Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_14983
• Subject: XR_001756784.2
• Aligned Length: 1926
• Identities: 1330
• Gaps: 382

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  CACACCCTGTGTGTCTCTCTGTCCTGCCAGCACTGAGGGCTCATCCCTCTGCAGAGCGCGGGGTCACCGGGAGG  74

Query    1  -------ATGACCCTCACCCTCTCAGTCCTGATTTGCCTCGGGCTGAGTGTGGGCCCCAGGACCTGCGTGCAGG  67
                   |||||.|.|.|||||.|||.||||.|.|||||.|||||||||.||||||||||||||.|||||||||
Sbjct   75  AGACGCCATGACGCCCGCCCTCACAGCCCTGCTCTGCCTTGGGCTGAGTCTGGGCCCCAGGACCCGCGTGCAGG  148

Query   68  CAGGCACCCTCCCCAAACCCACCCTCTGGGCTGAGCCAGCCTCTGTGAT-AGCTCGGGGGAAGCCCGTGACCCT  140
            ||||..||.||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||| |||| ||||||..|||||||||.|
Sbjct  149  CAGGGCCCTTCCCCAAACCCACCCTCTGGGCTGAGCCAGGCTCTGTGATCAGCT-GGGGGAGCCCCGTGACCAT  221

Query  141  CTGGTGTCAGGGGCCCCTGGAGACTGAGGAGTACCGTCTGGATAAGGAGGGACTCCCATGGGCCC--GGAAGAG  212
            |||||||||||||..|||||||.|..||||||||||.||||||||.||||||..|||| |.||||  || |.||
Sbjct  222  CTGGTGTCAGGGGAGCCTGGAGGCCCAGGAGTACCGACTGGATAAAGAGGGAAGCCCA-GAGCCCTTGG-ACAG  293

Query  213  ACAGAACCCACTGGAGCCTGGAGC-----CAAGGCCAAGTTCCACATTCCATCCACGGTGTATGACAG------  275
            |.|.|||||||||||.||     |     ||||||||..|||..|||.||||||       |||||||      
Sbjct  294  AAATAACCCACTGGAACC-----CAAGAACAAGGCCAGATTCTCCATCCCATCC-------ATGACAGAGCACC  355

Query  276  -TGCAGGGCGATACCGCTGCTACTATGAGACCCCTGCAGGCTGGTCAGAGCCCAGTGACCCCCTGGAGCTGGTG  348
             |||.|||.|||||||||||.|||||.|.|.|.||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct  356  ATGCGGGGAGATACCGCTGCCACTATTACAGCTCTGCAGGCTGGTCAGAGCCCAGCGACCCCCTGGAGCTGGTG  429

Query  349  GCGACAGGATTCTATGCA--GAACCCACTCTTTTAGCCCTGCCGAGTCCTGTGGTGGCCTCAGGAGGAAATGTG  420
            ..||||||||||||  ||  .|||||||.||.|.|||||||||.||.|||||||||||||||||.||.|||.||
Sbjct  430  ATGACAGGATTCTA--CAACAAACCCACCCTCTCAGCCCTGCCCAGCCCTGTGGTGGCCTCAGGGGGGAATATG  501

Query  421  ACCCTCCAGTGTGATACACTGGACGGACTTCTCAC--GTTTGTTCTTGTTG-AGGA---AGAACAGAAGCTCCC  488
            |||||||..||||...|||.|.|.|||  |.||||  .||||||| ||.|| ||||   ||||||..|||||||
Sbjct  502  ACCCTCCGATGTGGCTCACAGAAGGGA--TATCACCATTTTGTTC-TGATGAAGGAAGGAGAACACCAGCTCCC  572

Query  489  CAGGACCCTGTACTCACAGAAGCTCCCCAAAGGGCCATCCCAGGCCCTGTTCCCTGTGGGTCCCGTGACCCCCA  562
            |.||||||||.||||||||.||||||.||..|||...|.|||||||||||||||||||||.|||||||.|||||
Sbjct  573  CCGGACCCTGGACTCACAGCAGCTCCACAGTGGGGGGTTCCAGGCCCTGTTCCCTGTGGGCCCCGTGAACCCCA  646

Query  563  GCTGCAGGTGGAGGTTCAGATGCTATTACTATTACAGGAAAAACCCTCAGGTGTGGTCGAACCCCAGTGACCTC  636
            ||..||||||||||||||.|||||||||||||||.|.|||.|.|||.|||||||||||..||||||||||||.|
Sbjct  647  GCCACAGGTGGAGGTTCACATGCTATTACTATTATATGAACACCCCCCAGGTGTGGTCCCACCCCAGTGACCCC  720

Query  637  CTGGAGATTCTGGTCCCAGGCGTGTCTAGGAAGCCCTCCCTCCTGATCCCGCAGGGCTCTGTCGTGGCCCGCGG  710
            ||||||||||||..|.||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||.|||||.||||||..| 
Sbjct  721  CTGGAGATTCTGCCCTCAGGCGTGTCTAGGAAGCCCTCCCTCCTGACCCTGCAGGGCCCTGTCCTGGCCCCTG-  793

Query  711  AGGC--AGCCTGACCCTGCAGTGTCGCTCTGATGTCGGCTATGACATATTCGTTCTGTACAAGGAGGGGGAACA  782
             |||  |||||||||||.||||||.||||||||||||||||.||||.|||.||||||||.|||||||||||||.
Sbjct  794  -GGCAGAGCCTGACCCTCCAGTGTGGCTCTGATGTCGGCTACGACAGATTTGTTCTGTATAAGGAGGGGGAACG  866

Query  783  TGACCTCGTCCAGGGCTCTGGCCAGCAGCCCCAGGCTGGGCTCTCCCAGGCCAACTTCACCCTGGGCCCTGTGA  856
            ||||.||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  867  TGACTTCCTCCAGCGCCCTGGCCAGCAGCCCCAGGCTGGGCTCTCCCAGGCCAACTTCACCCTGGGCCCTGTGA  940

Query  857  GCCGCTCCCACGGGGGCCAGTACAGATGCTACGGTGCACACAACCTCTCC-CCTAGGTGGTCGGCCCCCAGCGA  929
            |||.|||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||| ||.| ||||||||||||||||||
Sbjct  941  GCCCCTCCCACGGGGGCCAGTACAGGTGCTATGGTGCACACAACCTCTCCTCCGA-GTGGTCGGCCCCCAGCGA  1013

Query  930  CCCCCTGGCCATCCTGATCGCAGGACTGATCCCTGACATACCCG---CCCTCTCGGTGCAGCCGGGCCCCAAGG  1000
            |||||||..|||||||||.|||||||.||||..|||||   |||   ||||.||.|..|||||||||||||..|
Sbjct 1014  CCCCCTGAACATCCTGATGGCAGGACAGATCTATGACA---CCGTCTCCCTGTCAGCACAGCCGGGCCCCACAG  1084

Query 1001  TGGCCTCAGGAGAGAACGTGACCCTGCTGTGTCAGTCATGGCATCAGATAGACACTTTCTTTTTGACCAAGGAG  1074
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||...|||.|.|||||||||.||.|||||||.||.
Sbjct 1085  TGGCCTCAGGAGAGAACGTGACCCTGCTGTGTCAGTCATGGTGGCAGTTTGACACTTTCCTTCTGACCAAAGAA  1158

Query 1075  GGGGCAGCCCATCCCCCGCTGTGTCTAAAGTCAAAGTAC-CAGTCTTATAGACACCAGGCTGAATTCTCCATGA  1147
            |||||||||||||||||.|||.||||.|..||||.|||| .|| ||.|||...||||||||||||||.||||||
Sbjct 1159  GGGGCAGCCCATCCCCCACTGCGTCTGAGATCAATGTACGGAG-CTCATAAGTACCAGGCTGAATTCCCCATGA  1231

Query 1148  GTCCTGTGACCTCAGCCCAGGGTGGAACCTACCGATGCTACAGCGCAATCAGGTCCTACCCCTACCTGCTGTCC  1221
            |||||||||||||||||||.|..||.||||||.|.||||||.||.||..|||.|||.|||||.||||||||||.
Sbjct 1232  GTCCTGTGACCTCAGCCCACGCGGGGACCTACAGGTGCTACGGCTCATACAGCTCCAACCCCCACCTGCTGTCT  1305

Query 1222  AGCCCTAGTTACCCCCAGGAGCTCGTGGTCTCAGGACCCTCTGG-GGATCCCAGCCTCTCACCTACAGGCTCCA  1294
            ..|||.|||.|.||||.|||.|||.||||||||||||.|||||| ||.| ||||||||.||||.||||| .||.
Sbjct 1306  TTCCCCAGTGAGCCCCTGGAACTCATGGTCTCAGGACACTCTGGAGGCT-CCAGCCTCCCACCCACAGG-GCCG  1377

Query 1295  CCC-CCACACCT---GGCCCTGAGGACCAGCCCCTCACCCCCACGGGGTTGGATCCCCAGAGTGGTCTGGGAAG  1364
            ||| ||||||||   ||.|||||||||||||||||.|.||||.|.||||..|..||.||||.||||||||||||
Sbjct 1378  CCCTCCACACCTGGAGGTCCTGAGGACCAGCCCCTTAACCCCCCAGGGTCAGGCCCTCAGAATGGTCTGGGAAG  1451

Query 1365  GCACCTGGGGGTTGTGACTGGGGTCTCAGTGGCCTTCGTCCTGCTGCTGTTCCTCCTCCTCTTCCTCCTCCTCC  1438
            ..||||||.||||.|||.|||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1452  ATACCTGGAGGTTTTGATTGGGGTCTCGGTGGCCTTCGTCCTGCTGCTCTTCCTCCTCCTCTTCCTCCTCCTCC  1525

Query 1439  GACATCGGCATCAGAGCAAACACAGGACATCGG-----------------------CCC---------------  1474
            |||.||.||.|||.|||||||||||||||||.|                       |||               
Sbjct 1526  GACGTCAGCGTCACAGCAAACACAGGACATCTGGGCTGAGACTCTGTCCATCTTCACCCAGACCAGAGAAAGAC  1599

Query 1475  --ATTTCTACCGTCCTGCAGGGGCTGCGGGGCCAGAGCCCAAGGACCAGGGCCTGCAGAAGAGGGCCAGCCCAG  1546
              |||||.|.|||||||||||||||||||.|.||||||||||||||..||||||||.||.||||.|||||||||
Sbjct 1600  TGATTTCCAGCGTCCTGCAGGGGCTGCGGAGACAGAGCCCAAGGACAGGGGCCTGCTGAGGAGGTCCAGCCCAG  1673

Query 1547  TTGCTGACATCCAGGAGGAAATTCTCAATGCTGCCGTGAAGGACACACAGCCCAAGGACGGGGTGGAGATGGAT  1620
            .|||||||.|||||||.||||..|||.                                               
Sbjct 1674  CTGCTGACGTCCAGGAAGAAAACCTCT-----------------------------------------------  1700

Query 1621  GCTCGGGCTGCTGCATCTGAAGCCCCCCAGGATGTGACCTACGCCCAGCTACACAGCTTGACCCTCAGACGGGA  1694
                                                                                      
Sbjct 1701  --------------------------------------------------------------------------  1700

Query 1695  GGCAACTGAGCCTCCTCCATCCCAGGAAAGGGAACCTCCAGCTGAACCCAGCATCTACGCCCCCCTGGCCATCC  1768
                                                                                      
Sbjct 1701  --------------------------------------------------------------------------  1700

Query 1769  AC  1770
              
Sbjct 1701  --  1700