Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_15082
• Subject: NM_133741.2
• Aligned Length: 2368
• Identities: 1843
• Gaps: 193

Alignment

Query    1  ATGGCAGGATTTAAGCGAGGGTATGATGGAAAGATTGCTGGATTATATGATCTGGATAAAACCTTGGGTCGAGG  74
            ||||||||.||.||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCAGGGTTCAAGCGAGGATATGATGGGAAAATTGCTGGATTATATGATCTGGATAAAACCTTGGGTCGAGG  74

Query   75  CCATTTTGCCGTGGTTAAACTTGCCAGGCATGTCTTTACGGGTGAAAAGGTGGCAGTAAAAGTTATTGACAAGA  148
            .||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||.|||||.||||||||||
Sbjct   75  TCATTTTGCAGTGGTCAAACTTGCCAGGCATGTCTTCACAGGTGAGAAGGTGGCAGTGAAAGTCATTGACAAGA  148

Query  149  CAAAACTGGACACTCTAGCTACTGGTCATCTTTTCCAGGAAGTGAGATGCATGAAACTAGTGCAGCATCCTAAC  222
            |.||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||
Sbjct  149  CGAAGCTGGACACTCTAGCCACTGGTCATCTCTTCCAGGAAGTGAGGTGCATGAAACTAGTGCAGCACCCCAAC  222

Query  223  ATCGTCCGCCTTTATGAAGTTATTGACACCCAGACCAAACTATATCTTATTCTAGAACTTGGGGATGGAGGAGA  296
            ||.||.||.||.||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  223  ATTGTGCGTCTCTATGAAGTCATAGACACCCAGACCAAACTTTATCTCATTCTAGAACTTGGAGATGGAGGAGA  296

Query  297  TATGTTTGATTATATAATGAAACATGAGGAGGGTCTTAATGAAGACTTGGCCAAGAAGTATTTTGCTCAGATAG  370
            |||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct  297  TATGTTTGATTATATAATGAAGCACGAGGAGGGTCTTAATGAAGACTTGGCCAAGAAGTACTTTGCTCAGATAG  370

Query  371  TTCATGCTATATCTTATTGCCATAAACTCCATGTGGTTCACAGAGACTTAAAACCAGAGAATGTAGTCTTCTTT  444
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  371  TTCATGCTATATCTTATTGCCATAAACTCCATGTGGTCCACAGAGACTTGAAACCAGAGAATGTAGTCTTTTTT  444

Query  445  GAAAAACAAGGTCTTGTAAAGTTGACAGACTTTGGGTTCAGCAACAAATTTCAACCAGGGAAGAAGCTCACTAC  518
            |||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.|||||.|||||.||
Sbjct  445  GAAAAACAAGGTCTTGTGAAGTTGACAGACTTTGGCTTCAGCAACAAATTTCAGCCTGGAAAGAAACTCACCAC  518

Query  519  AAGCTGTGGATCTCTTGCATATTCCGCTCCAGAAATTCTGCTTGGTGATGAGTATGATGCACCTGCAGTAGATA  592
            .|||||.||.|||||||||||.||.|||||||||||.||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.|
Sbjct  519  GAGCTGCGGGTCTCTTGCATACTCTGCTCCAGAAATCCTGCTTGGCGATGAGTACGATGCCCCTGCAGTAGACA  592

Query  593  TTTGGAGTCTGGGAGTGATCCTTTTCATGTTGGTGTGTGGGCAGCCGCCCTTTCAAGAAGCCAATGACAGTGAA  666
            |.|||||.|||||.|||||||||||||||.||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||.
Sbjct  593  TATGGAGCCTGGGCGTGATCCTTTTCATGCTGGTGTGTGGGCAGCCACCCTTCCAAGAAGCCAACGACAGCGAG  666

Query  667  ACACTGACAATGATCATGGATTGCAAATATACAGTACCATCCCATGTGTCTAAAGAGTGTAAAGACCTAATCAC  740
            ||||||||.|||||||||||.|||||.||.||.||.|||.|||..||||||..||.|||.|..|||||.|||||
Sbjct  667  ACACTGACCATGATCATGGACTGCAAGTACACGGTGCCACCCCGCGTGTCTGCAGGGTGCAGGGACCTGATCAC  740

Query  741  ACGGATGCTACAGAGAGATCCCAAGAGAAGGGCTTTCT-TTTAGAAGAGATTGAAAATCATCCTTGGCTTCAGG  813
            |||.||||||||||||||.|||||.||.||.||   || |.|.|||||||||||||..||.||||||||.||||
Sbjct  741  ACGAATGCTACAGAGAGACCCCAAAAGGAGAGC---CTCTCTGGAAGAGATTGAAAGCCACCCTTGGCTCCAGG  811

Query  814  GAGTGGACCCTTCACCAGCTACAAAGTATAACATTCCCCTTGTGTCATACAAAAATCTCTCGGAAGAGGAGCAC  887
            ||||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.||.|||||.||.||.||||||
Sbjct  812  GAGTGGACCCATCACCAGCCACCAAGTATAACATTCCCCTCGTGTCCTACAAGAACCTCTCCGAGGAAGAGCAC  885

Query  888  AACAGCATCATTCAGCGCATGGTGCTTGGGGACATAGCGGATCGAGACGCCATTGTAGAAGCCCTGGAAACCAA  961
            |||||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  886  AACAGCATCATCCAGCGCATGGTGCTCGGGGACATCGCGGACCGAGACGCCATCGTAGAAGCCCTGGAAACCAA  959

Query  962  CAGGTATAACCATATCACAGCCACATACTTCCTGCTGGCTGAAAGGATCCTGAGAGAAAAGCAAGAGAAAGAAA  1035
            ||||||.|||||.||.||.|||||.|||||..|.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  960  CAGGTACAACCACATTACCGCCACTTACTTTTTACTTGCTGAAAGGATCCTGAGAGAAAAGCAAGAGAAAGAAA  1033

Query 1036  TACAGACCAGATCTGCAAGCCCGAGCAATATCAAGGCCCAGTTTAGGCAGTCATGGCCAACCAAAATTGATGTA  1109
            ||||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1034  TACAGACCAGGTCTGCTAGCCCCAGCAACATCAAGGCCCAGTTTAGGCAGTCATGGCCAACCAAAATTGATGTA  1107

Query 1110  CCCCAGGACCTTGAGGATGACCTCACGGCCACTCCTTTGTCCCACGCGACTGTCCCTCAGTCTCCTGCTCGGGC  1183
            |||||.||||||||.|||||.|||||.|||||.|||.||||.||.||.||.|||||.||||||||||||.||||
Sbjct 1108  CCCCAAGACCTTGAAGATGATCTCACTGCCACCCCTCTGTCACATGCCACAGTCCCGCAGTCTCCTGCTAGGGC  1181

Query 1184  TGCTGACAGTGTCCTCAATGGCCACAGGAGCAAAGGCCTGTGTGACTCAGCTAAGAAAGATGACCTCCCTGAGT  1257
            ||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.|||||||||||.|||||.|||.
Sbjct 1182  TGGTGACAATGTCCTCAATGGCCACAGGAGCAAAGGCCTGTGTGACCCAGCCAAGAAAGATGAGCTCCCGGAGC  1255

Query 1258  TGGCTGGACCAGCACTCTCTACGGTGCCACCCGCAAGCTTAAAACCCACAGCCAGTGGGCGGAAGTGTCTGTTC  1331
            |||||||.||.|||||.||.||.||.|||||.||||||.|.||.|||.|||||||||||||.||||||||.|||
Sbjct 1256  TGGCTGGGCCGGCACTGTCCACTGTTCCACCTGCAAGCATGAAGCCCGCAGCCAGTGGGCGCAAGTGTCTCTTC  1329

Query 1332  AGGGTGGAAGAAGATGAAGAGGAAGATGAGGAGGACAAGAAACCCATGTCCCTCTCAACACAAGTGGTTTTGCG  1405
            |||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||..|||||||.||.||.||.|||||..||||
Sbjct 1330  AGGGTGGAAGAAGATGAGGAGGAGGATGAGGAGGACAAGAAGCCTGTGTCCCTGTCCACGCAGGTGGTGCTGCG  1403

Query 1406  CCGGAAGCCATCTGTAACCAACCGCCTGACATCCAGGAAGAGTGCGCCCGTCCTCAACCAGATCTTTGAGGAAG  1479
            ||||||||||||.||.|||||.||||||||.||..|.||||||||.||.||.||||||||||||||.|||||.|
Sbjct 1404  CCGGAAGCCATCGGTCACCAATCGCCTGACGTCTCGCAAGAGTGCCCCAGTGCTCAACCAGATCTTCGAGGAGG  1477

Query 1480  GGGAATCTGATGATGAGTTTGACATGGATGAGAATCTGCCTCCCAAGTTGAGCAGGTTAAAGATGAATACAGCA  1553
            |.||.||.||.||.||||||||||||||.|||||.|||||.||||||.|||||.||.|.||||||||.|..||.
Sbjct 1478  GCGAGTCAGACGACGAGTTTGACATGGACGAGAACCTGCCGCCCAAGCTGAGCCGGCTGAAGATGAACATTGCC  1551

Query 1554  TCTCAA--------GCACATGCTTCCTACTGCTTCCACCGATCGAGAAAG-CAAAGCAAGAGATCGAGCTGCAG  1618
            ||.|.|        |||||.||        |||.||||||...|| |||| ||..||..|.|.||.||||||||
Sbjct 1552  TCACCAGGCACAGTGCACAAGC--------GCTACCACCGCAGGA-AAAGCCAGGGCCGGGGCTCTAGCTGCAG  1616

Query 1619  TCGATATCTGCACAGCCGATGCTGAATCTGAGAG-CAGTTGAGGCAGTCATAGAGATCCAGAA--------TTG  1683
            ..|.|.|..|..||| |||||..||.||.||||| |.|..|||||     |.||   |.||.|        |||
Sbjct 1617  CAGCTCTGAGACCAG-CGATGACGACTCCGAGAGCCGGCGGAGGC-----TGGA---CAAGGACAGCGGCTTTG  1681

Query 1684  ACGTACTCCCAGGCAC-------------TTGAGGATGAGCTCA-CAGGCACTCCTTGGTAGCACGCGA-----  1738
             |.|||| |..|||||             .|||||    |..|| ||||||              ||||     
Sbjct 1682  -CTTACT-CGTGGCACCGGCGTGACAGCAGTGAGG----GGCCACCAGGCA--------------GCGAGGGCG  1735

Query 1739  --GATGTCCGTCAGTCTCGCAAGCCAAGCAATGACAGTGGAGTCAAGGACAACACCAGCACCAGCGAGAGC--G  1808
              |.||.|.|.|||   .|||||||.||||   .|.||||.|....||||||..||||  ||.|.|.||||  |
Sbjct 1736  ATGGTGGCGGCCAG---AGCAAGCCTAGCA---GCGGTGGCGGTGTGGACAAGGCCAG--CCCGGGTGAGCAGG  1801

Query 1809  ACTCAGGTG-----AGAACGGTCACTCCAGCGAG--TCGGGTGGCAACGCCATC-AATACATC-GGGTACCACA  1873
            .|.|.||||     ||          ||||.|||  ||.||||| .||.||.|| ..||||.| |||| ||.||
Sbjct 1802  GCACGGGTGGTGGCAG----------CCAGGGAGGCTCTGGTGG-GACCCCGTCGGGTACAGCAGGGT-CCTCA  1863

Query 1874  AGCCGCTGTGCCGGCCC-----CAGCAAGTCCAT-----------GCATCTGGCCTCTCGCA-GTGATGGGGAG  1930
            ||.||||||||.|||||     ||.|....||.|           ||.||| |||.||| || |||.||..|||
Sbjct 1864  AGGCGCTGTGCAGGCCCTGACTCATCCTCACCCTCCCCCGCCTCAGCCTCT-GCCGCTC-CACGTGGTGCAGAG  1935

Query 1931  GTGGATG-AGAGCGTCAAACTCATGAGCATGTGCCTCGGCTCCCAGGTTCATGGGAGCACCAAGTACATTATTG  2003
            .|.| || |||||.||||||||.|||||.|||||||.|||||.|||.|.||||   ||.|||||||||||.|.|
Sbjct 1936  CTTG-TGCAGAGCCTCAAACTCGTGAGCCTGTGCCTAGGCTCACAGCTGCATG---GCGCCAAGTACATTCTGG  2005

Query 2004  ATCCACAGAATGGCTTGTCATTTTGCAGTGTGATAGTCCAAGAGATATTTAAGGAGAAAAAATGCATTAGCTCC  2077
            |.||.|||||.|.||||   ||.|.|||.||||..||.||.||||..|..|.|..|||.|..|||||.|||.||
Sbjct 2006  ACCCGCAGAAGGCCTTG---TTCTCCAGCGTGAAGGTGCAGGAGAAGTCCACGTGGAAGATGTGCATCAGCGCC  2076

Query 2078  ACAGGGAATGCAGGGCATGTCCCTGCAGTGGGGGGCATAAAGTTTTTGTATGACCACATGGCAGATACCACCAC  2151
            .||||               |||  |||                         ||            ||.|..|
Sbjct 2077  CCAGG---------------CCC--CAG-------------------------CC------------CCTCTGC  2096

Query 2152  TGAATTGGAACGGATAAAGAGCAAGAACCTGAAAAATAACGTGCTGCAGCTACCTCTGTGCGAAAAGACCATCT  2225
            |||..|.||.|.|.|.|.||.||||||.||||..||.||||.|||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2097  TGACCTTGACCCGGTGAGGACCAAGAAGCTGAGGAACAACGCGCTCCAGCTACCTCTGTGCGAAAAGACCATCT  2170

Query 2226  CTGTGAACATCCAGCGGAACCCTAAGGAGGGGCTGCTGTGCGCATCCAGCCCAGCCAGCTGTTGCCATGTCATC  2299
            |.||||||||||||||.|.||..|||||.||||||||.|||||.||||||||.||||||||.||||||||||||
Sbjct 2171  CCGTGAACATCCAGCGCAGCCGCAAGGAAGGGCTGCTCTGCGCCTCCAGCCCCGCCAGCTGCTGCCATGTCATC  2244