Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_14947
- Subject:
- XM_017317580.1
- Aligned Length:
- 2298
- Identities:
- 1505
- Gaps:
- 651
Alignment
Query 1 ATGAGTGTCCAAAGTAGCAGTGGAAGTTTGGAGGGGCCGCCATCTTGGTCCCAGCTCTCCACGTCTCCAACCCC 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 GGGCTCGGCGGCGGCGGCCAGGTCCCTGCTGAATCACACGCCGCCATCCGGGAGGCCCAGGGAAGGTGCAATGG 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 ATGAGCTTCATAGTCTGGATCCAAGAAGGCAAGAGTTATTGGAAGCTAGATTTACTGGAGTTGCAAGTGGGAGC 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 ACTGGAAGTACGGGCAGTTGCAGTGTTGGAGCTAAAGCCTCAACAAATAACGAAAGCTCTAATCACAGTTTTGG 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 AAGCTTGGGATCTTTAAGTGACAAAGAATCAGAGACACCGGAGAAGAAACAATCGGAATCATCCAGGGGAAGAA 370
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 371 AGAGAAAAGCAGAAAACCAGAATGAAAGTAGTCAGGGAAAAAGTATTGGGGGACGTGGCCACAAAATTAGCGAC 444
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 445 TATTTTGAATACCAGGGTGGAAATGGCTCAAGTCCAGTAAGAGGCATACCTCCTGCAATCCGTTCTCCTCAAAA 518
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 519 TTCACATTCACATTCCACTCCTTCCTCATCTGTTCGACCGAATAGCCCTTCTCCTACTGCATTAGCATTTGGGG 592
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 593 ACCACCCTATTGTACAACCAAAGCAATTATCCTTTAAAATTATTCAGACTGATCTCACAATGCTGAAATTAGCA 666
|||||||||||.|||
Sbjct 1 -----------------------------------------------------------ATGCTGAAATTGGCA 15
Query 667 GCATTAGAAAGTAATAAAATCCAGGACCTGGAAAAGAAGGAGGGACGTATAGATGATTTGCTCAGGGCTAACTG 740
|||||||||||||.|||||..||.||||||||.||||||||.||.||.||.||||||.||||||||||.|||||
Sbjct 16 GCATTAGAAAGTACTAAAAATCAAGACCTGGAGAAGAAGGAAGGCCGGATTGATGATCTGCTCAGGGCCAACTG 89
Query 741 TGATCTCAGACGGCAAATAGATGAACAACAAAAATTACTTGAAAAATACAAAGAACGATTAAATAAGTGCATAT 814
|||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 90 TGATCTCAGGCGGCAAATAGATGATCAACAGAAATTACTTGAAAAATACAAAGAACGATTAAATAAGTGCATAT 163
Query 815 CAATGAGCAAGAAACTTCTTATTGAAAAGAGTACACAAGAAAAGCTGTCAAGCAGAGAGAAGAGTATGCAAGAT 888
|.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||..||||.||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 164 CTATGAGCAAGAAACTACTTATTGAAAAGAGTACACAAGAAAAATTGTCTAGCAGAGAAAAGAGTATGCAAGAT 237
Query 889 CGATTACGCCTTGGGCACTTTACAACAGTTAGACATGGCGCTTCATTTACTGAACAATGGACAGATGGTTTTGC 962
||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||
Sbjct 238 CGGTTGCGCCTTGGGCACTTTACCACAGTTAGACACGGCGCTTCCTTTACAGAACAGTGGACAGATGGTTTTGC 311
Query 963 ATTTCAGAATCTTGTGAAGCAACAAGAATGGGTGAATCAGCAAAGGGAAGATATTGAAAGGCAAAGGAAACTTC 1036
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||.|||||||.|||||||
Sbjct 312 ATTTCAGAATCTTGTGAAGCAACAAGAATGGGTGAATCAACAAAGGGAAGACATTGAACGGCAAAGAAAACTTC 385
Query 1037 TAGCCAAACGCAAACCTCCCACAGCTAATAATTCTCAGGCACCCTCTACCAATTCTGAACCAAAACAAAGGAAA 1110
|||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||||||||||||.|.||.|||||.||.
Sbjct 386 TAGGCAAACGCAAACCTCCCACAGCTAATAATTCTCAGGCACCTGCTACCAATTCTGAAGCCAAGCAAAGAAAG 459
Query 1111 AACAAAGCAGTCAATGGAGCAGAGAATGATCCCTTTGTTAGACCAAATTTACCACAACTGTTGACTTTGGCAGA 1184
|.|||.||||||||||||||.||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||.|||||.|||||||
Sbjct 460 ACCAAGGCAGTCAATGGAGCGGAAAACGATCCCTTTGTTAGGCCAAATTTACCACAACTGCTGACTCTGGCAGA 533
Query 1185 ATATCATGAACAGGAAGAAATTTTCAAACTTAGACTAGGACATCTCAAAAAGGAAGAGGCAGAAATCCAGGCAG 1258
.|||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|
Sbjct 534 GTATCATGAACAAGAGGAAATTTTTAAACTTAGACTAGGACATCTCAAAAAGGAAGAGGCTGAAATCCAGGCGG 607
Query 1259 AACTTGAACGTTTGGAAAGAGTCAGAAATCTTCACATACGTGAGCTGAAAAGAATAAACAATGAAGATAATTCA 1332
||||.||.||||||||.||.|||.|.||.||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 608 AACTGGAGCGTTTGGAGAGGGTCCGGAACCTTCACATCCGAGAGCTGAAGAGAATAAACAATGAGGATAATTCA 681
Query 1333 CAGTTCAAAGATCACCCAACATTAAATGAAAGATATTTATTACTTCATCTGCTTGGTAGAGGTGGCTTTAGTGA 1406
||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||
Sbjct 682 CAGTTCAAAGATCATCCAACGTTAAATGAAAGATATTTATTACTTCATCTGCTTGGGAGAGGCGGCTTTAGTGA 755
Query 1407 AGTGTATAAGGCTTTTGACCTTTATGAACAAAGATATGCTGCTGTGAAGATACATCAGCTTAATAAAAGCTGGA 1480
.||.||||||||.||.|||.|.|||||.||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||
Sbjct 756 GGTCTATAAGGCATTCGACTTGTATGAGCAAAGATACGCTGCTGTGAAGATCCACCAGCTTAATAAGAGCTGGA 829
Query 1481 GAGATGAGAAGAAAGAAAACTACCACAAACATGCCTGCAGAGAGTATAGAATACACAAAGAACTGGATCACCCC 1554
||||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||.||||||||.||||||||||.||||||||.||||||
Sbjct 830 GAGACGAGAAGAAAGAAAACTACCACAAACACGCTTGCCGAGAGTATCGAATACACAAGGAACTGGACCACCCC 903
Query 1555 AGAATAGTTAAACTCTATGATTATTTCTCCTTGGATACAGATACGTTTTGTACAGTGTTAGAATACTGTGAAGG 1628
|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.|||||||||||
Sbjct 904 AGAATAGTTAAACTCTATGATTACTTCTCCTTGGATACAGATACGTTTTGTACAGTGCTAGAGTACTGTGAAGG 977
Query 1629 CAATGACTTGGATTTCTATCTGAAGCAACACAAGTTAATGTCAGAGAAAGAAGCTCGGTCTATTGTAATGCAGA 1702
||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 978 CAATGACTTGGACTTCTACCTGAAGCAGCACAAGTTGATGTCTGAGAAAGAAGCTCGGTCTATTGTGATGCAGA 1051
Query 1703 TTGTAAATGCACTAAGATATCTCAATGAGATCAAACCCCCTATTATACATTATGATCTTAAGCCAGGAAACATC 1776
||||.|||||..||.|.|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||
Sbjct 1052 TTGTGAATGCCTTACGCTATCTCAATGAAATCAAACCTCCTATTATACATTATGACCTTAAGCCAGGAAATATC 1125
Query 1777 CTACTGGTAGATGGAACAGCATGTGGTGAAATCAAAATCACTGATTTTGGTCTGTCCAAGATTATGGATGATGA 1850
||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1126 CTTCTGGTAGATGGAACAGCATGTGGAGAAATCAAAATCACTGATTTTGGTCTGTCCAAGATTATGGATGACGA 1199
Query 1851 TAGCTATGGTGTAGATGGAATGGATCTAACTTCCCAGGGGGCAGGCACTTACTGGTATTTACCTCCTGAGTGTT 1924
|||.||.|||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1200 TAGTTACGGTGTTGATGGGATGGATCTGACTTCCCAGGGGGCAGGCACTTACTGGTATTTACCTCCTGAGTGCT 1273
Query 1925 TTGTAGTTGGAAAAGAGCCACCAAAGATTTCCAACAAGGTTGATGTATGGTCGGTTGGAGTCATCTTCTTTCAG 1998
||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||.|||||.|||||.|||||||||||.|||
Sbjct 1274 TTGTAGTTGGAAAAGAGCCACCGAAGATCTCCAACAAGGTTGACGTGTGGTCAGTTGGGGTCATCTTCTTCCAG 1347
Query 1999 TGTCTTTATGGTAGAAAGCCATTTGGTCACAATCAATCTCAACAAGACATTCTTCAAGAAAATACAATATTAAA 2072
||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||.|.||
Sbjct 1348 TGCCTCTATGGTAGAAAACCATTTGGTCACAATCAATCTCAACAAGACATTCTACAGGAAAACACAATACTGAA 1421
Query 2073 AGCCACAGAAGTCCAGTTCCCTGTAAAACCGGTTGTAAGCAGTGAAGCCAAGGCATTTATAAGACGCTGTTTGG 2146
||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||
Sbjct 1422 AGCCACAGAAGTCCAGTTCCCTGTAAAACCTGTTGTAAGCAGTGAAGCCAAGGCCTTCATAAGACGCTGTTTGG 1495
Query 2147 CATATCGAAAAGAAGATCGATTTGATGTGCACCAGCTGGCAAATGACCCATACCTTCTCCCACACATGAGAAGA 2220
|.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1496 CTTACCGAAAAGAAGATCGATTTGATGTGCACCAGCTGGCAAATGACCCATACCTTCTGCCACACATGAGAAGA 1569
Query 2221 TCAAATTCTTCAGGAAACCTACACATGGCTGGGCTGACAGCATCCCCTACACCCCCTTCTTCAAGCATAATTAC 2294
||||||||||||||||||.||||.|||.||||||||||||||.|.||.|||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1570 TCAAATTCTTCAGGAAACTTACATATGTCTGGGCTGACAGCAACTCCCACACCTCCTTCTTCAAGCATAATTAC 1643
Query 2295 TTAC 2298
||||
Sbjct 1644 TTAC 1647
