Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_15082
• Subject: NM_017719.5
• Aligned Length: 2321
• Identities: 2172
• Gaps: 48

Alignment

Query    1  ATGGCAGGATTTAAGCGAGGGTATGATGGAAAGATTGCTGGATTATATGATCTGGATAAAACCTTGGGTCGAGG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCAGGATTTAAGCGAGGGTATGATGGAAAGATTGCTGGATTATATGATCTGGATAAAACCTTGGGTCGAGG  74

Query   75  CCATTTTGCCGTGGTTAAACTTGCCAGGCATGTCTTTACGGGTGAAAAGGTGGCAGTAAAAGTTATTGACAAGA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCATTTTGCCGTGGTTAAACTTGCCAGGCATGTCTTTACGGGTGAAAAGGTGGCAGTAAAAGTTATTGACAAGA  148

Query  149  CAAAACTGGACACTCTAGCTACTGGTCATCTTTTCCAGGAAGTGAGATGCATGAAACTAGTGCAGCATCCTAAC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CAAAACTGGACACTCTAGCTACTGGTCATCTTTTCCAGGAAGTGAGATGCATGAAACTAGTGCAGCATCCTAAC  222

Query  223  ATCGTCCGCCTTTATGAAGTTATTGACACCCAGACCAAACTATATCTTATTCTAGAACTTGGGGATGGAGGAGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  ATCGTCCGCCTTTATGAAGTTATTGACACCCAGACCAAACTATATCTTATTCTAGAACTTGGGGATGGAGGAGA  296

Query  297  TATGTTTGATTATATAATGAAACATGAGGAGGGTCTTAATGAAGACTTGGCCAAGAAGTATTTTGCTCAGATAG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TATGTTTGATTATATAATGAAACATGAGGAGGGTCTTAATGAAGACTTGGCCAAGAAGTATTTTGCTCAGATAG  370

Query  371  TTCATGCTATATCTTATTGCCATAAACTCCATGTGGTTCACAGAGACTTAAAACCAGAGAATGTAGTCTTCTTT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TTCATGCTATATCTTATTGCCATAAACTCCATGTGGTTCACAGAGACTTAAAACCAGAGAATGTAGTCTTCTTT  444

Query  445  GAAAAACAAGGTCTTGTAAAGTTGACAGACTTTGGGTTCAGCAACAAATTTCAACCAGGGAAGAAGCTCACTAC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GAAAAACAAGGTCTTGTAAAGTTGACAGACTTTGGGTTCAGCAACAAATTTCAACCAGGGAAGAAGCTCACTAC  518

Query  519  AAGCTGTGGATCTCTTGCATATTCCGCTCCAGAAATTCTGCTTGGTGATGAGTATGATGCACCTGCAGTAGATA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AAGCTGTGGATCTCTTGCATATTCCGCTCCAGAAATTCTGCTTGGTGATGAGTATGATGCACCTGCAGTAGATA  592

Query  593  TTTGGAGTCTGGGAGTGATCCTTTTCATGTTGGTGTGTGGGCAGCCGCCCTTTCAAGAAGCCAATGACAGTGAA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TTTGGAGTCTGGGAGTGATCCTTTTCATGTTGGTGTGTGGGCAGCCGCCCTTTCAAGAAGCCAATGACAGTGAA  666

Query  667  ACACTGACAATGATCATGGATTGCAAATATACAGTACCATCCCATGTGTCTAAAGAGTGTAAAGACCTAATCAC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ACACTGACAATGATCATGGATTGCAAATATACAGTACCATCCCATGTGTCTAAAGAGTGTAAAGACCTAATCAC  740

Query  741  ACGGATGCTACAGAGAGATCCCAAGAGAAGGGCTTTCTTTTAGAAGAGATTGAAAATCATCCTTGGCTTCAGGG  814
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||  .||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  ACGGATGCTACAGAGAGATCCCAAGAGAAGGGCTT--CTTTAGAAGAGATTGAAAATCATCCTTGGCTTCAGGG  812

Query  815  AGTGGACCCTTCACCAGCTACAAAGTATAACATTCCCCTTGTGTCATACAAAAATCTCTCGGAAGAGGAGCACA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  813  AGTGGACCCTTCACCAGCTACAAAGTATAACATTCCCCTTGTGTCATACAAAAATCTCTCGGAAGAGGAGCACA  886

Query  889  ACAGCATCATTCAGCGCATGGTGCTTGGGGACATAGCGGATCGAGACGCCATTGTAGAAGCCCTGGAAACCAAC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  887  ACAGCATCATTCAGCGCATGGTGCTTGGGGACATAGCGGATCGAGACGCCATTGTAGAAGCCCTGGAAACCAAC  960

Query  963  AGGTATAACCATATCACAGCCACATACTTCCTGCTGGCTGAAAGGATCCTGAGAGAAAAGCAAGAGAAAGAAAT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  961  AGGTATAACCATATCACAGCCACATACTTCCTGCTGGCTGAAAGGATCCTGAGAGAAAAGCAAGAGAAAGAAAT  1034

Query 1037  ACAGACCAGATCTGCAAGCCCGAGCAATATCAAGGCCCAGTTTAGGCAGTCATGGCCAACCAAAATTGATGTAC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1035  ACAGACCAGATCTGCAAGCCCGAGCAATATCAAGGCCCAGTTTAGGCAGTCATGGCCAACCAAAATTGATGTAC  1108

Query 1111  CCCAGGACCTTGAGGATGACCTCACGGCCACTCCTTTGTCCCACGCGACTGTCCCTCAGTCTCCTGCTCGGGCT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1109  CCCAGGACCTTGAGGATGACCTCACGGCCACTCCTTTGTCCCACGCGACTGTCCCTCAGTCTCCTGCTCGGGCT  1182

Query 1185  GCTGACAGTGTCCTCAATGGCCACAGGAGCAAAGGCCTGTGTGACTCAGCTAAGAAAGATGACCTCCCTGAGTT  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1183  GCTGACAGTGTCCTCAATGGCCACAGGAGCAAAGGCCTGTGTGACTCAGCTAAGAAAGATGACCTCCCTGAGTT  1256

Query 1259  GGCTGGACCAGCACTCTCTACGGTGCCACCCGCAAGCTTAAAACCCACAGCCAGTGGGCGGAAGTGTCTGTTCA  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1257  GGCTGGACCAGCACTCTCTACGGTGCCACCCGCAAGCTTAAAACCCACAGCCAGTGGGCGGAAGTGTCTGTTCA  1330

Query 1333  GGGTGGAAGAAGATGAAGAGGAAGATGAGGAGGACAAGAAACCCATGTCCCTCTCAACACAAGTGGTTTTGCGC  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1331  GGGTGGAAGAAGATGAAGAGGAAGATGAGGAGGACAAGAAACCCATGTCCCTCTCAACACAAGTGGTTTTGCGC  1404

Query 1407  CGGAAGCCATCTGTAACCAACCGCCTGACATCCAGGAAGAGTGCGCCCGTCCTCAACCAGATCTTTGAGGAAGG  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1405  CGGAAGCCATCTGTAACCAACCGCCTGACATCCAGGAAGAGTGCGCCCGTCCTCAACCAGATCTTTGAGGAAGG  1478

Query 1481  GGAATCTGATGATGAGTTTGACATGGATGAGAATCTGCCTCCCAAGTTGAGCAGGTTAAAGATGAATACAGCAT  1554
            |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.|
Sbjct 1479  GGAATCTGACGATGAGTTTGACATGGATGAGAATCTGCCTCCCAAGTTGAGCAGGTTAAAGATGAATATAGCTT  1552

Query 1555  CTCAAG--------CACATGCTTCCTACTGCTTCCACCGATCGAG--AAAG-CAAAGCAAGAGATCGAGCTGCA  1617
            |||.||        ||||        |..|||.||||||   |||  |||| ||..||..|.|.||.|||||||
Sbjct 1553  CTCCAGGTACAGTTCACA--------AACGCTACCACCG---GAGGAAAAGTCAGGGCCGGGGCTCCAGCTGCA  1615

Query 1618  GTCGATATCTGCACAGCC----GATGCTGAATCTGAGAGCAGTTGAGGCAG-TC-ATAGAGATCCAGAATTGAC  1685
            ||.|     |.|..||.|    ||||.|||.|||||.|||.|  |.|||.| || |||.||||...|..||.||
Sbjct 1616  GTAG-----TTCGGAGACCAGTGATGATGATTCTGAAAGCCG--GCGGCGGCTCGATAAAGATAGCGGGTTCAC  1682

Query 1686  GTACTCCCAGGCACTTGA--GGATGAGCTCACAGGCACTCCTTGGTAGCACGCGAGATGTC---CGTCAGTCTC  1754
            .|||| ||.||||| .||  |||| |||....|||..|.||.|||.||...|.|.||||.|   .|.|||   .
Sbjct 1683  CTACT-CCTGGCAC-CGACGGGAT-AGCAGCGAGGGGCCCCCTGGCAGTGAGGGGGATGGCGGGGGCCAG---A  1750

Query 1755  GCAAGCCAAGCAATGACAGTGGAGTCAAGGACAACACCAGCACCAGCGAGAGCGACTCAGGTGAGAACGGTCAC  1828
            |||||||||||||||.||||||||....||||||..|||||.||||.||||.|.|..|.||||.|..|.|||.|
Sbjct 1751  GCAAGCCAAGCAATGCCAGTGGAGGGGTGGACAAGGCCAGCCCCAGTGAGAACAATGCTGGTGGGGGCAGTCCC  1824

Query 1829  TCCAGCGAGTCGGGTGGCAACGCCATCAATACATCGGGTACCACAAGCCGCTGTGCCGGCCCCAGCAAGTCCAT  1902
            |||||||..||||||||||||.|||.|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1825  TCCAGCGGCTCGGGTGGCAACCCCACCAATACATCGGGTACCACACGCCGCTGTGCCGGCCCCAGCAACTCCAT  1898

Query 1903  GCATCTGGCCTCTCGCAGTGATGGGGAGGTGGATGAGAGCGTCAAACTCATGAGCATGTGCCTCGGCTCCCAGG  1976
            |||.||||||||||||||||.|||||||.|.|.|||||||.||||||||||||||.|.|||||||||||||||.
Sbjct 1899  GCAGCTGGCCTCTCGCAGTGCTGGGGAGCTCGTTGAGAGCCTCAAACTCATGAGCCTCTGCCTCGGCTCCCAGC  1972

Query 1977  TTCATGGGAGCACCAAGTACATTATTGATCCACAGAATGGCTTGTCATTTTGCAGTGTGATAGTCCAAGAGATA  2050
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|
Sbjct 1973  TTCATGGGAGCACCAAGTACATTATTGATCCACAGAATGGCTTGTCATTTTCCAGTGTGAAAGTCCAAGAGAAA  2046

Query 2051  TTTAAGGAGAAAAAATGCATTAGCTCCACAGGGAATGCAGGGCATGTCCCTGCAGTGGGGGGCATAAAGTTTTT  2124
            |.||.|..|||||..|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 2047  TCTACGTGGAAAATGTGCATTAGCTCCACAGGGAATGCAGGGCAGGTCCCTGCAGTGGGCGGCATAAAGTTTTT  2120

Query 2125  GTATGACCACATGGCAGATACCACCACTGAATTGGAACGGATAAAGAGCAAGAACCTGAAAAATAACGTGCTGC  2198
            .|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2121  CTCTGACCACATGGCAGATACCACCACTGAATTGGAACGGATAAAGAGCAAGAACCTGAAAAATAACGTGCTGC  2194

Query 2199  AGCTACCTCTGTGCGAAAAGACCATCTCTGTGAACATCCAGCGGAACCCTAAGGAGGGGCTGCTGTGCGCATCC  2272
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2195  AGCTACCTCTGTGCGAAAAGACCATCTCTGTGAACATCCAGCGGAACCCTAAGGAGGGGCTGCTGTGCGCATCC  2268

Query 2273  AGCCCAGCCAGCTGTTGCCATGTCATC  2299
            |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2269  AGCCCAGCCAGCTGTTGCCATGTCATC  2295