Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_14988
- Subject:
- XM_006539998.2
- Aligned Length:
- 2504
- Identities:
- 1928
- Gaps:
- 237
Alignment
Query 1 ATGGACGTCGTGGACCCTGACATTTTCAATAGAGACCCCCGGGACCACTATGACCTGCTACAGCGGCTGGGTGG 74
||||.|.|.||||||||.||||||||.||||..|||||.||.||.||||||||.||.||.||.||.||||||||
Sbjct 1 ATGGCCCTTGTGGACCCCGACATTTTTAATAAGGACCCTCGAGAACACTATGATCTACTGCAACGACTGGGTGG 74
Query 75 CGGCACGTATGGGGAAGTCTTTAAGGCTCGAGACAAGGTGTCAGGGGACCTGGTGGCACTGAAGATGGTGAAGA 148
.||.||.|||||.|||||.||.||||||||.|||||||||||...||||||||||||..|||||||||||||||
Sbjct 75 TGGAACTTATGGAGAAGTATTCAAGGCTCGCGACAAGGTGTCTAAGGACCTGGTGGCTTTGAAGATGGTGAAGA 148
Query 149 TGGAGCCTGATGATGATGTCTCCACCCTTCAGAAGGAAATCCTCATATTGAAAACTTGCCGGCACGCCAACATC 222
||||||||||||||||.|||.||||||||||||||||.||.|||||..||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TGGAGCCTGATGATGACGTCGCCACCCTTCAGAAGGAGATTCTCATGCTGAAAACTTGCCGGCACGCCAACATC 222
Query 223 GTGGCCTACCATGGGAGTTATCTCTGGTTGCAGAAACTCTGGATCTGCATGGAATTCTGTGGGGCTGGTTCTCT 296
|||||.||||||||.|||||.||||||.|||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 223 GTGGCTTACCATGGCAGTTACCTCTGGCTGCAGAAGCTGTGGATCTGCATGGAATTCTGTGGAGCTGGTTCTCT 296
Query 297 CCAGGACATCTACCAAGTGACAGGCTCCCTGTCAGAGCTCCAGATTAGCTATGTCTGCCGGGAAGTGCTCCAGG 370
|||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||
Sbjct 297 CCAGGACATCTACCAAGTGACTGGCTCTCTGTCCGAGCTCCAGATCAGCTATGTGTGCCGGGAAGTGCTTCAGG 370
Query 371 GACTGGCCTATTTGCACTCACAGAAGAAGATACACAGGGACATCAAGGGAGCTAACATCCTCATCAATGA-TGC 443
||||||||||..||||.|||.|||||||||||||..|.||||||||||||||.||||||||||||||.|| |||
Sbjct 371 GACTGGCCTACCTGCATTCAGAGAAGAAGATACATCGAGACATCAAGGGAGCCAACATCCTCATCAACGACTGC 444
Query 444 TGGGGAGGTCAGATTGGCTGACTTTGGCATCTCGGCCCAGATTGGGGCTACACTGGCCAGACGCCTCTCTTTCA 517
||||||||.|...|||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||.|.|||||.|||||||
Sbjct 445 -GGGGAGGTTAAGCTGGCTGACTTTGGGATCTCAGCCCAGATTGGGGCGACACTGGCCCGGCGCCTTTCTTTCA 517
Query 518 TTGGGACACCCTACTGGATGGCTCCGGAAGTGGCAGCTGTGGCCCTGAAGGGAGGATACAATGAGCTGTGTGAC 591
||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||
Sbjct 518 TTGGGACACCGTACTGGATGGCTCCAGAGGTGGCAGCGGTGGCCCTGAAGGGTGGATACAATGAGCTGTGCGAC 591
Query 592 ATCTGGTCCCTGGGCATCACGGCCATCGAACTGGCCGAGCTACAGCCACCGCTCTTTGATGTGCACCCTCTCAG 665
||||||||.||.||||||||.||||||||.|||||.|||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 592 ATCTGGTCTCTTGGCATCACAGCCATCGAGCTGGCTGAGCTTCAGCCCCCTCTCTTTGATGTGCACCCTCTCAG 665
Query 666 AGTTCTCTTCCTCATGACCAAGAGTGGCTACCAGCCTCCCCGACTGAAGGAAAAAGGCAAATGGTCGGCTGCCT 739
.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||.|||||||||||..|||.||||||..||.|||
Sbjct 666 GGTTCTCTTCCTCATGACCAAGAGCGGGTACCAGCCTCCTCGGCTGAAGGAAAAGAGCAGATGGTCATCTTCCT 739
Query 740 TCCACAACTTCATCAAAGTCACTTCTGACTAAGAGTCCCAAGAAACGACCCAGCGCCACCAAGATGCTCAGTCA 813
||||||||||..|||||||||| .||.|||||||...||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 740 TCCACAACTTTGTCAAAGTCAC-CCTCACTAAGAACTCCAAGAAACGCCCCAGTGCCACCAAGATGCTCAGTCA 812
Query 814 TCAACTGGTATCCCAGCCTGGGCTGAATCGAGGCCTGATCCTGGATCTTCTTGACAAACTGAAGAATCCCGGGA 887
|||.|||||.||||||||.||||||||..|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||.||||
Sbjct 813 TCAGCTGGTGTCCCAGCCAGGGCTGAACAGAGGCCTGATCTTGGATCTTCTTGACAAAATGAAGAATCCTGGGA 886
Query 888 AAGGAC--CCTCCATTGGGGACATTGAGGATGAGGAGCCCGAGCTACCCCCTGCTATCCCTCGGCGGATCAGAT 959
|.||.| || ||..||.|||||.|||||||||||.||||.|||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 887 AGGGGCTGCC-----TGTTGATATTGAAGATGAGGAGCCTGAGCCACCCCCTGCCATCCCTCGGCGGATCAGAT 955
Query 960 CCACCCACCGCTCCAGCTCTCTGGGGATCCCAGATGCAGACTGCTGTCGGCGGCACATGGAGTTCAGGAAGCTC 1033
|.|||.||||..|||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||.||||.|||||||||..||.||.|
Sbjct 956 CTACCTACCGGGCCAGCTCACTAGGGATCCCAGATGCAGACTGCTGCCGGAGGCAAATGGAGTTCCAGAGGCCC 1029
Query 1034 CGAGGAATGGAGACCAGACCCCCAGCCAACACCGCTCGCCTACAGCCTCCTCGAGACCTCAGGAGCAGCAGCCC 1107
.||.|..||||...||||||.|..||..|.||.|.||||.||.|.||.|||..|.||.||.||||||.|||.||
Sbjct 1030 AGATGCGTGGACTGCAGACCTCAGGCTGAAACTGTTCGCTTATATCCCCCTGCACACTTCGGGAGCACCAGTCC 1103
Query 1108 CAGGAAGCAACTGTCAGAGTCGTCTGACGATGACTATGACGACGTGGACATCCCCACCCCTGCAGAGGACACAC 1181
|||||..||.|||||||| .|||||.||.||||||||.||.|||||||||||..|||||.|||||.|||.||
Sbjct 1104 CAGGAGTCAGCTGTCAGA---TTCTGATGACGACTATGATGATGTGGACATCCCTGCCCCTTCAGAGAACATAC 1174
Query 1182 CTCCTCCACTTCCCCCCAAGCCCAAGTTCCGTTCTCCATCAGACGAGGGTCCTGGGAGCATGGGGGATGATGGG 1255
||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||.||.|||.||||..|.||..||||.||||||
Sbjct 1175 CTCCTCCACTGCCCCCCAAGCCCAAGTTTCGGTCTCCATCAGATGATGGTTCTGGAGGAATTAGGGACGATGGG 1248
Query 1256 CAGCTGAGCCCGGGGGTGCTGGTCCGGTGTGCCAGTGGGCCCCCACCAAACAGCCCCCGTCCTGGGCCTCCCCC 1329
||..|||||||.|||||.|||||.||.|||||.|||||||||||.|||...|..|||||.|||||.||||||||
Sbjct 1249 CAATTGAGCCCAGGGGTTCTGGTTCGATGTGCAAGTGGGCCCCCTCCACGTACTCCCCGACCTGGACCTCCCCC 1322
Query 1330 ATCCACCAGCAGCCCCCACCTCACCGCCCATTCAGAACCCTCACTCTGGAACCCACC--CTCCCGGGAGCTTGA 1401
|.|.|||.|||||||.||||||||.||.|..|||||.||||||.|.|||||||||.| |||| |||||..|.
Sbjct 1323 AGCGACCTGCAGCCCTCACCTCACAGCTCGCTCAGATCCCTCATTGTGGAACCCAGCTGCTCC--GGAGCCAGG 1394
Query 1402 CAAGCCCCCACTTCTGCCCCCCAAGAAGGAAAAGATGAAGAGAAAG--GG----------------------AT 1451
|.||||||||||..|.|||||.|.||||||||||||||.|.||||| || ||
Sbjct 1395 CCAGCCCCCACTCGTACCCCCAAGGAAGGAAAAGATGAGGGGAAAGATGGAGAACGAGAAGCGCAGAGAGAAAT 1468
Query 1452 GTGCCCTTCTCGTAAAGTTGTTCAATGGCTGCCCCCTCCGGATCCACAGCACGGCCGCCTGGACACATCCCTCC 1525
.|.|||||||.||.||.||.|||||||||||.|||||.|.||||||||||||.||.|||||||||||||||||.
Sbjct 1469 ATCCCCTTCTTGTGAAATTATTCAATGGCTGTCCCCTTCAGATCCACAGCACAGCTGCCTGGACACATCCCTCT 1542
Query 1526 ACCAAGGACCAGCACCTGCTCCTGGGGGCAGAGGAAGGCATCTTCATCCTGAACCGGAATGACCAGGAGGCCAC 1599
||.||.||.|||.||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1543 ACAAAAGATCAGAACCTGCTCCTGGGGGCAGAGGAAGGCATTTTCATACTGAACCGGAATGATCAGGAGGCCAC 1616
Query 1600 GCTGGAAATGCTCTTTCCTAGCCGGACTACGTGGGTGTACTCCATCAACAACGTTCTCATGTCTCTCTCAGGAA 1673
||||||||||.||||.|||.||||.||.||.|||.|.||.|.||||||||||.|.|||||||||||||||||.|
Sbjct 1617 GCTGGAAATGATCTTCCCTGGCCGCACAACCTGGCTCTATTGCATCAACAACCTCCTCATGTCTCTCTCAGGGA 1690
Query 1674 AGACCCCCCCCTTTTATTCTCATAGCATCCCTTGCCCTGCTGGAACGGGAAAGAGACCAGAAGCAGGAAACCCC 1747
||||.|||..|.|.|||||||||||||| |||.|.||||||.||| .|||||||...||||| .||.||.|||
Sbjct 1691 AGACACCCTACCTGTATTCTCATAGCAT-CCTGGGCCTGCTTGAA-AGGAAAGACGGCAGAA--CGGGAAGCCC 1760
Query 1748 CATCGGTTCACATTAGCCCCCCACCGCCTACTGCNAANGGAGA-AACATGGTTTCCACCAANGATCCAGGACAC 1820
||| .|.||||||||| |||.|||||..|||||..|| ||.| ||||||||.||||..|| ||||||||||||
Sbjct 1761 CAT-TGCTCACATTAG-CCCTCACCGGTTACTGGCAA--GAAAGAACATGGTCTCCAGTAA-GATCCAGGACAC 1829
Query 1821 CAAAGGGCTGCCGGGCGTGCTGTGTGGCGGAGGGTGCGAGCTCTGGGGGCCCGTTCCTGTGCGGTGCATTGGAG 1894
|||| |||||||||||.|||||||||||.|||.||||.||||||||||||||.|||.|.||.||.|||||||||
Sbjct 1830 CAAA-GGCTGCCGGGCTTGCTGTGTGGCTGAGAGTGCTAGCTCTGGGGGCCCATTCTTATGTGGGGCATTGGAG 1902
Query 1895 ACGTCCGTTGTCCTGCTTCAGTGGTACCAGCCCATGAACAAATTCCTGCTTGTCCGGCAGGTGCTGTTCCCACT 1968
|||||.||.||..||||.|||||||||||.||.||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1903 ACGTCTGTGGTTTTGCTCCAGTGGTACCAACCAATGAACAAATTCTTGCTTGTCCGGCAGGTGCTGTTCCCGCT 1976
Query 1969 GCCGACGCCTCTGTCCGTGTTCGCGCTGCTGACCGGGCCAGGCTCTGAGCTGCCCGCTGTGTGCATCGGCGTGA 2042
|||.|||||.|||.|.||||||.||||||||||...|||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1977 GCCCACGCCGCTGCCGGTGTTCACGCTGCTGACAACGCCGGGCTCCGAGCTGCCAGCTGTGTGCATCGGCGTGA 2050
Query 2043 GCCCCGGGCGGCCGGGGAAGTCGGTGCTCTTCCACACGGTGCGCTTTGGCGCGCTCTCTTGCTGGCTGGGCGAG 2116
||||.||||.|.|||..||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||.||.||||||||||.|||.
Sbjct 2051 GCCCGGGGCAGGCGGCAAAGTCGGTGCTCTTCCACACCGTGCGCTTCGGTGCGCTGTCCTGCTGGCTGGACGAC 2124
Query 2117 ATGAGCACCGAGCACAGGGGACCCGTGCAGGTGACCCAGGTAGAGGAAGATATGGTGATGGTGTTGATGGATGG 2190
...|||||.|||||||.||||||.||||||||||.|||.|||.|||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 2125 TCCAGCACGGAGCACAAGGGACCAGTGCAGGTGATCCAAGTAAAGGAAGACATGGTGATGGTGTTGATGGAT-- 2196
Query 2191 CTCTGTGAAGCTGGTGACCCCGGAGGGGTCCCCAGTCCGGGGACTTCGCACACCTGAGATCCCCATGACCGAAG 2264
Sbjct 2197 -------------------------------------------------------------------------- 2196
Query 2265 CGGTGGAGGCCGTGGCTATGGTTGGAGGTCAGCTTCAGGCCTTCTGGAAGCATGGAGTGCAGGTGTGGGCTCTA 2338
||||||||||.||.||..||..||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.|
Sbjct 2197 --------------GCTATGGTTGAAGATCGACTCGAGGCCTTCTGGAAGCATGGAGTTCAGGTGTGGGCTCCA 2256
Query 2339 GGCTCGGATCAGCTGCTACAGGAGCTGAGAGACCCTACCCTCACTTTCCGTCTGCTTGGCTCCCCCAGGCCTGT 2412
|||| |||.| ||||||.||
Sbjct 2257 GGCT---------------------TGAAA-----------------------------------CAGGCCGGT 2274
Query 2413 AGTGGTGGAGAC-ACGCCCAGTGGATGATCCTACTGCTCCCAGCAACCTCTACATCCAGGAA 2473
|||||||||||| |.||||| .|||
Sbjct 2275 AGTGGTGGAGACAAGGCCCA-CGGA------------------------------------- 2298