Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_14950
• Subject: XM_017320418.1
• Aligned Length: 1440
• Identities: 1165
• Gaps: 186

Alignment

Query    1  ATGAGAGATGTTACCATTGTGAAAGAAGGTTGGGTTCAGAAGAGGGGAGAATATATAAAAAACTGGAGGCCAAG  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  ATACTTCCTTTTGAAGACAGATGGCTCATTCATAGGATATAAAGAGAAACCTCAAGATGTGGATTTACCTTATC  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  CCCTCAACAACTTTTCAGTGGCAAAATGCCAGTTAATGAAAACAGAACGACCAAAGCCAAACACATTTATAATC  222
                                               ||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||
Sbjct    1  -----------------------------------ATGAAAACAGAACGACCAAAGCCAAATACATTTATTATC  39

Query  223  AGATGTCTCCAGTGGACTACTGTTATAGAGAGAACATTTCATGTAGATACTCCAGAGGAAAGGGAAGAATGGAC  296
            ||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||
Sbjct   40  AGATGTCTTCAGTGGACCACTGTTATAGAGAGAACATTTCATGTAGATACACCAGAGGAAAGAGAAGAGTGGAC  113

Query  297  AGAAGCTATCCAGGCTGTAGCAGACAGACTGCAGAGGCAAGAAGAGGAGAGAATGAATTGTAGTCCAACTTCAC  370
            .|||||||||||.||.|||||.|||.||.|||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||.||||
Sbjct  114  GGAAGCTATCCAAGCCGTAGCCGACCGATTGCAGAGGCAAGAGGAGGAGAGGATGAATTGTAGCCCAACCTCAC  187

Query  371  AAATTGATAATATAGGAGAGGAAGAGATGGATGCCTCTACAACCCATCATAAAAGAAAGACAATGAATGATTTT  444
            |.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  188  AGATTGATAATATAGGAGAAGAAGAGATGGATGCGTCTACAACCCATCATAAAAGAAAGACGATGAATGATTTT  261

Query  445  GACTATTTGAAACTACTAGGTAAAGGCACTTTTGGGAAAGTTATTTTGGTTCGAGAGAAGGCAAGTGGAAAATA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  262  GACTATTTGAAACTACTAGGTAAAGGCACTTTTGGGAAAGTTATTTTGGTTCGAGAGAAGGCAAGTGGAAAATA  335

Query  519  CTATGCTATGAAGATTCTGAAGAAAGAAGTCATTATTGCAAAGGATGAAGTGGCACACACTCTAACTGAAAGCA  592
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct  336  CTATGCTATGAAGATTCTGAAGAAAGAAGTCATTATTGCAAAGGATGAAGTGGCACACACTCTTACTGAAAGCA  409

Query  593  GAGTATTAAAGAACACTAGACATCCCTTTTTAACATCCTTGAANTATNCNTNCCAGANAAAAGACNGTTTGTGT  666
            |||||.||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||.|.|.|||||.|||||||.||||||||
Sbjct  410  GAGTACTAAAGAACACCAGACATCCATTTTTAACATCCTTGAAATATTCCTTCCAGACAAAAGACCGTTTGTGT  483

Query  667  TTTGTGATGGAATATGTTANNGGGGGCGAGCTGTTTTTCCATTTGTCGAGAGAGCGGGTGTTCTCTGAGGACCG  740
            |||||||||||||||||||..||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  484  TTTGTGATGGAATATGTTAATGGCGGAGAGCTGTTTTTCCATTTGTCGAGAGAGCGAGTGTTCTCTGAGGACCG  557

Query  741  CACACGTTTCTATGGTGCAGAAATTGTCTCTGCCTTGGACTATCTACATTCCCGGNAAGATTTGTGGTACCGTG  814
            |||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||| |.||.|||| |||| ||||||||
Sbjct  558  CACACGTTTCTATGGTGCAGAAATTGTCTCTGCTTTGGACTATCTACATT-CTGGAAAGA-TTGT-GTACCGTG  628

Query  815  ATCTCAAGTTGGAGAATCTAATGCTGGACAAAGATGGCCACATAAAAATTACAGATTTTGGACTTTGCAAAGAA  888
            |||||||||||||||||.|.|||||.||.||.||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||
Sbjct  629  ATCTCAAGTTGGAGAATTTGATGCTAGATAAGGATGGCCATATAAAAATTACGGATTTTGGGCTTTGCAAAGAA  702

Query  889  GGGATCACAGATGCAGCCACCATGAAGACATTCTGTGGCACTCCAGAATATCTGGCACCAGAGGTGTTAGAAGA  962
            |||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||.||||||||
Sbjct  703  GGGATCACAGATGCAGCTACCATGAAGACATTCTGTGGCACACCAGAGTACCTGGCACCAGAGGTATTAGAAGA  776

Query  963  TAATGACTATGGCCGAGCAGTAGACTGGTGGGGCCTAGGGGTTGTCATGTATGAAATGATGTGTGGGAGGTTAC  1036
            ||||||||||||||||||.||.||||||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|
Sbjct  777  TAATGACTATGGCCGAGCCGTGGACTGGTGGGGCTTAGGTGTTGTCATGTATGAAATGATGTGTGGAAGGTTGC  850

Query 1037  CTTTCTACAACCAGGACCATGAGAAACTTTTTGAATTAATATTAATGGAAGACATTAAATTTCCTCGAACACTC  1110
            ||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||.|||||||||||||||||||.||.|||||||||
Sbjct  851  CTTTCTACAACCAGGATCATGAGAAACTCTTTGAATTAATACTAATGGAAGACATTAAATTCCCCCGAACACTC  924

Query 1111  TCTTCAGATGCAAAATCATTGCTTTCAGGGCTCTTGATAAAGGATCCAAATAAACGCCTTGGTGGAGGACCAGA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct  925  TCTTCAGATGCAAAATCATTGCTTTCAGGGCTCTTGATAAAGGATCCAAATAAACGCCTTGGTGGAGGGCCAGA  998

Query 1185  TGATGCAAAAGAAATTATGAGACACAGTTTCTTCTCTGGAGTAAACTGGCAAGATGTATATGATAAAAAGCTTG  1258
            |||||||||||||||.|||||.||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct  999  TGATGCAAAAGAAATCATGAGGCATAGTTTTTTTTCTGGAGTAAACTGGCAAGATGTATATGACAAAAAGCTTG  1072

Query 1259  TACCTCCTTTTAAACCTCAAGTAACATCTGAGACAGATACTAGATATTTTGATGAAGAATTTACAGCTCAGACT  1332
            |||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||..||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1073  TACCTCCTTTTAAGCCTCAAGTAACATCTGAAACAGACACCCGATATTTTGATGAAGAATTTACAGCTCAGACT  1146

Query 1333  ATTACAATAACACCACCTGAAAAATATGATGAGGATGGTATGGACTGCATGGACAATGAGAGGCGGCCGCATTT  1406
            |||||||||||||||||||||||.|||||.||.||.||.||||||.||||||||||.|||.|||||||.||.||
Sbjct 1147  ATTACAATAACACCACCTGAAAAGTATGACGACGACGGCATGGACGGCATGGACAACGAGCGGCGGCCACACTT  1220

Query 1407  CCCTCAATTTTCCTACTCTGCAAGTGGACGAGAA  1440
            ||||||.||.||||||||||||||.|||||.|||
Sbjct 1221  CCCTCAGTTCTCCTACTCTGCAAGCGGACGGGAA  1254