Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_14944
Subject:
NM_013881.4
Aligned Length:
3121
Identities:
2808
Gaps:
19

Alignment

Query    1  ATGGAGGTGGTGGGTGACTTCGAGTACAGCAAGAGGGATCTCGTGGGACACGGGGCCTTCGCCGTGGTCTTCCG  74
            ||||||||||||||.||||||||||||.|||||.||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct    1  ATGGAGGTGGTGGGCGACTTCGAGTACTGCAAGCGGGACCTCGTGGGACACGGGGCCTTCGCTGTGGTCTTCCG  74

Query   75  GGGGCGGCACCGCCAGAAAACTGATTGGGAGGTAGCTATTAAAAGTATTAATAAAAAGAACTTGTCAAAATCAC  148
            |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGGGCGGCACCGCCAGAAAACTGATTGGGAGGTGGCTATTAAAAGTATTAATAAAAAGAACTTGTCAAAATCAC  148

Query  149  AAATACTGCTTGGAAAGGAAATTAAAATCTTAAAGGAACTTCAGCATGAAAATATTGTAGCACTCTATGATGTT  222
            ||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||
Sbjct  149  AAATTCTGCTTGGAAAGGAAATAAAAATCTTAAAGGAGCTTCAGCATGAAAACATCGTAGCGCTCTATGATGTT  222

Query  223  CAGGAATTACCCAACTCTGTCTTTTTGGTGATGGAGTATTGCAATGGTGGAGACCTCGCAGATTATTTGCAAGC  296
            ||||||||.|||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  223  CAGGAATTGCCCAACTCTGTCTTTCTGGTGATGGAGTATTGCAATGGTGGAGACCTGGCAGATTATTTGCAAGC  296

Query  297  GAAAGGGACTCTCAGTGAAGACACGATCAGAGTGTTTCTGCATCAGATTGCTGCTGCCATGCGAATCCTGCACA  370
            .|||||.|||||.||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||||
Sbjct  297  TAAAGGAACTCTGAGTGAAGATACTATCAGAGTGTTTCTCCATCAGATTGCGGCAGCCATGCGAATCCTGCACA  370

Query  371  GCAAAGGAATCATCCACAGAGATCTCAAACCACAGAACATCTTGCTGTCCTATGCCAATCGCAGAAAATCAAGT  444
            |||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||.|||.||.||||.|||||||||||.||.||.||.|.|
Sbjct  371  GCAAAGGGATAATCCACAGGGATCTCAAACCACAGAATATCCTGTTGTCTTATGCCAATCGAAGGAAGTCGAAT  444

Query  445  GTCAGTGGTATTCGCATCAAAATAGCGGATTTTGGTTTTGCTCGTTACCTACATAGTAACATGATGGCTGCAAC  518
            ||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||.||.||.||||||||||||||||..|||||.||.||
Sbjct  445  GTCAGTGGTATTCGTATTAAAATAGCTGATTTTGGTTTCGCACGGTACCTACATAGTAACACAATGGCAGCGAC  518

Query  519  ACTGTGTGGATCCCCGATGTACATGGCTCCTGAGGTTATTATGTCTCAACATTATGATGCTAAGGCTGACTTGT  592
            |||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|
Sbjct  519  ACTGTGTGGATCCCCAATGTACATGGCTCCCGAGGTTATTATGTCTCAACATTATGATGCTAAGGCAGATTTAT  592

Query  593  GGAGCATAGGAACAGTGATATACCAATGCCTAGTTGGAAAACCACCTTTTCAGGCCAATAGTCCTCAAGACTTA  666
            |||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||.||
Sbjct  593  GGAGCATAGGAACAGTGATCTATCAATGCCTAGTTGGAAAACCACCTTTTCAGGCTAATAGTCCTCAGGACCTA  666

Query  667  AAGATGTTTTATGAAAAAAACAGGAGCTTAATGCCTAGTATTCCCAGAGAAACATCACCTTATTTGGCTAATCT  740
            |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  667  AGGATGTTTTATGAAAAAAACAGGAGCTTAATGCCTAGTATTCCCAGAGAAACATCACCTTACTTGGCTAATCT  740

Query  741  -CTTTTGGGTTTGCTTCAGAGAAACCAAAAAGATAAGAATGGACTTTGAAGCGTTTTT-AGCCATCCTTTTTCT  812
             |||||||||||||||||||||||.|||||.||| |||||||||||||||||.||||| |||||||| |||.||
Sbjct  741  CCTTTTGGGTTTGCTTCAGAGAAATCAAAAGGAT-AGAATGGACTTTGAAGCATTTTTCAGCCATCC-TTTCCT  812

Query  813  TGAGCAAGGTCCAGTAAAAAAATCTTGCCCAGTTCCAGTGCCCATGTATTCTGGTTCTGTCTCTGGAAGCTCCT  886
            ||||||||.||||||.|||||||||||||||||.||||||||..||||||||||..|||||.||||||||||||
Sbjct  813  TGAGCAAGTTCCAGTTAAAAAATCTTGCCCAGTCCCAGTGCCTGTGTATTCTGGCCCTGTCCCTGGAAGCTCCT  886

Query  887  GTGGCAGCTCTCCATCTTGTCGTTTTGCTTCTCCACCATCCCTTCCAGATATGCAGCATATTCAGGAAGAAAAC  960
            |..|||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  887  GCAGCAGCTCACCATCTTGTCGCTTTGCTTCTCCACCATCCCTTCCAGATATGCAGCATATTCAGGAAGAAAAC  960

Query  961  TTATCTTCCCCACCATTGGGTCCTCCCAACTATCTACAAGTTTCCAAAGATTCTGCCAGTACTAGTAGCAAGAA  1034
            |||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.||||.||||||||||||
Sbjct  961  TTATCCTCCCCACCGTTGGGTCCTCCCAACTATCTACAGGTGTCCAAAGACTCTGCGAGTAATAGTAGCAAGAA  1034

Query 1035  CTCTTCTTGTGACACGGATGACTTTGTTTTGGTGCCACACAACATCTCGTCAGACCACTCATGTGATATGCCAA  1108
            |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.|||.|||||||
Sbjct 1035  CTCTTCTTGTGACACGGATGACTTTGTTTTGGTTCCACACAACATCTCGTCAGACCACTCATATGACATGCCAA  1108

Query 1109  TGGGGACTGCTGGCAGACGTGCTTCAAATGAATTCTTGGTGTGTGGAGGGCAGTGTCAGCCTACTGTGTCACCT  1182
            ||||||||.|.|.||||||||||||||||||||||||..|||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1109  TGGGGACTACGGCCAGACGTGCTTCAAATGAATTCTTTATGTGTGGAGGGCAGTGTCAACCTACTGTGTCACCT  1182

Query 1183  CACAGCGAAACAGCACCAATTCCAGTTCCTACTCAAATAAGGAATTATCAGCGCATAGAGCAGAATCTTACATC  1256
            ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.||||||||||.|||
Sbjct 1183  CACAGCGAAACAGCCCCAATTCCAGTTCCTACTCAAGTAAGGAATTATCAGCGCATAGAACAGAATCTTATATC  1256

Query 1257  TACTGCCAGCTCAGGCACAAATGTACATGGTTCTCCAAGATCTGCAGTGGTACGAAGGTCCAACACCAGCCCCA  1330
            .|||||||||||.||||||||...||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||||
Sbjct 1257  CACTGCCAGCTCTGGCACAAACCCACATGGTTCTCCAAGATCTGCAGTAGTACGAAGGTCTAATACCAGCCCCA  1330

Query 1331  TGGGCTTCCTCCGGCCGGGATCATGCTCCCCAGTACCAGCAGACACAGCACAGACAGTTGGACGAAGGCTCTCC  1404
            ||||||||||||||...||.||.||||||||.|||||||.||||||||..|||||||..||||||||.|||||.
Sbjct 1331  TGGGCTTCCTCCGGGTTGGGTCCTGCTCCCCTGTACCAGGAGACACAGTGCAGACAGGAGGACGAAGACTCTCT  1404

Query 1405  ACTGGGTCTTCTAGGCCTTACTCACCTTCCCCTTTGGTTGGTACCATTCCTGAGCAATTCAGTCAGTGCTGCTG  1478
            |||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||
Sbjct 1405  ACTGGCTCTTCCAGGCCTTACTCACCATCCCCTTTGGTTGGTACCATTCCTGAACAGTTTAGTCAGTGCTGCTG  1478

Query 1479  TGGGCATCCTCAGGGCCATGACTCCAGGAGTAGAAACTCCTCAGGTTCTCCAGTGCCACAAGCTCAGTCCCCAC  1552
            |||.|||||||||||||||||..||||||||||..|||||||||||||||||||||||||..|.|||.|.||||
Sbjct 1479  TGGACATCCTCAGGGCCATGAAGCCAGGAGTAGGCACTCCTCAGGTTCTCCAGTGCCACAGACCCAGGCACCAC  1552

Query 1553  AGTCTCTCTTATCGGGTGCTAGACTGCAGAGCGCCCCCACCCTCACTGACATCTATCAGAACAAGCAGAAGCTC  1626
            ||||.||||||..||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1553  AGTCACTCTTACTGGGTGCTAGACTGCAGAGTGCACCCACCCTCACCGATATCTATCAGAACAAGCAGAAGCTC  1626

Query 1627  AGAAAACAGCACTCTGACCCCGTGTGCCCATCCCATACTGGGGCTGGGTACAGCTACTCGCCTCAGCCCAGTCG  1700
            |||||.||||||||||||||.|||||.||.||||||.||||.||||||||.||.|||||.||||||||.|||||
Sbjct 1627  AGAAAGCAGCACTCTGACCCTGTGTGTCCGTCCCATGCTGGAGCTGGGTATAGTTACTCACCTCAGCCTAGTCG  1700

Query 1701  GCCTGGCAGCCTTGGAACTTCTCCCACCAAGCACTTGGGGTCCTCTCCACGGAGTTCTGACTGGTTCTTTAAAA  1774
            |||||||||||||||.||.|||||||||||||||..|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1701  GCCTGGCAGCCTTGGGACCTCTCCCACCAAGCACACGGGGTCCTCTCCACGGAATTCTGACTGGTTCTTTAAAA  1774

Query 1775  CTCCTTTGCCAACAATCATTGGCTCTCCTACTAAGACCACAGCTCCTTTCAAAATCCCTAAAACTCAAGCATCT  1848
            |||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1775  CTCCTTTACCAACAATCATTGGCTCTCCTACTAAGACTACAGCTCCTTTCAAAATCCCTAAAACACAAGCATCT  1848

Query 1849  TCCAACCTGTTAGCCTTGGTTACTCGTCATGGGCCTGCTGAAGAACAGTCGAAAGATGGGAATGAGCCACGGGA  1922
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||...|||||.||||||||||||||.||.||.||
Sbjct 1849  TCTAACCTGTTAGCCTTGGTTACTCGTCATGGGCCTGCTGAAAGCCAGTCCAAAGATGGGAATGACCCTCGTGA  1922

Query 1923  ATGTGCCCATTGCCTCTTAGTGCAAGGAAGTGAGAGGCAGCGGGCCG---AGCAGCAGAGCAAGGCAGTGTTTG  1993
            .|||.||||.|||||||.|||.||||||||.||||||||.||..|.|   ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1923  GTGTTCCCACTGCCTCTCAGTACAAGGAAGCGAGAGGCATCGATCTGAGCAGCAGCAGAGCAAGGCAGTGTTTG  1996

Query 1994  GCAGATCTGTCAGTACCGGGAAGTTATCAGATCAACAAGGAAAGACTCCTATATGTCGACATCAGGGCAGCACA  2067
            ||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||.||||.|.|||.||.||.||||.|||||||||||.
Sbjct 1997  GCAGATCTGTCAGTACTGGGAAGTTATCAGAACAACAAGTAAAGGCACCTTTAGGTGGACACCAGGGCAGCACG  2070

Query 2068  GACAGTTTAAATACAGAACGACCAATGGATATAGCTCCGGCAGGAGCCTGTGGTGGTGTTCTGGCACCTCCTGC  2141
            ||.||||||||.||||||||||||||||||.|||||||.||||||||||||||||.|.|.||||||...||.||
Sbjct 2071  GATAGTTTAAACACAGAACGACCAATGGATGTAGCTCCTGCAGGAGCCTGTGGTGTTATGCTGGCATTGCCAGC  2144

Query 2142  AGGTACAGCAGCAAGTTCCAAGGCTGTCCTCTTCACTGTAGGGTCTCCTCCACACAGTGCGGCAGCCCCCACTT  2215
            |||.|||||||||||..|||..||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||..||||||||||||
Sbjct 2145  AGGAACAGCAGCAAGCGCCAGAGCTGTCCTCTTCACCGTGGGGTCTCCTCCACACAGTGCCACAGCCCCCACTT  2218

Query 2216  GTACCCACATGTTCCTTCGAACAAGAACAACCTCAGTGGGGCCCAGCAACTCCGGGGGCTCTCTT-TGTGCCAT  2288
            ||||.||.|||.||||||||||||||||.||||||||||||.||||||.|||.||.||.|| ||| |||.|  |
Sbjct 2219  GTACTCATATGGTCCTTCGAACAAGAACCACCTCAGTGGGGTCCAGCAGCTCAGGAGGTTC-CTTGTGTTC--T  2289

Query 2289  G--AGTGGCCGCGTTTGCGTGGGGTCCCCCGCTTGCCCCAAGCCTTCGGGTCTTTCCCTTTCCAGGAGCAGAGG  2360
            |  ||||||||.||.||.|||||.|||||..||.|.||  ||..||.||.||||.|||  .|||||||||||||
Sbjct 2290  GCAAGTGGCCGAGTATGTGTGGGCTCCCCTCCTGGACC--AGGGTTGGGCTCTTCCCC--ACCAGGAGCAGAGG  2359

Query 2361  CAGCTCCCAGCCTGAGATACGTGCCTTACGGTGCTTCACCCCCCCAGCCTAGAGGG-CTCATCACCTTTGAAGC  2433
            .||||||||||||.||||||||||||||.||||||||| ||.|||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2360  GAGCTCCCAGCCTAAGATACGTGCCTTATGGTGCTTCA-CCACCCAGCCTAGAGGGTCTCATCACCTTTGAAGC  2432

Query 2434  CCCTGAACTGCCGGAGGAGACGCTGATGGAGCGGGAACACACAGACACCTTACGCCATCTGAATGTGATGCTGA  2507
            |||||||||.||.||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||..|||||.|.|
Sbjct 2433  CCCTGAACTACCAGAGGAGACACTGATGGAGCGAGAGCACACAGACACCTTACGCCATCTGAACATGATGTTAA  2506

Query 2508  TGTTCACTGAGTGTGTGCTGGACCTGACAGCCATGAGGGGAGGAAACCNTGAGCTGTGCACATCTGCTGTGTCC  2581
            ||||.|||||||||||||||||||||||.||..|||||||.||.||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2507  TGTTTACTGAGTGTGTGCTGGACCTGACGGCAGTGAGGGGTGGGAACCCTGAGCTGTGCACATCTGCTGTGTCC  2580

Query 2582  TTGTACCAGATCCAGGAGAGTGTGGTGGTGGACCAGATCAGTCAGCTGAGCAAAGACTGGGGGCGGGTGGAGCA  2655
            |||||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 2581  TTGTACCAGATTCAGGAGAGTGTAGTTGTGGACCAGATCAGCCAGCTAAGCAAAGATTGGGGGCGGGTGGAGCA  2654

Query 2656  GCTGGTGTTGTACATGAAAGCAGCACAGCTGCTTGCGGCTTCTCTGCATCTTGCCAAAGCCCAGATCAAGTCCG  2729
            ||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||.|||.|||||||.|
Sbjct 2655  GCTGGTGTTGTACATGAAGGCAGCACAGCTGCTGGCGGCTTCCCTGCATCTCGCCAAAGCTCAGGTCAAGTCTG  2728

Query 2730  GGAAACTGAGCCCATCCACAGCTGTGAAACAAGTTGTCAAGAATCTGAACGAACGATATAAATTCTGCATCACC  2803
            ||||.|||||||||||||..|||||||||||||||||.||.||||||||.|||.||||.|||||||||||||||
Sbjct 2729  GGAAGCTGAGCCCATCCATGGCTGTGAAACAAGTTGTTAAAAATCTGAATGAAAGATACAAATTCTGCATCACC  2802

Query 2804  ATGTGCAAGAAACTTACAGAAAAGCTGAATCGATTCTTCTCTGACAAACAGAGGTTTATTGATGAAATCAACAG  2877
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 2803  ATGTGCAAGAAACTTACAGAAAAGCTGAATCGCTTCTTCTCCGATAAACAGAGATTTATTGATGAAATCAACAG  2876

Query 2878  TGTGACTGCAGAGAAACTCATCTATAATTGTGCTGTAGAAATGGTTCAGTCTGCAGCCCTGGATGAGATGTTTC  2951
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2877  TGTGACTGCAGAGAAACTCATCTATAATTGTGCTGTGGAAATGGTTCAATCTGCAGCCCTGGATGAGATGTTTC  2950

Query 2952  AGCAGACCGAAGATATTGTTTATCGCTATCATAAGGCAGCCCTTCTTTTGGAAGGCCTAAGTAGGATTCTACAG  3025
            |||||||.|||||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||.||||||.|||.||.|||
Sbjct 2951  AGCAGACTGAAGACATCGTTTATCGCTACCACAAGGCAGCCCTTCTTTTGGAAGGCTTAAGTAAGATCCTGCAG  3024

Query 3026  GACCCTGCAGATATTGAAAATGTGCATAAATATAAATGTAGTATTGAGAGAAGACTGTCGGCGCTCTGCCATAG  3099
            ||||||.|||||.||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||.||||.||.||||||..|||
Sbjct 3025  GACCCTACAGATGTTGAAAATGTGCATAAGTATAAATGTAGTATTGAAAGAAGATTGTCAGCACTCTGCTGTAG  3098

Query 3100  CACCGCAACCGTG  3112
            |||.|||||.|||
Sbjct 3099  CACTGCAACTGTG  3111