Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_15013
• Subject: NM_198094.2
• Aligned Length: 2174
• Identities: 1946
• Gaps: 10

Alignment

Query    1  ATGTCTGCGGAGAGCGGCCCTGGGACGAGATTGAGAAATCTGCCAGTAATGGGGGATGGACTAGAAACTTCCCA  74
            ||||||.|||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct    1  ATGTCTACGGAGAGCGGCCCTGGGACAAGATTGAGAAATCTGCCAGTAATGGGGGATGGACTAGAAACCTCCCA  74

Query   75  AATGTCTACAACACAGGCCCAGGCCCAACCCCAGCCAGCCAACGCAGCCAGCACCAACCCCCCGCCCCCAGAGA  148
            ||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||.||.||||||||||
Sbjct   75  AATGTCTACAACGCAGGCCCAGGCCCAACCCCAGCCAGCAAATGCAGCCAGCACCAATCCTCCACCCCCAGAGA  148

Query  149  CCTCCAACCCTAACAAGCCCAAGAGGCAGACCAACCAACTGCAATACCTGCTCAGAGTGGTGCTCAAGACACTA  222
            |||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CCTCCAACCCTAACAAGCCCAAGAGACAGACAAACCAACTGCAATATCTGCTCAGAGTGGTGCTCAAGACACTA  222

Query  223  TGGAAACACCAGTTTGCATGGCCTTTCCAGCAGCCTGTGGATGCCGTCAAGCTGAACCTCCCTGATTACTATAA  296
            |||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TGGAAACACCAGTTTGCGTGGCCTTTCCAGCAGCCCGTGGATGCCGTCAAGCTGAACCTCCCTGATTACTATAA  296

Query  297  GATCATTAAAACGCCTATGGATATGGGAACAATAAAGAAGCGCTTGGAAAACAACTATTACTGGAATGCTCAGG  370
            |||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GATTATTAAAACACCCATGGATATGGGAACAATAAAGAAGCGCTTGGAAAACAACTATTACTGGAATGCTCAGG  370

Query  371  AATGTATCCAGGACTTCAACACTATGTTTACAAATTGTTACATCTACAACAAGCCTGGAGATGACATAGTCTTA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  371  AATGTATCCAGGACTTCAACACTATGTTTACAAATTGTTACATCTATAACAAGCCTGGAGATGACATCGTCTTA  444

Query  445  ATGGCAGAAGCTCTGGAAAAGCTCTTCTTGCAAAAAATAAATGAGCTACCCACAGAAGAAACCGAGATCATGAT  518
            |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||
Sbjct  445  ATGGCAGAAGCTCTGGAGAAGCTCTTCTTGCAAAAAATCAATGAACTGCCTACAGAAGAAACTGAGATCATGAT  518

Query  519  AGTCCAGGCAAAAGGAAGAGGACGTGGGAGGAAAGAAACAGGGACAGCAAAACCTGGCGTTTCCACGGTACCAA  592
            ||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.|||||||.|||||.||.|||||||||||||
Sbjct  519  AGTCCAGGCAAAAGGAAGAGGACGAGGGAGGAAAGAAACAGGGGCAGCAAAGCCTGGTGTATCCACGGTACCAA  592

Query  593  ACACAACTCAAGCATCGACTCCTCCGCAGACCCAGACCCCTCAGCCGAA---TCCTCCTCCTGTGCAGGCCACG  663
            ||||||||||||||||.|||.||||||||||||||||.|||||||.|||   ||||||.||||||||||||||.
Sbjct  593  ACACAACTCAAGCATCAACTTCTCCGCAGACCCAGACGCCTCAGCAGAACCCTCCTCCACCTGTGCAGGCCACA  666

Query  664  CCTCACCCCTTCCCTGCCGTCACCCCGGACCTCATCGTCCAGACCCCTGTCATGACAGTGGTGCCTCCCCAGCC  737
            .||||||||||.|||||.||||||||.||||||||.|.||||.|.||||||||||||.|||||||.||.|||||
Sbjct  667  ACTCACCCCTTTCCTGCTGTCACCCCAGACCTCATTGCCCAGCCTCCTGTCATGACAATGGTGCCCCCTCAGCC  740

Query  738  ACTGCAGACGCC--CCCCGCCAGTGCCCCCCCAGCCACAACCCCAACCCGCTTCAGCTCCCCAGCCCGTACAGA  809
            |||.|||||.||  |.|||   ||.|||||||||||||.|||||.|||.|||.|||.|||.|||||.||.||||
Sbjct  741  ACTTCAGACTCCTTCACCG---GTACCCCCCCAGCCACCACCCCCACCTGCTCCAGTTCCACAGCCTGTGCAGA  811

Query  810  GCCACCCACCCATCATCGCGGCCACCCCACAGCCTGTGAAGACAAAGAAGGGAGTGAAGAGGAAAGCAGACACC  883
            |.|||||.||||||||.|||.|||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||
Sbjct  812  GTCACCCGCCCATCATTGCGACCACCCCCCAGCCTGTGAAGACAAAGAAAGGGGTGAAGAGGAAAGCAGATACC  885

Query  884  ACCACCCCCACCACCATTGACCCCATTCACGAGCCACCCTCGCTGCCCCCGGAGCCCAAGACCACCAAGCTGGG  957
            ||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||.||||.||||||||||||.||||||||||
Sbjct  886  ACCACCCCTACCACCATCGACCCCATTCATGAGCCACCCTCACTGGCCCCAGAGCCCAAGACCGCCAAGCTGGG  959

Query  958  CCAGCGGCGGGAGAGCAGCCGGCCTGTGAAACCTCCAAAGAAGGACGTGCCCGACTCTCAGCAGCACCCAGCAC  1031
            .|..|||||||||||||||.|.||||||||.||||||||||||||.||.||.|||||.|||||||||||||..|
Sbjct  960  TCCTCGGCGGGAGAGCAGCAGACCTGTGAAGCCTCCAAAGAAGGATGTACCGGACTCACAGCAGCACCCAGGGC  1033

Query 1032  CAGAGAAGAGCAGCAAGGTCTCGGAGCAGCTCAAGTGCTGCAGCGGCATCCTCAAGGAGATGTTTGCCAAGAAG  1105
            |||||||||||||||||.||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1034  CAGAGAAGAGCAGCAAGATCTCTGAGCAGCTAAAGTGCTGCAGTGGCATCCTCAAGGAGATGTTTGCCAAGAAA  1107

Query 1106  CACGCCGCCTACGCCTGGCCCTTCTACAAGCCTGTGGACGTGGAGGCACTGGGCCTACACGACTACTGTGACAT  1179
            ||.||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||
Sbjct 1108  CATGCTGCCTATGCCTGGCCTTTCTACAAGCCTGTGGATGTGGAGGCACTGGGTCTGCACGACTACTGTGACAT  1181

Query 1180  CATCAAGCACCCCATGGACATGAGCACAATCAAGTCTAAACTGGAGGCCCGTGAGTACCGTGATGCTCAGGAGT  1253
            ||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.||||.||||||.|.|||||.|||||.|
Sbjct 1182  CATCAAACATCCCATGGACATGAGCACAATCAAGTCTAAACTAGAGTCCCGAGAGTACAGAGATGCCCAGGAAT  1255

Query 1254  TTGGTGCTGACGTCCGATTGATGTTCTCCAACTGCTATAAGTACAACCCTCCTGACCATGAGGTGGTGGCCATG  1327
            ||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||
Sbjct 1256  TTGGTGCTGATGTCCGATTGATGTTCTCCAACTGCTACAAGTACAACCCCCCTGACCATGAAGTGGTAGCCATG  1329

Query 1328  GCCCGCAAGCTCCAGGATGTGTTCGAAATGCGCTTTGCCAAGATGCCGGACGAGCCTGAGGAGCCAGTGGTGGC  1401
            ||.||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.||..|
Sbjct 1330  GCTCGAAAACTCCAGGATGTGTTTGAAATGCGCTTTGCCAAGATGCCTGATGAGCCTGAAGAGCCAGTTGTTAC  1403

Query 1402  CGTGTCCTCCCCCGGCAGTGCTCCCTCCCACCAAGGTTGTGGCCCCGCCCTCATCCCAGCGACAGCAGCAGCGA  1475
            .||||||| |.||.|||||||..||.||.||.|||||.||.|||||.||||||| |.||.||||||||||||||
Sbjct 1404  AGTGTCCT-CTCCTGCAGTGCCACCCCCTACAAAGGTGGTAGCCCCACCCTCAT-CTAGTGACAGCAGCAGCGA  1475

Query 1476  TAGCTCCTCGGACAGTGACAGTTCGACTGATGACTCTGAGGAGGAGCGAGCCCAGCGGCTGGCTGAGCTCCAGG  1549
            .||.||.||.|||||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1476  CAGTTCTTCCGACAGCGACAGTTCCACTGACGACTCTGAGGAAGAGCGAGCCCAGCGGCTGGCTGAACTCCAGG  1549

Query 1550  AGCAGCTCAAAGCCGTGCACGAGCAGCTTGCAGCCCTCTCTCAGCCCCAGCAGAACAAACCAAAGAAAAAGGAG  1623
            |.||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1550  AACAGCTCAAGGCCGTGCATGAGCAGCTTGCAGCCCTCTCACAGCCCCAGCAGAACAAACCAAAGAAAAAGGAG  1623

Query 1624  AAAGACAAGAAGGAAAAGAAAAAAGAAAAGCACAAAAGGAAAGAGGAAGTGGAAGAGAATAAAAAAAGCAAAGC  1697
            ||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||.||||||.||||||||.||.|||||||||||||||.|
Sbjct 1624  AAGGACAAGAAGGAAAAGAAAAAGGAAAAGCACAAAAAGAAAGAAGAAGTGGAGGAAAATAAAAAAAGCAAAAC  1697

Query 1698  CAAGGAACCTCCTCCTAAAAAGACGAAGAAAAATAATAGCAGCAACAGCAATGTGAGCAAGAAGGAGCCAGCGC  1771
            ||||||||.||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||..|
Sbjct 1698  CAAGGAACTTCCTCCCAAAAAGACAAAGAAAAATAACAGCAGCAACAGCAATGTGAGCAAGAAGGAACCAGTAC  1771

Query 1772  CCATGAAGAGCAAGCCCCCTCCCACGTATGAGTCGGAGGAAGAGGACAAGTGCAAGCCTATGTCCTATGAGGAG  1845
            |||.|||||.||||||.||||||||.|||||.||.||.||.|||||.|||||.|||||.|||||.|||||||||
Sbjct 1772  CCACGAAGACCAAGCCGCCTCCCACATATGAATCAGAAGAGGAGGATAAGTGTAAGCCCATGTCTTATGAGGAG  1845

Query 1846  AAGCGGCAGCTCAGCTTGGACATCAACAAGCTCCCCGGCGAGAAGCTGGGCCGCGTGGTGCACATCATCCAGTC  1919
            |||||||||||.||..|.||.||||||||.||.||.||.||||||||.|||||.||.||.|||||.||.|||||
Sbjct 1846  AAGCGGCAGCTAAGTCTAGATATCAACAAACTTCCTGGTGAGAAGCTAGGCCGTGTAGTACACATAATTCAGTC  1919

Query 1920  ACGGGAGCCCTCCCTGAAGAATTCCAACCCCGACGAGATTGAAATCGACTTTGAGACCCTGAAGCCGTCCACAC  1993
            |.||||.||.||.||.||.||.|||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||.||.||||
Sbjct 1920  AAGGGAACCATCACTTAAAAACTCCAACCCCGATGAGATTGAGATTGACTTTGAGACCCTGAAGCCATCTACAC  1993

Query 1994  TGCGTGAGCTGGAGCGCTATGTCACCTCCTGTTTGCGGAAGAAAAGGAAACCTCAAGCTGAGAAAGTTGATGTG  2067
            |.||.|||.|||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||
Sbjct 1994  TACGAGAGTTGGAGCGATATGTCACCTCCTGTTTGCGGAAGAAAAGGAAACCTCAAGCTGAAAAAGTTGACGTG  2067

Query 2068  ATTGCCGGCTCCTCCAAGATGAAGGGCTTCTCGTCCTCAGAGTCGGAGAGCTCCAGTGAGTCCAGCTCCTCTGA  2141
            |||||.||.||.||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||.||||.||.||||||||||||||
Sbjct 2068  ATTGCTGGTTCTTCCAAGATGAAGGGATTCTCATCCTCTGAGTCGGAGAGCACCAGCGAATCCAGCTCCTCTGA  2141

Query 2142  CAGCGAAGACTCCGAAACAGGTCCTGCC  2169
            |||.||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 2142  CAGTGAAGACTCTGAAACAGGTCCTGCC  2169