Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_14983
• Subject: XM_017030297.1
• Aligned Length: 1972
• Identities: 1471
• Gaps: 281

Alignment

Query    1  ATGACCCTCACCCTCTCAGTCCTGATTTGCCTCGGGCTGAGTGTGGGCCCCAGGACCTGCGTGCAGGCAGGCAC  74
            |||||.|.|.|||||.|||.||||.|.|||||.|||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||..|
Sbjct    1  ATGACGCCCGCCCTCACAGCCCTGCTCTGCCTTGGGCTGAGTCTGGGCCCCAGGACCCGCGTGCAGGCAGGGCC  74

Query   75  CCTCCCCAAACCCACCCTCTGGGCTGAGCCAGCCTCTGTGAT-AGCTCGGGGGAAGCCCGTGACCCTCTGGTGT  147
            |.||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||| |||| ||||||..|||||||||.||||||||
Sbjct   75  CTTCCCCAAACCCACCCTCTGGGCTGAGCCAGGCTCTGTGATCAGCT-GGGGGAGCCCCGTGACCATCTGGTGT  147

Query  148  CAGGGGCCCCTGGAGACTGAGGAGTACCGTCTGGATAAGGAGGGACTCCCATGGGCCC--GGAAGAGACAGAAC  219
            ||||||..||.||||.|..||||||||||.|||.||||.||||||..|||| |.||||  || |.|||.|.|||
Sbjct  148  CAGGGGAGCCAGGAGGCCCAGGAGTACCGACTGCATAAAGAGGGAAGCCCA-GAGCCCTTGG-ACAGAAATAAC  219

Query  220  CCACTGGAGCCTGGAGC-----CAAGGCCAAGTTCCACATTCCATCCACGGTGTATGACAG-------TGCAGG  281
            ||||||||.||     |     ||||||||..|||..|||.||||||       |||||||       ||||||
Sbjct  220  CCACTGGAACC-----CAAGAACAAGGCCAGATTCTCCATCCCATCC-------ATGACAGAGCACCATGCAGG  281

Query  282  GCGATACCGCTGCTACTATGAGACCCCTGCAGGCTGGTCAGAGCCCAGTGACCCCCTGGAGCTGGTGGCGACAG  355
            |.|||||||||||.|||||.|.|.|.||||||||||||||||||||||.||||||||||||.|||||..|||||
Sbjct  282  GAGATACCGCTGCCACTATTACAGCTCTGCAGGCTGGTCAGAGCCCAGCGACCCCCTGGAGATGGTGATGACAG  355

Query  356  GATTCTATGCAG--AACCCACTCTTTTAGCCCTGCCGAGTCCTGTGGTGGCCTCAGGAGGAAATGTGACCCTCC  427
            ||..|||  |||  |||||||.||.|.|||||||||.||.|||||||||||||||||.||.|||.|||||||||
Sbjct  356  GAGCCTA--CAGCAAACCCACCCTCTCAGCCCTGCCCAGCCCTGTGGTGGCCTCAGGGGGGAATATGACCCTCC  427

Query  428  AGTGTGATACACTGGACGGACTTCTCAC--GTTTGTTCTTGTTG-AGGA---AGAACAGAAGCTCCCCAGGACC  495
            ..||||...|||.|.|.|||  |.||||  .||||||| ||.|| ||||   ||||||..||||||||.|||||
Sbjct  428  GATGTGGCTCACAGAAGGGA--TATCACCATTTTGTTC-TGATGAAGGAAGGAGAACACCAGCTCCCCCGGACC  498

Query  496  CTGTACTCACAGAAGCTCCCCAAAGGGCCATCCCAGGCCCTGTTCCCTGTGGGTCCCGTGACCCCCAGCTGCAG  569
            |||.||||||||.||||||.||...||...|.|||||||||||||||||||||.|||||||||||||||..|||
Sbjct  499  CTGGACTCACAGCAGCTCCACAGTCGGGGGTTCCAGGCCCTGTTCCCTGTGGGCCCCGTGACCCCCAGCCACAG  572

Query  570  GTGGAGGTTCAGATGCTATTACTATTACAGGAAAAACCCTC-AGGTGTGGTCGAACCCCAGTGACCTCCTGGAG  642
            |||||||||||.|||||||||||||||.| .|||.||||.| .|||||||||..||||||||||||.|||||||
Sbjct  573  GTGGAGGTTCACATGCTATTACTATTATA-CAAACACCCCCTGGGTGTGGTCCCACCCCAGTGACCCCCTGGAG  645

Query  643  ATTCTGGTCCCAGGCGTGTCTAGGAAGCCCTCCCTCCTGATCCCGCAGGGCTCTGTCGTGGCCCGCGGAGGC--  714
            ||||||..|.||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||.|||||.||||||..|  |||  
Sbjct  646  ATTCTGCCCTCAGGCGTGTCTAGGAAGCCCTCCCTCCTGACCCTGCAGGGCCCTGTCCTGGCCCCTG--GGCAG  717

Query  715  AGCCTGACCCTGCAGTGTCGCTCTGATGTCGGCTATGACATATTCGTTCTGTACAAGGAGGGGGAACATGACCT  788
            |||||||||||.||||||.||||||||||||||||..|||.|||.||||||||.|||||||||||||.||||.|
Sbjct  718  AGCCTGACCCTCCAGTGTGGCTCTGATGTCGGCTACAACAGATTTGTTCTGTATAAGGAGGGGGAACGTGACTT  791

Query  789  CGTCCAGGGCTCTGGCCAGCAGCCCCAGGCTGGGCTCTCCCAGGCCAACTTCACCCTGGGCCCTGTGAGCCGCT  862
            |.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  792  CCTCCAGCGCCCTGGCCAGCAGCCCCAGGCTGGGCTCTCCCAGGCCAACTTCACCCTGGGCCCTGTGAGCCCCT  865

Query  863  CCCACGGGGGCCAGTACAGATGCTACGGTGCACACAACCTCTCC-CCTAGGTGGTCGGCCCCCAGCGACCCCCT  935
            ||.|.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||| ||.| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct  866  CCAATGGGGGCCAGTACAGGTGCTACGGTGCACACAACCTCTCCTCCGA-GTGGTCGGCCCCCAGCGACCCCCT  938

Query  936  GGCCATCCTGATCGCAGGACTGATCCCTGACATACCCG---CCCTCTCGGTGCAGCCGGGCCCCAAGGTGGCCT  1006
            |..|||||||||.|||||||.||||..|||||   |||   ||||.||.|..|||||||||||||..|||||||
Sbjct  939  GAACATCCTGATGGCAGGACAGATCTATGACA---CCGTCTCCCTGTCAGCACAGCCGGGCCCCACAGTGGCCT  1009

Query 1007  CAGGAGAGAACGTGACCCTGCTGTGTCAGTCATGGCATCAGATAGACACTTTCTTTTTGACCAAGGAGGGGGCA  1080
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||...|||.|.|||||||||.||.|||||||.||.||||||
Sbjct 1010  CAGGAGAGAACGTGACCCTGCTGTGTCAGTCATGGTGGCAGTTTGACACTTTCCTTCTGACCAAAGAAGGGGCA  1083

Query 1081  GCCCATCCCCCGCTGTGTCTAAAGTCAAAGTAC-CAGTCTTATAGACACCAGGCTGAATTCTCCATGAGTCCTG  1153
            |||||||||||.|||.||||.|..||||.|||| .|| ||.|||...||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1084  GCCCATCCCCCACTGCGTCTGAGATCAATGTACGGAG-CTCATAAGTACCAGGCTGAATTCCCCATGAGTCCTG  1156

Query 1154  TGACCTCAGCCCAGGGTGGAACCTACCGATGCTACAGCGCAATCAGGTCCTACCCCTACCTGCTGTC-CAGCCC  1226
            |||||||||||||.|..||.||||||.|.||||||.||.||..|||.|||.|||||.|||||||||| || |||
Sbjct 1157  TGACCTCAGCCCACGCGGGGACCTACAGGTGCTACGGCTCATACAGCTCCAACCCCCACCTGCTGTCTCA-CCC  1229

Query 1227  TAGTTACCCCCAGGAGCTCGTGGTCTCAGGACCCTCTGG-GGATCCCAGCCTCTCACCTACAGGCTCCACCC-C  1298
            .|||.|.||||.||||||||||||||||||||.|||||| ||.| ||||||||.||||.||||| .||.||| |
Sbjct 1230  CAGTGAGCCCCTGGAGCTCGTGGTCTCAGGACACTCTGGAGGCT-CCAGCCTCCCACCCACAGG-GCCGCCCTC  1301

Query 1299  CACACCTGGCCCTGAGGACCAGCCCCTCACCCCCACGGGGTTGGATCCCCAGAGTGGTCTGGGAAGGCACCTGG  1372
            ||||||                                                ||||||||||||..||||||
Sbjct 1302  CACACC------------------------------------------------TGGTCTGGGAAGATACCTGG  1327

Query 1373  GGGTTGTGACTGGGGTCTCAGTGGCCTTCGTCCTGCTGCTGTTCCTCCTCCTCTTCCTCCTCCTCCGACATCGG  1446
            .||||.|||.|||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.||.|
Sbjct 1328  AGGTTTTGATTGGGGTCTCGGTGGCCTTCGTCCTGCTGCTCTTCCTCCTCCTCTTCCTCCTCCTCCGACGTCAG  1401

Query 1447  CATCAGAGCAAACACAGGACATCGGCCC------------ATTTCTACCGTCCTGCAGGGGCTGCGGGGCCAGA  1508
            |.|||.|||||||||||||||||.|.||            |||||.|.|||||||||||||||||||.|.||||
Sbjct 1402  CGTCACAGCAAACACAGGACATCTGACCAGAGAAAGACTGATTTCCAGCGTCCTGCAGGGGCTGCGGAGACAGA  1475

Query 1509  GCCCAAGGACCAGGGCCTGCAGAAGAGGGCCAGCCCAGTTGCTGACATCCAGGAGGAAATTCTCAATGCTGCCG  1582
            ||||||||||..||||||||.||.||||.|||||||||.|||||||.|||||||.||||..|||.|||||||||
Sbjct 1476  GCCCAAGGACAGGGGCCTGCTGAGGAGGTCCAGCCCAGCTGCTGACGTCCAGGAAGAAAACCTCTATGCTGCCG  1549

Query 1583  TGAAGGACACACAGCCCAAGGACGGGGTGG--------------------------------------------  1612
            ||||||||||||||.|..|||||.||||||                                            
Sbjct 1550  TGAAGGACACACAGTCTGAGGACAGGGTGGAGCTGGACAGTCAGAGCCCACACGATGAAGACCCCCAGGCAGTG  1623

Query 1613  --------------------------------------------------------------------------  1612
                                                                                      
Sbjct 1624  ACGTATGCCCCGGTGAAACACTCCAGTCCTAGGAGAGAAATGGCCTCTCCTCCCTCCTCACTGTCTGGGGAATT  1697

Query 1613  --------------------------------------AGATGGATGCTCGGGCTGCTGCATCTGAAGCCCCCC  1648
                                                  |||||||..||..|||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1698  CCTGGACACAAAGGACAGACAGGTGGAAGAGGACAGGCAGATGGACACTGAGGCTGCTGCATCTGAAGCCTCCC  1771

Query 1649  AGGATGTGACCTACGCCCAGCTACACAGCTTGACCCTCAGACGGGAGGCAACTGAGCCTCCTCCATCCCAGGAA  1722
            ||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1772  AGGATGTGACCTACGCCCAGCTGCACAGCTTGACCCTTAGACGGAAGGCAACTGAGCCTCCTCCATCCCAGGAA  1845

Query 1723  AGGGAACCTCCAGCTGAACCCAGCATCTACGCCCCCCTGGCCATCCAC  1770
            .||||||||||||||||.|||||||||||||||.|.||||||||||||
Sbjct 1846  GGGGAACCTCCAGCTGAGCCCAGCATCTACGCCACTCTGGCCATCCAC  1893