Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_14914
• Subject: XM_017021732.1
• Aligned Length: 910
• Identities: 816
• Gaps: 80

Alignment

Query   1  ATGATGGAGAAGTATGAAAAAATTGGGAAAATTGGAGAAGGATCCTATGGAGTTGTTTTCAAATGTAGAAACAG  74
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  ATGATGGAGAAGTATGAAAAAATTGGGAAAATTGGAGAAGGATCCTATGGAGTTGTTTTCAAATGTAGAAACAG  74

Query  75  GGACACGGGTCAGATTGTGGCCATCAAGAAGTTTCNGGAATCAGAAGATGACCCTGTCATAAANNAAANTNNCC  148
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||..|||.|..||
Sbjct  75  GGACACGGGTCAGATTGTGGCCATCAAGAAGTTTCTGGAATCAGAAGATGACCCTGTCATAAAGAAAATTGCCC  148

Query 149  TTCGGGAAATCCGAATGCTCAAGCAACTCAAGCATCCCAACCTTGTTAACCTNCTGGAAGTCTTCAGGAGGAAA  222
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 149  TTCGGGAAATCCGAATGCTCAAGCAACTCAAGCATCCCAACCTTGTTAACCTCCTGGAAGTCTTCAGGAGGAAA  222

Query 223  CGGAGGCTTCACCTGGTGTTTGAATATTGTGACCACACAGTTCTCCATGAGTTGGACAGATACCAAAGAGGGGT  296
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223  CGGAGGCTTCACCTGGTGTTTGAATATTGTGACCACACAGTTCTCCATGAGTTGGACAGATACCAAAGAGGGGT  296

Query 297  ACCAGAACATCTCGTGAAGAGCATAACTTGGCAGACACTGCAAGCTGTAAATTTTTGCCATAAACACAATTGCA  370
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297  ACCAGAACATCTCGTGAAGAGCATAACTTGGCAGACACTGCAAGCTGTAAATTTTTGCCATAAACACAATTGCA  370

Query 371  TACATAGAGACGTGAAGCCAGAAAATATCCTCATCACGAAACATTCCGTGATTAAGCTTTGTGACTTTGGATTT  444
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371  TACATAGAGACGTGAAGCCAGAAAATATCCTCATCACGAAACATTCCGTGATTAAGCTTTGTGACTTTGGATTT  444

Query 445  GCTCGGCTTTTGACTGGACCGAGTGACTACTATACAGACTACGTGGCTACCAGGTGGTACCGCTCCCCTGAGCT  518
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445  GCTCGGCTTTTGACTGGACCGAGTGACTACTATACAGACTACGTGGCTACCAGGTGGTACCGCTCCCCTGAGCT  518

Query 519  GCTGGTGGGGGACACGCAGTACGGCCCCCCGGTGGATGTTTGGGCAATTGGCTGTGTCTTTGCTGAGCTGCTGT  592
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519  GCTGGTGGGGGACACGCAGTACGGCCCCCCGGTGGATGTTTGGGCAATTGGCTGTGTCTTTGCTGAGCTGCTGT  592

Query 593  CAGGAGTGCCTCTGTGGCCAGGAAAATCGGATGTGGATCAGCTGTATCTGATTAGGAAGACCTTGGGGGATCTC  666
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593  CAGGAGTGCCTCTGTGGCCAGGAAAATCGGATGTGGATCAGCTGTATCTGATTAGGAAGACCTTGGGGGATCTC  666

Query 667  ATTCCTAGGCACCAGCAAGTGTTTAGCACGAATCAGTACTTCAGTGGAGTGAAAATTCCAGACCCTGAAGATAT  740
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667  ATTCCTAGGCACCAGCAAGTGTTTAGCACGAATCAGTACTTCAGTGGAGTGAAAATTCCAGACCCTGAAGATAT  740

Query 741  GGNACCACTTGAATTAAAATTCCCAAACATCTCTTATCCTGCCCTGGGGCTCCTAAAGTTGCAGTACCTACCCC  814
           ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              
Sbjct 741  GGAACCACTTGAATTAAAATTCCCAAACATCTCTTATCCTGCCCTGGGGCTCCTAAAGTT--------------  800

Query 815  AGCTAACTGGCAGCAGCATCCTTCCAGCTTTGGATAATAAGAAGTACTACTGTGATACCAAGAAACTTAACTAC  888
                          .||||.|||             .||||||               ||.|||.|       
Sbjct 801  ---------------TCATCTTTC-------------AAAGAAG---------------AAAAAAAT-------  824

Query 889  CGTTTTCCAAACATT-------  903
                    .|||||       
Sbjct 825  ---------GACATTAATAAGT  837