Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_14790
• Subject: NM_005400.3
• Aligned Length: 2214
• Identities: 2201
• Gaps: 5

Alignment

Query    1  ATGGTAGTGTTCAATGGCCTTCTTAAGATCAAAATCTGCGAGGCCGTGAGCTTGAAGCCCACAGCCTGGTCGCT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGTAGTGTTCAATGGCCTTCTTAAGATCAAAATCTGCGAGGCCGTGAGCTTGAAGCCCACAGCCTGGTCGCT  74

Query   75  GCGCCATGCGGTGGGACCCCGGCCGCAGACTTTCCTTCTCGACCCCTACATTGCCCTCAATGTGGACGACTCGC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GCGCCATGCGGTGGGACCCCGGCCGCAGACTTTCCTTCTCGACCCCTACATTGCCCTCAATGTGGACGACTCGC  148

Query  149  GCATCGGCCAAACGGCCACCAAGCAGAAGACCAACAGCCCGGCCTGGCACGACGAGTTCGTCACCGATGTGTGC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GCATCGGCCAAACGGCCACCAAGCAGAAGACCAACAGCCCGGCCTGGCACGACGAGTTCGTCACCGATGTGTGC  222

Query  223  AACGGACGCAAGATCGAGCTGGCTGTCTTTCACGATGCCCCCATAGGCTACGACGACTTCGTGGCCAACTGCAC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AACGGACGCAAGATCGAGCTGGCTGTCTTTCACGATGCCCCCATAGGCTACGACGACTTCGTGGCCAACTGCAC  296

Query  297  CATCCAGTTTGAGGAGCTGCTGCAGAACGGGAGCCGCCACTTCGAGGACTGGATTGATCTGGAGCCAGAAGGAA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CATCCAGTTTGAGGAGCTGCTGCAGAACGGGAGCCGCCACTTCGAGGACTGGATTGATCTGGAGCCAGAAGGAA  370

Query  371  GAGTGTATGTGATCATCGATCTCTCAGGGTCGTCGGGTGAAGCCCCTAAAGACAATGAAGAGCGTGTGTTCAGG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GAGTGTATGTGATCATCGATCTCTCAGGGTCGTCGGGTGAAGCCCCTAAAGACAATGAAGAGCGTGTGTTCAGG  444

Query  445  GAACGCATGCGGCCGAGGAAGCGGCAGGGGGCCGTCAGGCGCAGGGTCCATCAGGTCAACGGCCACAAGTTCAT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GAACGCATGCGGCCGAGGAAGCGGCAGGGGGCCGTCAGGCGCAGGGTCCATCAGGTCAACGGCCACAAGTTCAT  518

Query  519  GGCCACCTATCTTCGGCAGCCCACCTACTGCTCCCATTGCAGAGACTTCATCTGGGGTGTCATAGGAAAGCAGG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GGCCACCTATCTTCGGCAGCCCACCTACTGCTCCCATTGCAGAGACTTCATCTGGGGTGTCATAGGAAAGCAGG  592

Query  593  GATACCAGTGTCAAGTCTGCACCTGCGTGGTCCACAAGCGGTGCCACGAGCTCATAATCACAAAGTGTGCTGGG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GATACCAGTGTCAAGTCTGCACCTGCGTGGTCCACAAGCGGTGCCACGAGCTCATAATCACAAAGTGTGCTGGG  666

Query  667  GTTAAGAAGCAGGAAACCCCCGAACAGGTGGGCTCCCAGCGGTTCAACCGTC-ACATGGCCCCA-AAGTTCGGT  738
            .|.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||| |.|||| |||| |||||| |||||||||
Sbjct  667  TTAAAGAAGCAGGAGACCCCCGACCAGGTGGGCTCCCAGCGGTTC-AGCGTCAACAT-GCCCCACAAGTTCGGT  738

Query  739  ATCCACAACTACAAGGTCCCTACCTTCTGCGATCACTGTGGGTCCCTGCTCTGGGGACTCTTGCGGCAGGGTTT  812
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  739  ATCCACAACTACAAGGTCCCTACCTTCTGCGATCACTGTGGGTCCCTGCTCTGGGGACTCTTGCGGCAGGGTTT  812

Query  813  GCAGTGTAAAGTCTGCAAAATGAATGTTCACCGTCGATGTGAGACCAACGTGGCTCCCAACTGTGGAGTGGATG  886
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  813  GCAGTGTAAAGTCTGCAAAATGAATGTTCACCGTCGATGTGAGACCAACGTGGCTCCCAACTGTGGAGTGGATG  886

Query  887  CCAGAGGAATCGCCAAAGTACTGGCCGACCTGGGCGTTACCCCAGACAAAATCACCAACAGCGGCCAGAGAAGG  960
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  887  CCAGAGGAATCGCCAAAGTACTGGCCGACCTGGGCGTTACCCCAGACAAAATCACCAACAGCGGCCAGAGAAGG  960

Query  961  AAAAAGCTCATTGCTGGTGCCGAGTCCCCGCAGCCTGCTTCTGGAAGCTCACCATCTGAGGAAGATCGATCCAA  1034
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  961  AAAAAGCTCATTGCTGGTGCCGAGTCCCCGCAGCCTGCTTCTGGAAGCTCACCATCTGAGGAAGATCGATCCAA  1034

Query 1035  GTCAGCACCCACCTCCCCTTGTGACCAGGAAATAAAAGAACTTGAGAACAACATTCGGAAAGCCTTGTCATTTG  1108
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1035  GTCAGCACCCACCTCCCCTTGTGACCAGGAAATAAAAGAACTTGAGAACAACATTCGGAAAGCCTTGTCATTTG  1108

Query 1109  ACAACCGAGGAGAGGAGCACCGGGCAGCATCGTCTCCTGATGGCCAGCTGATGAGCCCCGGTGAGAATGGCGAA  1182
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1109  ACAACCGAGGAGAGGAGCACCGGGCAGCATCGTCTCCTGATGGCCAGCTGATGAGCCCCGGTGAGAATGGCGAA  1182

Query 1183  GTCCGGCAAGGCCAGGCCAAGCGCCTGGGCCTGGATGAGTTCAACTTCATCAAGGTGTTGGGCAAAGGCAGCTT  1256
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1183  GTCCGGCAAGGCCAGGCCAAGCGCCTGGGCCTGGATGAGTTCAACTTCATCAAGGTGTTGGGCAAAGGCAGCTT  1256

Query 1257  TGGCAAGGTCATGTTGGCAGAACTCAAGGGCAAAGATGAAGTATATGCTGTGAAGGTCTTAAAGAAGGACGTCA  1330
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1257  TGGCAAGGTCATGTTGGCAGAACTCAAGGGCAAAGATGAAGTATATGCTGTGAAGGTCTTAAAGAAGGACGTCA  1330

Query 1331  TCCTTCAGGATGATGACGTGGACTGCACAATGACAGAGAAGAGGATTTTGGCTCTGGCACGGAAACACCCGTAC  1404
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1331  TCCTTCAGGATGATGACGTGGACTGCACAATGACAGAGAAGAGGATTTTGGCTCTGGCACGGAAACACCCGTAC  1404

Query 1405  CTTACCCAACTCTACTGCTGCTTCCAGACCAAGGACCGCCTCTTTTTCGTCATGGAATATGTAAATGGTGGAGA  1478
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1405  CTTACCCAACTCTACTGCTGCTTCCAGACCAAGGACCGCCTCTTTTTCGTCATGGAATATGTAAATGGTGGAGA  1478

Query 1479  CCTCATGTTTCAGATTCAGCGCTCCCGAAAATTCGACGAGCCTCGTTCACGTTTCTATGCTGCAGAGGTCACAT  1552
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 1479  CCTCATGTTTCAGATTCAGCGCTCCCGAAAATTCGACGAGCCTCGTTCACGGTTCTATGCTGCAGAGGTCACAT  1552

Query 1553  CGGCCCCTCATGTTCTTCCACCAGCATGGAGTCATCTACAGGGATTTGAAACTGGACAACATCTTTCTGGATGC  1626
            ||| |||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 1553  CGG-CCCTCATGTTCCTCCACCAGCATGGAGTCATCTACAGGGATTTGAAACTGGACAACATCCTTCTGGATGC  1625

Query 1627  AGAAGGTCACTGCAAGCTGGCTGACTTCGGGATGTGCAAGGAAGGGATTCTGAATGGTGTGACGACCACCACGT  1700
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1626  AGAAGGTCACTGCAAGCTGGCTGACTTCGGGATGTGCAAGGAAGGGATTCTGAATGGTGTGACGACCACCACGT  1699

Query 1701  TCTGTGGGACTCCTGACTACATAGCTCCTGAGATCCTGCAGGAGTTGGAGTATGGCCCCTCCGTGGACTGGTGG  1774
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1700  TCTGTGGGACTCCTGACTACATAGCTCCTGAGATCCTGCAGGAGTTGGAGTATGGCCCCTCCGTGGACTGGTGG  1773

Query 1775  GCCCTGGGGGTGCTGATGTACGAGATGATGGCTGGACAGCCTCCCTTTGAGGCCGACAATGAGGACGACCTATT  1848
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1774  GCCCTGGGGGTGCTGATGTACGAGATGATGGCTGGACAGCCTCCCTTTGAGGCCGACAATGAGGACGACCTATT  1847

Query 1849  TGAGTCCATCCTCCATGACGACGTGCTGTACCCAGTCTGGCTCAGCAAGGAGGCTGTCAGCATCTTGAAAGCTT  1922
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1848  TGAGTCCATCCTCCATGACGACGTGCTGTACCCAGTCTGGCTCAGCAAGGAGGCTGTCAGCATCTTGAAAGCTT  1921

Query 1923  TCATGACGAAGAATCCCCACAAGCGCCTGGGCTGTGTGGCATCGCAGAATGGCGAGGACGCCATCAAGCAGCAC  1996
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1922  TCATGACGAAGAATCCCCACAAGCGCCTGGGCTGTGTGGCATCGCAGAATGGCGAGGACGCCATCAAGCAGCAC  1995

Query 1997  CCATTCTTCAAAGAGATTGACTGGGTGCTCCTGGAGCAGAAGAAGATCAAGCCACCCTTCAAACCACGCATTAA  2070
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1996  CCATTCTTCAAAGAGATTGACTGGGTGCTCCTGGAGCAGAAGAAGATCAAGCCACCCTTCAAACCACGCATTAA  2069

Query 2071  AACCAAAAGAGACGTCAATAATTTTGACCAAGACTTTACCCGGGAAGAGCCGGTACTCACCCTTGTGGACGAAG  2144
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2070  AACCAAAAGAGACGTCAATAATTTTGACCAAGACTTTACCCGGGAAGAGCCGGTACTCACCCTTGTGGACGAAG  2143

Query 2145  CAATTGTAAAGCAGATCAACCAGGAGGAATTCAAAGGTTTCTCCTACTTTGGTGAAGACCTGATGCCC  2212
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2144  CAATTGTAAAGCAGATCAACCAGGAGGAATTCAAAGGTTTCTCCTACTTTGGTGAAGACCTGATGCCC  2211