Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_14983
• Subject: NM_001081443.3
• Aligned Length: 1773
• Identities: 1467
• Gaps: 303

Alignment

Query    1  ATGACCCTCACCCTCTCAGTCCTGATTTGCCTCGGGCTGAGTGTGGGCCCCAGGACCTGCGTGCAGGCAGGCAC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGACCCTCACCCTCTCAGTCCTGATTTGCCTCGGGCTGAGTGTGGGCCCCAGGACCTGCGTGCAGGCAGGCAC  74

Query   75  CCTCCCCAAACCCACCCTCTGGGCTGAGCCAGCCTCTGTGATAGCTCGGGGGAAGCCCGTGACCCTCTGGTGTC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCTCCCCAAACCCACCCTCTGGGCTGAGCCAGCCTCTGTGATAGCTCGGGGGAAGCCCGTGACCCTCTGGTGTC  148

Query  149  AGGGGCCCCTGGAGACTGAGGAGTACCGTCTGGATAAGGAGGGACTCCCATGGGCCCGGAAGAGACAGAACCCA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AGGGGCCCCTGGAGACTGAGGAGTACCGTCTGGATAAGGAGGGACTCCCATGGGCCCGGAAGAGACAGAACCCA  222

Query  223  CTGGAGCCTGGAGCCAAGGCCAAGTTCCACATTCCATCCACGGTGTATGACAGTGCAGGGCGATACCGCTGCTA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CTGGAGCCTGGAGCCAAGGCCAAGTTCCACATTCCATCCACGGTGTATGACAGTGCAGGGCGATACCGCTGCTA  296

Query  297  CTATGAGACCCCTGCAGGCTGGTCAGAGCCCAGTGACCCCCTGGAGCTGGTGGCGACAGGATTCTATGCAGAAC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                  
Sbjct  297  CTATGAGACCCCTGCAGGCTGGTCAGAGCCCAGTGACCCCCTGGAGCTGGTGGCGA------------------  352

Query  371  CCACTCTTTTAGCCCTGCCGAGTCCTGTGGTGGCCTCAGGAGGAAATGTGACCCTCCAGTGTGATACACTGGAC  444
                                                                                      
Sbjct  353  --------------------------------------------------------------------------  352

Query  445  GGACTTCTCACGTTTGTTCTTGTTGAGGAAGAACAGAAGCTCCCCAGGACCCTGTACTCACAGAAGCTCCCCAA  518
                                                                                      
Sbjct  353  --------------------------------------------------------------------------  352

Query  519  AGGGCCATCCCAGGCCCTGTTCCCTGTGGGTCCCGTGACCCCCAGCTGCAGGTGGAGGTTCAGATGCTATTACT  592
                                                                                      
Sbjct  353  --------------------------------------------------------------------------  352

Query  593  ATTACAGGAAAAACCCTCAGGTGTGGTCGAACCCCAGTGACCTCCTGGAGATTCTGGTCCCAGGCGTGTCTAGG  666
                                                                        ||||||||||||||
Sbjct  353  ------------------------------------------------------------CAGGCGTGTCTAGG  366

Query  667  AAGCCCTCCCTCCTGATCCCGCAGGGCTCTGTCGTGGCCCGCGGAGGCAGCCTGACCCTGCAGTGTCGCTCTGA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  367  AAGCCCTCCCTCCTGATCCCGCAGGGCTCTGTCGTGGCCCGCGGAGGCAGCCTGACCCTGCAGTGTCGCTCTGA  440

Query  741  TGTCGGCTATGACATATTCGTTCTGTACAAGGAGGGGGAACATGACCTCGTCCAGGGCTCTGGCCAGCAGCCCC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  441  TGTCGGCTATGACATATTCGTTCTGTACAAGGAGGGGGAACATGACCTCGTCCAGGGCTCTGGCCAGCAGCCCC  514

Query  815  AGGCTGGGCTCTCCCAGGCCAACTTCACCCTGGGCCCTGTGAGCCGCTCCCACGGGGGCCAGTACAGATGCTAC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  515  AGGCTGGGCTCTCCCAGGCCAACTTCACCCTGGGCCCTGTGAGCCGCTCCCACGGGGGCCAGTACAGATGCTAC  588

Query  889  GGTGCACACAACCTCTCCCCTAGGTGGTCGGCCCCCAGCGACCCCCTGGCCATCCTGATCGCAGGACTGATCCC  962
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct  589  GGTGCACACAACCTCTCCCCTAGGTGGTCGGCCCCCAGCGACCCCCTGGACATCCTGATCGCAGGACTGATCCC  662

Query  963  TGACATACCCGCCCTCTCGGTGCAGCCGGGCCCCAAGGTGGCCTCAGGAGAGAACGTGACCCTGCTGTGTCAGT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  663  TGACATACCCGCCCTCTCGGTGCAGCCGGGCCCCAAGGTGGCCTCAGGAGAGAACGTGACCCTGCTGTGTCAGT  736

Query 1037  CATGGCATCAGATAGACACTTTCTTTTTGACCAAGGAGGGGGCAGCCCATCCCCCGCTGTGTCTAAAGTCAAAG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  737  CATGGCATCAGATAGACACTTTCTTTTTGACCAAGGAGGGGGCAGCCCATCCCCCGCTGTGTCTAAAGTCAAAG  810

Query 1111  TACCAGTCTTATAGACACCAGGCTGAATTCTCCATGAGTCCTGTGACCTCAGCCCAGGGTGGAACCTACCGATG  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  811  TACCAGTCTTATAGACACCAGGCTGAATTCTCCATGAGTCCTGTGACCTCAGCCCAGGGTGGAACCTACCGATG  884

Query 1185  CTACAGCGCAATCAGGTCCTACCCCTACCTGCTGTCCAGCCCTAGTTACCCCCAGGAGCTCGTGGTCTCAGGAC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  885  CTACAGCGCAATCAGGTCCTACCCCTACCTGCTGTCCAGCCCTAGTTACCCCCAGGAGCTCGTGGTCTCAGGAC  958

Query 1259  CCTCTGGGGATCCCAGCCTCTCACCTACAGGCTCCACCCCCACACCT---GGCCCTGAGGACCAGCCCCTCACC  1329
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||
Sbjct  959  CCTCTGGGGATCCCAGCCTCTCACCTACAGGCTCCACCCCCACACCTGCAGGCCCTGAGGACCAGCCCCTCACC  1032

Query 1330  CCCACGGGGTTGGATCCCCAGAGTGGTCTGGGAAGGCACCTGGGGGTTGTGACTGGGGTCTCAGTGGCCTTCGT  1403
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1033  CCCACGGGGTTGGATCCCCAGAGTGGTCTGGGAAGGCACCTGGGGGTTGTGACTGGGGTCTCAGTGGCCTTCGT  1106

Query 1404  CCTGCTGCTGTTCCTCCTCCTCTTCCTCCTCCTCCGACATCGGCATCAGAGCAAACACAGGACATCGGCCCATT  1477
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1107  CCTGCTGCTGTTCCTCCTCCTCTTCCTCCTCCTCCGACATCGGCATCAGAGCAAACACAGGACATCGGCCCATT  1180

Query 1478  TCTACCGTCCTGCAGGGGCTGCGGGGCCAGAGCCCAAGGACCAGGGCCTGCAGAAGAGGGCCAGCCCAGTTGCT  1551
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1181  TCTACCGTCCTGCAGGGGCTGCGGGGCCAGAGCCCAAGGACCAGGGCCTGCAGAAGAGGGCCAGCCCAGTTGCT  1254

Query 1552  GACATCCAGGAGGAAATTCTCAATGCTGCCGTGAAGGACACACAGCCCAAGGACGGGGTGGAGATGGATGCTCG  1625
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1255  GACATCCAGGAGGAAATTCTCAATGCTGCCGTGAAGGACACACAGCCCAAGGACGGGGTGGAGATGGATGCTCC  1328

Query 1626  GGCTGCTGCATCTGAAGCCCCCCAGGATGTGACCTACGCCCAGCTACACAGCTTGACCCTCAGACGGGAGGCAA  1699
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1329  GGCTGCTGCATCTGAAGCCCCCCAGGATGTGACCTACGCCCAGCTGCACAGCTTGACCCTCAGACGGGAGGCAA  1402

Query 1700  CTGAGCCTCCTCCATCCCAGGAAAGGGAACCTCCAGCTGAACCCAGCATCTACGCCCCCCTGGCCATCCAC  1770
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1403  CTGAGCCTCCTCCATCCCAGGAAAGGGAACCTCCAGCTGAACCCAGCATCTACGCCCCCCTGGCCATCCAC  1473