Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_15082
- Subject:
- XM_006512002.3
- Aligned Length:
- 2368
- Identities:
- 1843
- Gaps:
- 193
Alignment
Query 1 ATGGCAGGATTTAAGCGAGGGTATGATGGAAAGATTGCTGGATTATATGATCTGGATAAAACCTTGGGTCGAGG 74
||||||||.||.||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCAGGGTTCAAGCGAGGATATGATGGGAAAATTGCTGGATTATATGATCTGGATAAAACCTTGGGTCGAGG 74
Query 75 CCATTTTGCCGTGGTTAAACTTGCCAGGCATGTCTTTACGGGTGAAAAGGTGGCAGTAAAAGTTATTGACAAGA 148
.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||.|||||.||||||||||
Sbjct 75 TCATTTTGCAGTGGTCAAACTTGCCAGGCATGTCTTCACAGGTGAGAAGGTGGCAGTGAAAGTCATTGACAAGA 148
Query 149 CAAAACTGGACACTCTAGCTACTGGTCATCTTTTCCAGGAAGTGAGATGCATGAAACTAGTGCAGCATCCTAAC 222
|.||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||
Sbjct 149 CGAAGCTGGACACTCTAGCCACTGGTCATCTCTTCCAGGAAGTGAGGTGCATGAAACTAGTGCAGCACCCCAAC 222
Query 223 ATCGTCCGCCTTTATGAAGTTATTGACACCCAGACCAAACTATATCTTATTCTAGAACTTGGGGATGGAGGAGA 296
||.||.||.||.||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 223 ATTGTGCGTCTCTATGAAGTCATAGACACCCAGACCAAACTTTATCTCATTCTAGAACTTGGAGATGGAGGAGA 296
Query 297 TATGTTTGATTATATAATGAAACATGAGGAGGGTCTTAATGAAGACTTGGCCAAGAAGTATTTTGCTCAGATAG 370
|||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 297 TATGTTTGATTATATAATGAAGCACGAGGAGGGTCTTAATGAAGACTTGGCCAAGAAGTACTTTGCTCAGATAG 370
Query 371 TTCATGCTATATCTTATTGCCATAAACTCCATGTGGTTCACAGAGACTTAAAACCAGAGAATGTAGTCTTCTTT 444
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 371 TTCATGCTATATCTTATTGCCATAAACTCCATGTGGTCCACAGAGACTTGAAACCAGAGAATGTAGTCTTTTTT 444
Query 445 GAAAAACAAGGTCTTGTAAAGTTGACAGACTTTGGGTTCAGCAACAAATTTCAACCAGGGAAGAAGCTCACTAC 518
|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.|||||.|||||.||
Sbjct 445 GAAAAACAAGGTCTTGTGAAGTTGACAGACTTTGGCTTCAGCAACAAATTTCAGCCTGGAAAGAAACTCACCAC 518
Query 519 AAGCTGTGGATCTCTTGCATATTCCGCTCCAGAAATTCTGCTTGGTGATGAGTATGATGCACCTGCAGTAGATA 592
.|||||.||.|||||||||||.||.|||||||||||.||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.|
Sbjct 519 GAGCTGCGGGTCTCTTGCATACTCTGCTCCAGAAATCCTGCTTGGCGATGAGTACGATGCCCCTGCAGTAGACA 592
Query 593 TTTGGAGTCTGGGAGTGATCCTTTTCATGTTGGTGTGTGGGCAGCCGCCCTTTCAAGAAGCCAATGACAGTGAA 666
|.|||||.|||||.|||||||||||||||.||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||.
Sbjct 593 TATGGAGCCTGGGCGTGATCCTTTTCATGCTGGTGTGTGGGCAGCCACCCTTCCAAGAAGCCAACGACAGCGAG 666
Query 667 ACACTGACAATGATCATGGATTGCAAATATACAGTACCATCCCATGTGTCTAAAGAGTGTAAAGACCTAATCAC 740
||||||||.|||||||||||.|||||.||.||.||.|||.|||..||||||..||.|||.|..|||||.|||||
Sbjct 667 ACACTGACCATGATCATGGACTGCAAGTACACGGTGCCACCCCGCGTGTCTGCAGGGTGCAGGGACCTGATCAC 740
Query 741 ACGGATGCTACAGAGAGATCCCAAGAGAAGGGCTTTCT-TTTAGAAGAGATTGAAAATCATCCTTGGCTTCAGG 813
|||.||||||||||||||.|||||.||.||.|| || |.|.|||||||||||||..||.||||||||.||||
Sbjct 741 ACGAATGCTACAGAGAGACCCCAAAAGGAGAGC---CTCTCTGGAAGAGATTGAAAGCCACCCTTGGCTCCAGG 811
Query 814 GAGTGGACCCTTCACCAGCTACAAAGTATAACATTCCCCTTGTGTCATACAAAAATCTCTCGGAAGAGGAGCAC 887
||||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.||.|||||.||.||.||||||
Sbjct 812 GAGTGGACCCATCACCAGCCACCAAGTATAACATTCCCCTCGTGTCCTACAAGAACCTCTCCGAGGAAGAGCAC 885
Query 888 AACAGCATCATTCAGCGCATGGTGCTTGGGGACATAGCGGATCGAGACGCCATTGTAGAAGCCCTGGAAACCAA 961
|||||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 886 AACAGCATCATCCAGCGCATGGTGCTCGGGGACATCGCGGACCGAGACGCCATCGTAGAAGCCCTGGAAACCAA 959
Query 962 CAGGTATAACCATATCACAGCCACATACTTCCTGCTGGCTGAAAGGATCCTGAGAGAAAAGCAAGAGAAAGAAA 1035
||||||.|||||.||.||.|||||.|||||..|.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 960 CAGGTACAACCACATTACCGCCACTTACTTTTTACTTGCTGAAAGGATCCTGAGAGAAAAGCAAGAGAAAGAAA 1033
Query 1036 TACAGACCAGATCTGCAAGCCCGAGCAATATCAAGGCCCAGTTTAGGCAGTCATGGCCAACCAAAATTGATGTA 1109
||||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1034 TACAGACCAGGTCTGCTAGCCCCAGCAACATCAAGGCCCAGTTTAGGCAGTCATGGCCAACCAAAATTGATGTA 1107
Query 1110 CCCCAGGACCTTGAGGATGACCTCACGGCCACTCCTTTGTCCCACGCGACTGTCCCTCAGTCTCCTGCTCGGGC 1183
|||||.||||||||.|||||.|||||.|||||.|||.||||.||.||.||.|||||.||||||||||||.||||
Sbjct 1108 CCCCAAGACCTTGAAGATGATCTCACTGCCACCCCTCTGTCACATGCCACAGTCCCGCAGTCTCCTGCTAGGGC 1181
Query 1184 TGCTGACAGTGTCCTCAATGGCCACAGGAGCAAAGGCCTGTGTGACTCAGCTAAGAAAGATGACCTCCCTGAGT 1257
||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.|||||||||||.|||||.|||.
Sbjct 1182 TGGTGACAATGTCCTCAATGGCCACAGGAGCAAAGGCCTGTGTGACCCAGCCAAGAAAGATGAGCTCCCGGAGC 1255
Query 1258 TGGCTGGACCAGCACTCTCTACGGTGCCACCCGCAAGCTTAAAACCCACAGCCAGTGGGCGGAAGTGTCTGTTC 1331
|||||||.||.|||||.||.||.||.|||||.||||||.|.||.|||.|||||||||||||.||||||||.|||
Sbjct 1256 TGGCTGGGCCGGCACTGTCCACTGTTCCACCTGCAAGCATGAAGCCCGCAGCCAGTGGGCGCAAGTGTCTCTTC 1329
Query 1332 AGGGTGGAAGAAGATGAAGAGGAAGATGAGGAGGACAAGAAACCCATGTCCCTCTCAACACAAGTGGTTTTGCG 1405
|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||..|||||||.||.||.||.|||||..||||
Sbjct 1330 AGGGTGGAAGAAGATGAGGAGGAGGATGAGGAGGACAAGAAGCCTGTGTCCCTGTCCACGCAGGTGGTGCTGCG 1403
Query 1406 CCGGAAGCCATCTGTAACCAACCGCCTGACATCCAGGAAGAGTGCGCCCGTCCTCAACCAGATCTTTGAGGAAG 1479
||||||||||||.||.|||||.||||||||.||..|.||||||||.||.||.||||||||||||||.|||||.|
Sbjct 1404 CCGGAAGCCATCGGTCACCAATCGCCTGACGTCTCGCAAGAGTGCCCCAGTGCTCAACCAGATCTTCGAGGAGG 1477
Query 1480 GGGAATCTGATGATGAGTTTGACATGGATGAGAATCTGCCTCCCAAGTTGAGCAGGTTAAAGATGAATACAGCA 1553
|.||.||.||.||.||||||||||||||.|||||.|||||.||||||.|||||.||.|.||||||||.|..||.
Sbjct 1478 GCGAGTCAGACGACGAGTTTGACATGGACGAGAACCTGCCGCCCAAGCTGAGCCGGCTGAAGATGAACATTGCC 1551
Query 1554 TCTCAA--------GCACATGCTTCCTACTGCTTCCACCGATCGAGAAAG-CAAAGCAAGAGATCGAGCTGCAG 1618
||.|.| |||||.|| |||.||||||...|| |||| ||..||..|.|.||.||||||||
Sbjct 1552 TCACCAGGCACAGTGCACAAGC--------GCTACCACCGCAGGA-AAAGCCAGGGCCGGGGCTCTAGCTGCAG 1616
Query 1619 TCGATATCTGCACAGCCGATGCTGAATCTGAGAG-CAGTTGAGGCAGTCATAGAGATCCAGAA--------TTG 1683
..|.|.|..|..||| |||||..||.||.||||| |.|..||||| |.|| |.||.| |||
Sbjct 1617 CAGCTCTGAGACCAG-CGATGACGACTCCGAGAGCCGGCGGAGGC-----TGGA---CAAGGACAGCGGCTTTG 1681
Query 1684 ACGTACTCCCAGGCAC-------------TTGAGGATGAGCTCA-CAGGCACTCCTTGGTAGCACGCGA----- 1738
|.|||| |..||||| .||||| |..|| |||||| ||||
Sbjct 1682 -CTTACT-CGTGGCACCGGCGTGACAGCAGTGAGG----GGCCACCAGGCA--------------GCGAGGGCG 1735
Query 1739 --GATGTCCGTCAGTCTCGCAAGCCAAGCAATGACAGTGGAGTCAAGGACAACACCAGCACCAGCGAGAGC--G 1808
|.||.|.|.||| .|||||||.|||| .|.||||.|....||||||..|||| ||.|.|.|||| |
Sbjct 1736 ATGGTGGCGGCCAG---AGCAAGCCTAGCA---GCGGTGGCGGTGTGGACAAGGCCAG--CCCGGGTGAGCAGG 1801
Query 1809 ACTCAGGTG-----AGAACGGTCACTCCAGCGAG--TCGGGTGGCAACGCCATC-AATACATC-GGGTACCACA 1873
.|.|.|||| || ||||.||| ||.||||| .||.||.|| ..||||.| |||| ||.||
Sbjct 1802 GCACGGGTGGTGGCAG----------CCAGGGAGGCTCTGGTGG-GACCCCGTCGGGTACAGCAGGGT-CCTCA 1863
Query 1874 AGCCGCTGTGCCGGCCC-----CAGCAAGTCCAT-----------GCATCTGGCCTCTCGCA-GTGATGGGGAG 1930
||.||||||||.||||| ||.|....||.| ||.||| |||.||| || |||.||..|||
Sbjct 1864 AGGCGCTGTGCAGGCCCTGACTCATCCTCACCCTCCCCCGCCTCAGCCTCT-GCCGCTC-CACGTGGTGCAGAG 1935
Query 1931 GTGGATG-AGAGCGTCAAACTCATGAGCATGTGCCTCGGCTCCCAGGTTCATGGGAGCACCAAGTACATTATTG 2003
.|.| || |||||.||||||||.|||||.|||||||.|||||.|||.|.|||| ||.|||||||||||.|.|
Sbjct 1936 CTTG-TGCAGAGCCTCAAACTCGTGAGCCTGTGCCTAGGCTCACAGCTGCATG---GCGCCAAGTACATTCTGG 2005
Query 2004 ATCCACAGAATGGCTTGTCATTTTGCAGTGTGATAGTCCAAGAGATATTTAAGGAGAAAAAATGCATTAGCTCC 2077
|.||.|||||.|.|||| ||.|.|||.||||..||.||.||||..|..|.|..|||.|..|||||.|||.||
Sbjct 2006 ACCCGCAGAAGGCCTTG---TTCTCCAGCGTGAAGGTGCAGGAGAAGTCCACGTGGAAGATGTGCATCAGCGCC 2076
Query 2078 ACAGGGAATGCAGGGCATGTCCCTGCAGTGGGGGGCATAAAGTTTTTGTATGACCACATGGCAGATACCACCAC 2151
.|||| ||| ||| || ||.|..|
Sbjct 2077 CCAGG---------------CCC--CAG-------------------------CC------------CCTCTGC 2096
Query 2152 TGAATTGGAACGGATAAAGAGCAAGAACCTGAAAAATAACGTGCTGCAGCTACCTCTGTGCGAAAAGACCATCT 2225
|||..|.||.|.|.|.|.||.||||||.||||..||.||||.|||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2097 TGACCTTGACCCGGTGAGGACCAAGAAGCTGAGGAACAACGCGCTCCAGCTACCTCTGTGCGAAAAGACCATCT 2170
Query 2226 CTGTGAACATCCAGCGGAACCCTAAGGAGGGGCTGCTGTGCGCATCCAGCCCAGCCAGCTGTTGCCATGTCATC 2299
|.||||||||||||||.|.||..|||||.||||||||.|||||.||||||||.||||||||.||||||||||||
Sbjct 2171 CCGTGAACATCCAGCGCAGCCGCAAGGAAGGGCTGCTCTGCGCCTCCAGCCCCGCCAGCTGCTGCCATGTCATC 2244