Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_14931
- Subject:
- XM_006539527.3
- Aligned Length:
- 2067
- Identities:
- 1630
- Gaps:
- 300
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGCTGGCCGCTCGCCCACCGCACTGGGGTCCCCATCGCGCTCCAGCCCCCCGTGGGCCCAGCGCCATCCCTGA 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 CCCGGGTCTCAGCGGCGGTGGCAGCCGAGGTGCAGGATGCGAGAAGGCGCCCCCCGGCCGGGCTCCCGCTCCAG 148
Query 1 --------------------------------ATGGCCGTCCCACCGGGCCATGGTCCCTTCTCTGGCTTCCCA 42
||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.
Sbjct 149 GCCTCACGCCCCTGCGGCCCTCTGAGCCCACCATGGCCGTCCCACCAGGCCATGGTCCTTTCTCTGGCTTTCCG 222
Query 43 GGGCCCCAGGAGCACACGCAGGTATTGCCTGATGTGCGGCTACTGCCTCGGAGGCTGCCCCTGGCCTTCCGGGA 116
|||||||||||.|||||.||||||.|.||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GGGCCCCAGGAACACACACAGGTACTACCTGATGTGCGGCTCCTGCCCCGGAGACTGCCCCTGGCCTTCCGGGA 296
Query 117 TGCAACCTCAGCCCCGCTGCGTAAGCTCTCTGTGGACCTCATCAAGACCTACAAGCACATCAATGAGGTATACT 190
|||..||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TGCGGCCTCAGCCCCGCTGCGCAAGCTCTCGGTGGACCTCATCAAGACCTACAAGCACATCAATGAGGTATACT 370
Query 191 ATGCGAAGAAGAAGCGGCGGGCCCAGCAGGCGCCACCCCAGGATTCGAGCAACAAGAAGGAGAAGAAGGTCCTG 264
|||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||.|||.||||||||||||||||||
Sbjct 371 ATGCGAAGAAGAAGCGGCGGGCCCAACAGGCGCCACCCCAGGACTCGAGCACCAAAAAGGAGAAGAAGGTCCTG 444
Query 265 AACCATGGTTATGATGACGACAACCATGACTACATCGTGCGCAGTGGCGAGCGCTGGCTGGAGCGCTACGAAAT 338
|||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||
Sbjct 445 AACCACGGTTATGATGACGACAACCACGACTACATTGTGCGCAGTGGCGAGCGCTGGCTAGAGCGCTATGAGAT 518
Query 339 TGACTCGCTCATTGGCAAAGGCTCCTTTGGCCAGGTGGTGAAAGCCTATGATCATCAGACCCAGGAGCTTGTGG 412
||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||
Sbjct 519 TGACTCTCTTATTGGCAAAGGCTCCTTTGGCCAGGTGGTGAAAGCCTATGATCACCAGACTCAGGAGCTGGTGG 592
Query 413 CCATCAAGATCATCAAGAACAAAAAGGCTTTCCTGAACCAGGCCCAGATTGAGCTGCGGCTGCTGGAGCTGATG 486
||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||.|||||||||||
Sbjct 593 CCATCAAGATCATCAAGAACAAAAAGGCCTTCCTGAACCAGGCACAGATTGAGCTACGGCTGTTGGAGCTGATG 666
Query 487 AACCAGCATGACACGGAGATGAAGTACTATATAGTACACCTGAAGCGGCACTTCATGTTCCGGAACCACCTGTG 560
|||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 667 AACCAGCATGATACAGAGATGAAGTACTACATAGTACACCTTAAGCGGCACTTCATGTTCCGGAATCACCTGTG 740
Query 561 CCTGGTATTTGAGCTGCTGTCCTACAACCTGTACGACCTCCTGCGCAACACCCACTTCCGCGGCGTCTCGCTGA 634
||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||.||.|||||.||||
Sbjct 741 CCTGGTGTTTGAGCTGCTGTCCTACAACCTGTACGACCTCCTCCGCAACACACACTTTCGGGGTGTCTCACTGA 814
Query 635 ACCTGACCCGGAAGCTGGCGCAGCAGCTCTGCACGGCACTGCTCTTTCTGGCCACGCCTGAGCTCAGCATCATT 708
|||||||..||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||.
Sbjct 815 ACCTGACGAGGAAGCTGGCACAGCAGCTCTGCACAGCTCTGCTCTTTCTGGCCACCCCCGAGCTCAGCATCATC 888
Query 709 CACTGCGACCTCAAGCCCGAAAACATCTTGCTGTGCAACCCCAAGCGCAGCGCCATCAAGATTGTGGACTTCGG 782
|||||||||||||||||.||.||||||.||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||
Sbjct 889 CACTGCGACCTCAAGCCTGAGAACATCCTGCTCTGCAACCCCAAGCGCAGTGCCATCAAGATCGTGGACTTCGG 962
Query 783 CAGCTCCTGCCAGCTTGGCCAGAGGATCTACCAGTATATCCAGAGCCGCTTCTACCGCTCACCTGAGGTGCTCC 856
|||.||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 963 CAGTTCCTGCCAGCTTGGCCAGCGGATCTACCAGTATATCCAGAGCCGCTTCTACCGCTCACCCGAGGTGCTCC 1036
Query 857 TGGGCACACCCTACGACCTGGCCATTGACATGTGGTCCCTGGGCTGCATCCTTGTGGAGATGCACACCGGAGAG 930
||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 TGGGTACACCCTATGACCTGGCCATTGACATGTGGTCCCTGGGCTGCATCCTCGTGGAGATGCACACCGGAGAG 1110
Query 931 CCCCTCTTCAGTGGCTCCAATGAGGTCGACCAGATGAACCGCATTGTGGAGGTGCTGGGCATCCCACCGGCCGC 1004
|||||||||||||||||.||||||||.||||||||||.|||.||||||||||||.||||||||||.||.||..|
Sbjct 1111 CCCCTCTTCAGTGGCTCTAATGAGGTGGACCAGATGAGCCGTATTGTGGAGGTGTTGGGCATCCCTCCCGCACC 1184
Query 1005 CATGCTGGACCAGGCGCCCAAGGCTCGCAAGTACTTTGAACGGCTGCCTGGGGGTGGCTGGACCCTACGAAGGA 1078
|||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 CATGCTGGAACAGGCACCCAAGGCTCGAAAGTACTTTGAGCGGCTGCCTGGGGGTGGCTGGACCCTACGAAGGA 1258
Query 1079 CGAAAGAACTCAGGAAGGATTACCAGGGCCCCGGGACACGGCGGCTGCAGGAGGTGCTGGGCGTGCAGACGGGC 1152
|.||.||||||||||
Sbjct 1259 CAAAGGAACTCAGGA----------------------------------------------------------- 1273
Query 1153 GGGCCCGGGGGCCGGCGGGCGGGGGAGCCGGGCCACAGCCCCGCCGACTACCTCCGCTTCCAGGACCTGGTGCT 1226
|||||||||||||
Sbjct 1274 -------------------------------------------------------------AGGACCTGGTGCT 1286
Query 1227 GCGCATGCTGGAGTATGAGCCCGCCGCCCGCATCAGCCCCCTGGGGGCTCTGCAGCACGGCTTCTTCCGCCGCA 1300
||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1287 GCGCATGCTGGAATATGAGCCCGCCGCCCGCATCAGCCCTCTGGGCGCTCTGCAGCATGGCTTCTTCCGCCGCA 1360
Query 1301 CGGCCGACGAGGCCACCAACACGGGCCCGGCAGGCAGCAGTGCCTCCACCTCGCCCGCGCCCCTCGACACCTGC 1374
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||
Sbjct 1361 CGGCCGACGAGGCCACCAACACGGGCCCGGCAGGCAGCAGTGCCTCCACCTCGCCGGCGCCCCTTGACACCTGC 1434
Query 1375 CCCTCTTCCAGCACCGCCAGCTCCATCTCCAGTTCTGGAGGCTCCAGTGGCTCCTCCAGTGACAACCGGACCTA 1448
|||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||..||||||.|..||||
Sbjct 1435 CCCTCCTCTAGCACCGCCAGCTCCATCTCCAGCTCTGGAGGTTCCAGTGGCTCCTCCAACGACAACAGAGCCTA 1508
Query 1449 CCGCTACAGCAACCGATATTGTGGGGGCCCTGGGCCCCCTATCACAGACTGTGAGATGAACAGCCCCCAGGTCC 1522
|||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1509 CCGATACAGCAACCGATATTGTGGGGGCCCAGGGCCCCCCATCACTGACTGTGAGATGAACAGCCCCCAGGTCC 1582
Query 1523 CACCCTCCCAGCCGCTGCGGCCCTGGGCAGGGGGTGATGTGCCCCACAAGACACATCAAGCCCCTGCCTCTGCC 1596
.||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||
Sbjct 1583 TACCCTCCCAGCCTCTGCGCCCCTGGGCAGGGGGTGATGTGCCCCACAAGACACATCAAGCCCCTATCTCTGCC 1656
Query 1597 TCGTCACTGCCTGGGACCGGGGCCCAGTTACCCCCCCAGCCCCGATACCTTGGTCGTCCCCCATCACCAACCTC 1670
||..||.||||.|||||.|||||.|||||||||||...||||||.|.||||||.||.||||||||||||||.||
Sbjct 1657 TCAACATTGCCGGGGACTGGGGCTCAGTTACCCCCATTGCCCCGTTGCCTTGGACGACCCCCATCACCAACATC 1730
Query 1671 ACCACCACCCCCGGAGCTGATGGATGTGAGCCTGGTGGGCGGCCCTGCTGACTGCTCCCCACCTCACCCAGCGC 1744
||||||||||||.|||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|.||||||||.|||||||..|||||.|
Sbjct 1731 ACCACCACCCCCAGAGTTGATGGATGTGAGCCTGGTGGGCAGCCCTCCAGACTGCTCTCCACCTCCTCCAGCAC 1804
Query 1745 CTGCCCCCCAGCACCCGGCTGCCTCAGCCCTCCGGACTCGGATGACTGGAGGTCGTCCACCCCTCCCGCCTCCT 1818
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||.||.|||
Sbjct 1805 CTGCCCCCCAGCACCCGGCTGCCTCAGCCCTCCGGACTCGGATGACAGGAGGTCGACCACCTCTCCCACCCCCT 1878
Query 1819 GATGACCCTGCCACTCTGGGGCCTCACCTGGGCCTCCGTGGTGTACCCCAGAGCACAGCAGCCAGCTCG 1887
|||||||||||||||||||||||||.||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1879 GATGACCCTGCCACTCTGGGGCCTCGCCTGGGTCTCCATGGTGTACCCCAGAGCACAGCAGCCAGCTCA 1947