Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_14797
• Subject: XM_006526768.3
• Aligned Length: 2095
• Identities: 1794
• Gaps: 118

Alignment

Query    1  ATGGGC-------------ACCTTGCG-GGATTTACAGTACGCGCTC---CAGGAGAAGATCGAGGAGCTGAGG  57
            |||.||             ||.||||| .||||..||     .||||   .||||||.||||.|.||||||..|
Sbjct    1  ATGAGCGAACTGGAGGAAGACTTTGCGAAGATTCTCA-----TGCTCAAGGAGGAGAGGATCAAAGAGCTGGAG  69

Query   58  CAGCGGGATGCTCTCATCGACGAGCTGGAGCTGGAGTTGGATCAGAAGGACGAACTGATCCAGAAGCTGCAGAA  131
            .||||    |||.|||                          .|||||||.|||...||||||.|||||.|||.
Sbjct   70  AAGCG----GCTGTCA--------------------------GAGAAGGAGGAAGAAATCCAGGAGCTGAAGAG  113

Query  132  CGAGCTGGACAAGTACCGCTCGGTGAT-CCG--ACCAGCCACCCAGCAGGCGCAGAAGCAGAGCGCGAGCACCT  202
            ..|.||..||||.|.||..||||||.| |||  .||..|||||||                        ||.| 
Sbjct  114  GAAACTCCACAAATGCCAGTCGGTGCTGCCGGTGCCCTCCACCCA------------------------CATC-  162

Query  203  TGCAGGGCGAGCCGCGCACCAAGCG---GCAGGCGATCTCCGCCGAGCC-CACCG-CCTTCGACA------TCC  265
                 |||   |||||.||||..||   |||||..||||||||.||||| ||  | |||   |||      |||
Sbjct  163  -----GGC---CCGCGGACCACCCGGGCGCAGGGCATCTCCGCGGAGCCGCA--GACCT---ACAGGTCCTTCC  223

Query  266  AGGATCTCAGCCATGTGACCCTGCCCTTCTAC----CCCAAGAGCCCACAGTCCAAGGATCTTATAAAGGAAGC  335
            |.||.||..||||.|.|..||.|...||| ||    .||.||||      |||.||||||||.||||||||.||
Sbjct  224  ACGACCTGCGCCAGGCGTTCCGGAAGTTC-ACTAAATCCGAGAG------GTCGAAGGATCTCATAAAGGAGGC  290

Query  336  TATCCTTGACAATGACTTTATGAAGAACTTGGAGCTGTCGCAGATCCAGGAGATTGTGGATTGTATGTACCCGG  409
            ||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|
Sbjct  291  TATCCTTGACAATGACTTCATGAAGAACTTGGAGCTGTCACAGATCCAGGAGATTGTGGACTGTATGTACCCCG  364

Query  410  TGGAGTATGGCAAGGACAGTTGCATCATCAAAGAAGGAGACGTGGGGTCACTGGTGTATGTCATGGAAGATGGT  483
            ||||.||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.
Sbjct  365  TGGAATACGGCAAGGACAGCTGCATCATCAAGGAAGGCGATGTGGGGTCACTGGTGTACGTCATGGAAGATGGG  438

Query  484  AAGGTTGAAGTTACAAAAGAAGGTGTGAAGTTGTGTACCATGGGTCCAGGAAAAGTGTTTGGGGAATTGGCTAT  557
            |||||||||||.|||||||||||.||||||.|.||.|||||||||||.|||||||||||.|||||..|||||||
Sbjct  439  AAGGTTGAAGTCACAAAAGAAGGCGTGAAGCTCTGCACCATGGGTCCTGGAAAAGTGTTCGGGGAGCTGGCTAT  512

Query  558  TCTTTACAACTGTACCCGGACAGCGACCGTCAAGACTCTTGTAAATGTAAAACTCTGGGCCATTGATCGACAAT  631
            .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||
Sbjct  513  ACTTTACAACTGTACCCGGACAGCGACCGTCAAGACTCTTGTAAATGTGAAACTCTGGGCCATCGATCGACAAT  586

Query  632  GTTTTCAAACAATAATGATGAGGACAGGACTCATCAAGCATACCGAGTATATGGAATTTTTAAAAAGCGTTCCA  705
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||
Sbjct  587  GTTTTCAAACAATAATGATGAGGACAGGACTCATCAAGCATACCGAGTACATGGAATTTTTAAAAAGTGTTCCA  660

Query  706  ATATTCCAGAGCCTTCCTGAAGAGATCCTCAGCAAGCTTGCTGATGTCCTTGAAGAGACCCACTATGAAAATGG  779
            |.||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  661  ACATTCCAGAGCCTTCCTGATGAAATCCTCAGCAAGCTGGCTGATGTCCTCGAAGAGACCCACTATGAAAATGG  734

Query  780  AGAATATATTATCAGGCAAGGTGCAAGAGGGGACACCTTCTTTATCATCAGCAAAGGAACGGTAAATGTCACTC  853
            |||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||...|||.|||||.||||
Sbjct  735  AGAATATATCATCAGGCAGGGTGCAAGAGGAGACACCTTCTTCATCATCAGTAAAGGGCAGGTGAATGTTACTC  808

Query  854  GTGAAGACTCACCGAGTGAAGACCCAGTCTTTCTTAGAACTTTAGGAAAAGGAGACTGGTTTGGAGAGAAAGCC  927
            |.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||.
Sbjct  809  GAGAAGACTCACCAAGTGAAGACCCAGTCTTCCTTAGAACTTTAGGGAAGGGAGATTGGTTTGGAGAGAAAGCG  882

Query  928  TTGCAGGGGGAAGATGTGAGAACAGCAAACGTAATTGCTGCAGAAGCTGTAACCTGCCTTGTGATTGACAGAGA  1001
            |||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  883  TTGCAGGGGGAGGATGTGAGAACAGCAAATGTTATTGCCGCAGAAGCTGTCACCTGCCTTGTGATTGACAGAGA  956

Query 1002  CTCTTTTAAACATTTGATTGGAGGGCTGGATGATGTTTCTAATAAAGCATATGAAGATGCAGAAGCTAAAGCAA  1075
            ||||||.||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||.||.||||||||.|||||||
Sbjct  957  CTCTTTCAAGCATTTGATTGGAGGACTGGACGATGTTTCTAACAAAGCATATGAGGACGCAGAAGCAAAAGCAA  1030

Query 1076  AATATGAAGCTGAAGCGGCTTTCTTCGCCAACCTGAAGCTGTCTGATTTCAACATCATTGATACCCTTGGAGTT  1149
            ||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1031  AATATGAAGCCGAAGCTGCCTTCTTCGCCAACCTGAAGCTGTCTGATTTCAACATCATTGACACCCTTGGAGTT  1104

Query 1150  GGAGGTTTCGGACGAGTAGAACTGGTCCAGTTGAAAAGTGAAGAATCCAAAACGTTTGCAATGAAGATTCTCAA  1223
            ||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||
Sbjct 1105  GGAGGTTTCGGACGAGTAGAGCTGGTCCAGTTGAAAAGTGAAGAATCCAAAACATTTGCAATGAAGATCCTCAA  1178

Query 1224  GAAACGTCACATTGTGGACACAAGACAGCAGGAGCACATCCGCTCAGAGAAGCAGATCATGCAGGGGGCTCATT  1297
            ||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1179  GAAACGCCACATTGTGGACACCAGACAGCAGGAGCACATCCGCTCAGAGAAGCAGATCATGCAGGGGGCTCATT  1252

Query 1298  CCGATTTCATAAGTGAGACTGTACAAGAACATTTAAGGACAGCAAATATTTGTATATGTTGATGGAAGC-TGTC  1370
            |.||.||||| .|||||.|||||| ||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||| ||.|
Sbjct 1253  CTGACTTCAT-TGTGAGGCTGTAC-AGGACATTTAAAGACAGCAAATACTTGTATATGTTGATGGAAGCGTGCC  1324

Query 1371  TAGGTGGAGAGCTCTGGACCATTCTCAGGGATAGAGGTTCGTTTGAAGATTCTACAACCAGATTTTACACAGCA  1444
            |.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.|||
Sbjct 1325  TGGGTGGAGAGCTCTGGACTATTCTCAGGGATAGGGGTTCGTTTGAAGACTCAACAACCAGGTTTTACACTGCA  1398

Query 1445  TGTGTGGTAGAAGCTTTTGCCTATCTGCATTCCAAAGGAATCATTTACAGGGACCTCAAGCCAGAAAATCTCAT  1518
            ||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||
Sbjct 1399  TGTGTGGTAGAAGCATTCGCCTATCTGCATTCCAAAGGAATCATTTACAGGGACCTCAAGCCGGAGAATCTCAT  1472

Query 1519  CCTAGATCACCGAGGTTATGCCAAACTGGTTGATTTTGGCTTTGCAAAGAAAATAGGATTTGGAAAGAAAACAT  1592
            |||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1473  CCTAGATCATCGAGGCTATGCCAAACTGGTTGACTTTGGCTTTGCAAAGAAAATAGGATTTGGAAAGAAAACAT  1546

Query 1593  GGACTTTTTGTGGGACTCCAGAGTATGTAGCCCCAGAGATCATCCTGAACAAAGGCCATGACATTTCAGCCGAC  1666
            ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1547  GGACTTTTTGTGGGACTCCAGAATATGTAGCCCCAGAGATCATCCTGAACAAAGGCCATGACATTTCAGCTGAC  1620

Query 1667  TACTGGTCACTGGGAATCCTAATGTATGAACTCCTGACTGGCAGCCCACCTTTCTCAGGCCCAGATCCTATGAA  1740
            |||||||||||.|||||.||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1621  TACTGGTCACTAGGAATTCTGATGTATGAGCTTCTGACTGGCAGCCCACCTTTCTCAGGCCCAGATCCAATGAA  1694

Query 1741  AACCTATAACATCATATTGAGGGGGATTGACATGATAGAATTTCCAAAGAAGATTGCCAAAAATGCTGCTAATT  1814
            ||||||.||.||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1695  AACCTACAATATCATACTGCGGGGGATTGACATGATAGAATTTCCAAAGAAGATTGCAAAAAATGCTGCTAATT  1768

Query 1815  TAATTAAAAAACTATGCAGGGACAATCCATCAGAAAGATTAGGGAATTTGAAAAATGGAGTAAAAGACATTCAA  1888
            |||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.
Sbjct 1769  TAATTAAAAAACTATGCAGGGACAACCCATCAGAGAGGTTAGGAAATTTGAAAAACGGAGTCAAAGACATTCAG  1842

Query 1889  AAGCACAAATGGTTTGAGGGCTTTAACTGGGAAGGCTTAAGAAAAGGTACCTTGACACCTCCTATAATACCAAG  1962
            ||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||
Sbjct 1843  AAACACAAGTGGTTTGAGGGCTTTAATTGGGAAGGCTTAAGAAAAGGCACCTTGACACCTCCCATAATTCCAAG  1916

Query 1963  TGTTGCATCACCCACAGACACAAGTAATTTTGACAGTTTCCCTGAGGACAACGATGAACCACCACCTGATGACA  2036
            ||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1917  TGTTGCGTCACCCACAGACACAAGCAATTTTGACAGTTTCCCTGAGGACAGCGATGAGCCACCACCTGATGACA  1990

Query 2037  ACTCAGGATGGGATATAGACTTC  2059
            |||||||.|||||.|||||||||
Sbjct 1991  ACTCAGGCTGGGACATAGACTTC  2013