Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_14988
- Subject:
- NM_001042600.3
- Aligned Length:
- 2473
- Identities:
- 2454
- Gaps:
- 10
Alignment
Query 1 ATGGACGTCGTGGACCCTGACATTTTCAATAGAGACCCCCGGGACCACTATGACCTGCTACAGCGGCTGGGTGG 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGACGTCGTGGACCCTGACATTTTCAATAGAGACCCCCGGGACCACTATGACCTGCTACAGCGGCTGGGTGG 74
Query 75 CGGCACGTATGGGGAAGTCTTTAAGGCTCGAGACAAGGTGTCAGGGGACCTGGTGGCACTGAAGATGGTGAAGA 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CGGCACGTATGGGGAAGTCTTTAAGGCTCGAGACAAGGTGTCAGGGGACCTGGTGGCACTGAAGATGGTGAAGA 148
Query 149 TGGAGCCTGATGATGATGTCTCCACCCTTCAGAAGGAAATCCTCATATTGAAAACTTGCCGGCACGCCAACATC 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TGGAGCCTGATGATGATGTCTCCACCCTTCAGAAGGAAATCCTCATATTGAAAACTTGCCGGCACGCCAACATC 222
Query 223 GTGGCCTACCATGGGAGTTATCTCTGGTTGCAGAAACTCTGGATCTGCATGGAATTCTGTGGGGCTGGTTCTCT 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GTGGCCTACCATGGGAGTTATCTCTGGTTGCAGAAACTCTGGATCTGCATGGAATTCTGTGGGGCTGGTTCTCT 296
Query 297 CCAGGACATCTACCAAGTGACAGGCTCCCTGTCAGAGCTCCAGATTAGCTATGTCTGCCGGGAAGTGCTCCAGG 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CCAGGACATCTACCAAGTGACAGGCTCCCTGTCAGAGCTCCAGATTAGCTATGTCTGCCGGGAAGTGCTCCAGG 370
Query 371 GACTGGCCTATTTGCACTCACAGAAGAAGATACACAGGGACATCAAGGGAGCTAACATCCTCATCAATGATGCT 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 GACTGGCCTATTTGCACTCACAGAAGAAGATACACAGGGACATCAAGGGAGCTAACATCCTCATCAATGATGCT 444
Query 445 GGGGAGGTCAGATTGGCTGACTTTGGCATCTCGGCCCAGATTGGGGCTACACTGGCCAGACGCCTCTCTTTCAT 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GGGGAGGTCAGATTGGCTGACTTTGGCATCTCGGCCCAGATTGGGGCTACACTGGCCAGACGCCTCTCTTTCAT 518
Query 519 TGGGACACCCTACTGGATGGCTCCGGAAGTGGCAGCTGTGGCCCTGAAGGGAGGATACAATGAGCTGTGTGACA 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 TGGGACACCCTACTGGATGGCTCCGGAAGTGGCAGCTGTGGCCCTGAAGGGAGGATACAATGAGCTGTGTGACA 592
Query 593 TCTGGTCCCTGGGCATCACGGCCATCGAACTGGCCGAGCTACAGCCACCGCTCTTTGATGTGCACCCTCTCAGA 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TCTGGTCCCTGGGCATCACGGCCATCGAACTGGCCGAGCTACAGCCACCGCTCTTTGATGTGCACCCTCTCAGA 666
Query 667 GTTCTCTTCCTCATGACCAAGAGTGGCTACCAGCCTCCCCGACTGAAGGAAAAAGGCAAATGGTCGGCTGCCTT 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GTTCTCTTCCTCATGACCAAGAGTGGCTACCAGCCTCCCCGACTGAAGGAAAAAGGCAAATGGTCGGCTGCCTT 740
Query 741 CCACAACTTCATCAAAGTCACTTCTGACTAAGAGTCCCAAGAAACGACCCAGCGCCACCAAGATGCTCAGTCAT 814
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 CCACAACTTCATCAAAGTCAC-TCTGACTAAGAGTCCCAAGAAACGACCCAGCGCCACCAAGATGCTCAGTCAT 813
Query 815 CAACTGGTATCCCAGCCTGGGCTGAATCGAGGCCTGATCCTGGATCTTCTTGACAAACTGAAGAATCCCGGGAA 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 814 CAACTGGTATCCCAGCCTGGGCTGAATCGAGGCCTGATCCTGGATCTTCTTGACAAACTGAAGAATCCCGGGAA 887
Query 889 AGGACCCTCCATTGGGGACATTGAGGATGAGGAGCCCGAGCTACCCCCTGCTATCCCTCGGCGGATCAGATCCA 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 888 AGGACCCTCCATTGGGGACATTGAGGATGAGGAGCCCGAGCTACCCCCTGCTATCCCTCGGCGGATCAGATCCA 961
Query 963 CCCACCGCTCCAGCTCTCTGGGGATCCCAGATGCAGACTGCTGTCGGCGGCACATGGAGTTCAGGAAGCTCCGA 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 962 CCCACCGCTCCAGCTCTCTGGGGATCCCAGATGCAGACTGCTGTCGGCGGCACATGGAGTTCAGGAAGCTCCGA 1035
Query 1037 GGAATGGAGACCAGACCCCCAGCCAACACCGCTCGCCTACAGCCTCCTCGAGACCTCAGGAGCAGCAGCCCCAG 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1036 GGAATGGAGACCAGACCCCCAGCCAACACCGCTCGCCTACAGCCTCCTCGAGACCTCAGGAGCAGCAGCCCCAG 1109
Query 1111 GAAGCAACTGTCAGAGTCGTCTGACGATGACTATGACGACGTGGACATCCCCACCCCTGCAGAGGACACACCTC 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1110 GAAGCAACTGTCAGAGTCGTCTGACGATGACTATGACGACGTGGACATCCCCACCCCTGCAGAGGACACACCTC 1183
Query 1185 CTCCACTTCCCCCCAAGCCCAAGTTCCGTTCTCCATCAGACGAGGGTCCTGGGAGCATGGGGGATGATGGGCAG 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1184 CTCCACTTCCCCCCAAGCCCAAGTTCCGTTCTCCATCAGACGAGGGTCCTGGGAGCATGGGGGATGATGGGCAG 1257
Query 1259 CTGAGCCCGGGGGTGCTGGTCCGGTGTGCCAGTGGGCCCCCACCAAACAGCCCCCGTCCTGGGCCTCCCCCATC 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1258 CTGAGCCCGGGGGTGCTGGTCCGGTGTGCCAGTGGGCCCCCACCAAACAGCCCCCGTCCTGGGCCTCCCCCATC 1331
Query 1333 CACCAGCAGCCCCCACCTCACCGCCCATTCAGAACCCTCACTCTGGAACCCACCCTCCCGGGAGCTTGACAAGC 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1332 CACCAGCAGCCCCCACCTCACCGCCCATTCAGAACCCTCACTCTGGAACCCACCCTCCCGGGAGCTTGACAAGC 1405
Query 1407 CCCCACTTCTGCCCCCCAAGAAGGAAAAGATGAAGAGAAAGGGATGTGCCCTTCTCGTAAAGTTGTTCAATGGC 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1406 CCCCACTTCTGCCCCCCAAGAAGGAAAAGATGAAGAGAAAGGGATGTGCCCTTCTCGTAAAGTTGTTCAATGGC 1479
Query 1481 TGCCCCCTCCGGATCCACAGCACGGCCGCCTGGACACATCCCTCCACCAAGGACCAGCACCTGCTCCTGGGGGC 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1480 TGCCCCCTCCGGATCCACAGCACGGCCGCCTGGACACATCCCTCCACCAAGGACCAGCACCTGCTCCTGGGGGC 1553
Query 1555 AGAGGAAGGCATCTTCATCCTGAACCGGAATGACCAGGAGGCCACGCTGGAAATGCTCTTTCCTAGCCGGACTA 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1554 AGAGGAAGGCATCTTCATCCTGAACCGGAATGACCAGGAGGCCACGCTGGAAATGCTCTTTCCTAGCCGGACTA 1627
Query 1629 CGTGGGTGTACTCCATCAACAACGTTCTCATGTCTCTCTCAGGAAAGACCCCCCCCTTTTATTCTCATAGCATC 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.|.||||||||||||||
Sbjct 1628 CGTGGGTGTACTCCATCAACAACGTTCTCATGTCTCTCTCAGGAAAGACCCCCCACCTGTATTCTCATAGCAT- 1700
Query 1703 CCTTGCCCTGCTGGAACGGGAAAGAGACCAGAAGCAGGAAACCCCCATCGGTTCACATTAGCCCCCCACCGCCT 1776
|||||.||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |.||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1701 CCTTGGCCTGCTGGAAC-GGAAAGAGACCAG-AGCAGGAAA-CCCCATC-GCTCACATTAG-CCCCCACCGCCT 1769
Query 1777 ACTGCNAANGGAGAAACATGGTTTCCACCAANGATCCAGGACACCAAAGGGCTGCCGGGCGTGCTGTGTGGCGG 1850
||||..||.|.|| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1770 ACTGGCAAGGAAG-AACATGGTTTCCACCAA-GATCCAGGACACCAAA-GGCTGCCGGGCGTGCTGTGTGGCGG 1840
Query 1851 AGGGTGCGAGCTCTGGGGGCCCGTTCCTGTGCGGTGCATTGGAGACGTCCGTTGTCCTGCTTCAGTGGTACCAG 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1841 AGGGTGCGAGCTCTGGGGGCCCGTTCCTGTGCGGTGCATTGGAGACGTCCGTTGTCCTGCTTCAGTGGTACCAG 1914
Query 1925 CCCATGAACAAATTCCTGCTTGTCCGGCAGGTGCTGTTCCCACTGCCGACGCCTCTGTCCGTGTTCGCGCTGCT 1998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1915 CCCATGAACAAATTCCTGCTTGTCCGGCAGGTGCTGTTCCCACTGCCGACGCCTCTGTCCGTGTTCGCGCTGCT 1988
Query 1999 GACCGGGCCAGGCTCTGAGCTGCCCGCTGTGTGCATCGGCGTGAGCCCCGGGCGGCCGGGGAAGTCGGTGCTCT 2072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1989 GACCGGGCCAGGCTCTGAGCTGCCCGCTGTGTGCATCGGCGTGAGCCCCGGGCGGCCGGGGAAGTCGGTGCTCT 2062
Query 2073 TCCACACGGTGCGCTTTGGCGCGCTCTCTTGCTGGCTGGGCGAGATGAGCACCGAGCACAGGGGACCCGTGCAG 2146
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2063 TCCACACGGTGCGCTTTGGCGCGCTCTCTTGCTGGCTGGGCGAGATGAGCACCGAGCACAGGGGACCCGTGCAG 2136
Query 2147 GTGACCCAGGTAGAGGAAGATATGGTGATGGTGTTGATGGATGGCTCTGTGAAGCTGGTGACCCCGGAGGGGTC 2220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2137 GTGACCCAGGTAGAGGAAGATATGGTGATGGTGTTGATGGATGGCTCTGTGAAGCTGGTGACCCCGGAGGGGTC 2210
Query 2221 CCCAGTCCGGGGACTTCGCACACCTGAGATCCCCATGACCGAAGCGGTGGAGGCCGTGGCTATGGTTGGAGGTC 2294
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2211 CCCAGTCCGGGGACTTCGCACACCTGAGATCCCCATGACCGAAGCGGTGGAGGCCGTGGCTATGGTTGGAGGTC 2284
Query 2295 AGCTTCAGGCCTTCTGGAAGCATGGAGTGCAGGTGTGGGCTCTAGGCTCGGATCAGCTGCTACAGGAGCTGAGA 2368
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2285 AGCTTCAGGCCTTCTGGAAGCATGGAGTGCAGGTGTGGGCTCTAGGCTCGGATCAGCTGCTACAGGAGCTGAGA 2358
Query 2369 GACCCTACCCTCACTTTCCGTCTGCTTGGCTCCCCCAGGCCTGTAGTGGTGGAGACACGCCCAGTGGATGATCC 2442
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2359 GACCCTACCCTCACTTTCCGTCTGCTTGGCTCCCCCAGGCCTGTAGTGGTGGAGACACGCCCAGTGGATGATCC 2432
Query 2443 TACTGCTCCCAGCAACCTCTACATCCAGGAA 2473
|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2433 TACTGCTCCCAGCAACCTCTACATCCAGGAA 2463