Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_14944
- Subject:
- NM_013881.4
- Aligned Length:
- 3121
- Identities:
- 2808
- Gaps:
- 19
Alignment
Query 1 ATGGAGGTGGTGGGTGACTTCGAGTACAGCAAGAGGGATCTCGTGGGACACGGGGCCTTCGCCGTGGTCTTCCG 74
||||||||||||||.||||||||||||.|||||.||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1 ATGGAGGTGGTGGGCGACTTCGAGTACTGCAAGCGGGACCTCGTGGGACACGGGGCCTTCGCTGTGGTCTTCCG 74
Query 75 GGGGCGGCACCGCCAGAAAACTGATTGGGAGGTAGCTATTAAAAGTATTAATAAAAAGAACTTGTCAAAATCAC 148
|||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GGGGCGGCACCGCCAGAAAACTGATTGGGAGGTGGCTATTAAAAGTATTAATAAAAAGAACTTGTCAAAATCAC 148
Query 149 AAATACTGCTTGGAAAGGAAATTAAAATCTTAAAGGAACTTCAGCATGAAAATATTGTAGCACTCTATGATGTT 222
||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||
Sbjct 149 AAATTCTGCTTGGAAAGGAAATAAAAATCTTAAAGGAGCTTCAGCATGAAAACATCGTAGCGCTCTATGATGTT 222
Query 223 CAGGAATTACCCAACTCTGTCTTTTTGGTGATGGAGTATTGCAATGGTGGAGACCTCGCAGATTATTTGCAAGC 296
||||||||.|||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 223 CAGGAATTGCCCAACTCTGTCTTTCTGGTGATGGAGTATTGCAATGGTGGAGACCTGGCAGATTATTTGCAAGC 296
Query 297 GAAAGGGACTCTCAGTGAAGACACGATCAGAGTGTTTCTGCATCAGATTGCTGCTGCCATGCGAATCCTGCACA 370
.|||||.|||||.||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||||
Sbjct 297 TAAAGGAACTCTGAGTGAAGATACTATCAGAGTGTTTCTCCATCAGATTGCGGCAGCCATGCGAATCCTGCACA 370
Query 371 GCAAAGGAATCATCCACAGAGATCTCAAACCACAGAACATCTTGCTGTCCTATGCCAATCGCAGAAAATCAAGT 444
|||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||.|||.||.||||.|||||||||||.||.||.||.|.|
Sbjct 371 GCAAAGGGATAATCCACAGGGATCTCAAACCACAGAATATCCTGTTGTCTTATGCCAATCGAAGGAAGTCGAAT 444
Query 445 GTCAGTGGTATTCGCATCAAAATAGCGGATTTTGGTTTTGCTCGTTACCTACATAGTAACATGATGGCTGCAAC 518
||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||.||.||.||||||||||||||||..|||||.||.||
Sbjct 445 GTCAGTGGTATTCGTATTAAAATAGCTGATTTTGGTTTCGCACGGTACCTACATAGTAACACAATGGCAGCGAC 518
Query 519 ACTGTGTGGATCCCCGATGTACATGGCTCCTGAGGTTATTATGTCTCAACATTATGATGCTAAGGCTGACTTGT 592
|||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|
Sbjct 519 ACTGTGTGGATCCCCAATGTACATGGCTCCCGAGGTTATTATGTCTCAACATTATGATGCTAAGGCAGATTTAT 592
Query 593 GGAGCATAGGAACAGTGATATACCAATGCCTAGTTGGAAAACCACCTTTTCAGGCCAATAGTCCTCAAGACTTA 666
|||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||.||
Sbjct 593 GGAGCATAGGAACAGTGATCTATCAATGCCTAGTTGGAAAACCACCTTTTCAGGCTAATAGTCCTCAGGACCTA 666
Query 667 AAGATGTTTTATGAAAAAAACAGGAGCTTAATGCCTAGTATTCCCAGAGAAACATCACCTTATTTGGCTAATCT 740
|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 667 AGGATGTTTTATGAAAAAAACAGGAGCTTAATGCCTAGTATTCCCAGAGAAACATCACCTTACTTGGCTAATCT 740
Query 741 -CTTTTGGGTTTGCTTCAGAGAAACCAAAAAGATAAGAATGGACTTTGAAGCGTTTTT-AGCCATCCTTTTTCT 812
|||||||||||||||||||||||.|||||.||| |||||||||||||||||.||||| |||||||| |||.||
Sbjct 741 CCTTTTGGGTTTGCTTCAGAGAAATCAAAAGGAT-AGAATGGACTTTGAAGCATTTTTCAGCCATCC-TTTCCT 812
Query 813 TGAGCAAGGTCCAGTAAAAAAATCTTGCCCAGTTCCAGTGCCCATGTATTCTGGTTCTGTCTCTGGAAGCTCCT 886
||||||||.||||||.|||||||||||||||||.||||||||..||||||||||..|||||.||||||||||||
Sbjct 813 TGAGCAAGTTCCAGTTAAAAAATCTTGCCCAGTCCCAGTGCCTGTGTATTCTGGCCCTGTCCCTGGAAGCTCCT 886
Query 887 GTGGCAGCTCTCCATCTTGTCGTTTTGCTTCTCCACCATCCCTTCCAGATATGCAGCATATTCAGGAAGAAAAC 960
|..|||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 887 GCAGCAGCTCACCATCTTGTCGCTTTGCTTCTCCACCATCCCTTCCAGATATGCAGCATATTCAGGAAGAAAAC 960
Query 961 TTATCTTCCCCACCATTGGGTCCTCCCAACTATCTACAAGTTTCCAAAGATTCTGCCAGTACTAGTAGCAAGAA 1034
|||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.||||.||||||||||||
Sbjct 961 TTATCCTCCCCACCGTTGGGTCCTCCCAACTATCTACAGGTGTCCAAAGACTCTGCGAGTAATAGTAGCAAGAA 1034
Query 1035 CTCTTCTTGTGACACGGATGACTTTGTTTTGGTGCCACACAACATCTCGTCAGACCACTCATGTGATATGCCAA 1108
|||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.|||.|||||||
Sbjct 1035 CTCTTCTTGTGACACGGATGACTTTGTTTTGGTTCCACACAACATCTCGTCAGACCACTCATATGACATGCCAA 1108
Query 1109 TGGGGACTGCTGGCAGACGTGCTTCAAATGAATTCTTGGTGTGTGGAGGGCAGTGTCAGCCTACTGTGTCACCT 1182
||||||||.|.|.||||||||||||||||||||||||..|||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1109 TGGGGACTACGGCCAGACGTGCTTCAAATGAATTCTTTATGTGTGGAGGGCAGTGTCAACCTACTGTGTCACCT 1182
Query 1183 CACAGCGAAACAGCACCAATTCCAGTTCCTACTCAAATAAGGAATTATCAGCGCATAGAGCAGAATCTTACATC 1256
||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.||||||||||.|||
Sbjct 1183 CACAGCGAAACAGCCCCAATTCCAGTTCCTACTCAAGTAAGGAATTATCAGCGCATAGAACAGAATCTTATATC 1256
Query 1257 TACTGCCAGCTCAGGCACAAATGTACATGGTTCTCCAAGATCTGCAGTGGTACGAAGGTCCAACACCAGCCCCA 1330
.|||||||||||.||||||||...||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||||
Sbjct 1257 CACTGCCAGCTCTGGCACAAACCCACATGGTTCTCCAAGATCTGCAGTAGTACGAAGGTCTAATACCAGCCCCA 1330
Query 1331 TGGGCTTCCTCCGGCCGGGATCATGCTCCCCAGTACCAGCAGACACAGCACAGACAGTTGGACGAAGGCTCTCC 1404
||||||||||||||...||.||.||||||||.|||||||.||||||||..|||||||..||||||||.|||||.
Sbjct 1331 TGGGCTTCCTCCGGGTTGGGTCCTGCTCCCCTGTACCAGGAGACACAGTGCAGACAGGAGGACGAAGACTCTCT 1404
Query 1405 ACTGGGTCTTCTAGGCCTTACTCACCTTCCCCTTTGGTTGGTACCATTCCTGAGCAATTCAGTCAGTGCTGCTG 1478
|||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||
Sbjct 1405 ACTGGCTCTTCCAGGCCTTACTCACCATCCCCTTTGGTTGGTACCATTCCTGAACAGTTTAGTCAGTGCTGCTG 1478
Query 1479 TGGGCATCCTCAGGGCCATGACTCCAGGAGTAGAAACTCCTCAGGTTCTCCAGTGCCACAAGCTCAGTCCCCAC 1552
|||.|||||||||||||||||..||||||||||..|||||||||||||||||||||||||..|.|||.|.||||
Sbjct 1479 TGGACATCCTCAGGGCCATGAAGCCAGGAGTAGGCACTCCTCAGGTTCTCCAGTGCCACAGACCCAGGCACCAC 1552
Query 1553 AGTCTCTCTTATCGGGTGCTAGACTGCAGAGCGCCCCCACCCTCACTGACATCTATCAGAACAAGCAGAAGCTC 1626
||||.||||||..||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1553 AGTCACTCTTACTGGGTGCTAGACTGCAGAGTGCACCCACCCTCACCGATATCTATCAGAACAAGCAGAAGCTC 1626
Query 1627 AGAAAACAGCACTCTGACCCCGTGTGCCCATCCCATACTGGGGCTGGGTACAGCTACTCGCCTCAGCCCAGTCG 1700
|||||.||||||||||||||.|||||.||.||||||.||||.||||||||.||.|||||.||||||||.|||||
Sbjct 1627 AGAAAGCAGCACTCTGACCCTGTGTGTCCGTCCCATGCTGGAGCTGGGTATAGTTACTCACCTCAGCCTAGTCG 1700
Query 1701 GCCTGGCAGCCTTGGAACTTCTCCCACCAAGCACTTGGGGTCCTCTCCACGGAGTTCTGACTGGTTCTTTAAAA 1774
|||||||||||||||.||.|||||||||||||||..|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1701 GCCTGGCAGCCTTGGGACCTCTCCCACCAAGCACACGGGGTCCTCTCCACGGAATTCTGACTGGTTCTTTAAAA 1774
Query 1775 CTCCTTTGCCAACAATCATTGGCTCTCCTACTAAGACCACAGCTCCTTTCAAAATCCCTAAAACTCAAGCATCT 1848
|||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1775 CTCCTTTACCAACAATCATTGGCTCTCCTACTAAGACTACAGCTCCTTTCAAAATCCCTAAAACACAAGCATCT 1848
Query 1849 TCCAACCTGTTAGCCTTGGTTACTCGTCATGGGCCTGCTGAAGAACAGTCGAAAGATGGGAATGAGCCACGGGA 1922
||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||...|||||.||||||||||||||.||.||.||
Sbjct 1849 TCTAACCTGTTAGCCTTGGTTACTCGTCATGGGCCTGCTGAAAGCCAGTCCAAAGATGGGAATGACCCTCGTGA 1922
Query 1923 ATGTGCCCATTGCCTCTTAGTGCAAGGAAGTGAGAGGCAGCGGGCCG---AGCAGCAGAGCAAGGCAGTGTTTG 1993
.|||.||||.|||||||.|||.||||||||.||||||||.||..|.| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1923 GTGTTCCCACTGCCTCTCAGTACAAGGAAGCGAGAGGCATCGATCTGAGCAGCAGCAGAGCAAGGCAGTGTTTG 1996
Query 1994 GCAGATCTGTCAGTACCGGGAAGTTATCAGATCAACAAGGAAAGACTCCTATATGTCGACATCAGGGCAGCACA 2067
||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||.||||.|.|||.||.||.||||.|||||||||||.
Sbjct 1997 GCAGATCTGTCAGTACTGGGAAGTTATCAGAACAACAAGTAAAGGCACCTTTAGGTGGACACCAGGGCAGCACG 2070
Query 2068 GACAGTTTAAATACAGAACGACCAATGGATATAGCTCCGGCAGGAGCCTGTGGTGGTGTTCTGGCACCTCCTGC 2141
||.||||||||.||||||||||||||||||.|||||||.||||||||||||||||.|.|.||||||...||.||
Sbjct 2071 GATAGTTTAAACACAGAACGACCAATGGATGTAGCTCCTGCAGGAGCCTGTGGTGTTATGCTGGCATTGCCAGC 2144
Query 2142 AGGTACAGCAGCAAGTTCCAAGGCTGTCCTCTTCACTGTAGGGTCTCCTCCACACAGTGCGGCAGCCCCCACTT 2215
|||.|||||||||||..|||..||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||..||||||||||||
Sbjct 2145 AGGAACAGCAGCAAGCGCCAGAGCTGTCCTCTTCACCGTGGGGTCTCCTCCACACAGTGCCACAGCCCCCACTT 2218
Query 2216 GTACCCACATGTTCCTTCGAACAAGAACAACCTCAGTGGGGCCCAGCAACTCCGGGGGCTCTCTT-TGTGCCAT 2288
||||.||.|||.||||||||||||||||.||||||||||||.||||||.|||.||.||.|| ||| |||.| |
Sbjct 2219 GTACTCATATGGTCCTTCGAACAAGAACCACCTCAGTGGGGTCCAGCAGCTCAGGAGGTTC-CTTGTGTTC--T 2289
Query 2289 G--AGTGGCCGCGTTTGCGTGGGGTCCCCCGCTTGCCCCAAGCCTTCGGGTCTTTCCCTTTCCAGGAGCAGAGG 2360
| ||||||||.||.||.|||||.|||||..||.|.|| ||..||.||.||||.||| .|||||||||||||
Sbjct 2290 GCAAGTGGCCGAGTATGTGTGGGCTCCCCTCCTGGACC--AGGGTTGGGCTCTTCCCC--ACCAGGAGCAGAGG 2359
Query 2361 CAGCTCCCAGCCTGAGATACGTGCCTTACGGTGCTTCACCCCCCCAGCCTAGAGGG-CTCATCACCTTTGAAGC 2433
.||||||||||||.||||||||||||||.||||||||| ||.|||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2360 GAGCTCCCAGCCTAAGATACGTGCCTTATGGTGCTTCA-CCACCCAGCCTAGAGGGTCTCATCACCTTTGAAGC 2432
Query 2434 CCCTGAACTGCCGGAGGAGACGCTGATGGAGCGGGAACACACAGACACCTTACGCCATCTGAATGTGATGCTGA 2507
|||||||||.||.||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||..|||||.|.|
Sbjct 2433 CCCTGAACTACCAGAGGAGACACTGATGGAGCGAGAGCACACAGACACCTTACGCCATCTGAACATGATGTTAA 2506
Query 2508 TGTTCACTGAGTGTGTGCTGGACCTGACAGCCATGAGGGGAGGAAACCNTGAGCTGTGCACATCTGCTGTGTCC 2581
||||.|||||||||||||||||||||||.||..|||||||.||.||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2507 TGTTTACTGAGTGTGTGCTGGACCTGACGGCAGTGAGGGGTGGGAACCCTGAGCTGTGCACATCTGCTGTGTCC 2580
Query 2582 TTGTACCAGATCCAGGAGAGTGTGGTGGTGGACCAGATCAGTCAGCTGAGCAAAGACTGGGGGCGGGTGGAGCA 2655
|||||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 2581 TTGTACCAGATTCAGGAGAGTGTAGTTGTGGACCAGATCAGCCAGCTAAGCAAAGATTGGGGGCGGGTGGAGCA 2654
Query 2656 GCTGGTGTTGTACATGAAAGCAGCACAGCTGCTTGCGGCTTCTCTGCATCTTGCCAAAGCCCAGATCAAGTCCG 2729
||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||.|||.|||||||.|
Sbjct 2655 GCTGGTGTTGTACATGAAGGCAGCACAGCTGCTGGCGGCTTCCCTGCATCTCGCCAAAGCTCAGGTCAAGTCTG 2728
Query 2730 GGAAACTGAGCCCATCCACAGCTGTGAAACAAGTTGTCAAGAATCTGAACGAACGATATAAATTCTGCATCACC 2803
||||.|||||||||||||..|||||||||||||||||.||.||||||||.|||.||||.|||||||||||||||
Sbjct 2729 GGAAGCTGAGCCCATCCATGGCTGTGAAACAAGTTGTTAAAAATCTGAATGAAAGATACAAATTCTGCATCACC 2802
Query 2804 ATGTGCAAGAAACTTACAGAAAAGCTGAATCGATTCTTCTCTGACAAACAGAGGTTTATTGATGAAATCAACAG 2877
||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 2803 ATGTGCAAGAAACTTACAGAAAAGCTGAATCGCTTCTTCTCCGATAAACAGAGATTTATTGATGAAATCAACAG 2876
Query 2878 TGTGACTGCAGAGAAACTCATCTATAATTGTGCTGTAGAAATGGTTCAGTCTGCAGCCCTGGATGAGATGTTTC 2951
||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2877 TGTGACTGCAGAGAAACTCATCTATAATTGTGCTGTGGAAATGGTTCAATCTGCAGCCCTGGATGAGATGTTTC 2950
Query 2952 AGCAGACCGAAGATATTGTTTATCGCTATCATAAGGCAGCCCTTCTTTTGGAAGGCCTAAGTAGGATTCTACAG 3025
|||||||.|||||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||.||||||.|||.||.|||
Sbjct 2951 AGCAGACTGAAGACATCGTTTATCGCTACCACAAGGCAGCCCTTCTTTTGGAAGGCTTAAGTAAGATCCTGCAG 3024
Query 3026 GACCCTGCAGATATTGAAAATGTGCATAAATATAAATGTAGTATTGAGAGAAGACTGTCGGCGCTCTGCCATAG 3099
||||||.|||||.||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||.||||.||.||||||..|||
Sbjct 3025 GACCCTACAGATGTTGAAAATGTGCATAAGTATAAATGTAGTATTGAAAGAAGATTGTCAGCACTCTGCTGTAG 3098
Query 3100 CACCGCAACCGTG 3112
|||.|||||.|||
Sbjct 3099 CACTGCAACTGTG 3111