Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_14790
• Subject: NM_011104.3
• Aligned Length: 2219
• Identities: 2012
• Gaps: 15

Alignment

Query    1  ATGGTAGTGTTCAATGGCCTTCTTAAGATCAAAATCTGCGAGGCCGTGAGCTTGAAGCCCACAGCCTGGTCGCT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGTAGTGTTCAATGGCCTTCTTAAGATCAAAATCTGCGAGGCGGTGAGCTTGAAGCCCACAGCCTGGTCGCT  74

Query   75  GCGCCATGCGGTGGGACCCCGGCCGCAGACTTTCCTTCTCGACCCCTACATTGCCCTCAATGTGGACGACTCGC  148
            ||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||.|.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||
Sbjct   75  GCGCCATGCGGTGGGACCCCGGCCACAGACGTTCCTTTTGGACCCCTACATTGCCCTTAACGTGGACGACTCGC  148

Query  149  GCATCGGCCAAACGGCCACCAAGCAGAAGACCAACAGCCCGGCCTGGCACGACGAGTTCGTCACCGATGTGTGC  222
            |||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GCATCGGCCAAACAGCCACCAAGCAAAAGACCAACAGCCCGGCCTGGCACGATGAGTTCGTCACCGATGTGTGC  222

Query  223  AACGGACGCAAGATCGAGCTGGCTGTCTTTCACGATGCCCCCATAGGCTACGACGACTTCGTGGCCAACTGCAC  296
            ||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AATGGGCGCAAGATCGAGCTGGCTGTCTTTCACGACGCTCCTATCGGCTACGACGACTTCGTGGCCAACTGCAC  296

Query  297  CATCCAGTTTGAGGAGCTGCTGCAGAACGGGAGCCGCCACTTCGAGGACTGGATTGATCTGGAGCCAGAAGGAA  370
            |||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  297  CATCCAGTTCGAGGAGCTGCTGCAGAATGGGAGCCGTCACTTCGAGGACTGGATTGACCTGGAGCCAGAAGGAA  370

Query  371  GAGTGTATGTGATCATCGATCTCTCAGGGTCGTCGGGTGAAGCCCCTAAAGACAATGAAGAGCGTGTGTTCAGG  444
            .||||||.|||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||
Sbjct  371  AAGTGTACGTGATCATCGATCTCTCGGGATCATCGGGTGAAGCCCCTAAAGACAATGAAGAACGAGTGTTCAGG  444

Query  445  GAACGCATGCGGCCGAGGAAGCGGCAGGGGGCCGTCAGGCGCAGGGTCCATCAGGTCAACGGCCACAAGTTCAT  518
            ||.||.||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||
Sbjct  445  GAGCGTATGCGGCCAAGGAAGCGGCAAGGGGCTGTCAGGCGCAGGGTCCACCAGGTCAATGGCCACAAGTTCAT  518

Query  519  GGCCACCTATCTT-CGGCAGCCCACCTACTGCTCCCATTGCAGAGACTTCATCTGGGGTGTCATAGGAAAGCAG  591
            ||||||||| ||| |||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  519  GGCCACCTA-CTTGCGGCAACCCACCTACTGCTCCCACTGCAGAGATTTCATCTGGGGTGTCATAGGAAAACAG  591

Query  592  GGATACCAGTGTCAAGTCTGCACCTGCGTGGTCCACAAGCGGTGCCACGAGCTCATAATCACAAAGTGTGCTGG  665
            |||||.||.||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.||.||.||||||||.||.||||||||.|||||
Sbjct  592  GGATATCAATGTCAAGTTTGCACTTGCGTTGTCCACAAGCGATGTCATGAGCTCATTATTACAAAGTGCGCTGG  665

Query  666  GGTTAAGAAGCAGGAAACCCCCGAACAGGTGGGCTCCCAGCGGTTCAACCGTC-ACATGGCCCCA-AAGTTCGG  737
            |.|.|||||.|||||||||||.||..|||||||||||||.|||||| |.|||| |||| |||||| ||||||||
Sbjct  666  GCTGAAGAAACAGGAAACCCCTGACGAGGTGGGCTCCCAACGGTTC-AGCGTCAACAT-GCCCCACAAGTTCGG  737

Query  738  TATCCACAACTACAAGGTCCCTACCTTCTGCGATCACTGTGGGTCCCTGCTCTGGGGACTCTTGCGGCAGGGTT  811
            .||||||||||||||||||||.||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|
Sbjct  738  GATCCACAACTACAAGGTCCCCACGTTCTGTGACCACTGTGGGTCCCTGCTCTGGGGCCTCTTGCGGCAGGGCT  811

Query  812  TGCAGTGTAAAGTCTGCAAAATGAATGTTCACCGTCGATGTGAGACCAACGTGGCTCCCAACTGTGGAGTGGAT  885
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.
Sbjct  812  TGCAGTGTAAAGTCTGCAAAATGAATGTTCACCGGCGATGTGAGACCAATGTGGCTCCCAACTGTGGGGTAGAC  885

Query  886  GCCAGAGGAATCGCCAAAGTACTGGCCGACCTGGGCGTTACCCCAGACAAAATCACCAACAGCGGCCAGAGAAG  959
            |||||||||||.||||||||.|||||.|||||.||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||.||.||
Sbjct  886  GCCAGAGGAATTGCCAAAGTGCTGGCTGACCTTGGTGTTACTCCAGACAAAATCACCAACAGTGGCCAAAGGAG  959

Query  960  GAAAAAGCTCATTGCTGGTGCCGAGTCCCCGCAGCCTGCTTCTGGAAGCTCACCATCTGAGGAAGATCGATCCA  1033
            ||||||||||..|||||||||.||||||||.|||||.||||||||||.|||.||||||||.||.||.|||||||
Sbjct  960  GAAAAAGCTCGCTGCTGGTGCTGAGTCCCCACAGCCGGCTTCTGGAAACTCCCCATCTGAAGACGACCGATCCA  1033

Query 1034  AGTCAGCACCCACCTCCCCTTGTGACCAGGAAATAAAAGAACTTGAGAACAACATTCGGAAAGCCTTGTCATTT  1107
            |||||||.||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1034  AGTCAGCGCCCACCTCCCCTTGTGACCAGGAACTAAAAGAACTTGAAAACAACATTCGGAAGGCCTTGTCATTT  1107

Query 1108  GACAACCGAGGAGAGGAGCACCGGGCAGCATCGT----CTCCTGATGGCCAGCTGATGAGCCCCGGTGAGAATG  1177
            |||||||||||||||||||||||   |||.||||    |.|| ||||||||||||...||||||||.|||||.|
Sbjct 1108  GACAACCGAGGAGAGGAGCACCG---AGCGTCGTCGGCCACC-GATGGCCAGCTGGCAAGCCCCGGAGAGAACG  1177

Query 1178  GCGAAGTCCGGCAAGGCCAGGCCAAGCGCCTGGGCCTGGATGAGTTCAACTTCATCAAGGTGTTGGGCAAAGGC  1251
            |.||||||||||.||||||||||||||||.||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1178  GGGAAGTCCGGCCAGGCCAGGCCAAGCGCTTGGGGCTGGATGAGTTCAACTTCATCAAGGTGTTGGGCAAAGGC  1251

Query 1252  AGCTTTGGCAAGGTCATGTTGGCAGAACTCAAGGGCAAAGATGAAGTATATGCTGTGAAGGTCTTAAAGAAGGA  1325
            |||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1252  AGCTTTGGCAAGGTCATGTTGGCGGAACTCAAAGGCAAAGATGAAGTCTACGCTGTGAAGGTCTTGAAGAAGGA  1325

Query 1326  CGTCATCCTTCAGGATGATGACGTGGACTGCACAATGACAGAGAAGAGGATTTTGGCTCTGGCACGGAAACACC  1399
            |||.|||||.||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 1326  CGTTATCCTACAAGACGATGATGTGGACTGCACAATGACAGAGAAGAGGATTTTGGCTCTGGCTCGGAAACACC  1399

Query 1400  CGTACCTTACCCAACTCTACTGCTGCTTCCAGACCAAGGACCGCCTCTTTTTCGTCATGGAATATGTAAATGGT  1473
            |.||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1400  CTTATCTAACCCAACTCTATTGCTGCTTCCAGACCAAGGACCGCCTCTTCTTCGTCATGGAATATGTAAATGGT  1473

Query 1474  GGAGACCTCATGTTTCAGATTCAGCGCTCCCGAAAATTCGACGAGCCTCGTTCACGTTTCTATGCTGCAGAGGT  1547
            ||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||.||.||||||||.||||||||
Sbjct 1474  GGAGACCTCATGTTCCAGATTCAGCGGTCCCGAAAATTTGATGAGCCTCGTTCTCGGTTCTATGCCGCAGAGGT  1547

Query 1548  CACATCGGCCCCTCATGTTCTTCCACCAGCATGGAGTCATCTACAGGGATTTGAAACTGGACAACATCTTTCTG  1621
            ||||||.| ||||||||||..||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||.||||.
Sbjct 1548  CACATCAG-CCCTCATGTTTCTCCACCAGCACGGAGTGATCTACAGGGATTTGAAACTGGACAACATCCTTCTA  1620

Query 1622  GATGCAGAAGGTCACTGCAAGCTGGCTGACTTCGGGATGTGCAAGGAAGGGATTCTGAATGGTGTGACGACCAC  1695
            |||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.|||||||||||||.||.||
Sbjct 1621  GATGCAGAAGGCCACTGCAAGCTGGCTGACTTTGGGATGTGCAAGGAAGGGATTATGAATGGTGTGACAACTAC  1694

Query 1696  CACGTTCTGTGGGACTCCTGACTACATAGCTCCTGAGATCCTGCAGGAGTTGGAGTATGGCCCCTCCGTGGACT  1769
            |||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||||
Sbjct 1695  CACCTTCTGTGGGACTCCTGACTACATAGCTCCAGAGATCCTACAGGAGTTGGAGTACGGCCCCTCAGTGGACT  1768

Query 1770  GGTGGGCCCTGGGGGTGCTGATGTACGAGATGATGGCTGGACAGCCTCCCTTTGAGGCCGACAATGAGGACGAC  1843
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.|||||.|||||||||
Sbjct 1769  GGTGGGCCCTGGGGGTGCTGATGTACGAGATGATGGCTGGGCAGCCCCCCTTTGAAGCTGACAACGAGGACGAC  1842

Query 1844  CTATTTGAGTCCATCCTCCATGACGACGTGCTGTACCCAGTCTGGCTCAGCAAGGAGGCTGTCAGCATCTTGAA  1917
            .|.||.||.||||||||.|||||.||.||.||.||.||.||||||||.||||||||.||||||||||||.||||
Sbjct 1843  TTGTTCGAATCCATCCTTCATGATGATGTTCTCTATCCTGTCTGGCTTAGCAAGGAAGCTGTCAGCATCCTGAA  1916

Query 1918  AGCTTTCATGACGAAGAATCCCCACAAGCGCCTGGGCTGTGTGGCATCGCAGAATGGCGAGGACGCCATCAAGC  1991
            ||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||.|||||||.||.||||||||||||||||
Sbjct 1917  AGCTTTCATGACCAAGAACCCGCACAAGCGCCTGGGCTGTGTGGCAGCGCAGAACGGGGAGGACGCCATCAAGC  1990

Query 1992  AGCACCCATTCTTCAAAGAGATTGACTGGGTGCTCCTGGAGCAGAAGAAGATCAAGCCACCCTTCAAACCACGC  2065
            |.||.|||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||.||||||||.||..|.
Sbjct 1991  AACATCCATTCTTCAAGGAGATTGACTGGGTACTGCTGGAGCAGAAGAAAATCAAGCCCCCCTTCAAGCCGAGA  2064

Query 2066  ATTAAAACCAAAAGAGACGTCAATAATTTTGACCAAGACTTTACCCGGGAAGAGCCGGTACTCACCCTTGTGGA  2139
            |||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||..||||.||.||||||||
Sbjct 2065  ATTAAAACCAAAAGAGATGTCAATAACTTTGACCAAGACTTTACGCGGGAAGAGCCAATACTTACACTTGTGGA  2138

Query 2140  CGAAGCAATTGTAAAGCAGATCAACCAGGAGGAATTCAAAGGTTTCTCCTACTTTGGTGAAGACCTGATGCCC  2212
            .||||||||..|.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2139  TGAAGCAATCATTAAGCAGATCAACCAGGAAGAATTCAAAGGCTTCTCCTACTTTGGTGAAGACCTGATGCCC  2211