCGACTTAATGTCCTTGGTGACCAAGGCCAAGGAACTGCATGTACAGAATGTTC  2138
            ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.|||||||||||||.||||||.||||||||||||
Sbjct 2073  AGCTGCTGTGCAAACAACTTGCGACTTAATGTCCTTGGTGGCCAAGGCCAAGGAGCTGCATATACAGAATGTTC  2146

Query 2139  ACATGTATCTTCCTACGAAGTTATTTCAGGCTTCCCGGCCTTCATTCAACTTACTTGATTCACCTCA-TCCCCG  2211
            ||||||||||||||||.||||||||||||.||||.||.||||||.|||||||||||||.||.|||.| ||.|| 
Sbjct 2147  ACATGTATCTTCCTACAAAGTTATTTCAGCCTTCTCGTCCTTCACTCAACTTACTTGACTCCCCTGAGTCTCC-  2219

Query 2212  ACAGGAGAACCAGGTTCCCTCTGTTCGTGTAGAAATACATCTTCCTAGAGACCAGTCTGGGGAGGTGGACTTTA  2285
            |||.||.|.|||||||||.||.||||.|||||||.|.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||..
Sbjct 2220  ACAAGATAGCCAGGTTCCTTCCGTTCATGTAGAAGTGCATCTTCCTAGGGACCAGTCTGGGGAAGTGGACTTCC  2293

Query 2286  AAGCACTGGTTTTACAGTTGAAGGAGACCTCAAGCTTACAGGAACAAGCTGATATCCTCTATATGCTGTATACT  2359
            |..||.||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||.|.
Sbjct 2294  AGTCATTGGTTTCACAGTTGAAGGAGACCTCAAGCTTACAGGAGCAAGCTGATATACTCTACATGCTGTATTCA  2367

Query 2360  ATGAAAGGACCTGACTGGAACACTGAATTGTATAATGAACGGAGTGCTACAGTGAGAGAGCTTCTTACCGAGCT  2433
            |||||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||.||.|.|||||.||.|||||||||||||..||.||
Sbjct 2368  ATGAAAGGACCTGACTGGAACACTGAATTGTATGAAGAAGGGGGGGCTACTGTCAGAGAGCTTCTTAGTGAACT  2441

Query 2434  GTATGGCAAAGTGGGAGAAATTCGTCACTGGGGCCTGATCCGATACATTTCTGGGATCTTAAGGAAGAAAGTGG  2507
            |||||.||||||.||.||||||||.||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 2442  GTATGTCAAAGTTGGTGAAATTCGGCACTGGGGTCTGATCCGATATATCTCTGGGATCTTACGGAAGAAAGTGG  2515

Query 2508  AAGCACTTGATGAGGCCTGCACAGACCTTCTCTCCCACCAGAAACATTTGACAGTAGGACTTCCTCCAGAACCT  2581
            |.|||||||||||||||||||||||||||||.|||.||||||||||..||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2516  AGGCACTTGATGAGGCCTGCACAGACCTTCTGTCCTACCAGAAACACCTGACAGTAGGACTTCCTCCAGAACCT  2589

Query 2582  CGAGAAAAGACTATCTCTGCACCTCTGCCCTATGAGGCGCTCACTCAGCTGATAGATGAAGCCAGTGAAGGGGA  2655
            |||||.|||||.||||||||.|||||.||.||.|||||.||||||.|||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 2590  CGAGAGAAGACCATCTCTGCGCCTCTACCGTACGAGGCACTCACTAAGCTGATAGATGAAGCCAGTGAAGGCGA  2663

Query 2656  TATGAGCATTTCAATCCTTACACAGGAAATAATGGTATATCTAGCCATGTATATGCGAACCCAGCCTGGCCTCT  2729
            .||||||||.||||.|||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||.||||.|||||||||||||
Sbjct 2664  CATGAGCATCTCAACCCTTACACAGGAAATAATGGTCTATCTTGCCATGTATATGAGAACTCAGCCTGGCCTCT  2737

Query 2730  TTGCTGAAATGTTTCGACTTCGAATTGGTCTGATCATACAAGTTATGGCAACAGAACTGGCCCACTCCCTTCGA  2803
            ||||.||||||||..||||||||||.|||.||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||
Sbjct 2738  TTGCAGAAATGTTCAGACTTCGAATCGGTTTGATCATACAAGTTATGGCAACAGAACTAGCACACTCTCTTCGA  2811

Query 2804  TGCTCAGCTGAGGAAGCCACAGAGGGCCTGATGAATCTCAGTCCTTCGCCCATGAAGGATCTCCTGCATCACAT  2877
            ||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||||||.|.||||||||||||||
Sbjct 2812  TGTTCAGCTGAGGAAGCCACAGAGGGCCTGATGAATCTCAGTCCTTCAGCCATGAAGAACCTCCTGCATCACAT  2885

Query 2878  TCTCAGCCGCAAGGAG-TTGGAGTGGGAACGAAGCGTTCGTCCCACTGATCAAAATGTCAGTCCTGCTATTTCT  2950
            ||||||..||||.||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||..||||||.||||||||||||||.
Sbjct 2886  TCTCAGTGGCAAAGAGTTTGGAGT-GGAACGAAGCGTTCGTCCCACTGATTCAAATGTGAGTCCTGCTATTTCC  2958

Query 2951  ATCCACGAGATTGGTGCTG-TGGAGCAACCAAAACAGAACGAACTGGGATCATGCAGTTAAAAAGTGAGATAAA  3023
            |||||.||||||||||||| |||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2959  ATCCATGAGATTGGTGCTGTTGGAGCAACAAAAACTGAACGAACTGGAATCATGCAGTTAAAAAGTGAGATAAA  3032

Query 3024  GCA-----------------------------------------------------------------------  3026
            |||                                                                       
Sbjct 3033  GCAGGTGGAATTTCGTAGGCTGTCTGTCTCGATGGAGAGTCAGACTAGTGGTGGTCATCCCTCGGGTGTAGATT  3106

Query 3027  -------------------GTCACCTGGAACCTCTATGACTCCAAGTAGTGGGTCCTTTCCTA--GTGCATATG  3079
                               |||.||||.|.|||.|||..||.||||||||||.||||||||||  |||  |.||
Sbjct 3107  TGATGTCGCCATCCTTTCTGTCCCCTGCAGCCTGTATTGCTGCAAGTAGTGGATCCTTTCCTACGGTG--TGTG  3178

Query 3080  ATCAGCAGTCATCTAAAGATAGTCGTCAAGGTCAATGGCAACGCCGAAGAAGGCTGGATGGGGCACTGAATAGA  3153
            ||||.|||.||||||||||||||||||||||.||.|||||||||.|.||||||||.|||||.|||||.||||||
Sbjct 3179  ATCATCAGACATCTAAAGATAGTCGTCAAGGCCAGTGGCAACGCAGGAGAAGGCTAGATGGAGCACTAAATAGA  3252

Query 3154  GTTCCAGTTGGATTTTATCAGAAAGTATGGAAAGTTTTGCAGAAGTGTCACGGACTTTCTGTTGAAGGGTTTGT  3227
            ||.|||.|||||||||||||.||||||||||||.||||||||||.|||||.||.||||||||.|||||.|||||
Sbjct 3253  GTACCAATTGGATTTTATCAAAAAGTATGGAAAATTTTGCAGAAATGTCATGGGCTTTCTGTGGAAGGTTTTGT  3326

Query 3228  CCTTCCTTCCTCTACCACTAGAGAGATGACTCCAGGTGAGATTAAATTCTCTGTTCATGTGGAGTCTGTCCTGA  3301
            .|||||.||.||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 3327  TCTTCCCTCTTCAACCACTAGGGAGATGACCCCAGGTGAGATTAAATTCTCTGTCCATGTGGAGTCTGTCCTGA  3400

Query 3302  ATCGTGTACCTCAGCCAGAGTACCGTCAGCTGCTGGTTGAAGCCATCCTTGTCCTCACCATGCTGGCAGATATT  3375
            |||||||.|||||||||||.|||||.||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 3401  ATCGTGTCCCTCAGCCAGAATACCGCCAACTTCTGGTTGAAGCCATCCTTGTTCTCACCATGCTGGCAGATATT  3474

Query 3376  GAAATTCATAGCATCGGAAGCATCATTGCTGTGGAAAAAATAGTGCATATTGCCAATGACTTGTTCCTTCAAGA  3449
            ||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 3475  GAAATTCATAGCATTGGGAGCATCATTGCTGTGGAGAAAATAGTTCATATTGCCAACGACTTGTTCCTTCAAGA  3548

Query 3450  ACAGAAAACCCTTGGCGCAGATGATACCATGTTGGCAAAGGATCCCGCATCTGGCATCTGTACTCTTCTGTATG  3523
            ||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 3549  ACAGAAAACCCTCGGCGCAGATGATACCATGTTGGCAAAGGATCCTGCATCTGGCATCTGTACTCTCCTGTATG  3622

Query 3524  ACAGTGCACCCAGTGGCAGGTTTGGCACCATGACCTACCTCTCCAAGGCAGCCGCCACCTACGTGCAGGAGTTC  3597
            |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.
Sbjct 3623  ACAGTGCACCCAGTGGCAGATTTGGCACCATGACCTACCTCTCCAAGGCAGCTGCCACCTACGTGCAGGAGTTT  3696

Query 3598  CTGCCTCACAGCATCTGTGCCATGCAA  3624
            |||||.||||||.|||||||||||||.
Sbjct 3697  CTGCCACACAGCCTCTGTGCCATGCAG  3723