Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_14790
• Subject: XM_006523833.2
• Aligned Length: 2221
• Identities: 1642
• Gaps: 409

Alignment

Query    1  ATGGTAGTGTTCAATGGCCTTCTTAAGATCAAAATCTGCGAGGCCGTGAGCTTGAAGCCCACAGCCTGGTCGCT  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GCGCCATGCGGTGGGACCCCGGCCGCAGACTTTCCTTCTCGACCCCTACATTGCCCTCAATGTGGACGACTCGC  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  GCATCGGCCAAACGGCCACCAAGCAGAAGACCAACAGCCCGGCCTGGCACGACGAGTTCGTCACCGATGTGTGC  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  AACGGACGCAAGATCGAGCTGGCTGTCTTTCACGATGCCCCCATAGGCTACGACGACTTCGTGGCCAACTGCAC  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  CATCCAGTTTGAGGAGCTGCTGCAGAACGGGAGCCGCCACTTCGAGGACTGGATTGATCTGGAGCCAGAAGGAA  370
                                                                    ||         |||||| 
Sbjct    1  --------------------------------------------------------AT---------GAAGGA-  8

Query  371  GAGTGTATGTGATCATCGATCTCTCAGGGT--CGTCGGGTGAAGCCCCTAAAGACAATGAAGAGCGTGTGTTCA  442
                                  |||||..|  |.|        ||||||||||||||||||||.||.|||||||
Sbjct    9  ----------------------CTCAGACTCCCTT--------GCCCCTAAAGACAATGAAGAACGAGTGTTCA  52

Query  443  GGGAACGCATGCGGCCGAGGAAGCGGCAGGGGGCCGTCAGGCGCAGGGTCCATCAGGTCAACGGCCACAAGTTC  516
            ||||.||.||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||
Sbjct   53  GGGAGCGTATGCGGCCAAGGAAGCGGCAAGGGGCTGTCAGGCGCAGGGTCCACCAGGTCAATGGCCACAAGTTC  126

Query  517  ATGGCCACCTATCTT-CGGCAGCCCACCTACTGCTCCCATTGCAGAGACTTCATCTGGGGTGTCATAGGAAAGC  589
            ||||||||||| ||| |||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  127  ATGGCCACCTA-CTTGCGGCAACCCACCTACTGCTCCCACTGCAGAGATTTCATCTGGGGTGTCATAGGAAAAC  199

Query  590  AGGGATACCAGTGTCAAGTCTGCACCTGCGTGGTCCACAAGCGGTGCCACGAGCTCATAATCACAAAGTGTGCT  663
            |||||||.||.||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.||.||.||||||||.||.||||||||.|||
Sbjct  200  AGGGATATCAATGTCAAGTTTGCACTTGCGTTGTCCACAAGCGATGTCATGAGCTCATTATTACAAAGTGCGCT  273

Query  664  GGGGTTAAGAAGCAGGAAACCCCCGAACAGGTGGGCTCCCAGCGGTTCAACCGTC-ACATGGCCCCA-AAGTTC  735
            |||.|.|||||.|||||||||||.||..|||||||||||||.|||||| |.|||| |||| |||||| ||||||
Sbjct  274  GGGCTGAAGAAACAGGAAACCCCTGACGAGGTGGGCTCCCAACGGTTC-AGCGTCAACAT-GCCCCACAAGTTC  345

Query  736  GGTATCCACAACTACAAGGTCCCTACCTTCTGCGATCACTGTGGGTCCCTGCTCTGGGGACTCTTGCGGCAGGG  809
            ||.||||||||||||||||||||.||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct  346  GGGATCCACAACTACAAGGTCCCCACGTTCTGTGACCACTGTGGGTCCCTGCTCTGGGGCCTCTTGCGGCAGGG  419

Query  810  TTTGCAGTGTAAAGTCTGCAAAATGAATGTTCACCGTCGATGTGAGACCAACGTGGCTCCCAACTGTGGAGTGG  883
            .|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|
Sbjct  420  CTTGCAGTGTAAAGTCTGCAAAATGAATGTTCACCGGCGATGTGAGACCAATGTGGCTCCCAACTGTGGGGTAG  493

Query  884  ATGCCAGAGGAATCGCCAAAGTACTGGCCGACCTGGGCGTTACCCCAGACAAAATCACCAACAGCGGCCAGAGA  957
            |.|||||||||||.||||||||.|||||.|||||.||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||.||.
Sbjct  494  ACGCCAGAGGAATTGCCAAAGTGCTGGCTGACCTTGGTGTTACTCCAGACAAAATCACCAACAGTGGCCAAAGG  567

Query  958  AGGAAAAAGCTCATTGCTGGTGCCGAGTCCCCGCAGCCTGCTTCTGGAAGCTCACCATCTGAGGAAGATCGATC  1031
            ||||||||||||..|||||||||.||||||||.|||||.||||||||||.|||.||||||||.||.||.|||||
Sbjct  568  AGGAAAAAGCTCGCTGCTGGTGCTGAGTCCCCACAGCCGGCTTCTGGAAACTCCCCATCTGAAGACGACCGATC  641

Query 1032  CAAGTCAGCACCCACCTCCCCTTGTGACCAGGAAATAAAAGAACTTGAGAACAACATTCGGAAAGCCTTGTCAT  1105
            |||||||||.||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||
Sbjct  642  CAAGTCAGCGCCCACCTCCCCTTGTGACCAGGAACTAAAAGAACTTGAAAACAACATTCGGAAGGCCTTGTCAT  715

Query 1106  TTGACAACCGAGGAGAGGAGCACCGGGCAGCATCGT----CTCCTGATGGCCAGCTGATGAGCCCCGGTGAGAA  1175
            |||||||||||||||||||||||||   |||.||||    |.|| ||||||||||||...||||||||.|||||
Sbjct  716  TTGACAACCGAGGAGAGGAGCACCG---AGCGTCGTCGGCCACC-GATGGCCAGCTGGCAAGCCCCGGAGAGAA  785

Query 1176  TGGCGAAGTCCGGCAAGGCCAGGCCAAGCGCCTGGGCCTGGATGAGTTCAACTTCATCAAGGTGTTGGGCAAAG  1249
            .||.||||||||||.||||||||||||||||.||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  786  CGGGGAAGTCCGGCCAGGCCAGGCCAAGCGCTTGGGGCTGGATGAGTTCAACTTCATCAAGGTGTTGGGCAAAG  859

Query 1250  GCAGCTTTGGCAAGGTCATGTTGGCAGAACTCAAGGGCAAAGATGAAGTATATGCTGTGAAGGTCTTAAAGAAG  1323
            |||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||
Sbjct  860  GCAGCTTTGGCAAGGTCATGTTGGCGGAACTCAAAGGCAAAGATGAAGTCTACGCTGTGAAGGTCTTGAAGAAG  933

Query 1324  GACGTCATCCTTCAGGATGATGACGTGGACTGCACAATGACAGAGAAGAGGATTTTGGCTCTGGCACGGAAACA  1397
            |||||.|||||.||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  934  GACGTTATCCTACAAGACGATGATGTGGACTGCACAATGACAGAGAAGAGGATTTTGGCTCTGGCTCGGAAACA  1007

Query 1398  CCCGTACCTTACCCAACTCTACTGCTGCTTCCAGACCAAGGACCGCCTCTTTTTCGTCATGGAATATGTAAATG  1471
            |||.||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 1008  CCCTTATCTAACCCAACTCTATTGCTGCTTCCAGACCAAGGACCGCCTCTTCTTCGTCATGGAATATGTAAATG  1081

Query 1472  GTGGAGACCTCATGTTTCAGATTCAGCGCTCCCGAAAATTCGACGAGCCTCGTTCACGTTTCTATGCTGCAGAG  1545
            ||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||.||.||||||||.||||||
Sbjct 1082  GTGGAGACCTCATGTTCCAGATTCAGCGGTCCCGAAAATTTGATGAGCCTCGTTCTCGGTTCTATGCCGCAGAG  1155

Query 1546  GTCACATCGGCCCCTCATGTTCTTCCACCAGCATGGAGTCATCTACAGGGATTTGAAACTGGACAACATCTTTC  1619
            ||||||||.| ||||||||||..||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1156  GTCACATCAG-CCCTCATGTTTCTCCACCAGCACGGAGTGATCTACAGGGATTTGAAACTGGACAACATCCTTC  1228

Query 1620  TGGATGCAGAAGGTCACTGCAAGCTGGCTGACTTCGGGATGTGCAAGGAAGGGATTCTGAATGGTGTGACGACC  1693
            |.|||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.|||||||||||||.||.
Sbjct 1229  TAGATGCAGAAGGCCACTGCAAGCTGGCTGACTTTGGGATGTGCAAGGAAGGGATTATGAATGGTGTGACAACT  1302

Query 1694  ACCACGTTCTGTGGGACTCCTGACTACATAGCTCCTGAGATCCTGCAGGAGTTGGAGTATGGCCCCTCCGTGGA  1767
            |||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||
Sbjct 1303  ACCACCTTCTGTGGGACTCCTGACTACATAGCTCCAGAGATCCTACAGGAGTTGGAGTACGGCCCCTCAGTGGA  1376

Query 1768  CTGGTGGGCCCTGGGGGTGCTGATGTACGAGATGATGGCTGGACAGCCTCCCTTTGAGGCCGACAATGAGGACG  1841
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.|||||.|||||||
Sbjct 1377  CTGGTGGGCCCTGGGGGTGCTGATGTACGAGATGATGGCTGGGCAGCCCCCCTTTGAAGCTGACAACGAGGACG  1450

Query 1842  ACCTATTTGAGTCCATCCTCCATGACGACGTGCTGTACCCAGTCTGGCTCAGCAAGGAGGCTGTCAGCATCTTG  1915
            ||.|.||.||.||||||||.|||||.||.||.||.||.||.||||||||.||||||||.||||||||||||.||
Sbjct 1451  ACTTGTTCGAATCCATCCTTCATGATGATGTTCTCTATCCTGTCTGGCTTAGCAAGGAAGCTGTCAGCATCCTG  1524

Query 1916  AAAGCTTTCATGACGAAGAATCCCCACAAGCGCCTGGGCTGTGTGGCATCGCAGAATGGCGAGGACGCCATCAA  1989
            ||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||.|||||||.||.||||||||||||||
Sbjct 1525  AAAGCTTTCATGACCAAGAACCCGCACAAGCGCCTGGGCTGTGTGGCAGCGCAGAACGGGGAGGACGCCATCAA  1598

Query 1990  GCAGCACCCATTCTTCAAAGAGATTGACTGGGTGCTCCTGGAGCAGAAGAAGATCAAGCCACCCTTCAAACCAC  2063
            |||.||.|||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||.||||||||.||..
Sbjct 1599  GCAACATCCATTCTTCAAGGAGATTGACTGGGTACTGCTGGAGCAGAAGAAAATCAAGCCCCCCTTCAAGCCGA  1672

Query 2064  GCATTAAAACCAAAAGAGACGTCAATAATTTTGACCAAGACTTTACCCGGGAAGAGCCGGTACTCACCCTTGTG  2137
            |.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||..||||.||.||||||
Sbjct 1673  GAATTAAAACCAAAAGAGATGTCAATAACTTTGACCAAGACTTTACGCGGGAAGAGCCAATACTTACACTTGTG  1746

Query 2138  GACGAAGCAATTGTAAAGCAGATCAACCAGGAGGAATTCAAAGGTTTCTCCTACTTTGGTGAAGACCTGATGCC  2211
            ||.||||||||..|.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1747  GATGAAGCAATCATTAAGCAGATCAACCAGGAAGAATTCAAAGGCTTCTCCTACTTTGGTGAAGACCTGATGCC  1820

Query 2212  C  2212
            |
Sbjct 1821  C  1821