Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_14983
• Subject: XM_011526362.2
• Aligned Length: 2010
• Identities: 1467
• Gaps: 540

Alignment

Query    1  ATGACCCTCACCCTCTCAGTCCTGATTTGCCTCGGGCTGAGTGTGGGCCCCAGGACCTGCGTGCAGGCAGGCAC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGACCCTCACCCTCTCAGTCCTGATTTGCCTCGGGCTGAGTGTGGGCCCCAGGACCTGCGTGCAGGCAGGCAC  74

Query   75  CCTCCCCAAACCCACCCTCTGGGCTGAGCCAGCCTCTGTGATAGCTCGGGGGAAGCCCGTGACCCTCTGGTGTC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCTCCCCAAACCCACCCTCTGGGCTGAGCCAGCCTCTGTGATAGCTCGGGGGAAGCCCGTGACCCTCTGGTGTC  148

Query  149  AGGGGCCCCTGGAGACTGAGGAGTACCGTCTGGATAAGGAGGGACTCCCATGGGCCCGGAAGAGACAGAACCCA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AGGGGCCCCTGGAGACTGAGGAGTACCGTCTGGATAAGGAGGGACTCCCATGGGCCCGGAAGAGACAGAACCCA  222

Query  223  CTGGAGCCTGGAGCCAAGGCCAAGTTCCACATTCCATCCACGGTGTATGACAGTGCAGGGCGATACCGCTGCTA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CTGGAGCCTGGAGCCAAGGCCAAGTTCCACATTCCATCCACGGTGTATGACAGTGCAGGGCGATACCGCTGCTA  296

Query  297  CTATGAGACCCCTGCAGGCTGGTCAGAGCCCAGTGACCCCCTGGAGCTGGTGGCGACAGGATTCTATGCAGAAC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                  
Sbjct  297  CTATGAGACCCCTGCAGGCTGGTCAGAGCCCAGTGACCCCCTGGAGCTGGTGGCGA------------------  352

Query  371  CCACTCTTTTAGCCCTGCCGAGTCCTGTGGTGGCCTCAGGAGGAAATGTGACCCTCCAGTGTGATACACTGGAC  444
                                                                                      
Sbjct  353  --------------------------------------------------------------------------  352

Query  445  GGACTTCTCACGTTTGTTCTTGTTGAGGAAGAACAGAAGCTCCCCAGGACCCTGTACTCACAGAAGCTCCCCAA  518
                                                                                      
Sbjct  353  --------------------------------------------------------------------------  352

Query  519  AGGGCCATCCCAGGCCCTGTTCCCTGTGGGTCCCGTGACCCCCAGCTGCAGGTGGAGGTTCAGATGCTATTACT  592
                                                                                      
Sbjct  353  --------------------------------------------------------------------------  352

Query  593  ATTACAGGAAAAACCCTCAGGTGTGGTCGAACCCCAGTGACCTCCTGGAGATTCTGGTCCCAGGCGTGTCTAGG  666
                                                                        ||||||||||||||
Sbjct  353  ------------------------------------------------------------CAGGCGTGTCTAGG  366

Query  667  AAGCCCTCCCTCCTGATCCCGCAGGGCTCTGTCGTGGCCCGCGGAGGCAGCCTGACCCTGCAGTGTCGCTCTGA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  367  AAGCCCTCCCTCCTGATCCCGCAGGGCTCTGTCGTGGCCCGCGGAGGCAGCCTGACCCTGCAGTGTCGCTCTGA  440

Query  741  TGTCGGCTATGACATATTCGTTCTGTACAAGGAGGGGGAACATGACCTCGTCCAGGGCTCTGGCCAGCAGCCCC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  441  TGTCGGCTATGACATATTCGTTCTGTACAAGGAGGGGGAACATGACCTCGTCCAGGGCTCTGGCCAGCAGCCCC  514

Query  815  AGGCTGGGCTCTCCCAGGCCAACTTCACCCTGGGCCCTGTGAGCCGCTCCCACGGGGGCCAGTACAGATGCTAC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  515  AGGCTGGGCTCTCCCAGGCCAACTTCACCCTGGGCCCTGTGAGCCGCTCCCACGGGGGCCAGTACAGATGCTAC  588

Query  889  GGTGCACACAACCTCTCCCCTAGGTGGTCGGCCCCCAGCGACCCCCTGGCCATCCTGATCGCAGGACTGATCCC  962
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct  589  GGTGCACACAACCTCTCCCCTAGGTGGTCGGCCCCCAGCGACCCCCTGGACATCCTGATCGCAGGACTGATCCC  662

Query  963  TGACATACCCGCCCTCTCGGTGCAGCCGGGCCCCAAGGTGGCCTCAGGAGAGAACGTGACCCTGCTGTGTCAGT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  663  TGACATACCCGCCCTCTCGGTGCAGCCGGGCCCCAAGGTGGCCTCAGGAGAGAACGTGACCCTGCTGTGTCAGT  736

Query 1037  CATGGCATCAGATAGACACTTTCTTTTTGACCAAGGAGGGGGCAGCCCATCCCCCGCTGTGTCTAAAGTCAAAG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  737  CATGGCATCAGATAGACACTTTCTTTTTGACCAAGGAGGGGGCAGCCCATCCCCCGCTGTGTCTAAAGTCAAAG  810

Query 1111  TACCAGTCTTATAGACACCAGGCTGAATTCTCCATGAGTCCTGTGACCTCAGCCCAGGGTGGAACCTACCGATG  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  811  TACCAGTCTTATAGACACCAGGCTGAATTCTCCATGAGTCCTGTGACCTCAGCCCAGGGTGGAACCTACCGATG  884

Query 1185  CTACAGCGCAATCAGGTCCTACCCCTACCTGCTGTCCAGCCCTAGTTACCCCCAGGAGCTCGTGGTCTCAGGAC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  885  CTACAGCGCAATCAGGTCCTACCCCTACCTGCTGTCCAGCCCTAGTTACCCCCAGGAGCTCGTGGTCTCAGGAC  958

Query 1259  CCTCTGGGGATCCCAGCCTCTCACCTACAGGCTCCACCCCCACACCT---GGCCCTGAGGACCAGCCCCTCACC  1329
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||
Sbjct  959  CCTCTGGGGATCCCAGCCTCTCACCTACAGGCTCCACCCCCACACCTGCAGGCCCTGAGGACCAGCCCCTCACC  1032

Query 1330  CCCACGGGGTTGGATCCCCAGAGTGGTCTGGGAAGGCACCTGGGGGTTGTGACTGGGGTCTCAGTGGCCTTCGT  1403
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1033  CCCACGGGGTTGGATCCCCAGAGTGGTCTGGGAAGGCACCTGGGGGTTGTGACTGGGGTCTCAGTGGCCTTCGT  1106

Query 1404  CCTGCTGCTGTTCCTCCTCCTCTTCCTCCTCCTCCGACATCGGCATCAGAGCAAACACAGGACATCGGCCCATT  1477
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1107  CCTGCTGCTGTTCCTCCTCCTCTTCCTCCTCCTCCGACATCGGCATCAGAGCAAACACAGGACATCGGCCCATT  1180

Query 1478  TCTACCGTCCTGCAGGGGCTGCGGGGCCAGAGCCCAAGGACCAGGGCCTGCAGAAGAGGGCCAGCCCAGTTGCT  1551
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1181  TCTACCGTCCTGCAGGGGCTGCGGGGCCAGAGCCCAAGGACCAGGGCCTGCAGAAGAGGGCCAGCCCAGTTGCT  1254

Query 1552  GACATCCAGGAGGAAATTCTCAATGCTGCCGTGAAGGACACACAGCCCAAGGACGGGGTGGAGATGGATGCT--  1623
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  
Sbjct 1255  GACATCCAGGAGGAAATTCTCAATGCTGCCGTGAAGGACACACAGCCCAAGGACGGGGTGGAGATGGATGCTCC  1328

Query 1624  --------------------------------------------------------------------------  1623
                                                                                      
Sbjct 1329  GCAGAGCCCACACGATGAAGACCCCCAGGCAGTGACGTATGCCCCGGTGAAACACTCCAGACCTAGGAGAGAAA  1402

Query 1624  --------------------------------------------------------------------------  1623
                                                                                      
Sbjct 1403  TGGCCTCTCCTCCTTCCCCACTGTCTGGGGAATTCCTGGACACAAAGGACAGACAGGCAGAAGAGGACAGACAG  1476

Query 1624  --------------------------------------------------------------------------  1623
                                                                                      
Sbjct 1477  ATGGACACTGAGAGAGTCCTTTCCTCTCCAGGCCCCCAGGCCTCCCCCACCCCCACCACGTTCCTTCCCTCTCA  1550

Query 1624  -------------CGGGCTGCTGCATCTGAAGCCCCCCAGGATGTGACCTACGCCCAGCTACACAGCTTGACCC  1684
                         |.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1551  CTCTCCCCCGCTGCAGGCTGCTGCATCTGAAGCCCCCCAGGATGTGACCTACGCCCAGCTGCACAGCTTGACCC  1624

Query 1685  TCAGACGGGAGGCAACTGAGCCTCCTCCATCCCAGGAAAGGGAACCTCCAGCTGAACCCAGCATCTACGCCCCC  1758
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1625  TCAGACGGGAGGCAACTGAGCCTCCTCCATCCCAGGAAAGGGAACCTCCAGCTGAACCCAGCATCTACGCCCCC  1698

Query 1759  CTGGCCATCCAC  1770
            ||||||||||||
Sbjct 1699  CTGGCCATCCAC  1710