Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_14983
• Subject: XM_011548575.3
• Aligned Length: 1973
• Identities: 1510
• Gaps: 232

Alignment

Query    1  ATGACCCTCACCCTCTCAGTCCTGATTTGCCTCGGGCTGAGTGTGGGCCCCAGGACCTGCGTGCAGGCAGGCAC  74
            |||||.|.|.|||||.|||.||||.|.|||||.|||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||..|
Sbjct    1  ATGACGCCCGCCCTCACAGCCCTGCTCTGCCTTGGGCTGAGTCTGGGCCCCAGGACCCGCGTGCAGGCAGGGCC  74

Query   75  CCTCCCCAAACCCACCCTCTGGGCTGAGCCAGCCTCTGTGAT-AGCTCGGGGGAAGCCCGTGACCCTCTGGTGT  147
            |.||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||| |||| ||||||..|||||||||.||||||||
Sbjct   75  CTTCCCCAAACCCACCCTCTGGGCTGAGCCAGGCTCTGTGATCAGCT-GGGGGAGCCCCGTGACCATCTGGTGT  147

Query  148  CAGGGGCCCCTGGAGACTGAGGAGTACCGTCTGGATAAGGAGGGACTCCCATGGGCCC--GGAAGAGACAGAAC  219
            ||||||..|||||||.|..||||||||||.||||||||.||||||..|||| |.||||  || |.|||.|.|||
Sbjct  148  CAGGGGAGCCTGGAGGCCCAGGAGTACCGACTGGATAAAGAGGGAAGCCCA-GAGCCCTTGG-ACAGAAATAAC  219

Query  220  CCACTGGAGCCTGGAGC-----CAAGGCCAAGTTCCACATTCCATCCACGGTGTATGACAG-------TGCAGG  281
            ||||||||.||     |     ||||||||..|||..|||.||||||       |||||||       |||.||
Sbjct  220  CCACTGGAACC-----CAAGAACAAGGCCAGATTCTCCATCCCATCC-------ATGACAGAGCACCATGCGGG  281

Query  282  GCGATACCGCTGCTACTATGAGACCCCTGCAGGCTGGTCAGAGCCCAGTGACCCCCTGGAGCTGGTGGCGACAG  355
            |.|||||||||||.|||||.|.|.|.||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||..|||||
Sbjct  282  GAGATACCGCTGCCACTATTACAGCTCTGCAGGCTGGTCAGAGCCCAGCGACCCCCTGGAGCTGGTGATGACAG  355

Query  356  GATTCTATGCA--GAACCCACTCTTTTAGCCCTGCCGAGTCCTGTGGTGGCCTCAGGAGGAAATGTGACCCTCC  427
            |||||||  ||  .|||||||.||.|.|||||||||.||.|||||||||||||||||.||.|||.|||||||||
Sbjct  356  GATTCTA--CAACAAACCCACCCTCTCAGCCCTGCCCAGCCCTGTGGTGGCCTCAGGGGGGAATATGACCCTCC  427

Query  428  AGTGTGATACACTGGACGGACTTCTCAC--GTTTGTTCTTGTTG-AGGA---AGAACAGAAGCTCCCCAGGACC  495
            ..||||...|||.|.|.|||  |.||||  .||||||| ||.|| ||||   ||||||..||||||||.|||||
Sbjct  428  GATGTGGCTCACAGAAGGGA--TATCACCATTTTGTTC-TGATGAAGGAAGGAGAACACCAGCTCCCCCGGACC  498

Query  496  CTGTACTCACAGAAGCTCCCCAAAGGGCCATCCCAGGCCCTGTTCCCTGTGGGTCCCGTGACCCCCAGCTGCAG  569
            |||.||||||||.||||||.||..|||...|.|||||||||||||||||||||.|||||||.|||||||..|||
Sbjct  499  CTGGACTCACAGCAGCTCCACAGTGGGGGGTTCCAGGCCCTGTTCCCTGTGGGCCCCGTGAACCCCAGCCACAG  572

Query  570  GTGGAGGTTCAGATGCTATTACTATTACAGGAAAAACCCTCAGGTGTGGTCGAACCCCAGTGACCTCCTGGAGA  643
            |||||||||||.|||||||||||||||.|.|||.|.|||.|||||||||||..||||||||||||.||||||||
Sbjct  573  GTGGAGGTTCACATGCTATTACTATTATATGAACACCCCCCAGGTGTGGTCCCACCCCAGTGACCCCCTGGAGA  646

Query  644  TTCTGGTCCCAGGCGTGTCTAGGAAGCCCTCCCTCCTGATCCCGCAGGGCTCTGTCGTGGCCCGCGGAGGC--A  715
            |||||..|.||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||.|||||.||||||..|  |||  |
Sbjct  647  TTCTGCCCTCAGGCGTGTCTAGGAAGCCCTCCCTCCTGACCCTGCAGGGCCCTGTCCTGGCCCCTG--GGCAGA  718

Query  716  GCCTGACCCTGCAGTGTCGCTCTGATGTCGGCTATGACATATTCGTTCTGTACAAGGAGGGGGAACATGACCTC  789
            ||||||||||.||||||.||||||||||||||||.||||.|||.||||||||.|||||||||||||.||||.||
Sbjct  719  GCCTGACCCTCCAGTGTGGCTCTGATGTCGGCTACGACAGATTTGTTCTGTATAAGGAGGGGGAACGTGACTTC  792

Query  790  GTCCAGGGCTCTGGCCAGCAGCCCCAGGCTGGGCTCTCCCAGGCCAACTTCACCCTGGGCCCTGTGAGCCGCTC  863
            .|||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  793  CTCCAGCGCCCTGGCCAGCAGCCCCAGGCTGGGCTCTCCCAGGCCAACTTCACCCTGGGCCCTGTGAGCCCCTC  866

Query  864  CCACGGGGGCCAGTACAGATGCTACGGTGCACACAACCTCTCC-CCTAGGTGGTCGGCCCCCAGCGACCCCCTG  936
            ||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||| ||.| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct  867  CCACGGGGGCCAGTACAGGTGCTATGGTGCACACAACCTCTCCTCCGA-GTGGTCGGCCCCCAGCGACCCCCTG  939

Query  937  GCCATCCTGATCGCAGGACTGATCCCTGACATACCCG---CCCTCTCGGTGCAGCCGGGCCCCAAGGTGGCCTC  1007
            ..|||||||||.|||||||.||||..|||||   |||   ||||.||.|..|||||||||||||..||||||||
Sbjct  940  AACATCCTGATGGCAGGACAGATCTATGACA---CCGTCTCCCTGTCAGCACAGCCGGGCCCCACAGTGGCCTC  1010

Query 1008  AGGAGAGAACGTGACCCTGCTGTGTCAGTCATGGCATCAGATAGACACTTTCTTTTTGACCAAGGAGGGGGCAG  1081
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||...|||.|.|||||||||.||.|||||||.||.|||||||
Sbjct 1011  AGGAGAGAACGTGACCCTGCTGTGTCAGTCATGGTGGCAGTTTGACACTTTCCTTCTGACCAAAGAAGGGGCAG  1084

Query 1082  CCCATCCCCCGCTGTGTCTAAAGTCAAAGTAC-CAGTCTTATAGACACCAGGCTGAATTCTCCATGAGTCCTGT  1154
            ||||||||||.|||.||||.|..||||.|||| .|| ||.|||...||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1085  CCCATCCCCCACTGCGTCTGAGATCAATGTACGGAG-CTCATAAGTACCAGGCTGAATTCCCCATGAGTCCTGT  1157

Query 1155  GACCTCAGCCCAGGGTGGAACCTACCGATGCTACAGCGCAATCAGGTCCTACCCCTACCTGCTGTCCAGCCCTA  1228
            ||||||||||||.|..||.||||||.|.||||||.||.||..|||.|||.|||||.||||||||||...|||.|
Sbjct 1158  GACCTCAGCCCACGCGGGGACCTACAGGTGCTACGGCTCATACAGCTCCAACCCCCACCTGCTGTCTTTCCCCA  1231

Query 1229  GTTACCCCCAGGAGCTCGTGGTCTCAGGACCCTCTGG-GGATCCCAGCCTCTCACCTACAGGCTCCACCC-CCA  1300
            ||.|.||||.|||.|||.||||||||||||.|||||| ||.| ||||||||.||||.||||| .||.||| |||
Sbjct 1232  GTGAGCCCCTGGAACTCATGGTCTCAGGACACTCTGGAGGCT-CCAGCCTCCCACCCACAGG-GCCGCCCTCCA  1303

Query 1301  CACCT---GGCCCTGAGGACCAGCCCCTCACCCCCACGGGGTTGGATCCCCAGAGTGGTCTGGGAAGGCACCTG  1371
            |||||   ||.|||||||||||||||||.|.||||.|.||||..|..||.||||.||||||||||||..|||||
Sbjct 1304  CACCTGGAGGTCCTGAGGACCAGCCCCTTAACCCCCCAGGGTCAGGCCCTCAGAATGGTCTGGGAAGATACCTG  1377

Query 1372  GGGGTTGTGACTGGGGTCTCAGTGGCCTTCGTCCTGCTGCTGTTCCTCCTCCTCTTCCTCCTCCTCCGACATCG  1445
            |.||||.|||.|||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.||.
Sbjct 1378  GAGGTTTTGATTGGGGTCTCGGTGGCCTTCGTCCTGCTGCTCTTCCTCCTCCTCTTCCTCCTCCTCCGACGTCA  1451

Query 1446  GCATCAGAGCAAACACAGGACATCGGCCC------------ATTTCTACCGTCCTGCAGGGGCTGCGGGGCCAG  1507
            ||.|||.|||||||||||||||||.|.||            |||||.|.|||||||||||||||||||.|.|||
Sbjct 1452  GCGTCACAGCAAACACAGGACATCTGACCAGAGAAAGACTGATTTCCAGCGTCCTGCAGGGGCTGCGGAGACAG  1525

Query 1508  AGCCCAAGGACCAGGGCCTGCAGAAGAGGGCCAGCCCAGTTGCTGACATCCAGGAGGAAATTCTCAATGCTGCC  1581
            |||||||||||..||||||||.||.||||.|||||||||.|||||||.|||||||.||||..|||.||||||||
Sbjct 1526  AGCCCAAGGACAGGGGCCTGCTGAGGAGGTCCAGCCCAGCTGCTGACGTCCAGGAAGAAAACCTCTATGCTGCC  1599

Query 1582  GTGAAGGACACACAGCCCAAGGACGGGGTGG-------------------------------------------  1612
            |||||||||||||||.|..|||||.||||||                                           
Sbjct 1600  GTGAAGGACACACAGTCTGAGGACAGGGTGGAGCTGGACAGTCAGAGCCCACACGATGAAGACCCCCAGGCAGT  1673

Query 1613  --------------------------------------------------------------------------  1612
                                                                                      
Sbjct 1674  GACGTATGCCCCGGTGAAACACTCCAGTCCTAGGAGAGAAATGGCCTCTCCTCCCTCCTCACTGTCTGGGGAAT  1747

Query 1613  ---------------------------------------AGATGGATGCTCGGGCTGCTGCATCTGAAGCCCCC  1647
                                                   |||||||..||..|||||||||||||||||||.||
Sbjct 1748  TCCTGGACACAAAGGACAGACAGGTGGAAGAGGACAGGCAGATGGACACTGAGGCTGCTGCATCTGAAGCCTCC  1821

Query 1648  CAGGATGTGACCTACGCCCAGCTACACAGCTTGACCCTCAGACGGGAGGCAACTGAGCCTCCTCCATCCCAGGA  1721
            |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1822  CAGGATGTGACCTACGCCCAGCTGCACAGCTTGACCCTTAGACGGAAGGCAACTGAGCCTCCTCCATCCCAGGA  1895

Query 1722  AAGGGAACCTCCAGCTGAACCCAGCATCTACGCCCCCCTGGCCATCCAC  1770
            |.||||||||||||||||.|||||||||||||||.|.||||||||||||
Sbjct 1896  AGGGGAACCTCCAGCTGAGCCCAGCATCTACGCCACTCTGGCCATCCAC  1944