Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_14807
• Subject: XM_006511196.3
• Aligned Length: 1184
• Identities: 1003
• Gaps: 74

Alignment

Query    1  ATGCCCAAGAAGAAGCCGACGCCCATCCAGCTGAACCCGGCCCCCGACGGCTCTGCAGTTAACGGGACCAGCTC  74
                                                                           ..||  |||| 
Sbjct    1  ---------------------------------------------------------------ATGA--AGCT-  8

Query   75  TGCGGA---GACCAACTTGGAGGCCTTGCAGAAGAAGCTGGAGGAGCTAGAGCTTGATGAGCAGCAGCGAAAGC  145
               |||   |||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||||
Sbjct    9  ---GGAGAGGACCAACCTGGAGGCCTTGCAGAAGAAGCTGGAGGAGCTGGAGCTTGACGAGCAGCAGCGGAAGC  79

Query  146  GCCTTGAGGCCTTTCTTACCCAGAAGCAGAAGGTGGGAGAACTGAAGGATGACGACTTTGAGAAGATCAGTGAG  219
            |.||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.
Sbjct   80  GGCTCGAGGCCTTTCTGACGCAGAAGCAGAAGGTGGGGGAACTGAAGGATGATGACTTTGAGAAGATCAGCGAA  153

Query  220  CTGGGGGCTGGCAATGGCGGTGTGGTGTTCAAGGTCTCCCACAAGCCTTCTGGCCTGGTCATGGCCAGAAAGCT  293
            |||||.||||||||.||.||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||
Sbjct  154  CTGGGAGCTGGCAACGGTGGAGTGGTCTTCAAGGTCTCCCACAAGCCATCTGGCCTGGTTATGGCTAGAAAGCT  227

Query  294  AATTCATCTGGAGATCAAACCCGCAATCCGGAACCAGATCATAAGGGAGCTGCAGGTTCTGCATGAGTGCAACT  367
            .||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||||||.|||||.||||||||||
Sbjct  228  GATCCACCTGGAGATCAAACCCGCAATCCGGAACCAGATCATCCGGGAGCTGCAGGTACTGCACGAGTGCAACT  301

Query  368  CTCCGTACATCGTGGGCTTCTATGGTGCGTTCTACAGCGATGGCGAGGATCAGTATCTGCATGGAGCACATGGA  441
            |.||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.||||| ||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  302  CCCCGTACATCGTGGGCTTCTACGGGGCCTTCTACAGCGACGGCGA-GATCAGCATCTGCATGGAGCACATGGA  374

Query  442  TGGAGGTTCTCTGGATCAAGTCCTGAAGAAAGCTGGAAGAATTCCTGAACAAATTTTAGGAAAAGTTAGCATTG  515
            |||.||.||..||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  375  TGGTGGGTCCTTGGATCAAGTTCTGAAGAAAGCTGGAAGAATTCCTGAGCAAATTTTAGGAAAAGTTAGCATTG  448

Query  516  CTGTAATAAAAGGCCTGACATATCTGAGGGAGAAGCACAAGATCATGCACAGAGATGTCAAGCCCTCCAACATC  589
            ||||.||||||||||||||.|||||..||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.
Sbjct  449  CTGTGATAAAAGGCCTGACCTATCTTCGGGAGAAGCACAAGATTATGCACAGAGATGTCAAGCCATCCAACATT  522

Query  590  CTAGTCAACTCCCGTGGGGGAGATCAAGCTCTGTGACTTTGGGGTCAGCGGGCAGCTCATCGACTCCATGGCCA  663
            |||||.|||||.||| |||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||||
Sbjct  523  CTAGTGAACTCACGT-GGGGAGATCAAACTCTGTGATTTTGGGGTCAGCGGGCAGCTAATTGACTCTATGGCCA  595

Query  664  ACTCCTTCGTGGGCACAAGGTCCTACATGTCGCCAGAAAGACTCCAGGGGACTCATTACTCTGTGCAGTCAGAC  737
            ||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||
Sbjct  596  ACTCCTTCGTGGGCACGAGATCCTACATGTCGCCTGAGAGACTCCAGGGGACTCACTACTCTGTGCAGTCGGAC  669

Query  738  ATCTGGAGCATGGGACTGTCTCTGGTAGAGATGGCGGTTGGGAGGTATCCCATCCCTCCTCCAGATGCCAAGGA  811
            ||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.||||||||.||.|||||.||||||||.|||||||||||
Sbjct  670  ATCTGGAGCATGGGGCTCTCTCTGGTGGAGATGGCAGTTGGGAGATACCCCATTCCTCCTCCTGATGCCAAGGA  743

Query  812  GCTGGAGCTGATGTTTGGGTGCCAGGTGGAAGGAGATGCGGCTGAGACCCCACCCAGGCCAAGGACCCCCGGGA  885
            |||||||||..|||||||.|||||.|||||||||||.||.||.||.||.||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  744  GCTGGAGCTACTGTTTGGATGCCATGTGGAAGGAGACGCAGCCGAAACACCACCCAGGCCAAGGACCCCTGGGA  817

Query  886  GGCCCCTTAGCTCATACGGAATGGACAGCCGACCTCCCATGGCAATTTTTGAGTTGTTGGATTACATAGTCAAC  959
            ||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.
Sbjct  818  GGCCTCTCAGCTCATATGGAATGGACAGCCGACCTCCCATGGCAATTTTTGAGTTGTTGGATTACATTGTCAAT  891

Query  960  GAGCCTCCTCCAAAACTGCCCAGTGGAGTGTTCAGTCTGGAATTTCAAGATTTTGTGAATAAATGCTTAATAAA  1033
            |||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  892  GAGCCTCCTCCAAAACTGCCCAGTGGAGTATTCAGTCTGGAGTTTCAGGATTTTGTGAATAAATGCTTAATAAA  965

Query 1034  AAACCCCGCAGAGAGAGCAGATTTGAAGCAACTCATGGTTCATGCTTTTATCAAGAGATCTGATGCTGAGGAAG  1107
            .|||||.|||||||||||||||.|||||||.||||||||.||||||||.|||||.||||||||.||.|||||.|
Sbjct  966  GAACCCTGCAGAGAGAGCAGATCTGAAGCAGCTCATGGTACATGCTTTCATCAAAAGATCTGACGCCGAGGAGG  1039

Query 1108  TGGATTTTGCAGGTTGGCTCTGCTCCACCATCGGCCTTAACCAGCCCAGCACACCAACCCATGCTGCTGGCGTC  1181
            |.||.||.|||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||..||.||
Sbjct 1040  TAGACTTCGCAGGCTGGCTCTGCTCCACCATTGGGCTTAACCAGCCCAGCACACCAACCCACGCTGCCAGCATC  1113