Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_14988
• Subject: XM_017026231.1
• Aligned Length: 2647
• Identities: 2376
• Gaps: 241

Alignment

Query    1  -----ATGGACGTCGTGGACCCTGACATTTTCAATAGAGACCCCCGGGACCACTATGACCTGCTACAGCGGCTG  69
                 .||||     .||||.|||.||     |||.|||                   |||||        |||
Sbjct    1  ATGCTGTGGA-----GGGACTCTGGCA-----AATGGAG-------------------CCTGC--------CTG  37

Query   70  GGTGGCGGCACGTATGGGGAAGT----CTTT--AAGGCTCGAGACAAGGTGTCAGGGGACCTGGTGGCACTGAA  137
            ..||.|             ||.|    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   38  ACTGCC-------------AACTTCCCCTTTGCAAGGCTCGAGACAAGGTGTCAGGGGACCTGGTGGCACTGAA  98

Query  138  GATGGTGAAGATGGAGCCTGATGATGATGTCTCCACCCTTCAGAAGGAAATCCTCATATTGAAAACTTGCCGGC  211
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   99  GATGGTGAAGATGGAGCCTGATGATGATGTCTCCACCCTTCAGAAGGAAATCCTCATATTGAAAACTTGCCGGC  172

Query  212  ACGCCAACATCGTGGCCTACCATGGGAGTTATCTCTGGTTGCAGAAACTCTGGATCTGCATGGAATTCTGTGGG  285
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  173  ACGCCAACATCGTGGCCTACCATGGGAGTTATCTCTGGTTGCAGAAACTCTGGATCTGCATGGAATTCTGTGGG  246

Query  286  GCTGGTTCTCTCCAGGACATCTACCAAGTGACAGGCTCCCTGTCAGAGCTCCAGATTAGCTATGTCTGCCGGGA  359
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  247  GCTGGTTCTCTCCAGGACATCTACCAAGTGACAGGCTCCCTGTCAGAGCTCCAGATTAGCTATGTCTGCCGGGA  320

Query  360  AGTGCTCCAGGGACTGGCCTATTTGCACTCACAGAAGAAGATACACAGGGACATCAAGGGAGCTAACATCCTCA  433
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  321  AGTGCTCCAGGGACTGGCCTATTTGCACTCACAGAAGAAGATACACAGGGACATCAAGGGAGCTAACATCCTCA  394

Query  434  TCAATGATGCTGGGGAGGTCAGATTGGCTGACTTTGGCATCTCGGCCCAGATTGGGGCTACACTGGCCAGACGC  507
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  395  TCAATGATGCTGGGGAGGTCAGATTGGCTGACTTTGGCATCTCGGCCCAGATTGGGGCTACACTGGCCAGACGC  468

Query  508  CTCTCTTTCATTGGGACACCCTACTGGATGGCTCCGGAAGTGGCAGCTGTGGCCCTGAAGGGAGGATACAATGA  581
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  469  CTCTCTTTCATTGGGACACCCTACTGGATGGCTCCGGAAGTGGCAGCTGTGGCCCTGAAGGGAGGATACAATGA  542

Query  582  GCTGTGTGACATCTGGTCCCTGGGCATCACGGCCATCGAACTGGCCGAGCTACAGCCACCGCTCTTTGATGTGC  655
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  543  GCTGTGTGACATCTGGTCCCTGGGCATCACGGCCATCGAACTGGCCGAGCTACAGCCACCGCTCTTTGATGTGC  616

Query  656  ACCCTCTCAGAGTTCTCTTCCTCATGACCAAGAGTGGCTACCAGCCTCCCCGACTGAAGGAAAAAGGCAAATGG  729
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  617  ACCCTCTCAGAGTTCTCTTCCTCATGACCAAGAGTGGCTACCAGCCTCCCCGACTGAAGGAAAAAGGCAAATGG  690

Query  730  TCGGCTGCCTTCCACAACTTCATCAAAGTCACTTCTGACTAAGAGTCCCAAGAAACGACCCAGCGCCACCAAGA  803
            |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  691  TCGGCTGCCTTCCACAACTTCATCAAAGTCAC-TCTGACTAAGAGTCCCAAGAAACGACCCAGCGCCACCAAGA  763

Query  804  TGCTCAGTCATCAACTGGTATCCCAGCCTGGGCTGAATCGAGGCCTGATCCTGGATCTTCTTGACAAACTGAAG  877
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  764  TGCTCAGTCATCAACTGGTATCCCAGCCTGGGCTGAATCGAGGCCTGATCCTGGATCTTCTTGACAAACTGAAG  837

Query  878  AATCCCGGGAAAGGACCCTCCATTGGGGACATTGAGGATGAGGAGCCCGAGCTACCCCCTGCTATCCCTCGGCG  951
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  838  AATCCCGGGAAAGGACCCTCCATTGGGGACATTGAGGATGAGGAGCCCGAGCTACCCCCTGCTATCCCTCGGCG  911

Query  952  GATCAGATCCACCCACCGCTCCAGCTCTCTGGGGATCCCAGATGCAGACTGCTGTCGGCGGCACATGGAGTTCA  1025
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  912  GATCAGATCCACCCACCGCTCCAGCTCTCTGGGGATCCCAGATGCAGACTGCTGTCGGCGGCACATGGAGTTCA  985

Query 1026  GGAAGCTCCGAGGAATGGAGACCAGACCCCCAGCCAACACCGCTCGCCTACAGCCTCCTCGAGACCTCAGGAGC  1099
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  986  GGAAGCTCCGAGGAATGGAGACCAGACCCCCAGCCAACACCGCTCGCCTACAGCCTCCTCGAGACCTCAGGAGC  1059

Query 1100  AGCAGCCCCAGGAAGCAACTGTCAGAGTCGTCTGACGATGACTATGACGACGTGGACAT---------------  1158
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||               
Sbjct 1060  AGCAGCCCCAGGAAGCAACTGTCAGAGTCGTCTGACGATGACTATGACGACGTGGACATGCTGAACCTTGGCAC  1133

Query 1159  --------------------------------------------------------------------------  1158
                                                                                      
Sbjct 1134  CTGGAAATCTCCCAAAGACCAGATACTGAGCCCCAGATCCAGACCCAACAGTCAGCCCAGGCCCCCATACTCCC  1207

Query 1159  -------------------------------CCCCACCCCTGCAGAGGACACACCTCCTCCACTTCCCCCCAAG  1201
                                           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1208  CAGCCCACAGGCCGAGTCAGGCTCCATCCAGCCCCACCCCTGCAGAGGACACACCTCCTCCACTTCCCCCCAAG  1281

Query 1202  CCCAAGTTCCGTTCTCCATCAGACGAGGGTCCTGGGAGCATGGGGGATGATGGGCAGCTGAGCCCGGGGGTGCT  1275
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1282  CCCAAGTTCCGTTCTCCATCAGACGAGGGTCCTGGGAGCATGGGGGATGATGGGCAGCTGAGCCCGGGGGTGCT  1355

Query 1276  GGTCCGGTGTGCCAGTGGGCCCCCACCAAACAGCCCCCGTCCTGGGCCTCCCCCATCCACCAGCAGCCCCCACC  1349
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1356  GGTCCGGTGTGCCAGTGGGCCCCCACCAAACAGCCCCCGTCCTGGGCCTCCCCCATCCACCAGCAGCCCCCACC  1429

Query 1350  TCACCGCCCATTCAGAACCCTCACTCTGGAACCCACCCTCCCGGGAGCTTGACAAGCCCCCACTTCTGCCCCCC  1423
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1430  TCACCGCCCATTCAGAACCCTCACTCTGGAACCCACCCTCCCGGGAGCTTGACAAGCCCCCACTTCTGCCCCCC  1503

Query 1424  AAGAAGGAAAAGATGAAGAGAAAGGGATGTGCCCTTCTCGTAAAGTTGTTCAATGGCTGCCCCCTCCGGATCCA  1497
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1504  AAGAAGGAAAAGATGAAGAGAAAGGGATGTGCCCTTCTCGTAAAGTTGTTCAATGGCTGCCCCCTCCGGATCCA  1577

Query 1498  CAGCACGGCCGCCTGGACACATCCCTCCACCAAGGACCAGCACCTGCTCCTGGGGGCAGAGGAAGGCATCTTCA  1571
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1578  CAGCACGGCCGCCTGGACACATCCCTCCACCAAGGACCAGCACCTGCTCCTGGGGGCAGAGGAAGGCATCTTCA  1651

Query 1572  TCCTGAACCGGAATGACCAGGAGGCCACGCTGGAAATGCTCTTTCCTAGCCGGACTACGTGGGTGTACTCCATC  1645
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1652  TCCTGAACCGGAATGACCAGGAGGCCACGCTGGAAATGCTCTTTCCTAGCCGGACTACGTGGGTGTACTCCATC  1725

Query 1646  AACAACGTTCTCATGTCTCTCTCAGGAAAGACCCCCCCCTTTTATTCTCATAGCATCCCTTGCCCTGCTGGAAC  1719
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.|.|||||||||||||| |||||.|||||||||||
Sbjct 1726  AACAACGTTCTCATGTCTCTCTCAGGAAAGACCCCCCACCTGTATTCTCATAGCAT-CCTTGGCCTGCTGGAAC  1798

Query 1720  GGGAAAGAGACCAGAAGCAGGAAACCCCCATCGGTTCACATTAGCCCCCCACCGCCTACTGCNAANGGAGAAAC  1793
             ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |.||||||||| ||||||||||||||||..||.|.|| |||
Sbjct 1799  -GGAAAGAGACCAG-AGCAGGAAA-CCCCATC-GCTCACATTAG-CCCCCACCGCCTACTGGCAAGGAAG-AAC  1866

Query 1794  ATGGTTTCCACCAANGATCCAGGACACCAAAGGGCTGCCGGGCGTGCTGTGTGGCGGAGGGTGCGAGCTCTGGG  1867
            |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1867  ATGGTTTCCACCAA-GATCCAGGACACCAAA-GGCTGCCGGGCGTGCTGTGTGGCGGAGGGTGCGAGCTCTGGG  1938

Query 1868  GGCCCGTTCCTGTGCGGTGCATTGGAGACGTCCGTTGTCCTGCTTCAGTGGTACCAGCCCATGAACAAATTCCT  1941
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1939  GGCCCGTTCCTGTGCGGTGCATTGGAGACGTCCGTTGTCCTGCTTCAGTGGTACCAGCCCATGAACAAATTCCT  2012

Query 1942  GCTTGTCCGGCAGGTGCTGTTCCCACTGCCGACGCCTCTGTCCGTGTTCGCGCTGCTGACCGGGCCAGGCTCTG  2015
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2013  GCTTGTCCGGCAGGTGCTGTTCCCACTGCCGACGCCTCTGTCCGTGTTCGCGCTGCTGACCGGGCCAGGCTCTG  2086

Query 2016  AGCTGCCCGCTGTGTGCATCGGCGTGAGCCCCGGGCGGCCGGGGAAGTCGGTGCTCTTCCACACGGTGCGCTTT  2089
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2087  AGCTGCCCGCTGTGTGCATCGGCGTGAGCCCCGGGCGGCCGGGGAAGTCGGTGCTCTTCCACACGGTGCGCTTT  2160

Query 2090  GGCGCGCTCTCTTGCTGGCTGGGCGAGATGAGCACCGAGCACAGGGGACCCGTGCAGGTGACCCAGGTAGAGGA  2163
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2161  GGCGCGCTCTCTTGCTGGCTGGGCGAGATGAGCACCGAGCACAGGGGACCCGTGCAGGTGACCCAGGTAGAGGA  2234

Query 2164  AGATATGGTGATGGTGTTGATGGATGGCTCTGTGAAGCTGGTGACCCCGGAGGGGTCCCCAGTCCGGGGACTTC  2237
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2235  AGATATGGTGATGGTGTTGATGGATGGCTCTGTGAAGCTGGTGACCCCGGAGGGGTCCCCAGTCCGGGGACTTC  2308

Query 2238  GCACACCTGAGATCCCCATGACCGAAGCGGTGGAGGCCGTGGCTATGGTTGGAGGTCAGCTTCAGGCCTTCTGG  2311
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2309  GCACACCTGAGATCCCCATGACCGAAGCGGTGGAGGCCGTGGCTATGGTTGGAGGTCAGCTTCAGGCCTTCTGG  2382

Query 2312  AAGCATGGAGTGCAGGTGTGGGCTCTAGGCTCGGATCAGCTGCTACAGGAGCTGAGAGACCCTACCCTCACTTT  2385
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2383  AAGCATGGAGTGCAGGTGTGGGCTCTAGGCTCGGATCAGCTGCTACAGGAGCTGAGAGACCCTACCCTCACTTT  2456

Query 2386  CCGTCTGCTTGGCTCCCCCAGGCCTGTAGTG--GTGGAGACACG-------CCCAGTGGATGATCCTACTGCTC  2450
            |||||||||||||||||||||| |||.||||  ||||   ||||       |.||.||   .|.|||.||.|||
Sbjct 2457  CCGTCTGCTTGGCTCCCCCAGG-CTGGAGTGCAGTGG---CACGATCTCGCCTCACTG---CAACCTCCTCCTC  2523

Query 2451  CCAG---CAA------------CCTCTACATCCAG-GAA------------------  2473
            ||||   |||            ||||..|.|||.| |.|                  
Sbjct 2524  CCAGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCCTG  2580