Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_14849
• Subject: NM_001348412.2
• Aligned Length: 2390
• Identities: 2216
• Gaps: 161

Alignment

Query    1  ATGCCCCTGGCCGCCTACTGCTACCTGCGGGTCGTGGGCAAGGGGAGCTATGGAGAGGTGACGCTTGTGAAGCA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCCCCTGGCCGCCTACTGCTACCTGCGGGTCGTGGGCAAGGGGAGCTATGGAGAGGTGACGCTTGTGAAGCA  74

Query   75  CCGGCGGGACGGCAAGCAGTATGTCATCAAAAAACTGAACCTCCGAAATGCCTCTAGCCGAGAGCGGCGAGCTG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCGGCGGGACGGCAAGCAGTATGTCATCAAAAAACTGAACCTCCGAAATGCCTCTAGCCGAGAGCGGCGAGCTG  148

Query  149  CTGAACAGGAAGCCCAGCTCTTGTCTCAGTTGAAGCATCCCAACATTGTCACCTACAAGGAGTCATGGGAAGGA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CTGAACAGGAAGCCCAGCTCTTGTCTCAGTTGAAGCATCCCAACATTGTCACCTACAAGGAGTCATGGGAAGGA  222

Query  223  GGAGATGGTCTGCTCTACATTGTCATGGGCTTCTGTGAAGGAGGTGATTTGTACCGAAAGCTCAAGGAGCAGAA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GGAGATGGTCTGCTCTACATTGTCATGGGCTTCTGTGAAGGAGGTGATTTGTACCGAAAGCTCAAGGAGCAGAA  296

Query  297  AGGGCAGCTTCTGCCGGAGAATCAGGTGGTAGAGTGGTTTGTACAGATCGCCATGGCTTTGCAGTATTTACATG  370
            |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AGGGCAGCTTCTGCCTGAGAATCAGGTGGTAGAGTGGTTTGTACAGATCGCCATGGCTTTGCAGTATTTACATG  370

Query  371  AAAAACACATCCTTCATCGAGATCTGAAAACTCAAAATGTCTTCCTAACAAGAACAAACATCATCAAAGTAGGG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AAAAACACATCCTTCATCGAGATCTGAAAACTCAAAATGTCTTCCTAACAAGAACAAACATCATCAAAGTAGGG  444

Query  445  GACCTAGGAATTGCCCGAGTGTTGGAGAACCACTGTGACATGGCTAGCACCCTCATTGGCACACCCTACTACAT  518
            |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GACCTAGGAATTGCCCGAGTGTTAGAGAACCACTGTGACATGGCTAGCACCCTCATTGGCACACCCTACTACAT  518

Query  519  GAGCCCTGAATTGTTCTCAAACAAACCCTACAACTATAAGTCTGATGTTTGGGCTCTAGGATGCTGTGTCTATG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GAGCCCTGAATTGTTCTCAAACAAACCCTACAACTATAAGTCTGATGTTTGGGCTCTAGGATGCTGTGTCTATG  592

Query  593  AAATGGCCACCTTGAAGCATGCTTTCAATGCAAAAGATATGAATTCTTTAGTTTATCGGATTATTGAAGGAAAG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AAATGGCCACCTTGAAGCATGCTTTCAATGCAAAAGATATGAATTCTTTAGTTTATCGGATTATTGAAGGAAAG  666

Query  667  CTGCCAGCAATGCCAAGAGATTACAGCCCAGAGCTGGCAGGACCTGATAAGAACAATGCTGAGCAAAAGGCCTG  740
            ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||| ||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CTGCCACCAATGCCAAGAGATTACAGCCCAGAGCTGGCA-GAACTGATAAGAACAATGCTGAGCAAAAGGCCTG  739

Query  741  AAGAAAGGCCGTCTGTGAGGAGCATCCTGAGGCAGCCTTATATAAAGCGGCAAATCTCCTTCTTTTTGGAGGCC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  740  AAGAAAGGCCGTCTGTGAGGAGCATCCTGAGGCAGCCTTATATAAAGCGGCAAATCTCCTTCTTTTTGGAGGCC  813

Query  815  ACAAAGATAAAAACCTCCAAAAATAACATTAAAAATGGTGACTCTCAATCCAAGCCTTTTGCTACAGTGGTTTC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  814  ACAAAGATAAAAACCTCCAAAAATAACATTAAAAATGGTGACTCTCAATCCAAGCCTTTTGCTACAGTGGTTTC  887

Query  889  TGGAGAGGCAGAATCAAATCATGAAGTAATCCACCCCCAACCACTCTCTTCTGAGGGCTCCCAGACATATATAA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  888  TGGAGAGGCAGAATCAAATCATGAAGTAATCCACCCCCAACCACTCTCTTCTGAGGGCTCCCAGACATATATAA  961

Query  963  TGGGTGAAGGCAAATGTTTGTCCCAGGAGAAACCCAGGGCCTCTGGTCTCTTGAAGTCACCTGCCAGTCTGAAA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  962  TGGGTGAAGGCAAATGTTTGTCCCAGGAGAAACCCAGGGCCTCTGGTCTCTTGAAGTCACCTGCCAGTCTGAAA  1035

Query 1037  GCCCATACCTGCAAACAGGACTTGAGCAATACCACAGAACTAGCCACAATCAGTAGCGTAAATATTGACATCTT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1036  GCCCATACCTGCAAACAGGACTTGAGCAATACCACAGAACTAGCCACAATCAGTAGCGTAAATATTGACATCTT  1109

Query 1111  ACCTGCAAAAGGGAGGGATTCAGTGAGTGATGGCTTTGTTCAGGAGAATCAGCCAAGATATTTGGATGCCTCTA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1110  ACCTGCAAAAGGGAGGGATTCAGTGAGTGATGGCTTTGTTCAGGAGAATCAGCCAAGATATTTGGATGCCTCTA  1183

Query 1185  ATGAGTTAGGAGGTATATGCAGTATTTCTCAAGTGGAAGAGGAGATGCTGCAGGACAACACTAAATCCAGTGCC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1184  ATGAGTTAGGAGGTATATGCAGTATTTCTCAAGTGGAAGAGGAGATGCTGCAGGACAACACTAAATCCAGTGCC  1257

Query 1259  CAGCCTGAAAACCTGATTCCCATGTGGTCCTCTGACATTGTCACTGGGGAAAAGAATGAACCAGTGAAGCCTCT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1258  CAGCCTGAAAACCTGATTCCCATGTGGTCCTCTGACATTGTCACTGGGGAAAAGAATGAACCAGTGAAGCCTCT  1331

Query 1333  GCAGCCCCTAATCAAAGAACAAAAGCCAAAGGACCAGGATCAAGTTGCTGGTGAATGTATTATAGAAAAACAGG  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1332  GCAGCCCCTAATCAAAGAACAAAAGCCAAAGGACCAGGATCAAGTTGCTGGTGAATGTATTATAGAAAAACAGG  1405

Query 1407  GCAGAATCCACCCAGATTTACAGCCACACAACTCTGGGTCTGAACCTTCCCTGTCTCGACAGCGACGGCAAAAG  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1406  GCAGAATCCACCCAGATTTACAGCCACACAACTCTGGGTCTGAACCTTCCCTGTCTCGACAGCGACGGCAAAAG  1479

Query 1481  AGGAGAGAACAGACTGAGCACAGAGGGGAAAAGAGACAGGTCCGCAGAGATCTCTTTGCTTTCCAAGAGTCGCC  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1480  AGGAGAGAACAGACTGAGCACAGAGGGGAAAAGAGACAGGTCCGCAGAGATCTCTTTGCTTTCCAAGAGTCGCC  1553

Query 1555  TCCTCGATTTTTGCCTTCTCATCCCATTGTTGGGAAAGTGGATGTCACATCAACACAAAAAGAGGCTGAAAACC  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1554  TCCTCGATTTTTGCCTTCTCATCCCATTGTTGGGAAAGTGGATGTCACATCAACACAAAAAGAGGCTGAAAACC  1627

Query 1629  AACGTAGAGTGGTCACTGGGTCTGTGAGCAGTTCAAGGAGCAGTGAGATGTCATCATCAAAGGATCGACCATTA  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1628  AACGTAGAGTGGTCACTGGGTCTGTGAGCAGTTCAAGGAGCAGTGAGATGTCATCATCAAAGGATCGACCATTA  1701

Query 1703  TCAGCCAGAGAGAGGAGGCGACTAAAGCAGTCACAGGAAGAAATGTCCTCT-----------------------  1753
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                       
Sbjct 1702  TCAGCCAGAGAGAGGAGGCGACTAAAGCAGTCACAGGAAGAAATGTCCTCTTCAGGCCCTTCAGTGAGGAAAGC  1775

Query 1754  --------------------------------------------------------------------------  1753
                                                                                      
Sbjct 1776  GTCTCTGAGTGTAGCAGGGCCAGGAAAACCCCAGGAAGAAGACCAGCCCTTGCCTGCCCGACGGCTCTCCTCTG  1849

Query 1754  -------------TCAGGAAAGGAAACAGATTCATTGTCTGTCTGAGGATGAGTTAAGTTCTTCTACAAGTTCA  1814
                         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1850  ACTGCAGCGTCACTCAGGAAAGGAAACAGATTCATTGTCTGTCTGAGGATGAGTTAAGTTCTTCTACAAGTTCA  1923

Query 1815  ACTGATAAGTCAGATGGGGATTACGGGGAAGGGAAAGGTCAGACAAATGAAATTAATGCCTTGGTACAATTGAT  1888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1924  ACTGATAAGTCAGATGGGGATTACGGGGAAGGGAAAGGTCAGACAAATGAAATTAATGCCTTGGTACAATTGAT  1997

Query 1889  GACTCAGACCCTGAAACTGGATTCTAAAGAGAGCTGTGAAGATGTCCCGGTAGCAAACCCAGTGTCAGAATTCA  1962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1998  GACTCAGACCCTGAAACTGGATTCTAAAGAGAGCTGTGAAGATGTCCCGGTAGCAAACCCAGTGTCAGAATTCA  2071

Query 1963  AACTTCATCGGAAATATCGGGACACACTGATACTTCATGGGAAGGTTGCAGAAGAGGCAGAGGAAATCCATTTT  2036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2072  AACTTCATCGGAAATATCGGGACACACTGATACTTCATGGGAAGGTTGCAGAAGAGGCAGAGGAAATCCATTTT  2145

Query 2037  AAAGAGCTACCTTCAGCTATTATGCCAGGTTCTGAAAAGATCAGGAGACTAGTTGAAGTCTTGAGAACTGATGT  2110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2146  AAAGAGCTACCTTCAGCTATTATGCCAGGTTCTGAAAAGATCAGGAGACTAGTTGAAGTCTTGAGAACTGATGT  2219

Query 2111  AATTCGTGGCCTGGGAGTTCAGCTTTTAGAGCAGGTGTATGATCTTTTGGAGGAGGAGGATGAATTTGATAGAG  2184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2220  AATTCGTGGCCTGGGAGTTCAGCTTTTAGAGCAGGTGTATGATCTTTTGGAGGAGGAGGATGAATTTGATAGAG  2293

Query 2185  AGGTGAGTGT-------CTCA----TTAACTGTAT-CAAGATGCTTA---TGTTATAG------------AATT  2231
            ||||..||.|       |.||    |.||..|||| |||    ||||   |||.|.||            ||||
Sbjct 2294  AGGTACGTTTGCGGGAGCACATGGGTGAAAAGTATACAA----CTTACAGTGTGAAAGCTCGCCAGTTGAAATT  2363

Query 2232  TTT-------------------  2234
            |||                   
Sbjct 2364  TTTTGAAGAAAACATGAATTTT  2385