Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_14983
• Subject: XR_935722.1
• Aligned Length: 2324
• Identities: 1633
• Gaps: 623

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  AGAACCCAGCCTCCAGTCCACACTCTGCGTGTTTTTGTGTCCTGCCAGGCACCGTGGTCTCATCCGCCTGCACA  74

Query    1  -------------------------ATGACCCTCACCCTCTCAGTCCTGATTTGCCTCGGGCTGAGTGTGGGCC  49
                                     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GCTGAGTCCAGTGGGAGCTGACGCCATGACCCTCACCCTCTCAGTCCTGATTTGCCTCGGGCTGAGTGTGGGCC  148

Query   50  CCAGGACCTGCGTGCAGGCAGGCACCCTCCCCAAACCCACCCTCTGGGCTGAGCCAGCCTCTGTGATAGCTCGG  123
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CCAGGACCTGCGTGCAGGCAGGCACCCTCCCCAAACCCACCCTCTGGGCTGAGCCAGCCTCTGTGATAGCTCGG  222

Query  124  GGGAAGCCCGTGACCCTCTGGTGTCAGGGGCCCCTGGAGACTGAGGAGTACCGTCTGGATAAGGAGGGACTCCC  197
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GGGAAGCCCGTGACCCTCTGGTGTCAGGGGCCCCTGGAGACTGAGGAGTACCGTCTGGATAAGGAGGGACTCCC  296

Query  198  ATGGGCCCGGAAGAGACAGAACCCACTGGAGCCTGGAGCCAAGGCCAAGTTCCACATTCCATCCACGGTGTATG  271
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  ATGGGCCCGGAAGAGACAGAACCCACTGGAGCCTGGAGCCAAGGCCAAGTTCCACATTCCATCCACGGTGTATG  370

Query  272  ACAGTGCAGGGCGATACCGCTGCTACTATGAGACCCCTGCAGGCTGGTCAGAGCCCAGTGACCCCCTGGAGCTG  345
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ACAGTGCAGGGCGATACCGCTGCTACTATGAGACCCCTGCAGGCTGGTCAGAGCCCAGTGACCCCCTGGAGCTG  444

Query  346  GTGGCGACAGGATTCTATGCAGAACCCACTCTTTTAGCCCTGCCGAGTCCTGTGGTGGCCTCAGGAGGAAATGT  419
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GTGGCGACAGGATTCTATGCAGAACCCACTCTTTTAGCCCTGCCGAGTCCTGTGGTGGCCTCAGGAGGAAATGT  518

Query  420  GACCCTCCAGTGTGATACACTGGACGGACTTCTCACGTTTGTTCTTGTTGAGGAAGAACAGAAGCTCCCCAGGA  493
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GACCCTCCAGTGTGATACACTGGACGGACTTCTCACGTTTGTTCTTGTTGAGGAAGAACAGAAGCTCCCCAGGA  592

Query  494  CCCTGTACTCACAGAAGCTCCCCAAAGGGCCATCCCAGGCCCTGTTCCCTGTGGGTCCCGTGACCCCCAGCTGC  567
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CCCTGTACTCACAGAAGCTCCCCAAAGGGCCATCCCAGGCCCTGTTCCCTGTGGGTCCCGTGACCCCCAGCTGC  666

Query  568  AGGTGGAGGTTCAGATGCTATTACTATTACAGGAAAAACCCTCAGGTGTGGTCGAACCCCAGTGACCTCCTGGA  641
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AGGTGGAGGTTCAGATGCTATTACTATTACAGGAAAAACCCTCAGGTGTGGTCGAACCCCAGTGACCTCCTGGA  740

Query  642  GATTCTGGTCCCAGGCGTGTCTAGGAAGCCCTCCCTCCTGATCCCGCAGGGCTCTGTCGTGGCCCGCGGAGGCA  715
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GATTCTGGTCCCAGGCGTGTCTAGGAAGCCCTCCCTCCTGATCCCGCAGGGCTCTGTCGTGGCCCGCGGAGGCA  814

Query  716  GCCTGACCCTGCAGTGTCGCTCTGATGTCGGCTATGACATATTCGTTCTGTACAAGGAGGGGGAACATGACCTC  789
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GCCTGACCCTGCAGTGTCGCTCTGATGTCGGCTATGACATATTCGTTCTGTACAAGGAGGGGGAACATGACCTC  888

Query  790  GTCCAGGGCTCTGGCCAGCAGCCCCAGGCTGGGCTCTCCCAGGCCAACTTCACCCTGGGCCCTGTGAGCCGCTC  863
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GTCCAGGGCTCTGGCCAGCAGCCCCAGGCTGGGCTCTCCCAGGCCAACTTCACCCTGGGCCCTGTGAGCCGCTC  962

Query  864  CCACGGGGGCCAGTACAGATGCTACGGTGCACACAACCTCTCCCCTAGGTGGTCGGCCCCCAGCGACCCCCTGG  937
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CCACGGGGGCCAGTACAGATGCTACGGTGCACACAACCTCTCCCCTAGGTGGTCGGCCCCCAGCGACCCCCTGG  1036

Query  938  CCATCCTGATCGCAGGACTGATCCCTGACATACCCGCCCTCTCGGTGCAGCCGGGCCCCAAGGTGGCCTCAGGA  1011
            .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  ACATCCTGATCGCAGGACTGATCCCTGACATACCCGCCCTCTCGGTGCAGCCGGGCCCCAAGGTGGCCTCAGGA  1110

Query 1012  GAGAACGTGACCCTGCTGTGTCAGTCATGGCATCAGATAGACACTTTCTTTTTGACCAAGGAGGGGGCAGCCCA  1085
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GAGAACGTGACCCTGCTGTGTCAGTCATGGCATCAGATAGACACTTTCTTTTTGACCAAGGAGGGGGCAGCCCA  1184

Query 1086  TCCCCCGCTGTGTCTAAAGTCAAAGTACCAGTCTTATAGACACCAGGCTGAATTCTCCATGAGTCCTGTGACCT  1159
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TCCCCCGCTGTGTCTAAAGTCAAAGTACCAGTCTTATAGACACCAGGCTGAATTCTCCATGAGTCCTGTGACCT  1258

Query 1160  CAGCCCAGGGTGGAACCTACCGATGCTACAGCGCAATCAGGTCCTACCCCTACCTGCTGTCCAGCCCTAGTTAC  1233
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CAGCCCAGGGTGGAACCTACCGATGCTACAGCGCAATCAGGTCCTACCCCTACCTGCTGTCCAGCCCTAGTTAC  1332

Query 1234  CCCCAGGAGCTCGTGGTCTCAGGACCCTCTGGGGATCCCAGCCTCTCACCTACAGGCTCCACCCCCACACCT--  1305
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  
Sbjct 1333  CCCCAGGAGCTCGTGGTCTCAGGACCCTCTGGGGATCCCAGCCTCTCACCTACAGGCTCCACCCCCACACCTGC  1406

Query 1306  -GGCCCTGAGGACCAGCCCCTCACCCCCACGGGGTTGGATCCCCAGAGTGGT-------CTGGGAA--GGC---  1366
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|       |||..||  |||   
Sbjct 1407  AGGCCCTGAGGACCAGCCCCTCACCCCCACGGGGTTGGATCCCCAGAGTGTTTCAGCAGCTGTAAACTGGCTCA  1480

Query 1367  ------------------ACCTG------GGGGT-----------TGTGACTGGGGTCT-------------CA  1392
                              |.|||      ||.||           ||.|||..||..||             ||
Sbjct 1481  GTCCCATCCAGCTCACAGAACTGCTGCGAGGCGTAAGCAAAATCATGGGACCTGGCCCTGTACACAGCTCGGCA  1554

Query 1393  GTGG--CCTTCGTCCTGCTGCTGTTCCTCCTCCTCTTCCTC--------------CTCCT---CCGACA---TC  1444
            |.||  ||.||.|||||||.|    ||||..|| ||||| |              |.|||   |.||||   ||
Sbjct 1555  GGGGCACCGTCCTCCTGCTAC----CCTCAGCC-CTTCC-CAGATACACACAGAGCCCCTATCCAGACAGGTTC  1622

Query 1445  GGCATCAGAGCA----AACACAGGACATCGGCCCATT--TCTACCGTCCTGCAGGGGCTGCGGGGCCAGAGCCC  1512
            .||||..|||.|    |||        |.|||..|.|  ...||.|.||||...|.|||| ||.|..||||  |
Sbjct 1623  TGCATGGGAGTATGGGAAC--------TTGGCAGAGTGGGAAACGGACCTGGCTGAGCTG-GGAGTGAGAG--C  1685

Query 1513  AAGGACCAGGG-----CCTGCAGAAGAGGGCCA-------GCCCAG---TTGCTGACATCCAGGAGGAA-----  1566
            ||.|  |||||     ||||||.||    .|||       .|||||   .|||||   |.|.|| ||||     
Sbjct 1686  AATG--CAGGGTCCGTCCTGCACAA----CCCACTCCCTCTCCCAGGCCCTGCTG---TGCTGG-GGAAGGGAG  1749

Query 1567  -ATTCTCAATGCTGCCGTGAAGGACACACAGCC-------------CAAGGACGGG--------GT------GG  1612
             ||.||.|          ||||||||| |||||             |.|||||.||        ||      ||
Sbjct 1750  GATCCTAA----------GAAGGACAC-CAGCCCCAGATGGAGACACTAGGACAGGCCCCTCCTGTCAAATAGG  1812

Query 1613  AGA------TGGA--TGCTCGGGCTGCTG-----CATCTG-----------AAGCCC-----------CCCAGG  1651
            |.|      ||.|  ||.|.||||.||.|     ||.|||           |||.||           ||||  
Sbjct 1813  AAACAGGTGTGCACCTGGTGGGGCAGCAGGAGGACAGCTGGGGAAAACACAAAGTCCCTGGTTCCCTTCCCA--  1884

Query 1652  ATGTGACCTACGC-----CCAGCTACACAGCT--TGACCCTCAGACGGG--AGGCAA---------CTGAGCCT  1707
                |||||  ||     ||||       |||  .||.|||     |||  ||||.|         ||||||||
Sbjct 1885  ----GACCT--GCTTCTTCCAG-------GCTGAGGAGCCT-----GGGGCAGGCGATTCCCCTCTCTGAGCCT  1940

Query 1708  C------CTCC----------------------ATCCC------------------------------------  1717
            |      ||||                      |||||                                    
Sbjct 1941  CAGTTTGCTCCTCTGTGAATTGGGGGGTTGGCAATCCCATGTTGCACAACTGCTGTGAGGGTTGGAGCTCATGA  2014

Query 1718  AGGAAAGGGAACCTCCAG-------CTGAACCCAG----------CATCTACGCCCCCCTGGCCATCCAC----  1770
            |||||||   ||||  ||       |||.||.|||          ||||.|.|.|      |.|||||.|    
Sbjct 2015  AGGAAAG---ACCT--AGCTCGCGCCTGCACACAGAAGGTGCTCACATCAATGAC------GTCATCCCCATTC  2077

Query 1771  --------------------------------------------------------------------------  1770
                                                                                      
Sbjct 2078  CCAACGTCATCACGCTCAAGGTCTGGGAAGGCACCTGGGGGTTGTGACTGGGGTCTCAGTGGCCTTCGTCCTGC  2151

Query 1771  --------------------------------------------------------------------------  1770
                                                                                      
Sbjct 2152  TGCTGTTCCTCCTCCTCTTCCTCCTCCTCCGACATCGGCATCAGAGCAAACACAGGACATCGGCCCATTTCTAC  2225

Query 1771  ------------------------------  1770
                                          
Sbjct 2226  CGTCCTGCAGGGGCTGCGGGGCCAGAGCCC  2255